дДНК из Восточной Европы

[Arame]

Даваете здесь собирать информации о дДНК из Восточной Европы ( Прибалтика, Украина, Беларусь и Западная Россия )

Скоро выйдет новая работа из Прибалтики.  Можно его здесь обсуждать.

-------


дДНК из Латвии и Украины, мезолит и неолит
http://forum.molgen.org/index.php/topic,9740.0.html

дДНК ямной культуры
http://forum.molgen.org/index.php/topic,7832.0.html

дДНК - Салтово-маяцкая, сарматская, аланская Новый
http://forum.molgen.org/index.php/topic,8459.0.html

[rozenblatt]

Вот ситуация с дДНК из Восточной Европы на данный момент:



Как видно есть неплохое покрытие по Прибалтике, Армении и Поволжью. Остальные регионы пока не очень.

[Шад]

А что за "зеленые ромбики" на стыке границ Ставропольского края, Ростовской области и Калмыкии?

[rozenblatt]

А что за "зеленые ромбики" на стыке границ Ставропольского края, Ростовской области и Калмыкии?

Ямники из Калмыкии, Allentoft 2015.

[Шад]

А что за "зеленые ромбики" на стыке границ Ставропольского края, Ростовской области и Калмыкии?

Ямники из Калмыкии, Allentoft 2015.

Вот эти?

Код: [Выделить]

SAMEA3325353 RISE240 Sukhaya Termista I Yamnaya Russia Female 2880 BC 2632 BC
SAMEA3325410 RISE546 Temrta IV                 Yamnaya Russia Male nd nd R1b1a2 R1b
SAMEA3325411 RISE547 Temrta IV                 Yamnaya Russia Male 2887 BC 2634 BC R1b1a2a2(Parallel to Z2103) R1b
SAMEA3325412 RISE548 Temrta IV                 Yamnaya Russia Male nd nd R1b1a2a2 R1b
SAMEA3325413 RISE550 Peshany V         Yamnaya Russia Male 3334 BC 2635 BC R1b1a2a2 R1b
SAMEA3325414 RISE552 Ulan IV                 Yamnaya Russia Male 2849 BC 2143 BC I2a2a1b1b2 I2a


[rozenblatt]

Вот эти?

Код: [Выделить]

SAMEA3325353 RISE240 Sukhaya Termista I Yamnaya Russia Female 2880 BC 2632 BC
SAMEA3325410 RISE546 Temrta IV                 Yamnaya Russia Male nd nd R1b1a2 R1b
SAMEA3325411 RISE547 Temrta IV                 Yamnaya Russia Male 2887 BC 2634 BC R1b1a2a2(Parallel to Z2103) R1b
SAMEA3325412 RISE548 Temrta IV                 Yamnaya Russia Male nd nd R1b1a2a2 R1b
SAMEA3325413 RISE550 Peshany V         Yamnaya Russia Male 3334 BC 2635 BC R1b1a2a2 R1b
SAMEA3325414 RISE552 Ulan IV                 Yamnaya Russia Male 2849 BC 2143 BC I2a2a1b1b2 I2a


Они самые.

[Roaring]

Вот ситуация с дДНК из Восточной Европы на данный момент:



Как видно есть неплохое покрытие по Прибалтике, Армении и Поволжью. Остальные регионы пока не очень.

А по армянам что у нас? Помню только древнего какого-то, который вышел генетическим Чеченцем.

[Аббат Бузони]

Остальные регионы пока не очень.

Был бы выход на тех у кого останки есть, остальное дело наживное.

[rozenblatt]

А по армянам что у нас? Помню только древнего какого-то, который вышел генетическим Чеченцем.

Образцы из Армении представлены в статьях Population genomics of Bronze Age Eurasia(http://www.nature.com/nature/journal/v522/n7555/full/nature14507.html) и The genetic structure of the world's first farmers(http://biorxiv.org/content/early/2016/06/16/059311).

[rozenblatt]

В дополнительных материалах к статье про колоколовидные кубки указаны два образцы древних славян(?):

RISE568.SG   RISE568, F0525, A01623, gr. 16   tooth   1   Shotgun   AllentoftNature2015   ..   1200   600-900 CE   Czech_Early_Slav.SG   Czech_Early_Slav.SG   ..   Brandysek   ..   Czech Republic   50.19   14.16   F   H44a   ..   ..   ..   0.053   60816   minus   All
RISE569.SG   RISE569, F0527, A01643, gr. 35?'   tooth   1   Shotgun   AllentoftNature2015   ..   1235   660-770 calCE (1300±30 BP, Poz-84461)   Czech_Early_Slav.SG   Czech_Early_Slav.SG   ..   Brandysek   ..   Czech Republic   50.19   14.16   F   H1af   ..   ..   ..   0.98   708529   minus   All

Но почему-то указано что эти образцы были опубликованы в 2015 в статье Аллентофта. Кто-нибудь знает в чём тут дело?

[rozenblatt]

Что же, прогресс налицо, теперь у нас куча дДНК с Балкан и Украины:



Пока нет дДНК из Азербайджана, Беларуси, Молдовы и Центральной России. Надеюсь они скоро будут.

[AppS]

rozenblatt

I3717, I3718, I4111, I4114, S5875.E1.L1, S5876.E1.L1, S5879.E1.L1, S5883.E1.L1, S5885.E1.L1, S5890.E1.L1, S5892.E1.L1, Mariupol, 5500-4800 BCE

привязаны к Дериевке возле Кременчуга, тут нет ошибки?

[rozenblatt]

привязаны к Дериевке возле Кременчуга, тут нет ошибки?

Mariupol в данном случае означает что погребение относится к Мариупольской культуре. А находится оно действительно в Дереивке.

[rozenblatt]

Нашёл в интернете вот что: http://etd.asj-oa.am/4682/2/%D5%80.%D5%80%D5%B8%D5%B0%D5%BE%D5%B0%D5%A1%D5%B6%D5%B6%D5%AB%D5%BD%D5%B5%D5%A1%D5%B6_%D5%A1%D5%BF%D5%A5%D5%B6%D5%A1%D5%AD%D5%B8%D5%BD%D5%B8%D6%82%D5%A9%D5%B5%D5%B8%D6%82%D5%B6.pdf

MOLECULAR PHYLOGEOGRAPHY OF ARMENIANS BASED ON COMPLETE MITOCHONDRIAL GENOME DATA

BY HRANT HOVHANNISYAN

DISSERTATION

Там среди прочего упомянуто:

"To investigate mitochondrial DNA variation in ancient populations of Armenian Highland in 2014-2015 our team in collaboration with the Institute of Archaeology and Ethnography of National Academy of Sciences (Yerevan, Armenia) has collected bone and teeth specimens from burials located in the territory of the Republic of Armenian and Artsakh. The collection of ancient specimens represented different archaeological epochs spanning from Middle/Upper Paleolithic (20kay) to the late Bronze age (3kya).

Ca 90 collected specimens were subsequently delivered to Willerslev’s group at the Center for GeoGenetics (Copenhagen, Denmark) for complete mitochondrial DNA sequencing. All laboratory techniques for aDNA analysis, including DNA extraction and library preparation, molecular screening, next-generation sequencing (using Illumina HiSeq2500 platform) and DNA authentification were performed as described in Allentoft et al. 2015.

Consensus sequence calling based on both rCRS and whole genome was carried out using in-home python script.

44 out 90 sequences had the coverage > 9 and thus were subsequently considered for further analysis."

На странице 60 есть таблица с частотами мтДНК в древних образцах. Вопрос: это где-нибудь всё опубликовано?

[Kambic]

Вон оно что...живчики, однако. .. In addition, there is evidence that ancient pastoralists may have had healthier genomes than hunter-gatherers and agriculturalists. We also observed a temporal trend whereby genomes from the recent past are more likely to be healthier than genomes from the deep past. This calls into question the idea that modern lifestyles have caused genetic load to increase over time. Focusing on individual genomes, we find that the overall genomic health of the Altai Neandertal is worse than 97% of present day humans and that Otzi the Tyrolean Iceman had a genetic predisposition to gastrointestinal and cardiovascular diseases.
 http://www.biorxiv.org/content/early/2017/06/02/145193?%3Fcollection=
Рост цивилизаций всегда связывали с земледельческими культурами, а тут обратное.