АвторТема: Генотек  (Прочитано 68130 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Alexey_V.B.

  • Сообщений: 880
  • Страна: il
  • Рейтинг +223/-0
  • Y-ДНК: R1a (R-A8995*)
  • мтДНК: K1a1b1a
Re: Генотек
« Ответ #30 : 13 Март 2020, 16:51:04 »
6762 жителей страны, которые являются клиентами компании.
https://iz.ru/972402/2020-02-05/kazhdyi-tretii-zhitel-rossii-geneticheski-sklonen-k-psoriazu
[/quote]
Спасибо, но это некая выборка, как и другая с очень сомнительной апроксимацией и недостоверными выводами: "Эксперты проанализировали генетические данные 3000 человек — рандомизированно выбранную подгруппу клиентов медико-генетического центра Genotek, среди которых 44% женщин со средним возрастом 35 лет и 56% мужчин со средним возрастом 37 лет." https://www.vesty.co.il/articles/0,7340,L-5376211,00.html
Загрузив год назад несколько файлов с ДНК тестами MyHeritage, я регулярно получаю ежемесячную рассылку по e-mail от Генотек "Нашли Вашего родственника" (или "Деньги давай"). Пытаюсь понять: есть ли целесообразность платить немаленькие деньги за доступ к результатам в базе Генотек.
Как-то в прошлом году звонил в Генотек, задал вопрос по кол-ву тестов в базе и получил расплывчатый ответ про "тысячи". Полагаю, что на форуме может быть предствавитель Генотек и прояснит этот вопрос. По крайней мере на форуме VGD такой представитель ранее рекламировал Генотек и даже участовал в обсуждениях.

Оффлайн pashka_1604

  • берегите лес, негде будет партизанить
  • Сообщений: 447
  • Страна: ru
  • Рейтинг +285/-0
  • FTDNA: B486274 GEDmatch: HD652233 YFull: YF67527
  • Y-ДНК: R-Z92 (YP-569*> R-BY84206 / R-Y85137)
  • мтДНК: H6a1a (H6a1a21)
Re: Генотек
« Ответ #31 : 23 Апрель 2020, 21:33:37 »
Генотек обновил сайт, интерфейс и результаты тестов, в том числе "Происхождение", усовершенствовав алгоритмы. Заявляют как: "Самый подробный тест российских народов". "Научные сотрудники компании Genotek проанализировали 83 700 геномов людей из 168 народов и разработали тест, который определяет этническое происхождение человека по результатам его ДНК-теста с точностью до 99%. Из геномов представителей 168 народов на основе генетического сходства были сформированы 102 кластера, включающие в себя от 1 до 15 этносов и субэтносов. Особый интерес представляла возможность изучить наиболее близкие друг к другу народы: русских, украинцев и белорусов. Работы по хранению и обработке данных выполнялись в трех дата-центрах Яндекса. Мы планируем продолжить анализ собранных генетических данных россиян для более подробного изучения структуры и происхождения народов России.", - пишет Генотек. 

"Эксперты проанализировали генетические данные клиентов из десятков городов России. Первый этап
В ходе первого этапа были определены эталонные представители народов — люди, у которых бабушки и дедушки имеют одинаковое происхождение. Второй этап
На втором этапе специально разработанный алгоритм различал участки ДНК людей, имеющих смешанное происхождение. Благодаря разработанному тесту можно не только изучать происхождение конкретного человека, но и делать выводы о формировании и взаимосвязях целых этнических групп. В научных данных на графике можно увидеть расположение вашего генома  относительно относительно «эталонных» представителей народов. Теперь Вы сможете получить максимально полную информацию о вашем этническом составе!"
P.S. И, да, у них приличные скидки на генетический паспорт до 25 апреля в честь дня ДНК.

Посмотерел свои обновленные результаты, пропали всякие эстонцы, шведы, венгры, литовцы и прочие, кластеров стало больше и, естественно они стали меньше по охвату. А также добавили PCA, а-ля Mytrueancestry. Ниже скриншоты старой и новой версии с моего аккаунта для сравнения.




Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 8462
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4812/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: Генотек
« Ответ #32 : 24 Апрель 2020, 06:03:50 »
По хорошему, надо и поляков поместить на этот PCA. Но наверное, среди клиентов Генотека их очень мало и недовольства не возникнет ))

Интересно бы посмотреть на результаты людей смешанного происхождения (тестовый пример с их гендиректором Ильинским видел)

Оффлайн Alexey_V.B.

  • Сообщений: 880
  • Страна: il
  • Рейтинг +223/-0
  • Y-ДНК: R1a (R-A8995*)
  • мтДНК: K1a1b1a
Re: Генотек
« Ответ #33 : 24 Апрель 2020, 10:33:03 »
По хорошему, надо и поляков поместить на этот PCA. Но наверное, среди клиентов Генотека их очень мало и недовольства не возникнет ))

Интересно бы посмотреть на результаты людей смешанного происхождения (тестовый пример с их гендиректором Ильинским видел)

Удивляет отсутствие евреев, год назад слышал, что Генотек с Гл.Раввинатом в Москве сотрудничает.
У меня есть подозрение, что мой биоматериал уехал в прошлом году не только в YSEQ для анализа на mt гаплогруппу, но и в Геноток для участия в эталонной группе.

Хотя давно уже загрузил нескольких файлов с тестами родственников в Генотек, но пока жлоблюсь тратить деньги на совпаденцев, может не прав?

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 8462
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4812/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: Генотек
« Ответ #34 : 24 Апрель 2020, 10:38:02 »
Удивляет отсутствие евреев, год назад слышал, что Генотек с Гл.Раввинатом в Москве сотрудничает.
У меня есть подозрение, что мой биоматериал уехал в прошлом году не только в YSEQ для анализа на mt гаплогруппу, но и в Геноток для участия в эталонной группе.
Так есть евреи, посмотрите демо-результаты https://demo.genotek.ru/ancestry . Там же и список популяций по кнопке. Это у pashka_1604 их не найдено.

Мне тоже интересны источники их геномов, кроме открытых научных выборок :)

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 8462
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4812/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: Генотек
« Ответ #35 : 24 Апрель 2020, 11:02:52 »
Если бы за 10к был полный геном, я бы даже задумался.
У них разновидность GSA-чипа сейчас.

Оффлайн pashka_1604

  • берегите лес, негде будет партизанить
  • Сообщений: 447
  • Страна: ru
  • Рейтинг +285/-0
  • FTDNA: B486274 GEDmatch: HD652233 YFull: YF67527
  • Y-ДНК: R-Z92 (YP-569*> R-BY84206 / R-Y85137)
  • мтДНК: H6a1a (H6a1a21)
Re: Генотек
« Ответ #36 : 24 Апрель 2020, 16:00:13 »
Цитировать
Хотя давно уже загрузил нескольких файлов с тестами родственников в Генотек, но пока жлоблюсь тратить деньги на совпаденцев, может не прав?

Alexey_V.B., пока что у них не такой большой пул клиентов, поэтому шансы найти совпаденцев пропорциональные.

Оффлайн R1a-Stolin

  • Сообщений: 907
  • Страна: us
  • Рейтинг +505/-1
  • Y-ДНК: R1a
  • мтДНК: H
Re: Генотек
« Ответ #37 : 24 Апрель 2020, 16:35:45 »
Почти как MyHeritage с Балканами и Прибалтикой. 

Белорусы, русские, украинцы (мордвинов не нашли :) ) 64%
Балканские народы, западные славяне (странная категория, где Балканы, а где западные славяне, в западных славянах только чехи и словаки, поляков для Genotek не существует) 14%
Эстонцы, литовцы 13%
Британцы 9%




Без плотов по эстонцам-британцам. :)
Всего 3 совпаденца.

Оффлайн kardes

  • Сообщений: 1143
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1682/-11
  • Y-ДНК: G2a1
Re: Генотек
« Ответ #38 : 24 Апрель 2020, 17:53:34 »
Так есть евреи, посмотрите демо-результаты https://demo.genotek.ru/ancestry . Там же и список популяций по кнопке. Это у pashka_1604 их не найдено.
Мне тоже интересны источники их геномов, кроме открытых научных выборок :)
Интересные русские  субклады у лахлухов G1a2b-GG265, J2-L70, J1-CTS5368, R1a-CTS6, I1-M253, I1-M253, E1b1b-V13, Q1-L245 
По мито его бабки и со стороны его жены нашёл общих родственников среди евреев  )
а свой субклад G1a2b-GG265 он генотекским GSA-чипом определил или Бигом?

Оффлайн valera27

  • Сообщений: 732
  • Страна: ru
  • Рейтинг +161/-0
  • Y - R1a1a-YP682(xYP1260,YP612,YP1696); mt - H1a
Re: Генотек
« Ответ #39 : 26 Апрель 2020, 00:31:42 »
У меня тоже "Русские, украинцы 100%"

Оффлайн R1a1a1b1a2a1

  • Сообщений: 76
  • Страна: ru
  • Рейтинг +24/-0
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a2a1c2 Y20653 или YP569
  • мтДНК: H2a2a1
Re: Генотек
« Ответ #40 : 26 Апрель 2020, 03:45:01 »
загрузил нескольких файлов с тестами родственников в Генотек, но пока жлоблюсь тратить деньги на совпаденцев, может не прав?
Pre-2019 data format или v2 format introduced in April 2019? Если загрузили наборы старых чипов, то совпаденцев будет меньше среди клиентов, генотипированных на новых GSA, чем если бы родственники тоже на новых GSA генотипировались. Думаю правы, если уж тратить, то не ограничиваться областью пересечения в 2 наборах снипов.
« Последнее редактирование: 26 Апрель 2020, 03:54:52 от R1a1a1b1a2a1 »

Оффлайн Ankor

  • Сообщений: 399
  • Страна: ru
  • Рейтинг +199/-0
Re: Генотек
« Ответ #41 : 02 Май 2020, 21:45:47 »
Загрузил данные с MyHeritage, получил 100% русские



Оффлайн i.vet

  • Сообщений: 117
  • Страна: ru
  • Рейтинг +48/-0
  • Y-ДНК: N-FGC14542
Re: Генотек
« Ответ #42 : 02 Май 2020, 22:26:53 »
Тоже загрузил данные с MyHeritage.
В итоге, 88% восточные славяне, 5% народы Финляндии и Карелии, 4% Прибалты и 3% народы Поволжья и Урала. Довольно близко, на самом деле.
На PCA смещение к Южной России и Украине/Беларуси, как я понимаю

Оффлайн Roaring

  • Сообщений: 652
  • Рейтинг +155/-1
  • Y-ДНК: R1b-DF99
  • мтДНК: U5b1e
Re: Генотек
« Ответ #43 : 04 Май 2020, 00:53:05 »
Тоже загрузил данные с MyHeritage.
В итоге, 88% восточные славяне, 5% народы Финляндии и Карелии, 4% Прибалты и 3% народы Поволжья и Урала. Довольно близко, на самом деле.
На PCA смещение к Южной России и Украине/Беларуси, как я понимаю


Загрузка платная?

Оффлайн i.vet

  • Сообщений: 117
  • Страна: ru
  • Рейтинг +48/-0
  • Y-ДНК: N-FGC14542
Re: Генотек
« Ответ #44 : 04 Май 2020, 12:45:42 »
Тоже загрузил данные с MyHeritage.
В итоге, 88% восточные славяне, 5% народы Финляндии и Карелии, 4% Прибалты и 3% народы Поволжья и Урала. Довольно близко, на самом деле.
На PCA смещение к Южной России и Украине/Беларуси, как я понимаю


Загрузка платная?

Да, 2500 рублей. Где-то в течение пары суток обрабатывается.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.