АвторТема: Генотек  (Прочитано 24008 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Farharaji

  • Сообщений: 717
  • Страна: aq
  • Рейтинг +129/-7
    • Ytree YF71444
  • Y-ДНК: R1b-DF98+FT22607+BY20662+
  • мтДНК: U5b1e1*
Re: Генотек
« Ответ #300 : 10 Август 2022, 18:57:19 »
Добрый день.
Очень странные результаты в Генотек и MyHeritage.
Сдал анализы в генотек и потом загрузил их в MyHeritage.

На этом можно и закончить. Ибо Генотек и Майхеритэдж компании как бы это сказать, ну по мне чисто 2го уровня...Преимущество генотека -по популяциям  народов РФ чтото осмысленное плюс база из местных плюс гаплогруппы. Премущества майхера ну чисто база тоже, то что туда все кому не лень загружают. Еще делают разбивки на кластеры среди потенциальных родственников(совпаденцев)

Оффлайн Roaring

  • Сообщений: 639
  • Рейтинг +144/-1
  • Y-ДНК: R1b-DF99
  • мтДНК: U5b1e
Re: Генотек
« Ответ #301 : 11 Август 2022, 09:24:33 »
Я как понимаю вы имеет ввиду Admixture heritage?
Какие лучше настройки выбирать не подскажете? Там куча проектов и настроек. Есть что то дефолтное?

Попробуйте eurogenes k13, k15 mdlp k22

Оффлайн Vicrius

  • Сообщений: 11
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2/-0
Re: Генотек
« Ответ #302 : 11 Август 2022, 12:11:41 »
Я как понимаю вы имеет ввиду Admixture heritage?
Какие лучше настройки выбирать не подскажете? Там куча проектов и настроек. Есть что то дефолтное?

Попробуйте eurogenes k13, k15 mdlp k22
Всё же Myherutage получается точнее? На сколько я разобрался с gedmatch.
Тут тоже всплывает средиземноморье.

K13
Population   
North_Atlantic   19.34 Pct
Baltic   35.04 Pct
West_Med   8.57 Pct
West_Asian   23.39 Pct
East_Med   11.89 Pct
Red_Sea   -   
South_Asian   -   
East_Asian   -   
Siberian   -   
Amerindian   -   
Oceanian   0.25 Pct
Northeast_African   1.48 Pct
Sub-Saharan   -

K15
Population   
North_Sea   9.86 Pct
Atlantic   17.22 Pct
Baltic   22.81 Pct
Eastern_Euro   15.13 Pct
West_Med   2.83 Pct
West_Asian   22.02 Pct
East_Med   9.11 Pct
Red_Sea   -   
South_Asian   -   
Southeast_Asian   -   
Siberian   -   
Amerindian   -   
Oceanian   -   
Northeast_African   0.76 Pct
Sub-Saharan   0.25 Pct

K22
Population   
Pygmy   -   
West-Asian   24.01 Pct
North-European-Mesolithic   0.93 Pct
Indo-Tibetan   0.3 Pct
Mesoamerican   -   
Arctic-Amerind   -   
South-America_Amerind   -   
Indian   -   
North-Siberean   -   
Atlantic_Mediterranean_Neolithic   21.76 Pct
Samoedic   -   
Indo-Iranian   0.12 Pct
East-Siberean   2.31 Pct
North-East-European   46.56 Pct
South-African   -   
North-Amerind   -   
Sub-Saharian   0.74 Pct
East-South-Asian   -   
Near_East   2.75 Pct
Melanesian   0.27 Pct
Paleo-Siberian   -   
Austronesian   0.26 Pct

Оффлайн Vicrius

  • Сообщений: 11
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2/-0
Re: Генотек
« Ответ #303 : 11 Август 2022, 12:13:12 »
Добрый день.
Очень странные результаты в Генотек и MyHeritage.
Сдал анализы в генотек и потом загрузил их в MyHeritage.

На этом можно и закончить. Ибо Генотек и Майхеритэдж компании как бы это сказать, ну по мне чисто 2го уровня...Преимущество генотека -по популяциям  народов РФ чтото осмысленное плюс база из местных плюс гаплогруппы. Премущества майхера ну чисто база тоже, то что туда все кому не лень загружают. Еще делают разбивки на кластеры среди потенциальных родственников(совпаденцев)

Да я это понимаю. Но только вхожу в тему. Взял что было под рукой так сказать.

Оффлайн AleksG

  • Maternal Y-DNA: R1a-L365
  • Сообщений: 222
  • Страна: 00
  • Рейтинг +75/-0
  • Y-ДНК: Q-PH2513
  • мтДНК: U5a1a1
Re: Генотек
« Ответ #304 : 11 Август 2022, 13:49:11 »
На этом можно и закончить. Ибо Генотек и Майхеритэдж компании как бы это сказать, ну по мне чисто 2го уровня...

А что по сервисам этно-калькуляторов можно считать 1го уровня ?

Оффлайн AleksG

  • Maternal Y-DNA: R1a-L365
  • Сообщений: 222
  • Страна: 00
  • Рейтинг +75/-0
  • Y-ДНК: Q-PH2513
  • мтДНК: U5a1a1
Re: Генотек
« Ответ #305 : 11 Август 2022, 13:50:25 »
Всё же Myherutage получается точнее? На сколько я разобрался с gedmatch.
Тут тоже всплывает средиземноморье.

Под этими результатами кнопочки там с Oracle и Oracle-4 понажимайте.

Оффлайн Vicrius

  • Сообщений: 11
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2/-0
Re: Генотек
« Ответ #306 : 12 Август 2022, 11:22:37 »
Я как понимаю это вероятности этносов. Либо молдованин? ??? Либо украинец+абхазец?
Ладно, украина+абхазия это вменяемый вариант.
Если брать Oracle4 там вот так например.
Using 2 populations approximation:
1 50% Kumyk +50% Lithuanian @ 5.355213

K13 и K15 в целом пересекаются по Single Population Sharing. А вот MDLP world 22 показывает босницев.
В целом по  Mixed Mode Population Sharing все увидели Абхазов/Мингрельцев но вторая компонента получилась у каждого своя  ;D
Всё же вопрос если по Single Population Sharing у меня дистанция Moldavian 14.23 . А по Mixed Mode Population Sharing 69.7%Ukrainian_Belgorod+30.3%Abhkasian@3.02
Это значит что ближе второе? Или эти измерения не пересекаются?
Извините что закидываю вопросами. Если есть где почитать что ткните носом.

Вот по К13 Oracle.
Admix Results (sorted):
#   Population   Percent
1   Baltic   35.04
2   West_Asian   23.39
3   North_Atlantic   19.34
4   East_Med   11.89
5   West_Med   8.57
6   Northeast_African   1.48
7   Oceanian   0.25
8   Sub-Saharan   0.03
9   Siberian   0.01

Single Population Sharing:

#   Population (source)   Distance
1   Moldavian   14.23
2   Croatian   16.21
3   Serbian   17.31
4   Romanian   17.59
5   Bulgarian   17.99

Mixed Mode Population Sharing:

#       Primary Population (source)   Secondary Population (source)   Distance
1       69.7%   Ukrainian_Belgorod   +   30.3%   Abhkasian   @   3.02
2       68.4%   Ukrainian_Belgorod   +   31.6%   Georgian   @   3.07
3       61.3%   Lithuanian   +   38.7%   Abhkasian   @   3.33
4       59.8%   Lithuanian   +   40.2%   Georgian   @   3.41
5       64.1%   Belorussian   +   35.9%   Abhkasian   @   3.42
6       68.5%   Southwest_Russian   +   31.5%   Abhkasian   @   3.56

Оффлайн bulatv2

  • Сообщений: 238
  • Страна: ru
  • Рейтинг +64/-1
  • ftdna: 468412
  • Y-ДНК: R1a-Y35123
  • мтДНК: H1b2c
Re: Генотек
« Ответ #307 : 12 Август 2022, 11:41:46 »
дистанция 14.23 это много
у меня в k13 - Using 2 populations approximation:
1 50% Shors +50% Ukrainian_Belgorod @ 4.963952
если в общем то можно считать что правильно сибирь + восточная европа.
а самый точный результат у меня показывает mdlp k16 modern
« Последнее редактирование: 12 Август 2022, 11:51:55 от bulatv2 »

Оффлайн AleksG

  • Maternal Y-DNA: R1a-L365
  • Сообщений: 222
  • Страна: 00
  • Рейтинг +75/-0
  • Y-ДНК: Q-PH2513
  • мтДНК: U5a1a1
Re: Генотек
« Ответ #308 : 12 Август 2022, 11:52:11 »
Вы же точно знаете что ваши предки из разных популяций. Поэтому на single смотреть совсем не надо.
По K13 в mixed результат выглядит близким к тому что дал Генотек.

Оффлайн Farharaji

  • Сообщений: 717
  • Страна: aq
  • Рейтинг +129/-7
    • Ytree YF71444
  • Y-ДНК: R1b-DF98+FT22607+BY20662+
  • мтДНК: U5b1e1*
Re: Генотек
« Ответ #309 : 12 Август 2022, 19:02:02 »
На этом можно и закончить. Ибо Генотек и Майхеритэдж компании как бы это сказать, ну по мне чисто 2го уровня...

А что по сервисам этно-калькуляторов можно считать 1го уровня ?
По этно-калькуляторам сказать трудно..такая вещь. Хотя тот же gedmatch, о котором вы и говорили можно использовать, если уметь. Ну а в целом флагманские компании в этой области известны, прежде всего 23andMe, а также AncestryDNA ну и в каком-то смысле FTDNA, хотя они больше по игреку. К сожалению тот же 23andMe малодоступен, а АнцестриДНА для азиатских популяций напр. тоже не оч. подходит, недалеко ушел от MyHeritage. Да, для европопуляций конечно стоит использовать. Я соглашусь что тот же Херитэйдж развивается и сейчас уже лучше,впрочем и Анцестри напр. развивается, сейчас предлагает фазирование, но пока что они его выполняют оч. не очень.
А вообще я сторонник больше WGS тестов и компаний

Оффлайн kardes

  • Сообщений: 973
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1230/-11
  • Y-ДНК: G2a1
Re: Генотек
« Ответ #310 : 12 Август 2022, 19:41:53 »
  Истории обывателей Генотека -
Касе   Сати   Шац   Лера   Швай  Завал
Гостем нового выпуска Генотека «Происхождение. Просто такая генетика» стала балерина Анастасия Волочкова, якобы в её генеалогии и Наполеон и Мария Антуанетта,) возможно из за mtDNA - H?
« Последнее редактирование: 14 Август 2022, 22:51:23 от kardes »

Оффлайн nilogov

  • Сообщений: 1314
  • Страна: ru
  • Рейтинг +90/-3
  • философ антиязыка
  • Y-ДНК: R-BY55151
  • мтДНК: T2b-T152C!
Re: Генотек
« Ответ #311 : 13 Август 2022, 07:19:40 »
Базы базами, но смысл имеют лишь те базы, которые вносят новое общедоступное знание в фонд снипов и гаплогрупп...

Оффлайн Nowmenkino

  • Сообщений: 10
  • Страна: ru
  • Рейтинг +0/-0
  • Y-ДНК: E1b1b-V13 (E1b1b1a1b1a)
Re: Генотек
« Ответ #312 : 23 Август 2022, 18:12:44 »
Всем добра!
Дано: два исходных файла генома от компании Генотек в разных форматах:
1 тыц https://cloud.mail.ru/public/YjJ8/RyxWUJTgH в формате 23andme TXT
2 тыц https://cloud.mail.ru/public/K5vD/3oeUQVUC1 в формате VCF

Вопрос: Что с ними можно сделать, где и для получения какого результата?

Оффлайн AleksG

  • Maternal Y-DNA: R1a-L365
  • Сообщений: 222
  • Страна: 00
  • Рейтинг +75/-0
  • Y-ДНК: Q-PH2513
  • мтДНК: U5a1a1
Re: Генотек
« Ответ #313 : 23 Август 2022, 18:57:07 »
23andme v5?

Загружаете на
Gedmatch.com
Familytreedna.com
Geni.com
Myheritage.com


Оффлайн 19986

  • Сообщений: 156
  • Страна: us
  • Рейтинг +121/-1
  • Y-ДНК: I1 > M253 > L22 > S19986/Y3603 > S9318* (Нижегородская обл.)
  • мтДНК: J1c2* (Ивановская обл.)
Re: Генотек
« Ответ #314 : 23 Август 2022, 20:10:50 »
Да, я загружал 2 файла в MyHeritage (все отлично сработало) и FamilyTreeDNA (один файл ок, со вторым возникли проблемы).

Еще можете попробовать Familio (это бывший ExpertDNA, у истоков которого стоял один из завсегдатаев этого сайта) - он платное и сейчас они перегружены, но они делают интерпретацию с фокусом на народы России-СНГ. Тема: https://forum.molgen.org/index.php/topic,13913.msg548397.html#msg548397

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.