Сравнение геномов на 23andMe

Автор dnaexplora, 25 декабря 2009, 23:27:52

« назад - далее »

dnaexplora

Несколько вопросов:
1. Правильно ли я понимаю что число которое там показывается (процент) -- это совпадения в 1% генома который у всех индивидумальный (т.е. игнорируются 99% генома которые у всех одинаковые) ?
2. Какой процент похожести должен быть у сына и отца или двух братьев? Какие реально диапазоны выпадают у различных протестированных?
3. Какое максимальное число там может быть теоретически?
4. Может ли быть высокий процент похожести (90%, например) у двух неродственников?
5. Существует ли порог выше которого люди гарантированно родственники в каком-то поколении (соотв. порог относительный)?

Mich Glitch

Цитата: dnaexplora от 25 декабря 2009, 23:27:52
Несколько вопросов:
1. Правильно ли я понимаю что число которое там показывается (процент) -- это совпадения в 1% генома который у всех индивидумальный (т.е. игнорируются 99% генома которые у всех одинаковые) ?

Пропустил Ваши вопросы, так как они были не в секции 23эндМи.
По поводу общего совпадения.
Конечно было бы хорошо сравнивать наиболее вариабельную часть генома. Т.е. тот пресловутый 1%. На деле же речь идёт о сравнении по панели снипов в 577 тысяч. Многие из них выбраны достаточно случайно, чисто по техническим причинам. Как результат, процент сравнения никогда не опускается ниже 60%. Даже, если бы значения снипов были строго бинарными, то и тогда бы в идеальном случае статистически минимальная разница должна находиться на уровне 50%.

Цитата: dnaexplora от 25 декабря 2009, 23:27:522. Какой процент похожести должен быть у сына и отца или двух братьев? Какие реально диапазоны выпадают у различных протестированных?
Лучше один раз увидеть. В своих настройках аккаунта выставьте крестик напротив показа семейства Менделей. Наряду с УПСами:



посмотрите и процент совпадения. Цифра находится в районе 85% для пары родитель-ребёнок.
Самоё высокое совпадение в среднем случае бывает у бар брат-брат и сестра-сестра. Особенно у пар близнецовых.

Цитата: dnaexplora от 25 декабря 2009, 23:27:523. Какое максимальное число там может быть теоретически?
Не совсем корректный вопрос. Поэтому и отвечу расплычато: мне неизвестны случаи 90% совпадения.

Цитата: dnaexplora от 25 декабря 2009, 23:27:52
5. Существует ли порог выше которого люди гарантированно родственники в каком-то поколении (соотв. порог относительный)?
Если брать дальнее родство, то для европейцев с высокой степени вероятности можно оценить по % совпадение двоюродное родство и ближе.
Но вообще родство смотрят по  УПСам, а % совпадения, наряду с этно-плотом характеризует Ваше этно окружение.

М: J-PF7321*
ЖМ: E-L117
МЖМ, МЖЖМ, ММЖЖМ: I-A19454
ЖЖМ: Шимоновичи E-Y40386*
ММЖМ: R-Y5973.2
MЖMЖЖM: R-YP4335
MMЖЖЖЖM: I-Y10622
MЖЖMMЖM: Шимоновичи I-Y12650*
ЖЖMMMЖM: Ратшичи R-YP684
МЖМММЖЖМ: J-Y144394
ЖЖMMMЖMMЖM, ЖЖMMMЖЖЖЖM, ЖЖMMMЖЖMMЖM, ЖЖMMMЖЖЖMЖM, ЖЖMMMЖЖЖЖЖM: Рюриковичи N-Y10931

Ж: H6a1a5a
МЖ: Н92
ММЖ: U5b2a2b2
МЖМЖ: J2b1a6a1
MЖMMЖ: U5a2b1*
MЖMMMЖ: H1q