мтДНК: гаплогруппа HV

[Tusya84]

Добрый день, так как я сдавала тест в фтдна и там не было мт гаплогруппы, сдала сыну в генотек. И  выявилась гаплогруппа HV. По калькуляторам у меня показывает перекос к полякам/немцам/белорусам. Может ли эта гаплогруппа принадлежать данным национальностям?  Что можно о ней сказать и может быть побольше узнать?
Спасибо.

[Valery]

HV распространена практически повсеместно в Евразии, везде куда доходили люди "западноевразийского" происхождения (т.е. в переводе с современного геномно-политкорректного языка на старый морфологический, - европеоиды, Caucasians). От Бретани и до Монголии. Обычно когда пишут HV, имеют в виду ее линии более редкие чем H и V. Уточните в файле от генотека какие снипы субветвей HV протестированы.

[Tusya84]

Спасибо, напишу им в техподдержку. Так как я думала моя гаплогруппа немного поможет и прояснит мое происхождение, поможет понять откуда у меня везде в калькуляторах поляки и немцы.

[Tusya84]

Вот ответил генотек:
Добрый день!
По митхондриальной ДНК мы определяем только гаплогруппу, детальнее субклады не анализируем.
В файле с исходными данными вы можете ознакомиться со всеми SNP-маркерами, которые были расшифрованы в рамках теста.

Что теперь мне лучше сделать?

[Tusya84]

Прошла по вашей ссылке, но прошу простить, не поняла, что там ко мне относится и про Зою не нашла?
Поняла, вы наверное хотели указать, что у княгинь, погребенных у кремля, такая гаплогруппа. Но как связать эту гаплогруппу с ними, если моя прабабушка из крестьян государственных Тверской области, Зубцовского района.

[Tusya84]

Подскажите, а есть какая то возможность, далее определить по снипам субклад (подгруппу)? HV2, HV3, HV5 и тд?
Может конвектировать или из текстового документа видно по снипам?

[NathanS]

Подскажите, а есть какая то возможность, далее определить по снипам субклад (подгруппу)? HV2, HV3, HV5 и тд?
Может конвектировать или из текстового документа видно по снипам?

Для этого надо сделать тест mtFull в FTDNA или полногеномный тест WGS.
Далее нужно проанализировать результаты в YFull.

[Tusya84]

Спасибо, думала может что-то из теста генотек можно выудить.
Но видать придется довольствоваться тем, что есть.
А  не подскажете, характерна ли данная гаплогруппа для Тверской области?

И такой вопрос. В корне всего семейства HV и R0 (не показано на картинке) имеется мутация в 73 и в 11719. Затем группы делятся на две: семейство HV (у которого есть мутация в 14766) и R0 (или pre-HV), у которого ее нет. Вот в снипах я у себя 73А и в 11719А нашла, а 14766 у меня нет. Значит ли это или можно ли предположить, что у меня R0?
Или я вообще не правильно мыслю?

[Valery]

14766C обязательная для HV. Если у вас ее нет то тогда чтобы быть HV нужно доказательно быть в какой-то нижележащей кладе, скажем H или HV2 и иметь обратную мутацию в позиции 14766. Но в этом случае фирма рапортовала бы что вы соответственно H или HV2.

[Valery]

А  не подскажете, характерна ли данная гаплогруппа для Тверской области?

не переживайте, если в одной губернии HV вдруг начнут вымирать, в нее тут же понаедут HV из соседних 

[Valery]

Значит ли это или можно ли предположить, что у меня R0?
Или я вообще не правильно мыслю?

мыслите вы абсолютно правильно
но дело в том что гаплогруппу у них назначает машина
у нее должно быть какое-то железное основание
исходя из сообщенных вами первичных данных, у вас действительно R0
то есть что-то они вам рапортовали не так

[Tusya84]

14766C обязательная для HV. Если у вас ее нет то тогда чтобы быть HV нужно доказательно быть в какой-то нижележащей кладе, скажем H или HV2 и иметь обратную мутацию в позиции 14766. Но в этом случае фирма рапортовала бы что вы соответственно H или HV2.

Ну по краней мере, в снипах МТ я данной мутации не нашла. Есть rs527236041 MT   14767 C

[Valery]

Ну по краней мере, в снипах МТ я данной мутации не нашла. Есть rs527236041 MT   14767 C

это ровно то что требуется ))
не знаю почему номер позиции не такой как в rCRS, ведь генотек вроде использует как референс мт именно rCRS

[Tusya84]

Спасибо большое. А вы не знаете, какие нужно снипы искать, чтобы проследить дальше субклад?
Допустим HV0 - ......HV1 - ...... HV2......
Может они присутствуют у меня файле, просто генотек их не интерпретирует?

Тут в теме ранее писали:
HVR2: 263G
CR: 750G 1438G 2706G 4769G 7028T 8860G 10283G 15326G
HVR1: 16311C
IMPORTANT NOTE: The above marker list is almost certainly incomplete due to limitations of genotyping technology and is not comparable to mtDNA sequencing results. It should not be used with services or tools that expect sequencing results such as mitosearch.

Best mtDNA Haplogroup Matches:
1) HV11
Defining Markers for haplogroup HV11:
HVR2: 263G
CR: 750G 1438G 2706G 4769G 6040G 7028T 8860G 9000G 10283G 15326G
HVR1: 16311C
Marker path from rCRS to haplogroup HV11:
H2a2a(rCRS) ? 263G 8860G 15326G ? H2a2 ? 750G ? H2a ? 4769G ? H2 ? 1438G ? H ? 2706G 7028T ? HV ? 16311C ? HV(16311) ? 6040G 9000G 10283G ? HV11
Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(10): 263G 750G 1438G 2706G 4769G 7028T 8860G 10283G 15326G 16311C
Untested(2): 6040 9000

2) HV(16311)
Defining Markers for haplogroup HV(16311):
HVR2: 263G
CR: 750G 1438G 2706G 4769G 7028T 8860G 15326G
HVR1: 16311C
Marker path from rCRS to haplogroup HV(16311) (plus extra markers):
H2a2a(rCRS) ? 263G 8860G 15326G ? H2a2 ? 750G ? H2a ? 4769G ? H2 ? 1438G ? H ? 2706G 7028T ? HV ? 16311C ? HV(16311) ? 10283G
Good Match! Your results also had extra markers for this haplogroup:
Matches(9): 263G 750G 1438G 2706G 4769G 7028T 8860G 15326G 16311C
Extras(1): 10283G

3) HV10
Defining Markers for haplogroup HV10:
HVR2: 263G
CR: 750G 1438G 2706G 4769G 7028T 8860G 13449T 15326G
HVR1: 16311C
Marker path from rCRS to haplogroup HV10 (plus extra markers):
H2a2a(rCRS) ? 263G 8860G 15326G ? H2a2 ? 750G ? H2a ? 4769G ? H2 ? 1438G ? H ? 2706G 7028T ? HV ? 16311C ? HV(16311) ? 13449T ? HV10 ? 10283G
Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(9): 263G 750G 1438G 2706G 4769G 7028T 8860G 15326G 16311C
Extras(1): 10283G
Untested(1): 13449

3) HV9
Defining Markers for haplogroup HV9:
HVR2: 263G
CR: 750G 1438G 2706G 4769G 7028T 8860G 8994A 15326G
HVR1: 16311C
Marker path from rCRS to haplogroup HV9 (plus extra markers):
H2a2a(rCRS) ? 263G 8860G 15326G ? H2a2 ? 750G ? H2a ? 4769G ? H2 ? 1438G ? H ? 2706G 7028T ? HV ? 16311C ? HV(16311) ? 8994A ? HV9 ? 10283G
Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(9): 263G 750G 1438G 2706G 4769G 7028T 8860G 15326G 16311C
Extras(1): 10283G
No-Calls(1): 8994A

У меня встречаются вот эти снип, которые перечислены выше, если я правильно их интерпретирую:
rs2001030   MT   1438   G
rs2854128   MT   2706   G
rs2015062   MT   7028   T
rs2001031   MT   8860   G
rs2001030   MT   1438   G
rs2854128   MT   2706   G
rs2015062   MT   7028   T
rs2001031   MT   8860   G

[Valery]

посмотрите например здесь снипы непосредственных потомков HV, но скорее всего наиболее крупные ветви уже проверены автоматическим классификатором