Здравствуйте Всем, дорогие форумчане !) Вчера получил ответ Y Full...
пожалуйста, кто-нибудь сможет перевести на сырьмяжный ензык ))
"Маркер Y-GGAAT-1B07 в YFull не совпадает с номенклатурой FTDNA!
Маркер Y-GGAAT-1B07 можно назвать странным. Лаборатория SMGF разработала праймеры для этого маркера используя сиквенс AC019099 клона RP11-428D10 от донора RP11. Однако, этот сиквенс нельзя обнаружить в референсной последовательности человеческого генома. Даже в сброке GRCh37/hg18. Мы точно знаем, что последовательность существует (почти) у каждого мужчины, и что она наследуется по прямой мужской линии. Поэтому она должна быть где-то на Y-хромосоме. Повторяющиеся сегменты GGAAT очень сильно распространены в области центромеры на Y-хромосоме, но в то же время они являются общим мотивом в регионе Yq12. Оба этих региона являются мало изученными, потому что нет достаточно данных для картирования, чтобы создать сборку и полную последовательность для них. Поэтому точное положение маркера Y-GGAAT-1B07 остается загадкой до тех пор, пока у нас не появятся улучшенные технологии секвенирования, которые способны упорядочить и просеквенировать десятки тысяч нуклеотидов подряд.
Thomas Krahn // http://archiver.rootsweb.ancestry.com/th/read/GENEALOGY-DNA/2013-01/1357339085"
...я , признаться к своему стыду. ничаво не "срубил" ))
Спасибо огромное Всем за внимание!
А где и как себя увидеть в Большом дереве ?...
Ещё раз спасибо.
Попробую объяснить. Сначала надо понять как тестируют STR маркеры классическим способом. Для метода ПЦР необходимы праймеры
https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9F%D0%BE%D0%BB%D0%B8%D0%BC%D0%B5%D1%80%D0%B0%D0%B7%D0%BD%D0%B0%D1%8F_%D1%86%D0%B5%D0%BF%D0%BD%D0%B0%D1%8F_%D1%80%D0%B5%D0%B0%D0%BA%D1%86%D0%B8%D1%8F#%D0%9F%D1%80%D0%B0%D0%B9%D0%BC%D0%B5%D1%80%D1%8Bhttps://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9F%D1%80%D0%B0%D0%B9%D0%BC%D0%B5%D1%80Так вот, когда ученые нашли этот STR и создали для него праймеры, то эти праймеры стали ловить результаты не того STR, который ожидали, а совершенно другого, который как все понимали, где-то существует на Y хромосоме, но где точно - не знал никто. Чтоб не морочиться - оставили как есть. Дали ему название, а на исходный STR маркер забили.
NGS технология секвенирования отличается от ПЦР, и зная на каком участке должен был находится Y-GGAAT-1B07, мы его нашли и спокойно считаем его повторы. Проблема только в том, что FTDNA пользуется методом ПЦР и теми самыми праймерами, которые ловят непонятный STR маркер)
В результате мы имеем два разных STR маркера, реально существующих, расположенных в разных участках Y-хромосомы, но имеющих одно и тоже имя. Поэтому на сайте YFull и размещено примечание о несовпадении номенклатур, так как часто возникали вопросы, почему этот маркер FTDNA мне насчитали так, а YFull этак. Причем если использовать строго научный подход, то в YFull правильный Y-GGAAT-1B07, но в FTDNA общепринятый.
В продолжение всей этой эпопеи, с выходом референса сборки hg38, мы нашли тот самый STR маркер, который FTDNA принимала за Y-GGAAT-1B07. Этот участок отсутствовал в более ранних референсных файлах. Так что можно теперь определять и научный Y-GGAAT-1B07 и Y-GGAAT-1B07 в версии FTDNA.
Тема: Сдал в ДНК-НАСЛЕДИЕ, получил R1a1a (M198) (Прочитано 14609 раз)