АвторТема: J2a2-PF5008 > L581  (Прочитано 8799 раз)

0 Пользователей и 2 Гостей просматривают эту тему.

Оффлайн G-Man

  • Сообщений: 681
  • Страна: ru
  • Рейтинг +650/-1
  • Y-ДНК: G-Z6700
Re: J2a2-PF5008 > L581
« Ответ #15 : 09 Ноябрь 2020, 15:21:02 »
Древние PH1795 с территории Монголии:

TUH002   Arkhangai, Mongolia   Late Xiongnu   50 BCE - 100 CE

UGU001   Selenge, Mongolia   Early Medieval Türk   687-711 CE

ZAA005   Bulgan, Mongolia   Late Medieval Khitan   1025-1155 CE

ULA001   Bulgan, Mongolia   Late Medieval Khitan   1033-1159 CE

Оффлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1474
  • Страна: ru
  • Рейтинг +472/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b
Re: J2a2-PF5008 > L581
« Ответ #16 : 09 Ноябрь 2020, 20:20:22 »
Древние PH1795 с территории Монголии:

TUH002   Arkhangai, Mongolia   Late Xiongnu   50 BCE - 100 CE

UGU001   Selenge, Mongolia   Early Medieval Türk   687-711 CE

ZAA005   Bulgan, Mongolia   Late Medieval Khitan   1025-1155 CE

ULA001   Bulgan, Mongolia   Late Medieval Khitan   1033-1159 CE

Их BAМы доступны?

Оффлайн G-Man

  • Сообщений: 681
  • Страна: ru
  • Рейтинг +650/-1
  • Y-ДНК: G-Z6700
Re: J2a2-PF5008 > L581
« Ответ #17 : 10 Ноябрь 2020, 02:00:51 »
Древние PH1795 с территории Монголии:

TUH002   Arkhangai, Mongolia   Late Xiongnu   50 BCE - 100 CE

UGU001   Selenge, Mongolia   Early Medieval Türk   687-711 CE

ZAA005   Bulgan, Mongolia   Late Medieval Khitan   1025-1155 CE

ULA001   Bulgan, Mongolia   Late Medieval Khitan   1033-1159 CE

Их BAМы доступны?

Да, уже пару недель копаемся
http://forum.molgen.org/index.php/topic,12613.msg504590.html#msg504590

Оффлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1474
  • Страна: ru
  • Рейтинг +472/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b
Re: J2a2-PF5008 > L581
« Ответ #18 : 15 Ноябрь 2020, 02:47:27 »
Проверил вышеупомянутых новичков из ветви PH1795. Картинка получилась следующая:
Все четыре образца имеют отрицательные показатели, как минимум, в одном локусе из узла PH1795 в его актуальном виде на дереве YFull. Другими словами, все они не являются непосредственными предками современных представителей PH1795, сделавших NGS тест. При этом речь идет почти исключительно о западной части современного ареала носителей данного субклада. Восточная его часть, откуда как раз происходят древние образцы, протестирована в основном в рамках научных исследований и, следовательно, без полного секвенирования Y-хромосомы. Кроме того, ув. Nimissin обратил внимание на то, что и у RISE602 из Сары-Бел один снип (Y164821) показывает отсутствие нужной мутации. Таким образом, и это образец не может считаться прямым предком современных западных линий PH1795.
Наиболее удаленным ото всех остальных оказался TUH002 Late Xiongnu, у которого сразу 4 снипа из узла PH1795 оказались отрицательными: BY54304 (х4); PH3439 (х1); BZ2730 (х1) и Z15293 (х1). В связи с тем, что TUH002 - один из самых ранних образцов возрастом около 2 тысяч лет, можно было бы предположить, что эти 4 мутации произошли уже после него. Однако это опровергается тем, что у практически современного ему RISE602 два снипа из четырех - положительные.
Далее любопытнее - Y164969 оказался "в минусе"  сразу у трех образцов ULA001 Late Med. Khitan, ZAA005 Late Med. Khitan и UGU001 Early Med. Türk. При этом снип Y164935 отрицателен у ULA001, но "в плюсе", как минимум, у ZAA005. Складывается впечатление, что Y164935 - один из наиболее "молодых" снипов узла PH1795 и отвалится от узла при первом же случае. К сожалению, он не прочитан у образцов из Кытманово и Тянь Шаня, и пока сложно сказать, образуют ли они общую ветвь с монгольскими дДНК или же нет. Возможно это проясниться в случае их попадания на дерево YFull и обнаружения общих новелей с кем-то из монгольских образцов.

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2402
  • Рейтинг +759/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b12a
Re: J2a2-PF5008 > L581
« Ответ #19 : 15 Ноябрь 2020, 04:52:08 »
Складывается впечатление, что Y164935 - один из наиболее "молодых" снипов узла PH1795 и отвалится от узла при первом же случае. К сожалению, он не прочитан у образцов из Кытманово и Тянь Шаня, и пока сложно сказать, образуют ли они общую ветвь с монгольскими дДНК или же нет.
В образце DA124 есть мутация FT96741, совпадающая с приватными мутациями образца уйгура HGDP01304:
14860919 (hg38), 16972799 (hg19) C A.
Таким образом, у образца DA124 также есть мутация Y164935.


Оффлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1474
  • Страна: ru
  • Рейтинг +472/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b
Re: J2a2-PF5008 > L581
« Ответ #20 : 16 Ноябрь 2020, 11:28:14 »
В образце DA124 есть мутация FT96741, совпадающая с приватными мутациями образца уйгура HGDP01304:
14860919 (hg38), 16972799 (hg19) C A.
Таким образом, у образца DA124 также есть мутация Y164935.
Спасибо за очень значимую ремарку. Жалко, что HGDP01304 не смогли разместить его на YFull. Из этого региона это насколько мне известно единственный полный сиквенс. Вы анализировали его FASTQ?

Оффлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1474
  • Страна: ru
  • Рейтинг +472/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b
Re: J2a2-PF5008 > L581
« Ответ #21 : 16 Ноябрь 2020, 11:40:18 »
К 4 уже проанализированным образцам можно со всем основанием прибавить еще одно древнего тюрка ULI002 с возрастом 650-765 н.э.  Покрытие у него совсем слабенькое, но 2 снипа на уровне PH1975 удалось выловить (PH1105+, SK1405+). Кроме того, у него в плюсе снип V7034/FGC197/SK2005, который также положителен у всех древних образцов, у которых был прочитан данный регион. Однако этого снипа нет на дереве. Видимо, что-то с качеством. К сожалению, в виду отсутвия доступа к сырым данным не могу проверить, что с ним у современных представителей PH1795.
Итого имеем: позднего хунну, 2 древних тюрка и 2 кидани.

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2402
  • Рейтинг +759/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b12a
Re: J2a2-PF5008 > L581
« Ответ #22 : 16 Ноябрь 2020, 15:16:38 »
В образце DA124 есть мутация FT96741, совпадающая с приватными мутациями образца уйгура HGDP01304:
14860919 (hg38), 16972799 (hg19) C A.
Таким образом, у образца DA124 также есть мутация Y164935.
Спасибо за очень значимую ремарку. Жалко, что HGDP01304 не смогли разместить его на YFull. Из этого региона это насколько мне известно единственный полный сиквенс. Вы анализировали его FASTQ?
Провел анализ по BAM файлу. Файл собрал из 12 частей с помощью пакета программ samtools.

Оффлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1474
  • Страна: ru
  • Рейтинг +472/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b
Re: J2a2-PF5008 > L581
« Ответ #23 : 16 Ноябрь 2020, 18:30:29 »
Не погружался глубоко в тему археологической атрибуции  DA124. В статье указано очень расплывчато -кочевник. Время в принципе уже монгольское. Ув. Nimissin, нет ли у вас информации о каком все-таки номаде в данном случае идет речь? Кто там хотя бы в теории мог быть.

Оффлайн G-Man

  • Сообщений: 681
  • Страна: ru
  • Рейтинг +650/-1
  • Y-ДНК: G-Z6700
Re: J2a2-PF5008 > L581
« Ответ #24 : 17 Ноябрь 2020, 09:07:08 »
Не погружался глубоко в тему археологической атрибуции  DA124. В статье указано очень расплывчато -кочевник. Время в принципе уже монгольское

DA124   654-689 calCE

1271 — это BP

Оффлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1474
  • Страна: ru
  • Рейтинг +472/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b
Re: J2a2-PF5008 > L581
« Ответ #25 : 17 Ноябрь 2020, 13:09:02 »

DA124   654-689 calCE

1271 — это BP

Большое спасибо, что обратили внимание на ошибку!

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 6009
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4220/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: J2a2-PF5008 > L581
« Ответ #26 : 18 Ноябрь 2020, 10:51:12 »
В образце DA124 есть мутация FT96741, совпадающая с приватными мутациями образца уйгура HGDP01304:
14860919 (hg38), 16972799 (hg19) C A.
Таким образом, у образца DA124 также есть мутация Y164935.
Спасибо за очень значимую ремарку. Жалко, что HGDP01304 не смогли разместить его на YFull. Из этого региона это насколько мне известно единственный полный сиквенс. Вы анализировали его FASTQ?
https://www.yfull.com/tree/J-BY114993/  :)

Оффлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1474
  • Страна: ru
  • Рейтинг +472/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b
Re: J2a2-PF5008 > L581
« Ответ #27 : 18 Ноябрь 2020, 17:09:22 »
Спасибо за очень значимую ремарку. Жалко, что HGDP01304 не смогли разместить его на YFull. Из этого региона это насколько мне известно единственный полный сиквенс. Вы анализировали его FASTQ?
https://www.yfull.com/tree/J-BY114993/  :)
 
Ура! Спасибо!
Праздник в ветке продолжается)

Оффлайн Fruit

  • Сообщений: 6
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1/-0
  • Y-ДНК: J m172
Re: J2a2-PF5008 > L581
« Ответ #28 : 18 Декабрь 2020, 18:33:41 »
Добрый вечер! Кто-нибудь пожалуйста прокомментируйте, что происходит на https://yfull.com/tree/J-PH1795/ ! Абхаз с грузинским флагом, появляется и исчезает, китайские мандарины и уйгуры с алтайцами скачут то вверх то вниз! Какие версии по кавказским образцам? Какой волной попали? Абхаз как я понял из древнего абхазского рода, к поздним тюркским миграциям не должен иметь отношение. Черкесы и кабардинцы вроде тоже. Но они на древе Y-Full  ко мне ближе всех кроме мордовских мишар. Заранее благодарю за ответ!

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10107
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1380/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: J2a2-PF5008 > L581
« Ответ #29 : 18 Декабрь 2020, 18:35:07 »
офф. Кстати а как YFull разруливает вопросы Крыма, Абхазии и иже с ними? По IP? ))

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.