АвторТема: Whole Genome Sequence от YSEQ  (Прочитано 20585 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн G-Man

  • Сообщений: 697
  • Страна: ru
  • Рейтинг +669/-1
  • Y-ДНК: G-Z6700
Re: Whole Genome Sequence от YSEQ
« Ответ #90 : 05 Январь 2022, 10:20:46 »
Знакомый залил свой WGS400 в YFull.  Статистика удручающая:



Покрытие comBED — 3,87 млн базовых пар.  Это в два раза меньше, чем у BigY прошлого поколения.  До минимального требования YFull не хватает более 2 млн пар
« Последнее редактирование: 22 Апрель 2022, 15:42:38 от G-Man »

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 6043
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4281/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Whole Genome Sequence от YSEQ
« Ответ #91 : 05 Январь 2022, 11:57:37 »
Покрытие comBED — 3,87 млн базовых пар.  Это в два раза меньше, чем у BigY прошлого поколения.  До минимального требования YFull не хватает более 2 млн пар
Небольшое уточнение. Покрытие comBED считается если есть 3 чтения или выше. То есть comBED может быть покрыт весь, но с очень низким покрытием в глубину. Как видим, медианное покрытие 3...
Возможно стоит обратиться к Томасу?

Оффлайн G-Man

  • Сообщений: 697
  • Страна: ru
  • Рейтинг +669/-1
  • Y-ДНК: G-Z6700
Re: Whole Genome Sequence от YSEQ
« Ответ #92 : 05 Январь 2022, 17:15:56 »
Покрытие comBED — 3,87 млн базовых пар.  Это в два раза меньше, чем у BigY прошлого поколения.  До минимального требования YFull не хватает более 2 млн пар
Небольшое уточнение. Покрытие comBED считается если есть 3 чтения или выше. То есть comBED может быть покрыт весь, но с очень низким покрытием в глубину. Как видим, медианное покрытие 3...
Возможно стоит обратиться к Томасу?

На два письма в декабре не ответили.  Попробуем еще раз

YSEQ39569
« Последнее редактирование: 22 Апрель 2022, 15:43:10 от G-Man »

Оффлайн Val_Metov

  • Сообщений: 1250
  • Страна: ru
  • Рейтинг +929/-2
  • Y-ДНК: J-Y94477
Re: Whole Genome Sequence от YSEQ
« Ответ #93 : 05 Январь 2022, 22:57:37 »
Такой же результат и у нас. (Еще 2х ждем). Пожалуй этот продукт пока рекомендовать действительно сложно. Томас говорил что в новых батчах качество улучшилось. Реагенты поменяли. Дело точно не в качестве материала. Посмотрим как будет меняться качество.

Оффлайн Val_Metov

  • Сообщений: 1250
  • Страна: ru
  • Рейтинг +929/-2
  • Y-ДНК: J-Y94477
Re: Whole Genome Sequence от YSEQ
« Ответ #94 : 13 Апрель 2022, 17:47:36 »
Yseq вместо WGS400 выдали 150 bp 82 гб. Покрытие Y x16. Раза в 4 выросло выросло качество. То что не 400 длина прочтения а 150 в данном случае уже и не важно.
Судя по всему тесты теперь делают не они сами. Главное что результаты хорошие. Наконец-то.

Оффлайн Val_Metov

  • Сообщений: 1250
  • Страна: ru
  • Рейтинг +929/-2
  • Y-ДНК: J-Y94477
Re: Whole Genome Sequence от YSEQ
« Ответ #95 : 03 Май 2022, 18:51:40 »
Тесты YSEQ без проблем можно оплатить криптовалютой. Курс конечно получается менее выгодный чем ЦБэшный.
Завести деньги на биржу(и) +- 80 руб. 1 доллара получается. Недавно оплачивали полный геном через такой платеж. Все прошло быстро и без проблем.

Новые тесты YSEQ WGS400+ пожалуй безальтернативный выбор в наших условиях. Качество хорошее.
1 образец загрузили на Yfull - https://www.yfull.com/tree/N-Y21575/ YF102871

Аутосомы выделяются все также с помощью WGS extract. Те что дают YSEQ загружаются только на getmatch. FTDNA и Myheritage принимают 23andme формат без проблем (v3\v5 пробовал). Да и в целом эти сайты меньше всего капризничают.
Генотек уже почти 2 недели обрабатывает 23andme v3.

Если есть вопросы с отправкой и оплатой тестов обращайтесь.

Еще раз напомню, что отправлять можно свои щетки, не обязательно заказывать набор. И оплачивать можно уже после доставки образца.

Оффлайн nilogov

  • Сообщений: 1387
  • Страна: ru
  • Рейтинг +97/-7
  • философ антиязыка
  • Y-ДНК: R-BY55151
  • мтДНК: T2b-T152C!
Re: Whole Genome Sequence от YSEQ
« Ответ #96 : 08 Январь 2023, 07:25:12 »
Тесты YSEQ без проблем можно оплатить криптовалютой. Курс конечно получается менее выгодный чем ЦБэшный.
Завести деньги на биржу(и) +- 80 руб. 1 доллара получается. Недавно оплачивали полный геном через такой платеж. Все прошло быстро и без проблем.

Новые тесты YSEQ WGS400+ пожалуй безальтернативный выбор в наших условиях. Качество хорошее.
1 образец загрузили на Yfull - https://www.yfull.com/tree/N-Y21575/ YF102871

Аутосомы выделяются все также с помощью WGS extract. Те что дают YSEQ загружаются только на getmatch. FTDNA и Myheritage принимают 23andme формат без проблем (v3\v5 пробовал). Да и в целом эти сайты меньше всего капризничают.
Генотек уже почти 2 недели обрабатывает 23andme v3.

Если есть вопросы с отправкой и оплатой тестов обращайтесь.

Еще раз напомню, что отправлять можно свои щетки, не обязательно заказывать набор. И оплачивать можно уже после доставки образца.
Подскажите, а сколько месяцев вам делали полногеномный тест в YSEQ?

Оффлайн nilogov

  • Сообщений: 1387
  • Страна: ru
  • Рейтинг +97/-7
  • философ антиязыка
  • Y-ДНК: R-BY55151
  • мтДНК: T2b-T152C!

Оффлайн Val_Metov

  • Сообщений: 1250
  • Страна: ru
  • Рейтинг +929/-2
  • Y-ДНК: J-Y94477
Re: Whole Genome Sequence от YSEQ
« Ответ #98 : 08 Январь 2023, 12:18:55 »
Полногеномные тесты в YSEQ делают не быстро. Рекорд 2 месяц. Антирекорд 6.

Оффлайн Elektor

  • Сообщений: 36
  • Страна: ru
  • Рейтинг +7/-0
Re: Whole Genome Sequence от YSEQ
« Ответ #99 : 21 Апрель 2023, 23:20:59 »
Добрый день, заказал WGS+ в YSEQ и возник такой вопрос. Как пишут в этой и не только темах, сам анализ может занять несколько месяцев, вплоть до полугода.
Соответственно вопрос, результаты будут доступны только в самом конце, или по мере поступления? Видел в одной из соседних тем, что человек заказывал в YSEQ проверку на отдельный тип, и ему с периодичностью в неделю приходили отчеты о продвижении. В моем случае, будут ли какие-то изменения до окончания, или так и будет висеть в статусе Processing с полным результатом лишь в конце?

Оффлайн nilogov

  • Сообщений: 1387
  • Страна: ru
  • Рейтинг +97/-7
  • философ антиязыка
  • Y-ДНК: R-BY55151
  • мтДНК: T2b-T152C!
Re: Whole Genome Sequence от YSEQ
« Ответ #100 : 03 Июнь 2023, 09:23:55 »
Полногеномные тесты в YSEQ делают не быстро. Рекорд 2 месяц. Антирекорд 6.

Подскажите, а как скачать результат полногеномного анализа с YSEQ, чтобы загрузить на YFull?


Оффлайн Val_Metov

  • Сообщений: 1250
  • Страна: ru
  • Рейтинг +929/-2
  • Y-ДНК: J-Y94477
Re: Whole Genome Sequence от YSEQ
« Ответ #101 : 03 Июнь 2023, 13:10:43 »
В письме которое они вам прислали на почту есть ссылка на передачу в Yfull

Оффлайн nilogov

  • Сообщений: 1387
  • Страна: ru
  • Рейтинг +97/-7
  • философ антиязыка
  • Y-ДНК: R-BY55151
  • мтДНК: T2b-T152C!
Re: Whole Genome Sequence от YSEQ
« Ответ #102 : 03 Июнь 2023, 13:51:52 »
В письме которое они вам прислали на почту есть ссылка на передачу в Yfull
А что за письмо? Оно высылается по готовности результата?

Оффлайн NathanS

  • Сообщений: 1277
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1205/-2
Re: Whole Genome Sequence от YSEQ
« Ответ #103 : 03 Июнь 2023, 17:55:43 »
В письме которое они вам прислали на почту есть ссылка на передачу в Yfull
А что за письмо? Оно высылается по готовности результата?

Письма на Gmail не доходят. Смотрите данные в заказе теста - там продублировано содержание письма.

Оффлайн nilogov

  • Сообщений: 1387
  • Страна: ru
  • Рейтинг +97/-7
  • философ антиязыка
  • Y-ДНК: R-BY55151
  • мтДНК: T2b-T152C!
Re: Whole Genome Sequence от YSEQ
« Ответ #104 : 03 Июнь 2023, 18:17:15 »
В письме которое они вам прислали на почту есть ссылка на передачу в Yfull
А что за письмо? Оно высылается по готовности результата?

Письма на Gmail не доходят. Смотрите данные в заказе теста - там продублировано содержание письма.

Я с ними по яндексу переписывался…

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.