АвторТема: Analysis of genetic admixture in Uyghur using the 26 Y-STR loci system  (Прочитано 2484 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн NimissinАвтор темы

  • Сообщений: 2238
  • Рейтинг +657/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Analysis of genetic admixture in Uyghur using the 26 Y-STR loci system

Yingnan Bian, Suhua Zhang, Wei Zhou, Qi Zhao, Siqintuy, Ruxin Zhu, Zheng Wang, Yuzhen Gao, Jie Hong, Daru Lu & Chengtao Li

Abstract


The Uyghur population has experienced extensive interaction with European and Eastern Asian populations historically. A set of high-resolution genetic markers could be useful to infer the genetic relationships between the Uyghur population and European and Asian populations. In this study we typed 100 unrelated Uyghur males living in southern Xinjiang at 26 Y-STR loci. Using the high-resolution 26 Y-STR loci system, we investigated genetic and phylogenetic relationship between the Uyghur population and 23 reference European or Asian populations. We found that the Uyghur population exhibited a genetic admixture of Eastern Asian and European populations, and had a slightly closer relationship with the selected European populations than the Eastern Asian populations. We also demonstrated that the 26 Y-STR loci system was potentially useful in forensic sciences because it has a large power of discrimination and rarely exhibits common haplotypes. However, ancestry inference of Uyghur samples could be challenging due to the admixed nature of the population.

http://www.nature.com/articles/srep19998#additional-information

Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 8933
  • Страна: kz
  • Рейтинг +872/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: Analysis of genetic admixture in Uyghur using the 26 Y-STR loci system
« Ответ #1 : 05 Февраль 2016, 13:16:01 »
Рахмет.

Оффлайн Vernyj

  • Сообщений: 1498
  • Страна: 00
  • Рейтинг +202/-75
Re: Analysis of genetic admixture in Uyghur using the 26 Y-STR loci system
« Ответ #2 : 05 Февраль 2016, 13:20:10 »
We showed that the Uyghur population from southern Xinjiang is genetically admixed with reference populations in Eastern Asia and Europe, with a slightly closer relationship to the European populations.

В общем, секрет полишинеля. В плане их связей с европейцами нас интересуют конкретные субклады R1a, R1b и их проценты.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6295
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1233/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Analysis of genetic admixture in Uyghur using the 26 Y-STR loci system
« Ответ #3 : 05 Февраль 2016, 16:50:37 »
Если у кого будет время и настроение - прогоните через предиктор данные:)

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6295
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1233/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z

Оффлайн NimissinАвтор темы

  • Сообщений: 2238
  • Рейтинг +657/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: Analysis of genetic admixture in Uyghur using the 26 Y-STR loci system
« Ответ #5 : 07 Февраль 2016, 02:51:26 »
Данные прогнали:
http://forum-eurasica.ru/index.php?/topic/795-dnk-proekt-obschie-voprosy/?p=189249
Из 100 образцов к гаплогруппе Q предиктор отнес 10 (DYS393 DYS390 DYS19 DYS391 DYS385ab DYS426(=0) DYS388 DYS439 DYS389I DYS392 DYS389II DYS458):
14 25 13 11 13,20 12 11 12 13 30 16 Q M346(99%)
14 24 13 9 15,22 12 10 14 14 30 15 Q M346(100%)
13 24 13 10 14,17 12 12 13 14 31 18 Q M346(99%)
12 25 14 10 13,21 12 12 13 14 30 18 Q M346/O3a2
13 23 13 11 14,15 12 12 14 16 31 18 Q M346(72%)
13 23 13 10 15,16 12 14 13 14 30 16 Q M346(98%)
13 22 13 10 11,18 12 14 14 15 30 17 Q L275(85%)
13 23 13 11 14,15 12 12 15 16 32 18 Q M346(65%)
13 23 13 10 15,16 12 13 13 14 30 16 Q M346(95%)
13 23 13 10 15,16 12 13 13 14 30 15 Q M346(99%)
Получается, десять процентов исследованной мужской популяции уйгуров из южного Синьцзяна имеет игрек-хромосому гаплогруппы Q. Это - много для Центральной Азии. Причем на 9 гаплотипов Q1a приходится один гаплотип Q1b. Сразу возникают ассоциации с данными о древнем захоронении Хэйгоулян в восточном Синьцзяне (http://rjgg.molgen.org/index.php/RJGGRE/article/view/149/171).

Предиктор не идентифицировал гаплогруппы, легко распознаваемые на глаз, из-за неправильного представления значений локуса DYS385a,b:
13 23 16,17 9 12 12 11 14 11 31 18 ???? C3c1-M86,M77 с дупликацией в DYS19, DYS385=12,12
13 19 14 11 13 12 13 14 13 30 18 ????? R1b1a1-M73 DYS385=13,13
13 19 14 11 13 12 12 14 13 29 17 ????? R1b1a1-M73 DYS385=13,13
13 25 15 10 11 12 13 14 7 30 17 ????? D3a-P47 DYS385=11,11
13 25 15 10 11 12 12 14 7 30 17 ???????? D3a-P47 DYS385=11,11
13 25 15 10 11 12 12 14 7 31 17 ???? D3a-P47 DYS385=11,11
13 25 16 10 11 12 12 14 7 30 16 ??????? D3a-P47 DYS385=11,11
13 25 15 10 11 12 12 14 7 30 16 ?????? D3a-P47 DYS385=11,11
и т.д.


Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6295
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1233/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Analysis of genetic admixture in Uyghur using the 26 Y-STR loci system
« Ответ #6 : 07 Февраль 2016, 10:33:48 »
Из 100 образцов к гаплогруппе Q предиктор отнес 10 (DYS393 DYS390 DYS19 DYS391 DYS385ab DYS426(=0) DYS388 DYS439 DYS389I DYS392 DYS389II DYS458):

Махтал

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6295
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1233/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Analysis of genetic admixture in Uyghur using the 26 Y-STR loci system
« Ответ #7 : 07 Февраль 2016, 11:10:16 »
Занес данные по уйгуру 60 (по предиктору Q-L275) в базу Семаргла.
http://www.semargl.me/kit/69316/

На 17 маркерах действительно ближе всего пуштуны Q-L275 (L68+). На 25 маркерах картина менее очевидная. Но в любом случае - это точно Q-L275.

Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 8933
  • Страна: kz
  • Рейтинг +872/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Re: Analysis of genetic admixture in Uyghur using the 26 Y-STR loci system
« Ответ #8 : 07 Февраль 2016, 12:45:17 »
6 гаплотипов из коммерческого проекта
274414 Mr. Sabitov Kachluk (Kashgar uigur) C-M217 C3-Starcluster
13 25 16 10 12-12 11 14 10 13 11 29
185649  Khamrayev KZ uigur Kazakhstan C-M217 C3-Starcluster
14 25 16 10 12-13 11 14 10 13 11 29 18 8-8 11 12 26 14 22 27 11-11-12-15 10 10 22-23 15 13 17 16 33-36 11 10
K1857 Tudiyarov J2
12 24 15 10 13-16 11 14 11 14 11 30 18 9-9 11 11 19 15 19 29 14-14-16-19 11 10 19-22 15 13 17 18 32-34 11 10 11 7 15-16 8 10 10 8 11 9 13 21-21 15 10 12 13 14 9 13 23 21 13 14 10 13 12 12 12 11
277594 Ashimov R1a
13 25 15 10 11-14 12 12 10 13 11 31 16 9-10 11 11 25 14 20 32 12-15-15-16 11 11 19-23 15 16 21 20 35-39 12 11 11 8 17-17 8 12 10 8 11 10 12 22-22 15 10 12 12 13 8 14 23 21 12 13 11 13 11 11 12 13
421426  Kibirov Valihan, Kashgar, 18?? China R1a
13 25 15 11 11-14 12 12 10 14 11 32
K1823 Yakupov R1a
13 25 17 10 11-14 12 12 10 13 11 31 15 9-9 11 11 24 14 20 37 12-15-15-15 11 11 19-23 16 14 19 18 34-37 12 11 11 9 17-17 8 11 10 8 12 10 12 22-22 15 10 12 12 13 8 14 23 21 12 12 11 13 10 11 12 13

Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 8933
  • Страна: kz
  • Рейтинг +872/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+

Оффлайн NimissinАвтор темы

  • Сообщений: 2238
  • Рейтинг +657/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: Analysis of genetic admixture in Uyghur using the 26 Y-STR loci system
« Ответ #10 : 05 Апрель 2017, 15:26:02 »
Занес данные по уйгуру 60 (по предиктору Q-L275) в базу Семаргла.
http://www.semargl.me/kit/69316/

На 17 маркерах действительно ближе всего пуштуны Q-L275 (L68+). На 25 маркерах картина менее очевидная. Но в любом случае - это точно Q-L275.
17-маркерный гаплотип уйгура 60 (19, 389I, 389II, 390, 391, 392, 393, 385a,b, 438, 439, 437, 448, 456, 458, 635, H4)

13   14   30   22   10   15   13   11   18   11   14   14   18   15   17   22   10

сравним с древним образцом чемурчекской культуры № 13 (Hollard, 2014, аймак Ховд, Монголия, 4300-3800 лет назад)

13   13   29   22   10   15   13   11   17   11   13   14   19   15   16   22   10

Видим, что обладатели игрек-хромосомы Q1b-L275 давно проживают в тех краях (Синьцзян и Монгольский Алтай).
Просмотрел современные гаплотипы. Думаю, что ближе всех к этим двум гаплотипам располагается гаплотип образца YF03718 (ветвь Q-YP755).
Интересно, есть ли похожие образцы в Западной Европе? Чемурчекскую культуру некоторые археологи выводят из мегалитической культуры Франции.



Оффлайн Pre Slav

  • Где начало того конца которым оканчивается начало?
  • Сообщений: 1693
  • Страна: 00
  • Рейтинг +122/-94
Re: Analysis of genetic admixture in Uyghur using the 26 Y-STR loci system
« Ответ #11 : 05 Апрель 2017, 15:32:43 »
Чемурчекскую культуру некоторые археологи выводят из мегалитической культуры Франции.
выводят то выводят, но вот генетика пока не поддерживает их выводы, да и проблема в том что между францией и алтаем ничего не нашли, а расстояние то гигантское, неужели они бегом бежали???

Оффлайн zastrug

  • ...
  • Сообщений: 10663
  • Страна: tt
  • Рейтинг +2057/-46
  • I2b1c (P78+)=I2a2a1b1a
  • Y-ДНК: I2b1c
  • мтДНК: T2a1a
Re: Analysis of genetic admixture in Uyghur using the 26 Y-STR loci system
« Ответ #12 : 05 Апрель 2017, 22:25:29 »
Чемурчекскую культуру некоторые археологи выводят из мегалитической культуры Франции.
Ну некоторые это Ковалев и Клейн ученика поддерживает.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6295
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1233/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Analysis of genetic admixture in Uyghur using the 26 Y-STR loci system
« Ответ #13 : 06 Апрель 2017, 10:21:30 »
Занес данные по уйгуру 60 (по предиктору Q-L275) в базу Семаргла.
http://www.semargl.me/kit/69316/

На 17 маркерах действительно ближе всего пуштуны Q-L275 (L68+). На 25 маркерах картина менее очевидная. Но в любом случае - это точно Q-L275.
17-маркерный гаплотип уйгура 60 (19, 389I, 389II, 390, 391, 392, 393, 385a,b, 438, 439, 437, 448, 456, 458, 635, H4)

13   14   30   22   10   15   13   11   18   11   14   14   18   15   17   22   10

сравним с древним образцом чемурчекской культуры № 13 (Hollard, 2014, аймак Ховд, Монголия, 4300-3800 лет назад)

13   13   29   22   10   15   13   11   17   11   13   14   19   15   16   22   10

Видим, что обладатели игрек-хромосомы Q1b-L275 давно проживают в тех краях (Синьцзян и Монгольский Алтай).
Просмотрел современные гаплотипы. Думаю, что ближе всех к этим двум гаплотипам располагается гаплотип образца YF03718 (ветвь Q-YP755).
Интересно, есть ли похожие образцы в Западной Европе? Чемурчекскую культуру некоторые археологи выводят из мегалитической культуры Франции.

Похожие образцы из Западной Европы есть и как раз совпадают с чемурчекским образцом. Это образцы семьи Hill и Bales (формат FTDNA):

120337 Hill 13 22 13 - 10 14 17 12 12 13 13 15 29 16 9 10 11 11 25 14 19 29 14 15 15 16 - - - 11 9 19 20 15 15 17 16 34 36 12 11 11 8 15 17 8 10 10 8 13 10 0 22 22 16 11 12 12 18 8 12 24 16 14 12 11 13 10 12 13 13 33 15 9 15 12 26 28 18 11 12 12 11 10 9 11 11 10 11 11 33 12 13 27 15 11 9 19 15 19 14 25 14 13 16 24 12 22 17 12 15 18 9 12 11 -
115890 Hill 13 22 13 - 10 14 17 12 12 13 13 15 29 16 9 10 11 11 25 14 19 29 14 15 15 16 - - - 11 9 19 20 15 15 17 16 34 36 13 11 11 8 15 17 8 10 10 8 12 10 0 22 22 16 11 12 12 19 8 12 24 16 14 12 11 13 10 12 13 13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
141901 Hill 13 22 13 - 10 14 17 12 12 13 13 15 29 16 9 10 11 11 25 14 19 30 14 15 15 16 - - - 11 9 19 20 15 15 17 16 33 36 12 11 11 8 15 17 8 10 10 8 13 10 0 22 22 16 11 12 12 19 8 12 24 16 14 12 11 13 10 12 13 13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4075 Hill 13 22 13 - 10 14 17 12 12 13 13 15 29 16 9 10 11 11 25 14 19 29 14 15 15 16 - - - 11 9 19 20 15 15 17 16 34 36 12 11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Y32ZG Hill 13 22 13 - 10 14 17 12 12 13 13 15 29 16 9 10 11 11 25 14 19 29 14 15 15 16 - - - 11 9 19 20 15 15 17 16 34 36 12 11 11 8 15 17 8 10 10 8 13 10 0 22 22 16 11 12 12 18 8 12 24 16 14 12 11 13 10 12 13 13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
100870 Bales 13 22 13 - 10 14 17 12 12 13 13 15 29 16 9 10 11 11 25 14 19 29 14 15 15 16 - - - 11 9 19 20 15 15 17 16 34 36 12 11 11 8 15 17 8 10 10 8 13 10 0 22 22 16 11 12 12 19 8 12 24 16 14 12 11 13 10 12 13 13 33 15 9 15 12 26 28 18 11 12 12 11 10 9 11 11 10 11 11 33 12 13 27 15 11 9 19 16 19 14 25 14 13 16 24 12 22 17 12 15 18 9 12 11 -
170078 Hill 13 22 13 - 10 13 17 12 12 12 13 15 29 16 9 10 11 11 25 14 19 29 14 15 15 16 - - - 11 9 19 20 15 15 17 16 34 36 12 11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
SBs SBs 13 22 13 - 10 12 17 - - 11 13 15 29 16 - - - - - 14 19 - - - - - - - - - 9 - - 16 - - - - - - 11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 22 - - - - - - - -

SB - это талыш.

Интересно, что уйгур 60 такой близости к этому кластеру не имеет (во всяком случае в базе Семаргла).
« Последнее редактирование: 06 Апрель 2017, 10:28:48 от Шад »

Оффлайн zastrug

  • ...
  • Сообщений: 10663
  • Страна: tt
  • Рейтинг +2057/-46
  • I2b1c (P78+)=I2a2a1b1a
  • Y-ДНК: I2b1c
  • мтДНК: T2a1a
Re: Analysis of genetic admixture in Uyghur using the 26 Y-STR loci system
« Ответ #14 : 06 Апрель 2017, 11:26:09 »
Только это можно трактовать как и то, что потомки чемурчекцев мигрировали на запад с любой из зафиксированных волн.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100