АвторТема: дДНК из Латвии и Украины, мезолит и неолит  (Прочитано 13589 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн rozenblattАвтор темы

  • Сообщений: 1501
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1947/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
http://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(16)31542-1

The Neolithic Transition in the Baltic Was Not Driven by Admixture with Early European Farmers

Eppie R. Jones, Gunita Zarina, Vyacheslav Moiseyev, Emma Lightfoot, Philip R. Nigst, Andrea Manica, Ron Pinhasi, Daniel G. Bradley

Published Online: February 02, 2017

Open Access

DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.cub.2016.12.060

Highlights



A degree of genetic continuity from the Mesolithic to the Neolithic in the Baltic


Steppe-related genetic influences found in the Baltic during the Neolithic


No Anatolian farmer-related genetic admixture in Neolithic Baltic samples


Steppe ancestry in Latvia at the time of the emergence of Balto-Slavic languages

Summary

The Neolithic transition was a dynamic time in European prehistory of cultural, social, and technological change. Although this period has been well explored in central Europe using ancient nuclear DNA [1, 2], its genetic impact on northern and eastern parts of this continent has not been as extensively studied. To broaden our understanding of the Neolithic transition across Europe, we analyzed eight ancient genomes: six samples (four to ∼1- to 4-fold coverage) from a 3,500 year temporal transect (∼8,300–4,800 calibrated years before present) through the Baltic region dating from the Mesolithic to the Late Neolithic and two samples spanning the Mesolithic-Neolithic boundary from the Dnieper Rapids region of Ukraine. We find evidence that some hunter-gatherer ancestry persisted across the Neolithic transition in both regions. However, we also find signals consistent with influxes of non-local people, most likely from northern Eurasia and the Pontic Steppe. During the Late Neolithic, this Steppe-related impact coincides with the proposed emergence of Indo-European languages in the Baltic region [3, 4]. These influences are distinct from the early farmer admixture that transformed the genetic landscape of central Europe, suggesting that changes associated with the Neolithic package in the Baltic were not driven by the same Anatolian-sourced genetic exchange.

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2005
  • Страна: 00
  • Рейтинг +527/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: дДНК из Латвии и Украины, мезолит и неолит
« Ответ #1 : 02 Февраль 2017, 20:51:53 »
Mother of God, неужели))

по идее, скоро должны выпустить вторую работу по прибалтийским дДНК с образцами Тштинецкой.

Оффлайн rozenblattАвтор темы

  • Сообщений: 1501
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1947/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
Re: дДНК из Латвии и Украины, мезолит и неолит
« Ответ #2 : 02 Февраль 2017, 20:57:54 »
 Further, the Y chromosomes of two of our Latvian Mesolithic samples were assigned to haplogroup R1b (the maximum-likelihood sub-haplogroup is R1b1b), which is the most common haplogroup found in modern Western Europeans [36].

Латвийский мезолит -  R1b, замечательно!

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2005
  • Страна: 00
  • Рейтинг +527/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: дДНК из Латвии и Украины, мезолит и неолит
« Ответ #3 : 02 Февраль 2017, 21:00:54 »
Further, the Y chromosomes of two of our Latvian Mesolithic samples were assigned to haplogroup R1b (the maximum-likelihood sub-haplogroup is R1b1b), which is the most common haplogroup found in modern Western Europeans [36].

Латвийский мезолит -  R1b, замечательно!

очень интересно, особенно если вспомнить об итальянских и испанских R1b в мезолите, но и в том и в другом случае, Поляко нашел минорной степной адмикс
Цитировать
This haplogroup has been found at low frequencies before the Late Neolithic in Western Europe [1, 35] but at higher frequencies in Russia and is suggested to have spread into Europe from the East after 5,000 cal BP [1]. The presence of this haplogroup in Mesolithic Latvia points to a more westward ancestral range.
надо подождать более тщательных тестов=)

украинские сэмплы оказались неожиданно западными, я ожидал "крен" в сторону WHG у образцов западнее Дона, но не такой явный

образцы пока еще не доступны
http://www.ebi.ac.uk/ena/data/search?query=PRJEB18067
Цитировать
Accession Numbers
The accession number for the sequence data reported in this paper is European Nucleotide Archive (ENA): PRJEB18067.

Из дополнительных материалов, украинские образцы:
неолит - Вовниги, 4519-4343 cal BC
мезолит - Васильевка, 9193-8641 cal BC
« Последнее редактирование: 02 Февраль 2017, 21:09:09 от FenriR »

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2005
  • Страна: 00
  • Рейтинг +527/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: дДНК из Латвии и Украины, мезолит и неолит
« Ответ #4 : 02 Февраль 2017, 21:16:04 »
Интересно, что латвийских HG, (HG2 и HG3 - как раз тех, у кого нашли R1b) на PCA выбрасывает к скандинавским охотникам-собирателям, у которых была таки примесь ANE)

Оффлайн Arthwr

  • Сообщений: 1315
  • Страна: ua
  • Рейтинг +765/-6
    • ΑΡΧΑΙΑ ΓΛΩΣΣΑ
  • Y-ДНК: R1b-PF7563
  • мтДНК: K1c1e
Re: дДНК из Латвии и Украины, мезолит и неолит
« Ответ #5 : 02 Февраль 2017, 21:20:01 »
Один R1b1b 7791-7586 cal BP Late Mesolithic, beginnings of the Narva culture.
Второй R1b1b 7252-6802 cal BP Early Neolithic, Earliest pottery.

Оффлайн Pre Slav

  • Где начало того конца которым оканчивается начало?
  • Сообщений: 1693
  • Страна: 00
  • Рейтинг +123/-111
Re: дДНК из Латвии и Украины, мезолит и неолит
« Ответ #6 : 02 Февраль 2017, 21:23:11 »
Further, the Y chromosomes of two of our Latvian Mesolithic samples were assigned to haplogroup R1b (the maximum-likelihood sub-haplogroup is R1b1b), which is the most common haplogroup found in modern Western Europeans [36].

Латвийский мезолит -  R1b, замечательно!
R1b1 из прибалтики/беларусии в кунда и нарве значительно более ожидаемо, чем R1a там же в мезолите...
плохо что днепро-донецкая осталась без гаплогрупп...


начался февраль - повалили новости с дднк, у них там явно госплан график выдачи результатов расписывает)))

Оффлайн Pre Slav

  • Где начало того конца которым оканчивается начало?
  • Сообщений: 1693
  • Страна: 00
  • Рейтинг +123/-111
Re: дДНК из Латвии и Украины, мезолит и неолит
« Ответ #7 : 02 Февраль 2017, 21:37:16 »
Интересно, что латвийских HG, (HG2 и HG3 - как раз тех, у кого нашли R1b) на PCA выбрасывает к скандинавским охотникам-собирателям, у которых была таки примесь ANE)
PCA and ADMIXTURE довольно таки плохие, EHG от WHG никак не отделены друг от друга, EHG подобность видна только по наличию CHG подобности... поэтому EHG, WHG, SHG  оказались все скомканными, в общем, это худший PCA что я видел в подобных работах... у всех других между ними видна разница...

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2005
  • Страна: 00
  • Рейтинг +527/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: дДНК из Латвии и Украины, мезолит и неолит
« Ответ #8 : 02 Февраль 2017, 21:47:20 »
Интересно, что латвийских HG, (HG2 и HG3 - как раз тех, у кого нашли R1b) на PCA выбрасывает к скандинавским охотникам-собирателям, у которых была таки примесь ANE)
PCA and ADMIXTURE довольно таки плохие, EHG от WHG никак не отделены друг от друга, EHG подобность видна только по наличию CHG подобности... поэтому EHG, WHG, SHG  оказались все скомканными, в общем, это худший PCA что я видел в подобных работах... у всех других между ними видна разница...
ADMIXTURE-анализ ("наличие CHG"- вероятно, 20%-примесь EHG, которую у CHG нашел Лазаридис), не отделяет их друг от друга, на PCA же, видно, что HG2 и HG3 уходят в сторону скандинавских охотников-собирателей по направленияю к EHG
Цитировать
Episodes of Continuity and Change during the Mesolithic and Neolithic in the Baltic
The two earliest samples in our Baltic time series, Latvia_HG1 (8,417–8,199 cal BP), associated with the Kunda culture, and Latvia_HG2 (7,791–7,586 cal BP), associated with the Narva culture, derive from the Late Mesolithic period [17, 21]. A third sample, Latvia_HG3 (7,252–6,802 cal BP), dates to the Late Mesolithic/Early Neolithic period, with the burial showing no major departures from the preceding Mesolithic traditions [21].
...
In keeping with their geographical origins, they are in an intermediate position between Western European hunter-gatherer samples (WHG; from Luxembourg, Hungary, Italy, France, and Switzerland) and Eastern European hunter-gatherer samples (EHG; from Russia). They are composed of the same (blue) major component as these other hunter-gatherer groups in an ancestry coefficient decomposition analysis performed using ADMIXTURE [25] (Figure 2B), suggesting a close relationship between these groups. We found that although the Latvian Mesolithic samples share closer affinity to WHG than to EHG, the Latvian Mesolithic samples do not belong entirely to either hunter-gatherer group (tested using D statistics [27], which offer a formal test of admixture; Table 2). This suggests that they may be a previously unsampled component of a hunter-gatherer meta-population that stretched across Northern Europe during the early Holocene.
интересное дополнение о, пока еще не протестированной, мета-популяции североевропейских HG.

...
украинские сэмплы оказались неожиданно западными, я ожидал "крен" в сторону WHG у образцов западнее Дона, но не такой явный
...
собственно, это не так: украинские образцы распологаются между скандинавскими HG и восточноевропейскими EHG, т.е. обнаруживают чуть бОльший крен в сторону WHG, нежели мезолитические "карел" и "самарец" - "как и ожидалось"=)
могли бы и выделить EHG в отдельный компонент-ADMIXTURE, так глаза можно сломать...

Оффлайн Pre Slav

  • Где начало того конца которым оканчивается начало?
  • Сообщений: 1693
  • Страна: 00
  • Рейтинг +123/-111
Re: дДНК из Латвии и Украины, мезолит и неолит
« Ответ #9 : 02 Февраль 2017, 21:53:46 »
Интересно, что латвийских HG, (HG2 и HG3 - как раз тех, у кого нашли R1b) на PCA выбрасывает к скандинавским охотникам-собирателям, у которых была таки примесь ANE)
PCA and ADMIXTURE довольно таки плохие, EHG от WHG никак не отделены друг от друга, EHG подобность видна только по наличию CHG подобности... поэтому EHG, WHG, SHG  оказались все скомканными, в общем, это худший PCA что я видел в подобных работах... у всех других между ними видна разница...
ADMIXTURE-анализ ("наличие CHG"- вероятно, 20%-примесь EHG, которую у CHG нашел Лазаридис), не отделяет их друг от друга, на PCA же, видно, что HG2 и HG3 уходят в сторону скандинавских охотников-собирателей по направленияю к EHG
про ADMIXTURE именно так, у них плохой... про PCA - да, но точность настолько низка, что не понятно HG2 и HG3, WHG они или SHG, просто уклоняющиеся в ту или иную сторону, в общем, этому PCA сильно доверять нельзя... будем ждать более качественных PCA...
 

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2005
  • Страна: 00
  • Рейтинг +527/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: дДНК из Латвии и Украины, мезолит и неолит
« Ответ #10 : 02 Февраль 2017, 22:01:45 »
про ADMIXTURE именно так, у них плохой... про PCA - да, но точность настолько низка, что не понятно HG2 и HG3, WHG они или SHG, просто уклоняющиеся в ту или иную сторону, в общем, этому PCA сильно доверять нельзя... будем ждать более качественных PCA...
да, вроде бы, все довольно неплохо видно:
снежинки - WHG
крестики - SHG
иксы - EHG
"латыши" уклоняются к SHG, "украинцы" - еще дальше к EHG
=))

но, конечно же, хотелось бы увидеть более детальный анализ.

Кстати, вероятное присутствие "северной" части EHG у латышских охотников-собирателей и одновременное отсутствие "южной", попавшей к CHG, скорее всего, снижает вероятность (за)кавказского происхождения этой гаплогруппы, имхо.

Оффлайн Pre Slav

  • Где начало того конца которым оканчивается начало?
  • Сообщений: 1693
  • Страна: 00
  • Рейтинг +123/-111
Re: дДНК из Латвии и Украины, мезолит и неолит
« Ответ #11 : 02 Февраль 2017, 22:06:34 »
"латыши" уклоняются к SHG
а может наоборот, это SHG уклоняющиеся к WHG, непонятно...

Цитировать
"украинцы" - еще дальше к EHG
да они и есть EHG, просто более юго-западные, в отличии от наших северо-восточных...

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2005
  • Страна: 00
  • Рейтинг +527/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: дДНК из Латвии и Украины, мезолит и неолит
« Ответ #12 : 02 Февраль 2017, 22:14:24 »
"латыши" уклоняются к SHG
а может наоборот, это SHG уклоняющиеся к WHG, непонятно...

Цитировать
"украинцы" - еще дальше к EHG
да они и есть EHG, просто более юго-западные, в отличии от наших северо-восточных...
ну, такую "относительность" и на PCA Поляко не заметить=)

HG2 (7,791–7,586 cal BP) и HG3 (7,252–6,802 cal BP) находятся между более древним HG1 (8,417–8,199 cal BP) и EHG - вероятно, со временем усиливается и генетическое влияние условных EHG на "латышей"
но тут можно долго всматриваться в бездну "научной визуализации". Подождем более качественных плотов

вероятное влияние культуры ямочно-гребенчатой керамики:
Цитировать
Next we sampled two Middle Neolithic individuals, Latvia_MN1 (6,201–5,926 cal BP), from an isolated grave located among burials from earlier periods, and Latvia_MN2 (6,179–5,750 cal BP), who was interred in a collective burial with five other individuals. During the Middle Neolithic at Zvejnieki, mortuary practices from the preceding periods were partially maintained, but some new features appeared, including collective burials and votive deposits, which are associated with the Comb Ware culture or its influences in the Baltic
...
 In contrast, Latvia_MN2 is placed toward EHG in PCA space and has several components in ADMIXTURE analysis that are found in Native Americans, Siberians, and hunter-gatherer samples from the Caucasus. In keeping with these results, we found that there has been a northern Eurasian influence in the Baltic region since the Mesolithic period, as suggested by significantly positive statistics for the test D(Mbuti, X; Latvia Mesolithic, Latvia_MN2) when X was an EHG, modern and ancient Siberian (including the Upper Palaeolithic Mal’ta genome [29]), or Native American (Table 2). This influence is supported archaeologically by the appearance of copper rings and amber jewelry in Middle Neolithic collective burials that bear similarities to artifacts found in Estonia, Finland, and northwestern Russia [21, 30]. [21].

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2005
  • Страна: 00
  • Рейтинг +527/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: дДНК из Латвии и Украины, мезолит и неолит
« Ответ #13 : 02 Февраль 2017, 22:39:08 »
Цитировать
Discussion
...
However, we also find indications of genetic impact from exogenous populations during the Neolithic, most likely from northern Eurasia and the Pontic Steppe. These influences are distinct from the Anatolian-farmer-related gene flow found in central Europe during this period. It is interesting to note that even in outlying areas of Europe, such as Sweden and Ireland [38, 39], an Anatolian-farmer-related genetic signature is present by the Middle to Late Neolithic period (∼5,300–4,700 cal BP). We conclude that the gradual appearance of features associated with the Neolithic package in the Baltic and Dnieper Rapids was not tied to the same major genetic changes as in other regions of Europe. The emergence of Neolithic features in the absence of immigration by Anatolian farmers highlights the roles of horizontal cultural transmission and potentially independent innovation during the Neolithic transition.

В общем, бОльшая часть неолитического адмикса (если не весь) у современных прибалтов попадает к ним от шнуровиков


и тут же,
последний гвоздь пинок Анатолийской гипотезе
Цитировать
The latest Neolithic sample in our Baltic time series, Latvia_LN1 (5,039–4,626 cal BP), which was found in a crouched burial of the type associated with the Late Neolithic Corded Ware culture [21], falls near other Late Neolithic and Bronze Age European and Steppe samples in PCA analysis
...
 Interestingly, this individual lived around the time of later date estimates (∼4,500–7,000 cal BP) proposed for the split of Proto-Balto-Slavic from other Indo-European languages [3, 4]. There are two major theories to explain the distribution of Indo-European languages that constitute the most widely spoken language family in the world: (1) they have an Anatolian origin and were spread by Neolithic agriculturalists [32, 33] and (2) they developed in the Pontic Steppe and proliferated through Late Neolithic/Bronze Age migrations [1, 3, 34]. The presence of a Steppe-related component in Latvia_LN1 in the absence of an Anatolian farmer-related genetic input supports a Steppe rather than an Anatolian origin for the Balto-Slavic branch of the Indo-European language family.
« Последнее редактирование: 02 Февраль 2017, 23:01:42 от FenriR »

Оффлайн Pre Slav

  • Где начало того конца которым оканчивается начало?
  • Сообщений: 1693
  • Страна: 00
  • Рейтинг +123/-111
Re: дДНК из Латвии и Украины, мезолит и неолит
« Ответ #14 : 02 Февраль 2017, 23:03:59 »
Цитировать
Цитировать
"украинцы" - еще дальше к EHG
да они и есть EHG, просто более юго-западные, в отличии от наших северо-восточных...
ну, такую "относительность" и на PCA Поляко не заметить=)
по д-статистике заметить, хотя они ее используют несколько странно, но все же видно
Mbuti Karelia (EHG) Loschbour (WHG) Ukraine_HG1 0.0269 2.451
Mbuti Karelia (EHG) Loschbour (WHG) Ukraine_N1 0.0491 4.426
Mbuti Karelia (EHG) Bichon (WHG) Ukraine_HG1 0.0348 3.069
Mbuti Karelia (EHG) Bichon (WHG) Ukraine_N1 0.0560 4.998
Mbuti Kotias (CHG) Loschbour (WHG) Ukraine_HG1 0.0016 0.155
Mbuti Kotias (CHG) Loschbour (WHG) Ukraine_N1 0.004 0.381
Mbuti Kotias (CHG) Bichon (WHG) Ukraine_HG1 0.0054 0.494
Mbuti Kotias (CHG) Bichon (WHG) Ukraine_N1 0.0057 0.551
Mbuti MA1 WHG Ukraine_N1 0.0708 3.369
Mbuti AfontovaGora3 WHG Ukraine_N1 0.1462 4.461
в общем, это EHG, но "украинцы" имеют разное происхождение, неолитический гораздо более (северо-)восточный чем мезолитический...

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.