FTDNA начала принимать более новые файлы 23andme и AncestryDNA

[Srkz]

Эти цифры наводят меня на мысль, что чипы Иллюмина стабильно читают только 680545 позиции в аутосомах + 17587 в Х. Остальные результаты, как видите, даже если по количеству SNP совпадают, то no-call'ов (в терминологии gedmatch, утилит Пайка и пр.) разное кол-во.
К тому же, они отличаются от приведенных мной официальных и полуофициальных данных здесь.

Не совсем, у них просто время от времени чуть корректируется панель. Количество no call, думаю, может быть связано с качеством образца (хотя бы частично).

PS Возможно, по поводу размеров файлов Михаилу будет понятнее такая картинка:

Это один и тот же геном, заархивированный с разными настройками (десятки однообразных постов о том, что геном здесь один и содержимое каждого из файлов после распаковки совпадает до последнего знака, добавить по вкусу)

[gecube_ru]

Srkz

Не совсем, у них просто время от времени чуть корректируется панель

Читай - новая ревизия чипа? Но не каждые же полгода!!! :-)

[Srkz]

Srkz

Не совсем, у них просто время от времени чуть корректируется панель

Читай - новая ревизия чипа? Но не каждые же полгода!!! :-)

У меня семь ревизий записано - видимо, где-то раз в год.

[gecube_ru]

Таким образом, следует признать, что все то что есть в аутосомном csv файле от FTDNA, это действительно все, что было прочитано чипом Иллюмина. Не больше и не меньше.

Ну, и понятно, что чем больше номер кита, то тем, как правило, свежее ff, но бывает и ситуация, когда человек давно сделал Y-DNA и получил маленький номер кита, а потом через полгода, год или больший срок решил сделать FF. Поэтому сортировка по номеру не совсем верная )))) Лучше сортировать по размеру файла (в SNP).

[AlexanderK]

человек давно сделал Y-DNA и получил маленький номер кита, а потом через полгода, год или больший срок решил сделать FF.

Конечно бывает. Мой троюродный брат делал Y в 2008 а ФФ - в 2016 

[Mich Glitch]

То есть. Если понял правильно, разные настройки архивирования?
Обратите внимание на даты. Странно, что в интервале 5 минут сменились настройки.
Также не понятно почему вне зависимости от билда и "настроек архиватора", первый файл всегда меньше второго.
Не могу связать настройки архивирования с разнящимися размеров выходных файлов.
И тем более непонятно, как по идентичным файлам получаем ращные суммы совпадений (разные отдельные УПСы).

Но гипотеза принята.

Кстати. Не скажу, чтобы данный ТЕХНИЧЕСКИЙ вопрос меня особо волновал. Я вообще предпочитаю абстрагироваться от деталей.

[ankr21]

Ради эксперимента 19$ перечислил. Получил доступ к myOrigins и ancientOrigins, матчей больше не стало. Вывод: все в gedmatch.com.,пока бесплатно .

[AlexanderK]

Вывод: все в gedmatch.com.,пока бесплатно .

В гедматче, увы, народу на порядок меньше. И если у 23andMe  Gedmatch хотя бы в партнерах числится, то ФТДНА его  как бы и не замечает.  Поэтому от поиска по базе ФТДНА по-любому никда не денешься, реальным альтернатив по массовости нет. Да и по Y в Гедматче проверки нет.

Если уж агитировать - имхо есть смысл всех агитировать нарисовать хоть маленькое дерево (папа-мама-бабушка-дедушка) в Geni.com и MyHeritage и подгрузить в него вои ДНК-тесты. 

[Mich Glitch]

Про ГедМатч.
Кто нибудь использовал платную опцию построения лерева по результатам тестов ближайшего окружения?

Эта вещь, если когда- нибудь будет сделана, означает построение связующего генелогического дерева на основании одних только тестов современников.

[gecube_ru]

Кто нибудь использовал платную опцию построения лерева по результатам тестов ближайшего окружения?

Эта вещь, если когда- нибудь будет сделана, означает построение связующего генелогического дерева на основании одних только тестов современников.

Не использовал, и более того - боюсь, что эта штука никогда не будет работать точно. Чтобы она фурыкала 100%, нужно иметь полный набор тестов ДНК и иметь достаточно кол-во родственников. Документальную генеалогию это не заменит. Но как подспорье очень может помочь.

Еще момент - на гедматче подписка на такая дорогая. Ув.Михаил может сам попробовать эту функцию, как владелец большого количества китов. У меня, увы, столько протестированных пока нет.

[Mich Glitch]

По поводу поброьовать.
Уже пробовал.
Сначала выдвинул идею (чуть позже дам ссылку). Потом посмотрел сырой блин комом мастера многостаночника Феликса, запамятовал его индийскую фамилию.
Сейчас не виду внятного концепта. Хочу спросить (точнее уже спросил) - стоит ли тратить время. Ведь множественные пересечения толком обрабатывать никто не умеет. Нет никакого желания тратить время на ввод реальных для какого-то студента.
А вот если скажут, что это не вьюнош, которому всё уже ясно, тогда можно и расстараться.

[Mich Glitch]

Вот обещанная ссылка на тему


http://forum.molgen.org/index.php/topic,1147.msg28127.html#msg28127

[Mich Glitch]

Вот тут, если убрать все бла-бла, постановка задачи:

http://forum.molgen.org/index.php/topic,1147.msg196881.html#msg196881

[Srkz]

То есть. Если понял правильно, разные настройки архивирования?
Обратите внимание на даты. Странно, что в интервале 5 минут сменились настройки.
Также не понятно почему вне зависимости от билда и "настроек архиватора", первый файл всегда меньше второго.
Не могу связать настройки архивирования с разнящимися размеров выходных файлов.
И тем более непонятно, как по идентичным файлам получаем ращные суммы совпадений (разные отдельные УПСы).

Ох Еще раз и по пунктам, чтобы никто не запутался. Архивы на картинке сгенерированы мной для иллюстрации (кроме исходного файла от FTDNA, где стоит время 19.02). Внутри каждого из них один и тот же файл (23 100 КБ). Файлов для 277811 и 277812 на картинке нет. Файлы для 277811 и 277812 не идентичны, они должны незначительно отличаться. Файлы FTDNA на 6 Мб меньше файлов на 7.5 Мб именно из-за настроек архиватора.

Кстати. Не скажу, чтобы данный ТЕХНИЧЕСКИЙ вопрос меня особо волновал. Я вообще предпочитаю абстрагироваться от деталей.

Пожалуйста, в следующий раз тогда не надо строчить десятки постов по вопросу, который вас волнует недостаточно, чтобы разбираться хотя бы в минимальном объеме.

[Mich Glitch]

Вот тебе раз.
Аппелирую к своим картинкам.
Всемвопросы по ним. Ваша же картинка вносит только дополнительную сумятицу.

Как Вы можете в свете своего предположения оиветить на сомнения моего предыдущего поста?