Whole Genome Sequence от YSEQ

[G-Man]

Знакомый залил свой WGS400 в YFull.  Статистика удручающая:



Покрытие comBED — 3,87 млн базовых пар.  Это в два раза меньше, чем у BigY прошлого поколения.  До минимального требования YFull не хватает более 2 млн пар

[Semargl]

Покрытие comBED — 3,87 млн базовых пар.  Это в два раза меньше, чем у BigY прошлого поколения.  До минимального требования YFull не хватает более 2 млн пар

Небольшое уточнение. Покрытие comBED считается если есть 3 чтения или выше. То есть comBED может быть покрыт весь, но с очень низким покрытием в глубину. Как видим, медианное покрытие 3...
Возможно стоит обратиться к Томасу?

[G-Man]

Покрытие comBED — 3,87 млн базовых пар.  Это в два раза меньше, чем у BigY прошлого поколения.  До минимального требования YFull не хватает более 2 млн пар

Небольшое уточнение. Покрытие comBED считается если есть 3 чтения или выше. То есть comBED может быть покрыт весь, но с очень низким покрытием в глубину. Как видим, медианное покрытие 3...
Возможно стоит обратиться к Томасу?

На два письма в декабре не ответили.  Попробуем еще раз

YSEQ39569

[Val_Metov]

Такой же результат и у нас. (Еще 2х ждем). Пожалуй этот продукт пока рекомендовать действительно сложно. Томас говорил что в новых батчах качество улучшилось. Реагенты поменяли. Дело точно не в качестве материала. Посмотрим как будет меняться качество.

[Val_Metov]

Yseq вместо WGS400 выдали 150 bp 82 гб. Покрытие Y x16. Раза в 4 выросло выросло качество. То что не 400 длина прочтения а 150 в данном случае уже и не важно.
Судя по всему тесты теперь делают не они сами. Главное что результаты хорошие. Наконец-то.

[Val_Metov]

Тесты YSEQ без проблем можно оплатить криптовалютой. Курс конечно получается менее выгодный чем ЦБэшный.
Завести деньги на биржу(и) +- 80 руб. 1 доллара получается. Недавно оплачивали полный геном через такой платеж. Все прошло быстро и без проблем.

Новые тесты YSEQ WGS400+ пожалуй безальтернативный выбор в наших условиях. Качество хорошее.
1 образец загрузили на Yfull - https://www.yfull.com/tree/N-Y21575/ YF102871

Аутосомы выделяются все также с помощью WGS extract. Те что дают YSEQ загружаются только на getmatch. FTDNA и Myheritage принимают 23andme формат без проблем (v3\v5 пробовал). Да и в целом эти сайты меньше всего капризничают.
Генотек уже почти 2 недели обрабатывает 23andme v3.

Если есть вопросы с отправкой и оплатой тестов обращайтесь.

Еще раз напомню, что отправлять можно свои щетки, не обязательно заказывать набор. И оплачивать можно уже после доставки образца.

[nilogov]

Тесты YSEQ без проблем можно оплатить криптовалютой. Курс конечно получается менее выгодный чем ЦБэшный.
Завести деньги на биржу(и) +- 80 руб. 1 доллара получается. Недавно оплачивали полный геном через такой платеж. Все прошло быстро и без проблем.

Новые тесты YSEQ WGS400+ пожалуй безальтернативный выбор в наших условиях. Качество хорошее.
1 образец загрузили на Yfull - https://www.yfull.com/tree/N-Y21575/ YF102871

Аутосомы выделяются все также с помощью WGS extract. Те что дают YSEQ загружаются только на getmatch. FTDNA и Myheritage принимают 23andme формат без проблем (v3\v5 пробовал). Да и в целом эти сайты меньше всего капризничают.
Генотек уже почти 2 недели обрабатывает 23andme v3.

Если есть вопросы с отправкой и оплатой тестов обращайтесь.

Еще раз напомню, что отправлять можно свои щетки, не обязательно заказывать набор. И оплачивать можно уже после доставки образца.

Подскажите, а сколько месяцев вам делали полногеномный тест в YSEQ?

[nilogov]

https://nebula.org/blog/ru/yseq-%D0%BE%D0%B1%D0%B7%D0%BE%D1%80/

[Val_Metov]

Полногеномные тесты в YSEQ делают не быстро. Рекорд 2 месяц. Антирекорд 6.

[Elektor]

Добрый день, заказал WGS+ в YSEQ и возник такой вопрос. Как пишут в этой и не только темах, сам анализ может занять несколько месяцев, вплоть до полугода.
Соответственно вопрос, результаты будут доступны только в самом конце, или по мере поступления? Видел в одной из соседних тем, что человек заказывал в YSEQ проверку на отдельный тип, и ему с периодичностью в неделю приходили отчеты о продвижении. В моем случае, будут ли какие-то изменения до окончания, или так и будет висеть в статусе Processing с полным результатом лишь в конце?

[nilogov]

Полногеномные тесты в YSEQ делают не быстро. Рекорд 2 месяц. Антирекорд 6.

Подскажите, а как скачать результат полногеномного анализа с YSEQ, чтобы загрузить на YFull?

[Val_Metov]

В письме которое они вам прислали на почту есть ссылка на передачу в Yfull

[nilogov]

В письме которое они вам прислали на почту есть ссылка на передачу в Yfull

А что за письмо? Оно высылается по готовности результата?

[NathanS]

В письме которое они вам прислали на почту есть ссылка на передачу в Yfull

А что за письмо? Оно высылается по готовности результата?

Письма на Gmail не доходят. Смотрите данные в заказе теста - там продублировано содержание письма.

[nilogov]

В письме которое они вам прислали на почту есть ссылка на передачу в Yfull

А что за письмо? Оно высылается по готовности результата?

Письма на Gmail не доходят. Смотрите данные в заказе теста - там продублировано содержание письма.

Я с ними по яндексу переписывался…