BigY: pro et contra

[Белгородец]

Спасибо за подробный ответ!

Проверить наличие 13 новелей моего односельчанина (с его странички Private Variants) на моей страничке в YFull не представляется возможным, так как для новелей в YFull дано только положение по hg38, а поиск в YFull осуществляется по названию снипа, а не по его позиции. YFull на все 13 новелей выдает один ответ "This SNP is not in the data base".

На страничке односельчанина в ФТДНА BigY-Results/ Matching/ Non-Matching Variants перечислено 10 снипов, значения которых не совпадают у меня и у односельчанина.
Из них один мой уникальный самый молодой снип и два самых молодых снипа односельчанинa (для них указано положение по hg38, это восьмизначные числа).
Для остальных семи Non-Matching Variants указаны названия снипов (например, S8361). Этих семи снипов нет в 13 новелях односельчанина.
Результаты по этим семи снипам для меня в YFull неоднозначные. Например, G (0.516), A (0.484) или G (0.861), A (0.129), C (0.011).
ФТДНА (в разделе Named Variants, затем SNP name search) выдает среди этих семи снипов "no results" для 6 снипов у односельчанина и для одного снипа у меня.
Причем для этого снипа BY227899 YFull выдает для меня G (0.861), A (0.129), C (0.011), а ФТДНА для односельчанина А. Референсное значение G, поэтому думаю, что это частный снип односельчанина.

Видимо, для расчета среднего количества частных снипов - новелей в разделе Block Tree ФТДНА (у нас их там 5) использует количество Non-Matching Variants (их на двоих 10). Это верно? Ведь в разделе Private Variants у меня 1 снип, а у односельчанина 13, в среднем выходит 7, а не 5.

Еще осталось понять, как можно определить, какие именно из этих новелей будет использовать YFull для оценки возраста нашей ветки, если я загружу данные односельчанина на YFull.

И сколько частных снипов у односельчанина, образовавшихся после разделения со мной?
2 (число его снипов, которые есть и в Non-Matching Variants, и в Private Variants), 3 (если считать еще BY227899) или вообще все 13 (полный список Private Variants)?

[Доронин Дмитрий]

Доброе утро!

Подскажите, прошу, пожалуйста, "чайнику", как и где сейчас лучше протестировать Y ДНК, если сам находишься только в России?
Есть ли какие-то новости за последние года два по технологиям ? Есть ли где-то скидки, например, рождественские?

Спасибо!

[Доронин Дмитрий]

Если надо у нас дёшево и сердито, то у Дениса, а если за бугром, то лучше начинать с FF FTDNA.

Большое спасибо! Не знал об этом. А насколько "сердито"? )) Нужно будет перепроверять в FTDNA? И что в Генопоиске с базами данных, как потом интерпретировать данные? (Заливать их потом в FTDNA?)

[Древ]

Доронин Дмитрий
В целом ситуация такая. В РФ есть компании которые делают полный геном/глубокое исследование на Y, но за неадекватно (рынку) большие деньги. 100 тыщ (Генотек, например)
Генопоиск это лучший из российских, кто делает бюджетные исследования Y, но это НЕ ЗАМЕНЯЕТ дорогие и глубокие тесты.
Вот мой личный опыт говорит, что простые тесты на Y - бессмысленная трата денег и лучше всё-таки заморочиться и заказать bigY в FTDNA или его аналог (Nebula, YSEQ).

Будет лучше, если вы опишите конкретно вашу задачу и тогда мы лучше поймём, что вам посоветовать.

[Доронин Дмитрий]

Будет лучше, если вы опишите конкретно вашу задачу и тогда мы лучше поймём, что вам посоветовать.

Большое спасибо за ответ! Я бы хотел сделать максимально глубокое исследование на Y, чтобы исследовать дальше свою V13.
Но проблемы такие:

1) У меня нет больших денег, поэтому хотел сделать в FTDNA (или его аналоге) во время рождественских скидок или (если сосем будет для меня дорого) буду делать сначала 37, а потом там же апгрейд до БИГа
2) Я не знаю, как в нынешних политических обстоятельствах отправлять в FTDNA анализ и как за него платить (за рубеж у меня сейчас пока никто не едет). Можно ли пользоваться сейчас "Заплати легко" и "Бандеролькой", как мне советовали год с лишним назад, или нет, или лучше как-то еще?
3) Я слышал, что эта сейчас большая бюрократическая волокита (с договорами, разрешениями, заключениями Росздравнадзора). Где об этом можно почитать, чтобы понять, как лучше действовать?
4) Нет ли у Генопоиска преимуществ в том, что у них какие-нибудь российские базы и новые наши географически-локальные данные, которых нет у FTDNA?
5) Не выйдет ли по нынешним ситуации с долларом и пересылками те же 100 кусков или около того, если пытаться заказать в FTDNA?

Спасибо большое за советы!

[Древ]

Доронин Дмитрий
Вот, теперь всё понятно!
В вашем случае, это только иностранные компании.  Например, FTDNA.
1. Делать Y37 вам бессмысленно, делайте сразу bigY.
2. Отправлять бандероль из РФ в США можно спокойно. Главное, не афишировать для российской стороны, что отправляешь ДНК-тест. Люди пишут "samples", "plastic stiks" или что-то в этом духе. Главное, что-то нейтральное. Вы тут ничем не рискуете. "Бандеролькой" и т.п. для оплаты пользоваться можно, а ещё можно написать в личку уважаемому форумчанину gecube_ru  и он вам наверняка поможет с оплатой (он 100% достоин всяческого доверия!) . Что касается получения самой коробочки с тестом из США в РФ, лучше всего безнаборный способ, описанный уважаемым Farroukh (как самый бюджетный): https://forum.molgen.org/index.php/topic,15166.0.html
3. Не заморачивайтесь.
4. Учитывая, что Генопоиск не делает глубоких тестов, откуда бы у них взялись какие-то особые данные... Вцелом, имеет смысл делать bigY и заливать на YFULL, где собираются данные разных лабораторий.
5. Нет))) Пересылка из РФ в США максимум 3000р. Тут со мной, наверняка поспорят, т.к. люди всячески хитрят и отправляют ещё дешевле. BigY сейчас стоит 399 баксов, это 42000 рублей. Итого ваши расходы 45000 рублей. Ну, заливка на YFULL ещё, но это ж не сейчас, а через полгода.

[Дачник44]

Но проблемы такие:

1) Взял бы на скидке Y37, поигрался бы, пока коплю, в предикторы с Y37, вступил в проект FTDNA, посмотрел бы таблицы,  может повезет на совпаденца у которого BigY, затем свой апгрейд BigY на скидке. Можно растянуть удовольствие через Y111, вроде бы, а потом BigY.
2)Все работает, комиссия только под 10%. Отправление в США шло несколько больше месяца по почте, относит. недорого, около 700 руб.
3)Безнаборный тест. Есть тема. Никаких волокит, только в FTDNA договоритесь. Взял сам тест у себя и отправил.
4)
5) 500$ всё удовольствие, примерно так.

[gecube_ru]

1) Взял бы на скидке Y37, поигрался бы, пока коплю, в предикторы с Y37, вступил в проект FTDNA, посмотрел бы таблицы,  может повезет на совпаденца у которого BigY, затем свой апгрейд BigY на скидке. Можно растянуть удовольствие через Y111, вроде бы, а потом BigY.

это не растягивание удовольствия, а скорее агония отсутствия денег. Делайте BigY без промежуточных остановок!

1) У меня нет больших денег, поэтому хотел сделать в FTDNA (или его аналоге) во время рождественских скидок или (если сосем будет для меня дорого) буду делать сначала 37, а потом там же апгрейд до БИГа

тогда лучше сделать ФФ и молиться, чтобы материала из второй пробирки хватило на бигбургер, когда созреете

[Farroukh]

У меня нет больших денег, поэтому хотел сделать в FTDNA (или его аналоге) во время рождественских скидок или (если сосем будет для меня дорого) буду делать сначала 37, а потом там же апгрейд до БИГа

Дмитрий, ситуация понятна. Если за раз реально выложить не более 10 тыс. руб., то для поэтапного приближения к BigY воспользуйтесь советом gecube_ru и закажите на скидках Family Finder - он стоит 49$ (+11$ сам кит и доставка, по итогу 60$). Далее действуете следующим образом:
1) После получения результата Family Finder на скидках берёте апгрейд до Y37 (99$)
2) Апгрейд Y37>Y111 обойдётся в $119
3) Апгрейд Y111>BigY700 встанет в $189
То есть по итогу Вам всё обойдётся в 60+99+119+189=467$ - как видим, это дороже, чем BigY без скидок ($449, на скидках он $399).

Тут выгоднее взять в кредит 45 тыс. и сразу заказать BigY за $399, с проведением оплаты ребята помогут.
Я могу сделать следующее - как админ сделать предварительный заказ BigY на скидочной цене $399, а Вы потом как будут деньги вносите донат в FTDNA и кит приезжает к Вам.

[gecube_ru]

Тут выгоднее взять в кредит 45 тыс. и сразу заказать BigY за $399, с проведением оплаты ребята помогут.

+++++

То есть по итогу Вам всё обойдётся в 60+99+119+189=467$ - как видим, это дороже, чем BigY без скидок ($449, на скидках он $399).

ну, главное, чтобы материала хватило и не заставили собирать повторно!

[Ankor]

Если надо у нас дёшево и сердито, то у Дениса, а если за бугром, то лучше начинать с FF FTDNA.

Большое спасибо! Не знал об этом. А насколько "сердито"? )) Нужно будет перепроверять в FTDNA? И что в Генопоиске с базами данных, как потом интерпретировать данные? (Заливать их потом в FTDNA?)

Family Finder - это не так уж и сердито, вы получите как они сами пишут "Intermediate Y-DNA Haplogroup"
Насколько я понимаю, это лучше, чем допустим 37 маркеров

[gecube_ru]

Family Finder - это не так уж и сердито, вы получите как они сами пишут "Intermediate Y-DNA Haplogroup"
Насколько я понимаю, это лучше, чем допустим 37 маркеров

+/- одинаково, только маркеры менее точные.

[Древ]

ну, главное, чтобы материала хватило и не заставили собирать повторно!

Да даже если и попросят повторно. Ну и отошлёт он повторно! Я отсылал так дважды - ничего такого. Время только тратится.
А с безнаборным способом вообще можно 4 щётки положить и всего делов! И на всё хватит!

[Ankor]

Family Finder - это не так уж и сердито, вы получите как они сами пишут "Intermediate Y-DNA Haplogroup"
Насколько я понимаю, это лучше, чем допустим 37 маркеров

+/- одинаково, только маркеры менее точные.

Сейчас из любопытства прогнал свои 37 маркеров через Невген, получил снип всего одним уровнем выше терминального снипа. Конечно такая точность возможна благодаря тому, что я и другие из моей гаплогруппы делали Big Y, но всё равно впечатляет, можно теперь проверять совпаденцев по маркерам

[AleksG]

Невген уже не модно, модно http://predictor.ddns.net/ (в дневное время)