т.к. образцов дДНК пока недостатчно, имеет смысл обратиться к антропологии.
Если брать за типичных представителей восточноиранских языков в древности скифов, то среди них можно, условно выделить две группы: степную и лесостепную.
Первая -
собственно скифская, по комплексу признаков обнаруживает наибольшее число параллей среди Чаахольцев Тувы (41,2%), далее следуют ямники с р. Ингулец (29%), и ранние катакомбники с р. Молочная (29%), плюс еще несколько серий: черногоровские "киммерийцы" (29.4%), поздние катакомбники степного Крыма (29.4%), саратовские срубники (17.6%)
Чаахольцы Тувы сами ближе всего к ямникам с Ингульца (расстояние -0.21) и к тем же самым, более грацильным, катакомбникам с Молочной (0.41). Ямники с Ингульца, в свою очередь, ближе всего к КВК немецкого Осторфа (-0.07), к ним же близка и упомянутая выше серия ранних катакомбников (-0.42). Видно, что все они тяготеют к европейскому неолиту, в особенности через ингулецких ямников, которые жили на территории, где ранее соприкасались Трипольская и Нижнемихайловская культуры.
Вторая скифская группа - лесостепная, особых связей ни с кем не обнаруживает, но все же ближе к срубникам, которые, согласно данным дДНК, также обнаруживают "сильнее влияние неолитических земледельцев и Ближнего Востока".
Т.е. видимо, предки скифов обретались где-то в западной степи - там, где происходила более интенсивная метисация с грацильными неолитчиками, после этого они мигрируют на восток, и в конце-концов часть (?) из них возвращается на Запад и становится известна нам в качестве скифов.
Upd: забыл источники
Козинцев, Скифы Северного Причерноморья (2007), стр. 149Козинцев, Вторая волна миграции европеоидов в Южную Сибирь и Центральную Азию (презентация, 2015), слайд 8