мтДНК: Гаплогруппа K

[Yaroslav]

Всем доброе время суток! В ноябре получил результаты тестирование Y и mtDNA. По материнской линии оказался K1b1a1-T199C. Присоединился к проекту К в FTDNA. Бабушка родом из деревни Луги, Старооскольского уезда Курской губернии. К сожалению, кто была её мать не знаю, т.к. умерла ещё до революции, прадед второй раз потом женился. Все совпденцы - из Западной Европы. Моя линия гаплогруппы К нераспространённая в Восточной Европе, насколько я понял?

[Jonik]

Всем доброе время суток! В ноябре получил результаты тестирование Y и mtDNA. По материнской линии оказался K1b1a1-T199C. Присоединился к проекту К в FTDNA. Бабушка родом из деревни Луги, Старооскольского уезда Курской губернии. К сожалению, кто была её мать не знаю, т.к. умерла ещё до революции, прадед второй раз потом женился. Все совпденцы - из Западной Европы. Моя линия гаплогруппы К нераспространённая в Восточной Европе, насколько я понял?

[Yaroslav]

Спасибо за карту, Jonik! Самый правый (восточный) значок - это мой. Да... ближайший совпаденец по географическому расстоянию - из Чехии... Занесло ж мою линию на Белгородщину. Что Y, что mt - сплошные для России раритеты .

[Jonik]

Еще одно совпадение K1c1c (-1 genetic distance) два дня назад - опять Финляндия.

[Yaroslav]

Подскажите, пожалуйста. В проекте К, помимо меня (# 299529), есть ещё 2 человека: 295572 Jacoba Olva и 76350 Martha Wheeler, как и я K1b1a1-Т199С:



Насколько я понимаю, Т199С – это наш терминальный снип, и поэтому я с этими людьми нахожусь в одном субкладе. А значит, это самые близкие мне в проекте случаи K1b1a1 (сужу по аналогии с Y, поэтому не знаю, насколько это правильно).

Кроме того, в Matches у меня 3 человека с Genetic Distance 2 и 3, тоже Т199С:



Сориентируйте меня, пожалуйста, как можно узнать ВБОП с моими «односубкладниками» в проекте К и совпаденцами в Matches)?

[пенелопа]

Сориентируйте меня, пожалуйста, как можно узнать ВБОП с моими «односубкладниками» в проекте К и совпаденцами в Matches)?

Yaroslav, мутации в мито происходят редко, раз в 3.500-4.000 лет, об общем предке в пределах документально-письменного времени имеет смысл говорить, если есть полное совпадение полных митосиквенсов...

[Yaroslav]

Yaroslav, мутации в мито происходят редко, раз в 3.500-4.000 лет, об общем предке в пределах документально-письменного времени имеет смысл говорить, если есть полное совпадение полных митосиквенсов...

Да, я понимаю, что в мито мутации случаются намного реже чем в Y. Но я спросил не в плане идентификации общих предков между нами, а просто чтоб хотя бы приблизительно сориентироваться по времени, когда у меня произошли расхождения с этими людьми, являющимися, как я понимаю, наиболее приближёнными ко мне.

если есть полное совпадение полных митосиквенсов...

Это когда Genetic Distance при наличии FMS у обоих = 0, я правильно понял?

[VVR]

Можете посмотреть возраста мт-субкладов по версии Валерия (он бывает на форуме) здесь. Субклад U8K1b1a1.

[Yaroslav]

Можете посмотреть возраста мт-субкладов по версии Валерия (он бывает на форуме) здесь. Субклад U8K1b1a1.

Спасибо за ссылку, VVR! Изо всех сил пытаюсь вникнуть, что такое все эти (Rho и Years) Age Full, Age Coding, Age Synonymous.

По возрастам субкладов своей линии гаплогруппы К находил кое-что в инете:

К – 16000 лет (Вики), или 12000 лет (та же Вики, со ссылкой на Richards), или 38000-18000 лет (Eupedia).

К1 – 12000 лет (Вики).

K1b1a – возраст пока не нашёл.

K1b1a1 – 8100 ± 3,200 лет (группа Haplogroup К в фейсбуке, со ссылкой на Behar).

Вот, только, как определять примерные возрасты общих предков уже в субкладах K1b1a1, в частности, в моём Т199С Или для mt это нереально?

[Yaroslav]

Yaroslav, мутации в мито происходят редко, раз в 3.500-4.000 лет, об общем предке в пределах документально-письменного времени имеет смысл говорить, если есть полное совпадение полных митосиквенсов...

По-моему, Бог услышал Ваши слова, Пенелопа Ночью пришло письмо от FTDNA с известием о том, что появился новый совпаденец, причём полный: Exact match в HVR1, HVR2 и FMS. И что самое интересное – второй после меня случай K1b1a1-T199C из России. Уже перекинулись с ним письмами, дал ему ссылки на Молген, RussiaDNA и Semargl. Его мито-линия – «из села Нароватово Теньгушевского района республики Мордовия. В этом селе проживает мордва-эрзя».

У него также сделан FF, но в совпаденцах у меня его нет.

[Yaroslav]

Список моих мутаций в формате отличия от rCRS:

HVR1 DIFFERENCES FROM rCRS

16224C 16311C 16319A 16463G 16519C

HVR2 DIFFERENCES FROM rCRS

73G 152C 199C 263G 309.1C 309.2C 315.1C

CODING REGION DIFFERENCES FROM rCRS

750G 1189C 1438G 1811G 2706G 3480G 4769G 5913A 7028T 8860G 9055A 9698C 9962A 10289G 10398G 10550G 11299C 11467G 11719A 11923G 12308G 12372A 13967T 14167T 14766T 14798C 15257A 15326G 15946T

HVR1 REFERENCE SEQUENCE

Position   CRS   Your Result
16224   T           C
16311   T            C
16319   G            A
16463   A            G
16519   T             C

HVR2 REFERENCE SEQUENCE

Position   CRS   Your Result
73           A                G
152           T                C
199           T                C
263           A                G
309.1                    C
309.2                    C
315.1                    C

CR REFERENCE SEQUENCE

Position   CRS   Your Result
750   A   G
1189   T   C
1438   A   G
1811   A   G
2706   A   G
3480   A   G
4769   A   G
5913   G   A
7028   C   T
8860   A   G
9055   G   A
9698   T   C
9962   G   A
10289   A   G
10398   A   G
10550   A   G
11299   T   C
11467   A   G
11719   G   A
11923   A   G
12308   A   G
12372   G   A
13967   C   T
14167   C   T
14766   C   T
14798   T   C
15257   G   A
15326   A   G
15946   C   T

[Valery]

Ярослав, сочувствую, но у Вас предковый вариант (( Генеалогия бессильна. Полных матчей будут тонны.

http://forensicdna.ru/db/the_tree/tx/hg/U/tx_U8K1b1a1_644639.htm#

Вы бы могли и сами найти эту запись она висит уже полтора года.

[Valery]

Хотя например в моей базе на сайте по ссылке выше (состояние по давности полтора года назад) полных матчей нет, у Вас предковый вариант, вы - ископаемое промежуточное звено

[Yaroslav]

Хотя например в моей базе на сайте по ссылке выше (состояние по давности полтора года назад) полных матчей нет, у Вас предковый вариант, вы - ископаемое промежуточное звено

Валерий, огромное спасибо за информацию!

К сожалению, как-то прошёл мимо этой ссылки, да и тема мито для меня дремучий лес, ещё более дремучий, чем игрек. Поэтому вряд ли бы что-то понял.

Т.е., насколько я понял, в мито нельзя определить, например (говорю по аналогии с игреком), если я с определёнными людьми в субкладе K1b1 - значит, диапазон ВБОП такой-то, если я с ними в K1b1а1 - диапазон ВБОП такой-то, K1b1а1-Т199С - ВБОП такой-то? А дальше с матчами: GD 3 - диапазон ВБОП такой-то, и так до полного совпаденца в фулл мито - тогда диапазон такой-то?

[Valery]

действительно, бывают такие случаи, когда предковый вариант очень редок и выявляется далеко не сразу. В этой ветви по-видимому, именно так. Но наука увы бессильна в том чтобы разобраться, каково расстояние между двумя носителями предковых гаплотипов. У них верхняя граница TMRCA увы равна возрасту всей клады, в корне которой лежат их варианты.

Еще нетривиальный момент. Обратите внимание на вариант http://forensicdna.ru/db/the_tree/tx/hg/U/tx_U8K1b1a1a_611330.htm

он отличается от корня всего одной заменой. Есть предположение что Ваш образовался обратной мутацией от этого. Или от какого-то еще варианта с одной определяющей заменой, которого в моей базе пока нет. Почему так? Просто там среднее расстояние от корня вниз - 3 мутации. Это невероятно чтобы они обратились сразу. Значит, либо Ваш немутировавший (дикий) вариант существовал всегда (но увы совпаденцев мало, преобладают мутировавшие, это я погорячился предположив что будут тонны, вот нифига) либо он получился обратной мутацией из какой-то ветви которая мутировала меньше других. Чем реже встречается дикий аллель и чем больше среднее количество мутаций у недиких - тем больше вероятность что дикий вернулся назад из мутантного состояния. Но умозрительно это решить нельзя. Всегда остается вероятность что предковая форма сохранилась. Бывают случаи когда в кладе среднее число замен не 3 как в вашей а 4-5 - и все равно сохраняются дикие аллели.

Кстати можно поэкспериментировать с гистограммой на эту тему. Она может нехило пролить свет на генеалогическое разрешение мт. Нет только времени на эти развлечения ))