Q1a-M25 (Q1a2/Q1a1b1)

[Niezgoda]

У меня есть вопрос:

известны ли какие-то научные статьи или договоры, которые говорят что гаплогруппы Q1a2 или Q1b приходят из гуннов?
Я искал информацию в Интернете, но, эта тема очень редко и только в блогах и на дискуссионных группах.
Есть отсутствие голоса науки.

Заранее спасибо.
C уважением
Адам

[Yurgan]

У меня есть вопрос:

известны ли какие-то научные статьи или договоры, которые говорят что гаплогруппы Q1a2 или Q1b приходят из гуннов?
Я искал информацию в Интернете, но, эта тема очень редко и только в блогах и на дискуссионных группах.
Есть отсутствие голоса науки.

Заранее спасибо.
C уважением
Адам

Все зависит от того, каких гуннов мы имеем ввиду.
Тех сюнну-хунну, которые жили в Монголии  или тех гуннов, которые пришли в Европу во главе с Атиллой?

[Niezgoda]

У меня есть вопрос:

известны ли какие-то научные статьи или договоры, которые говорят что гаплогруппы Q1a2 или Q1b приходят из гуннов?
Я искал информацию в Интернете, но, эта тема очень редко и только в блогах и на дискуссионных группах.
Есть отсутствие голоса науки.

Заранее спасибо.
C уважением
Адам

Все зависит от того, каких гуннов мы имеем ввиду.
Тех сюнну-хунну, которые жили в Монголии  или тех гуннов, которые пришли в Европу во главе с Атиллой?

Я думаю, что есть достаточно доказательств, что европейские гунны происходят из племен сюнну.
Мы также знаем, что они были конфедерации разных народов.
Тем не менее, гунны могут быть ядром этих племен.

Я забочусь о научных принципах, которые говорят о генетике европейских гуннов, также сюннов, которые жили в Монголии.

[Шад]

У меня есть вопрос:

известны ли какие-то научные статьи или договоры, которые говорят что гаплогруппы Q1a2 или Q1b приходят из гуннов?
Я искал информацию в Интернете, но, эта тема очень редко и только в блогах и на дискуссионных группах.
Есть отсутствие голоса науки.

Заранее спасибо.
C уважением
Адам

Адам,
у нас есть раздел, где я пытаюсь собирать ссылки на интересные статьи по этой теме.
http://forum.molgen.org/index.php/topic,5206.msg213469.html#msg213469

Но, к сожалению, что-то глубоко конкретного на этот счет нет. Редкое исключение, информация по Q1b в этой же теме. Но я не считаю этот могильник гуннским. Культура Яньбулакэ в моем понимании это скорее юэчжи.

[Шад]

Туркмены Q-M25 принадлежат к субкладу Q-L712.
Источник - данные Эстонского биоцентра.
http://dienekes.blogspot.ru/2015/02/estonian-biocentre-high-coverage-y.html
В течение выходных надеюсь обработать данные по всем Q и сообщу подробности.

[Fire]

Туркмены Q-M25 принадлежат к субкладу Q-L712.
Источник - данные Эстонского биоцентра.
http://dienekes.blogspot.ru/2015/02/estonian-biocentre-high-coverage-y.html
В течение выходных надеюсь обработать данные по всем Q и сообщу подробности.

а какой документ вы обработали чтоб понять что они Q-L712 ?

[Teresh]

В течение выходных надеюсь обработать данные по всем Q и сообщу подробности.

Да, для Q там много чего интересного может быть. Меня почему-то в первую очередь коряки заинтересовали.

[Шад]

Туркмены Q-M25 принадлежат к субкладу Q-L712.
Источник - данные Эстонского биоцентра.
http://dienekes.blogspot.ru/2015/02/estonian-biocentre-high-coverage-y.html
В течение выходных надеюсь обработать данные по всем Q и сообщу подробности.

Можно уточнить, где конкретно запрятана эта информация и что необходимо для её извлечения ?

На самом деле там нет BAM файлов. В архиве есть файл в формате VCF.
Там я вручную ищу позицию по Hg19 и проверяю наличие мутации или ее отсутствие.

[пенелопа]

А с помощью какой программы можно открыть VCF ?

Да хотя бы Блокнотом. Файл же текстовый.

[Шад]

На самом деле там нет BAM файлов. В архиве есть файл в формате VCF.
Там я вручную ищу позицию по Hg19 и проверяю наличие мутации или ее отсутствие.

А с помощью какой программы можно открыть VCF ?

Я использую платный UltaEdit. Он позволяет работать с текстовыми файлами в несколько десятков мегабайт. Блокнот на таких размерах виснет.

[G-Man]

На самом деле там нет BAM файлов. В архиве есть файл в формате VCF.
Там я вручную ищу позицию по Hg19 и проверяю наличие мутации или ее отсутствие.

А с помощью какой программы можно открыть VCF ?

Я использую платный UltaEdit. Он позволяет работать с текстовыми файлами в несколько десятков мегабайт. Блокнот на таких размерах виснет.

Excel неплохо справляется.

[Yurgan]

На самом деле там нет BAM файлов. В архиве есть файл в формате VCF.
Там я вручную ищу позицию по Hg19 и проверяю наличие мутации или ее отсутствие.

А с помощью какой программы можно открыть VCF ?

Я использую платный UltaEdit. Он позволяет работать с текстовыми файлами в несколько десятков мегабайт. Блокнот на таких размерах виснет.

Excel неплохо справляется.

файл, котрый начинается на var- открывается NotePad

[Nimissin]

Ориентируйтесь по координатам и направлению мутаций. Из 70 тыс. записей кандидатур в снипы 3-4 тыс. Наименований, как правило, нет. Это уже Ваша задача установить, известный это снип, или новый, безымянный. По VCF файлу можно установить только кандидатуры с производным аллелем (т.е. с отличием от референсной последовательности). Если какая-либо позиция в записях отсутствует, то возможны следующие варианты:
1) аллель предковый, мутации нет;
2) сайт (позиция) не был прочитан.

[Шад]

Туркмены Q-M25 принадлежат к субкладу Q-L712.
Источник - данные Эстонского биоцентра.
http://dienekes.blogspot.ru/2015/02/estonian-biocentre-high-coverage-y.html
В течение выходных надеюсь обработать данные по всем Q и сообщу подробности.

а какой документ вы обработали чтоб понять что они Q-L712 ?

Принадлежность туркменских образцов даже не к Q-L712, а к находящемуся гораздо ниже субкладу Q-L713 достоверно подтверждена по следующим снипам: L713, YP844,  FGC7020, Y10786. Все эти снипы уровня Q-L713, подтвержденные по двум образцам имеющимся в YFull. Но не все снипы этого уровня были положительны на туркменский образец из эстонского биоцентра. Завтра буду анализировать - это особенность одного образца или аналогичная ситуация будет во всех трех туркменских образцах?
В последнем случае, ветвь Q-L713 разобьется на две - европейскую и туркменскую. Что скорее всего и произойдет.
Таким образом, можно уже достоверно утверждать, что европейские Q-L713 появились в результате миграции из Средней Азии. А вот к какому компоненту этногенеза туркменов они изначально принадлежали - пока неясно. Там участвовали тюрки-огузы и местный ираноязычный субстрат.

[Шад]

здесь STR маркеры
http://onlinelibrary.wiley.com/store/10.1002/ajhb.22677/asset/supinfo/ajhb22677-sup-0008-supptable3.pdf?v=1&s=ca861fd31cfc93bc8ba6857c060ca90b680da36f

@Fire

Вам будет интересно узнать, что описанные в статье итальянские Q (из Jenne/ High Aniene Valley) точно Q-L712. И на 17 гаплотипах очень напоминают дигорско-балкарские Q-L715 (xL713).

http://www.semargl.me/kit/67421/