АвторТема: дДНК из Ирландии - неолит и бронзовый век  (Прочитано 11802 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 8872
  • Страна: gr
  • Рейтинг +823/-129
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
Re: дДНК из Ирландии - неолит и бронзовый век
« Ответ #135 : 09 Январь 2016, 20:12:14 »
Надо собрать культуры которые достоверно Индоевропейские и их язык зафиксирован или частично зафиксирован, или там где зафиксировано их название и позднее их язык знаком
например собрать
Скифы 5-6 века до н.э в Приазовье,
Ранние Аланы Предкавказья 2-7 века н.э
Персов 4-5  века до н.э
Мидян из Эгбатаны 5-7  века до н.э
Хальсттат Прото-Кельтов
Фракийцев 5-6 века до н.э
Греков например Спартанцев 5-6 века до н.э
Анатолийскую какую нибудь ветвь долго продержавшую свой язык
Италийцев
Раннею Пражско-Корчакскую
 итд итд
и сравнить их всех с древними Культурами Энеолита и ранней Бронзы и посмотреть какая древнея культура им более родственна по аутосомам

Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 8872
  • Страна: gr
  • Рейтинг +823/-129
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
Re: дДНК из Ирландии - неолит и бронзовый век
« Ответ #136 : 09 Январь 2016, 20:15:45 »
Так Гоготас 1 и аргарская культура все происходят от бикеров.
Только ли от бикеров? Может, тут как с басками - язык местный... ::)
А что у Басков язык местный в Испании?
например Кельты могли потеснить пра-Басков из Центральной и Северной Франции в ходе своей миграции на запад

Оффлайн Asmat headhunter

  • Биохимическая субстанция
  • Сообщений: 11842
  • Страна: id
  • Рейтинг +753/-34
  • И того казака те тунгусы пальмами тут искололи
Re: дДНК из Ирландии - неолит и бронзовый век
« Ответ #137 : 09 Январь 2016, 20:22:57 »
например Кельты могли потеснить пра-Басков из Центральной и Северной Франции в ходе своей миграции на запад
Могли подвинуть. А могли не подвинуть. А может это баски подвинули кельтов в обе стороны, придя со стороны иберов.

Онлайн rozenblattАвтор темы

  • Сообщений: 1378
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1722/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
Re: дДНК из Ирландии - неолит и бронзовый век
« Ответ #138 : 09 Январь 2016, 20:27:38 »
Надо собрать культуры которые достоверно Индоевропейские и их язык зафиксирован или частично зафиксирован, или там где зафиксировано их название и позднее их язык знаком
например собрать
Скифы 5-6 века до н.э в Приазовье,
Ранние Аланы Предкавказья 2-7 века н.э
Персов 4-5  века до н.э
Мидян из Эгбатаны 5-7  века до н.э
Хальсттат Прото-Кельтов
Фракийцев 5-6 века до н.э
Греков например Спартанцев 5-6 века до н.э
Анатолийскую какую нибудь ветвь долго продержавшую свой язык
Италийцев
Раннею Пражско-Корчакскую
 итд итд
и сравнить их всех с древними Культурами Энеолита и ранней Бронзы и посмотреть какая древнея культура им более родственна по аутосомам

Немного странный выбор образцов. Например вместо спартанцев 5-6 века до н.э лучше проверить погребения микенского периода, мы точно знаем что они были грекоязычны. Например погребение из Пилоса: http://polit.ru/news/2015/10/27/ps_pylos/
Хеттов тоже было бы неплохо проверить, как никак самая ранняя отделившаяся ветвь индоевропейцев.

Оффлайн Asmat headhunter

  • Биохимическая субстанция
  • Сообщений: 11842
  • Страна: id
  • Рейтинг +753/-34
  • И того казака те тунгусы пальмами тут искололи
Re: дДНК из Ирландии - неолит и бронзовый век
« Ответ #139 : 09 Январь 2016, 20:40:23 »
Хеттов тоже было бы неплохо проверить, как никак самая ранняя отделившаяся ветвь индоевропейцев.
Митаннийских ариев бы найти.

Оффлайн Vernyj

  • Сообщений: 1498
  • Страна: 00
  • Рейтинг +202/-75
Re: дДНК из Ирландии - неолит и бронзовый век
« Ответ #140 : 09 Январь 2016, 21:04:19 »
например Кельты могли потеснить пра-Басков из Центральной и Северной Франции в ходе своей миграции на запад
Могли подвинуть. А могли не подвинуть. А может это баски подвинули кельтов в обе стороны, придя со стороны иберов.

Если рассматривать басков синхронно бикерам, то как считается в это время баски обитали и в середине нынешней Франции. Именно они не позволили бикерам проникнуть в Центральную Францию. Так считается, не знаю обитали ли они в это время на Перенеях. Но точно их никогда не было в Северной Франции, даже гипотез таких нет.
Баски естественно, однозначно неолитическое население этих мест, поэтому никакой миграции на запад в эти времена быть у них не могло (поэтому и считают что они жили в Центральной Франции тоже, вроде как преемственность археологических культур наблюдается).


Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 8872
  • Страна: gr
  • Рейтинг +823/-129
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
Re: дДНК из Ирландии - неолит и бронзовый век
« Ответ #141 : 09 Январь 2016, 21:08:13 »
Надо собрать культуры которые достоверно Индоевропейские и их язык зафиксирован или частично зафиксирован, или там где зафиксировано их название и позднее их язык знаком
например собрать
Скифы 5-6 века до н.э в Приазовье,
Ранние Аланы Предкавказья 2-7 века н.э
Персов 4-5  века до н.э
Мидян из Эгбатаны 5-7  века до н.э
Хальсттат Прото-Кельтов
Фракийцев 5-6 века до н.э
Греков например Спартанцев 5-6 века до н.э
Анатолийскую какую нибудь ветвь долго продержавшую свой язык
Италийцев
Раннею Пражско-Корчакскую
 итд итд
и сравнить их всех с древними Культурами Энеолита и ранней Бронзы и посмотреть какая древнея культура им более родственна по аутосомам

Немного странный выбор образцов. Например вместо спартанцев 5-6 века до н.э лучше проверить погребения микенского периода, мы точно знаем что они были грекоязычны. Например погребение из Пилоса: http://polit.ru/news/2015/10/27/ps_pylos/
Хеттов тоже было бы неплохо проверить, как никак самая ранняя отделившаяся ветвь индоевропейцев.
Мне интереснее Исторические народы которые показали героизм,
"300 Спартанцев" исторических времен, мне интереснее, чем Микенцы Мифических времен

Оффлайн Asmat headhunter

  • Биохимическая субстанция
  • Сообщений: 11842
  • Страна: id
  • Рейтинг +753/-34
  • И того казака те тунгусы пальмами тут искололи
Re: дДНК из Ирландии - неолит и бронзовый век
« Ответ #142 : 09 Январь 2016, 21:08:37 »
Именно они не позволили бикерам проникнуть в Центральную Францию.
Им просто колоколовидные кубки не понравились. :)

Оффлайн Vernyj

  • Сообщений: 1498
  • Страна: 00
  • Рейтинг +202/-75
Re: дДНК из Ирландии - неолит и бронзовый век
« Ответ #143 : 09 Январь 2016, 21:16:32 »
Если рассматривать басков синхронно бикерам, то как считается в это время баски обитали и в середине нынешней Франции. Именно они не позволили бикерам проникнуть в Центральную Францию. Так считается, не знаю обитали ли они в это время на Перенеях. Но точно их никогда не было в Северной Франции, даже гипотез таких нет.
Баски естественно, однозначно неолитическое население этих мест, поэтому никакой миграции на запад в эти времена быть у них не могло (поэтому и считают что они жили в Центральной Франции тоже, вроде как преемственность археологических культур наблюдается).
Баски и есть бикеры по папам по крайней мере  ;D

Не исключено, но видимо позднее. Судя по всему это кельтские бастарды после того как их кельты выбили из Центральной Франции. А может даже латиняне постарались еще. Явно баски прошли бутылочное горлышко, только так можно объяснить их генетику с достаточно молодым субкладом R1b, но древними компонентами. А это бутылочное горлышко можно объяснить только выбиванием их из Центральной Франции. Бикеры их не выбивали, они их просто обошли.


Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5871
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2127/-12
  • мтДНК: H1b
Re: дДНК из Ирландии - неолит и бронзовый век
« Ответ #144 : 12 Январь 2016, 12:13:55 »
В теме что-то давно нет ничего по сабжу. Оффтоп перенесен в Беседку: http://forum.molgen.org/index.php/topic,8468.450.html

Оффлайн Vernyj

  • Сообщений: 1498
  • Страна: 00
  • Рейтинг +202/-75
Re: дДНК из Ирландии - неолит и бронзовый век
« Ответ #145 : 16 Январь 2016, 17:56:57 »
Ну наконец-то эту статью прописали на генофонде http://генофонд.рф/?page_id=6773

Кстати, из их связи с Причерноморьем, как обычно утверждается на западе, однако никак не следует что ген лактозной толлерантности и болезнь гемахроматоз пришли из Причерноморья, как написано здесь http://lenta.ru/news/2015/12/29/irishgenome/ . Это не следует из ничего, чистая логическая ошибка.

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 6161
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2823/-2
  • Y-ДНК: N-L1025*
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: дДНК из Ирландии - неолит и бронзовый век
« Ответ #146 : 17 Январь 2016, 21:03:39 »
Ballynahatty на Gedmatch: M427312

Длинные сегменты (обычно нормирую, чтобы максимум был красным, но здесь взял те же настройки, что у Rathlin1 для сравнения):


Короткие сегменты:


Предковые компоненты по К27:
  0.31%  Nilotic-Omotic     
  0.00%  Ancestral-South-Ind.
 10.84%  North-European-Balt.
  0.00%  Uralic             
  0.15%  Australo-Melanesian
  0.00%  East-Siberian       
  1.75%  Ancestral-Yayoi     
 21.16%  Caucasian-Near-East.
  0.01%  Tibeto-Burman       
  0.04%  Austronesian       
  0.38%  Central-African-Pygm
  0.00%  Central-African-HG 
  0.00%  Nilo-Saharian       
  5.52%  North-African       
  0.00%  Gedrosia-Caucasian 
  0.40%  Cushitic           
  0.00%  Congo-Pygmean       
  0.00%  Bushmen             
  0.00%  South-Meso-Amerind.
 56.77%  South-West-European
  0.26%  North-Amerindian   
  1.65%  Arabic             
  0.00%  North-Circumpolar   
  0.00%  Kalash             
  0.00%  Papuan-Australian   
  0.00%  Baltic-Finnic       
  0.77%  Bantu

Палеооракул:
Using 1 population approximation:
1 European_Neolithic_Farmers_Spain_Late @ 8,80718
2 European_Neolithic_Farmers_Center_Late @ 15,983139
3 European_Neolithic_Farmers_Spain @ 16,997405
4 European_Neolithic_Farmers-LBK @ 23,569177
5 Bronze_Age_Hungary @ 37,962439
6 Bell-Beaker @ 39,761253
7 Unetice @ 47,629005
8 Corded_Ware_North_Baltic @ 47,73956
9 Sintashta @ 52,793992
10 Srubnaya-Andronovo @ 56,515973
11 Western_Hunter-Gatherers @ 56,609796
12 Corded_Ware_Germany @ 57,360974
13 Mezhovskaya @ 57,381079
14 Karasuk @ 63,96317
15 Yamnaya-Poltavka @ 75,53186
16 Afanasyevo @ 78,015182
17 Caucasus_Hunter-Gatherers @ 78,529077
18 Eastern_Hunter-Gatherers @ 79,440882
19 Karasuk_497 @ 80,563973
19 iterations.

Using 2 populations approximation:
1 European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Center_Late @ 7,909065
2 European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late @ 8,80718
3 European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late @ 11,344623
4 European_Neolithic_Farmers-LBK+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late @ 11,889653
5 European_Neolithic_Farmers_Spain+Bell-Beaker @ 13,756757
6 European_Neolithic_Farmers_Spain+Bronze_Age_Hungary @ 14,605929
7 European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Center_Late @ 14,909815
8 European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+Bronze_Age_Hungary @ 15,522596
9 European_Neolithic_Farmers_Center_Late+European_Neolithic_Farmers_Center_Late @ 15,983139
10 European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain @ 16,997405
11 European_Neolithic_Farmers_Spain+Corded_Ware_North_Baltic @ 17,285359
12 European_Neolithic_Farmers_Spain+Unetice @ 17,349783
13 European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+Bell-Beaker @ 17,640606
14 European_Neolithic_Farmers-LBK+Bell-Beaker @ 17,792776
15 European_Neolithic_Farmers-LBK+European_Neolithic_Farmers_Spain @ 19,047078
16 European_Neolithic_Farmers_Center_Late+Bell-Beaker @ 19,133399
17 European_Neolithic_Farmers-LBK+European_Neolithic_Farmers_Center_Late @ 19,633944
18 European_Neolithic_Farmers_Spain+Sintashta @ 19,967679
19 European_Neolithic_Farmers-LBK+Bronze_Age_Hungary @ 21,102478
190 iterations.

Using 3 populations approximation:
1 50% European_Neolithic_Farmers_Spain_Late +25% European_Neolithic_Farmers_Spain +25% Bronze_Age_Hungary @ 4,679926
2 50% European_Neolithic_Farmers_Spain +25% European_Neolithic_Farmers_Spain_Late +25% Bell-Beaker @ 5,427403
3 50% European_Neolithic_Farmers_Spain_Late +25% European_Neolithic_Farmers_Spain_Late +25% Bronze_Age_Hungary @ 5,445853
4 50% European_Neolithic_Farmers_Spain +25% European_Neolithic_Farmers_Spain_Late +25% Corded_Ware_North_Baltic @ 5,632584
5 50% European_Neolithic_Farmers_Spain +25% European_Neolithic_Farmers_Spain_Late +25% Unetice @ 5,758275
6 50% European_Neolithic_Farmers_Spain_Late +25% European_Neolithic_Farmers_Spain +25% Bell-Beaker @ 5,790008
7 50% European_Neolithic_Farmers_Spain_Late +25% European_Neolithic_Farmers-LBK +25% Bell-Beaker @ 6,193966
8 50% European_Neolithic_Farmers_Spain +25% European_Neolithic_Farmers_Spain_Late +25% Bronze_Age_Hungary @ 6,435481
9 50% European_Neolithic_Farmers_Spain_Late +25% European_Neolithic_Farmers_Spain +25% Unetice @ 6,561013
10 50% European_Neolithic_Farmers_Spain_Late +25% European_Neolithic_Farmers_Spain +25% Corded_Ware_North_Baltic @ 6,570759
11 50% European_Neolithic_Farmers_Spain_Late +25% European_Neolithic_Farmers_Spain_Late +25% European_Neolithic_Farmers_Center_Late @ 6,638508
12 50% European_Neolithic_Farmers_Spain +25% European_Neolithic_Farmers_Spain_Late +25% Sintashta @ 6,670707
13 50% European_Neolithic_Farmers_Spain +25% European_Neolithic_Farmers_Spain +25% Corded_Ware_North_Baltic @ 6,895392
14 50% European_Neolithic_Farmers_Spain_Late +25% European_Neolithic_Farmers_Center_Late +25% Bell-Beaker @ 6,988679
15 50% European_Neolithic_Farmers_Spain +25% European_Neolithic_Farmers_Spain +25% Unetice @ 7,109001
16 50% European_Neolithic_Farmers_Spain +25% Western_Hunter-Gatherers +25% European_Neolithic_Farmers_Spain_Late @ 7,188097
17 50% European_Neolithic_Farmers_Spain_Late +25% European_Neolithic_Farmers_Center_Late +25% Bronze_Age_Hungary @ 7,227895
18 50% European_Neolithic_Farmers_Spain +25% European_Neolithic_Farmers_Spain +25% Bell-Beaker @ 7,25662
19 50% European_Neolithic_Farmers_Spain_Late +25% European_Neolithic_Farmers-LBK +25% Bronze_Age_Hungary @ 7,273545
3056 iterations.

Using 4 populations approximation:
1 European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+Bronze_Age_Hungary @ 4,679926
2 European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+Bell-Beaker @ 5,427403
3 European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+Bronze_Age_Hungary @ 5,445853
4 European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+Corded_Ware_North_Baltic @ 5,632584
5 European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+Unetice @ 5,758275
6 European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+Bell-Beaker @ 5,790008
7 European_Neolithic_Farmers-LBK+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+Bell-Beaker @ 6,193966
8 European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+Bronze_Age_Hungary @ 6,435481
9 European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+Unetice @ 6,561013
10 European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+Corded_Ware_North_Baltic @ 6,570759
11 European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Center_Late @ 6,638508
12 European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+Sintashta @ 6,670707
13 European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Center_Late+Bell-Beaker @ 6,682712
14 European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain+Corded_Ware_North_Baltic @ 6,895392
15 European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Center_Late+Bell-Beaker @ 6,988679
16 European_Neolithic_Farmers-LBK+European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+Bell-Beaker @ 7,04285
17 European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain+Unetice @ 7,109001
18 Western_Hunter-Gatherers+European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late @ 7,188097
19 European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Center_Late+Bronze_Age_Hungary @ 7,227895
20 European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain+Bell-Beaker @ 7,25662
21 European_Neolithic_Farmers-LBK+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+Bronze_Age_Hungary @ 7,273545
22 European_Neolithic_Farmers-LBK+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+Corded_Ware_North_Baltic @ 7,523831
23 European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+Sintashta @ 7,569255
24 European_Neolithic_Farmers-LBK+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+Unetice @ 7,602173
25 Western_Hunter-Gatherers+European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain @ 7,667675
26 European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain+Sintashta @ 7,679347
27 European_Neolithic_Farmers-LBK+European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+Corded_Ware_North_Baltic @ 7,775806
28 European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Center_Late+Corded_Ware_North_Baltic @ 7,869323
29 European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Center_Late+European_Neolithic_Farmers_Center_Late @ 7,909065
30 European_Neolithic_Farmers-LBK+European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+Unetice @ 7,950339
31 European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Center_Late+Unetice @ 7,998612
32 European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+Bell-Beaker @ 8,053632
33 European_Neolithic_Farmers-LBK+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late @ 8,103828
34 European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Center_Late+Bell-Beaker @ 8,230733
35 European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Center_Late+Bronze_Age_Hungary @ 8,464081
36 European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+Srubnaya-Andronovo @ 8,464311
37 Western_Hunter-Gatherers+European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late @ 8,474287
38 European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain+European_Neolithic_Farmers_Spain_Late+Corded_Ware_Germany @ 8,564766

Современный оракул:
Using 1 population approximation:
1 Spanish_North_R2 @ 22,002428
2 French_R1 @ 32,169072
3 English_R2 @ 37,333916
4 Irish_Scottish_R2 @ 37,881843
5 German_R3 @ 38,434667
6 Sicilian_R3 @ 38,798651
7 Ashkenazi_R3 @ 40,771511
8 Greek_R1 @ 41,296474
9 Norwegian_R4 @ 42,909521
10 Bulgarian_S14 @ 43,485815
11 Serbian_R1 @ 44,114781
12 Romanian_D @ 45,380244
13 Croatian_S11 @ 47,099267
14 Moldavian_S3 @ 48,536021
15 Carpathian_R1 @ 49,062985
16 Slovak_D @ 51,112786
17 Turkish_R7 @ 55,049579
18 Ukrainian_West_R2 @ 55,713619
19 Tatar_Kazan_Apastovskiy_R4 @ 56,475009
20 Tatar_Kazan_Kaybitskiy_R3 @ 56,485589
21 Ukrainian_R2 @ 57,413478
22 Tatar_Mishar_West_R3 @ 57,44695
23 Tatar_Kryashen_S3 @ 57,713179
24 Tatar_Mishar_Bashkiria_R4 @ 58,07632
25 Nogay_DR1 @ 58,270278
26 Armenian_Lebanon_S39 @ 58,753117
27 Tatar_Kazan_Tarhanovskiy_R5 @ 58,839733
28 Tatar_Mishar_Drozzhanovskiy_R3 @ 59,163646
29 Polish_S13 @ 59,309284
30 Tatar_Kazan_Zelenodolskiy_R3 @ 59,59339
31 Tatar_Ural_R6 @ 59,723256
32 Armenian_S76 @ 59,90164
33 Ukrainian_East_R4 @ 60,272703
34 Belarusian_SW_R2 @ 60,354042
35 Greek_Tsalka_R3 @ 60,382777
36 Pontus_R4 @ 60,830611
37 Russian_South_West_R7 @ 61,01039
38 Russian_South_R3 @ 61,015963
39 Bashkir_R2 @ 61,016514
40 Karachay_R3 @ 61,369949
41 Moksha_R3 @ 61,610624
42 Balkar_R4 @ 61,6198
43 Russian_Perm_R6 @ 61,65645
44 Kumyk_S3 @ 61,778577
45 Chuvash_Anatri_R2 @ 62,048699
46 Erzya_R4 @ 62,283954
47 Russian_Center @ 62,355364
48 Ossetian_R4 @ 62,589565
49 Russian_Meshtchyora_R5 @ 62,767003
50 Udmurt_R1 @ 62,906594
93 iterations.

Using 2 populations approximation:
1 Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 22,002428
2 French_R1+Spanish_North_R2 @ 26,761845
3 Sicilian_R3+Spanish_North_R2 @ 28,700726
4 English_R2+Spanish_North_R2 @ 29,207628
5 Irish_Scottish_R2+Spanish_North_R2 @ 29,228022
6 Ashkenazi_R3+Spanish_North_R2 @ 29,764404
7 German_R3+Spanish_North_R2 @ 29,955029
8 Greek_R1+Spanish_North_R2 @ 30,646173
9 Norwegian_R4+Spanish_North_R2 @ 31,868071
10 French_R1+Sicilian_R3 @ 32,11452
11 French_R1+French_R1 @ 32,169072
12 Bulgarian_S14+Spanish_North_R2 @ 32,207347
13 Serbian_R1+Spanish_North_R2 @ 32,395487
14 Irish_Scottish_R2+Sicilian_R3 @ 32,89385
15 Romanian_D+Spanish_North_R2 @ 33,056573
16 Ashkenazi_R3+French_R1 @ 33,262406
17 English_R2+Sicilian_R3 @ 33,622796
18 Croatian_S11+Spanish_North_R2 @ 34,015301
19 Ashkenazi_R3+Irish_Scottish_R2 @ 34,039151
20 English_R2+French_R1 @ 34,692004
21 Ashkenazi_R3+English_R2 @ 34,795029
22 French_R1+Irish_Scottish_R2 @ 34,822681
23 Moldavian_S3+Spanish_North_R2 @ 34,880812
24 Carpathian_R1+Spanish_North_R2 @ 34,905264
25 French_R1+Greek_R1 @ 34,910899
26 French_R1+German_R3 @ 35,247239
27 German_R3+Sicilian_R3 @ 35,292106
28 Norwegian_R4+Sicilian_R3 @ 35,605739
29 Slovak_D+Spanish_North_R2 @ 36,047638
30 Greek_R1+Irish_Scottish_R2 @ 36,116939
31 Ashkenazi_R3+German_R3 @ 36,464535
32 Spanish_North_R2+Turkish_R7 @ 36,692364
33 English_R2+Greek_R1 @ 36,728327
34 Ashkenazi_R3+Norwegian_R4 @ 36,787775
35 Bulgarian_S14+French_R1 @ 36,923572
36 French_R1+Serbian_R1 @ 37,230988
37 English_R2+English_R2 @ 37,333916
38 French_R1+Norwegian_R4 @ 37,342197
39 English_R2+Irish_Scottish_R2 @ 37,527641
40 French_R1+Romanian_D @ 37,558193
41 Armenian_Lebanon_S39+Spanish_North_R2 @ 37,590501
42 English_R2+German_R3 @ 37,774316
43 German_R3+Irish_Scottish_R2 @ 37,826
44 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2 @ 37,881843
45 German_R3+Greek_R1 @ 38,11616
46 Spanish_North_R2+Ukrainian_West_R2 @ 38,318261
47 Armenian_S76+Spanish_North_R2 @ 38,379565
48 Pontus_R4+Spanish_North_R2 @ 38,406561
49 German_R3+German_R3 @ 38,434667
50 Greek_Tsalka_R3+Spanish_North_R2 @ 38,439077
4371 iterations.

Using 3 populations approximation:
1 50% Spanish_North_R2 +25% Spanish_North_R2 +25% Spanish_North_R2 @ 22,002428
2 50% Spanish_North_R2 +25% French_R1 +25% Spanish_North_R2 @ 24,276144
3 50% Spanish_North_R2 +25% Sicilian_R3 +25% Spanish_North_R2 @ 24,721891
4 50% Spanish_North_R2 +25% Ashkenazi_R3 +25% Spanish_North_R2 @ 25,26243
5 50% Spanish_North_R2 +25% Irish_Scottish_R2 +25% Spanish_North_R2 @ 25,354856
6 50% Spanish_North_R2 +25% English_R2 +25% Spanish_North_R2 @ 25,438682
7 50% Spanish_North_R2 +25% German_R3 +25% Spanish_North_R2 @ 25,881749
8 50% Spanish_North_R2 +25% Greek_R1 +25% Spanish_North_R2 @ 25,937543
9 50% Spanish_North_R2 +25% French_R1 +25% Sicilian_R3 @ 26,651014
10 50% Spanish_North_R2 +25% Norwegian_R4 +25% Spanish_North_R2 @ 26,703318
11 50% Spanish_North_R2 +25% Bulgarian_S14 +25% Spanish_North_R2 @ 26,891411
12 50% Spanish_North_R2 +25% Serbian_R1 +25% Spanish_North_R2 @ 26,932815
13 50% Spanish_North_R2 +25% Ashkenazi_R3 +25% French_R1 @ 27,2123
14 50% Spanish_North_R2 +25% Irish_Scottish_R2 +25% Sicilian_R3 @ 27,238936
15 50% Spanish_North_R2 +25% Romanian_D +25% Spanish_North_R2 @ 27,27035
16 50% Spanish_North_R2 +25% English_R2 +25% Sicilian_R3 @ 27,543368
17 50% Spanish_North_R2 +25% Croatian_S11 +25% Spanish_North_R2 @ 27,785391
18 50% Spanish_North_R2 +25% Ashkenazi_R3 +25% Irish_Scottish_R2 @ 27,795606
19 50% Spanish_North_R2 +25% French_R1 +25% Irish_Scottish_R2 @ 27,922324
20 50% Spanish_North_R2 +25% English_R2 +25% French_R1 @ 27,963206
21 50% Spanish_North_R2 +25% French_R1 +25% Greek_R1 @ 28,104338
22 50% Spanish_North_R2 +25% Ashkenazi_R3 +25% English_R2 @ 28,109767
23 50% Spanish_North_R2 +25% Carpathian_R1 +25% Spanish_North_R2 @ 28,185566
24 50% Spanish_North_R2 +25% German_R3 +25% Sicilian_R3 @ 28,268022
25 50% Spanish_North_R2 +25% Moldavian_S3 +25% Spanish_North_R2 @ 28,27676
26 50% Spanish_North_R2 +25% French_R1 +25% German_R3 @ 28,343128
27 50% Spanish_North_R2 +25% Armenian_Lebanon_S39 +25% Spanish_North_R2 @ 28,457571
28 50% Spanish_North_R2 +25% Spanish_North_R2 +25% Turkish_R7 @ 28,504039
29 50% Spanish_North_R2 +25% Norwegian_R4 +25% Sicilian_R3 @ 28,605501
30 50% Spanish_North_R2 +25% Pontus_R4 +25% Spanish_North_R2 @ 28,727907
31 50% Spanish_North_R2 +25% Slovak_D +25% Spanish_North_R2 @ 28,801902
32 50% Spanish_North_R2 +25% Greek_R1 +25% Irish_Scottish_R2 @ 28,814697
33 50% French_R1 +25% Sicilian_R3 +25% Spanish_North_R2 @ 28,827453
34 50% Spanish_North_R2 +25% Ashkenazi_R3 +25% German_R3 @ 28,837213
35 50% Spanish_North_R2 +25% Greek_Tsalka_R3 +25% Spanish_North_R2 @ 28,878229
36 50% Spanish_North_R2 +25% Armenian_S76 +25% Spanish_North_R2 @ 28,944041
37 50% Spanish_North_R2 +25% English_R2 +25% Greek_R1 @ 29,085679
38 50% Spanish_North_R2 +25% Ashkenazi_R3 +25% Norwegian_R4 @ 29,174288
39 50% Spanish_North_R2 +25% Bulgarian_S14 +25% French_R1 @ 29,186626
40 50% Spanish_North_R2 +25% English_R2 +25% Irish_Scottish_R2 @ 29,191701
41 50% Spanish_North_R2 +25% Ashkenazi_R3 +25% Sicilian_R3 @ 29,224732
42 50% Spanish_North_R2 +25% French_R1 +25% Norwegian_R4 @ 29,240136
43 50% Spanish_North_R2 +25% French_R1 +25% Serbian_R1 @ 29,270261
44 50% French_R1 +25% Ashkenazi_R3 +25% Spanish_North_R2 @ 29,401855
45 50% French_R1 +25% French_R1 +25% Spanish_North_R2 @ 29,405822
46 50% Spanish_North_R2 +25% German_R3 +25% Irish_Scottish_R2 @ 29,486605
47 50% Spanish_North_R2 +25% French_R1 +25% Romanian_D @ 29,501596
48 50% Spanish_North_R2 +25% Greek_R1 +25% Sicilian_R3 @ 29,521209
49 50% Spanish_North_R2 +25% English_R2 +25% German_R3 @ 29,547229
50 50% Spanish_North_R2 +25% German_R3 +25% Greek_R1 @ 29,725889
397947 iterations.

Using 4 populations approximation:
1 Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 22,002428
2 French_R1+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 24,276144
3 Sicilian_R3+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 24,721891
4 Ashkenazi_R3+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 25,26243
5 Irish_Scottish_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 25,354856
6 English_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 25,438682
7 German_R3+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 25,881749
8 Greek_R1+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 25,937543
9 French_R1+Sicilian_R3+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 26,651014
10 Norwegian_R4+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 26,703318
11 French_R1+French_R1+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 26,761845
12 Bulgarian_S14+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 26,891411
13 Serbian_R1+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 26,932815
14 Ashkenazi_R3+French_R1+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 27,2123
15 Irish_Scottish_R2+Sicilian_R3+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 27,238936
16 Romanian_D+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 27,27035
17 English_R2+Sicilian_R3+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 27,543368
18 Croatian_S11+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 27,785391
19 Ashkenazi_R3+Irish_Scottish_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 27,795606
20 French_R1+Irish_Scottish_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 27,922324
21 English_R2+French_R1+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 27,963206
22 French_R1+Greek_R1+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 28,104338
23 Ashkenazi_R3+English_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 28,109767
24 Carpathian_R1+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 28,185566
25 German_R3+Sicilian_R3+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 28,268022
26 Moldavian_S3+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 28,27676
27 French_R1+German_R3+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 28,343128
28 Armenian_Lebanon_S39+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 28,457571
29 Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Turkish_R7 @ 28,504039
30 Norwegian_R4+Sicilian_R3+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 28,605501
31 Sicilian_R3+Sicilian_R3+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 28,700726
32 Pontus_R4+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 28,727907
33 Slovak_D+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 28,801902
34 Greek_R1+Irish_Scottish_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 28,814697
35 French_R1+French_R1+Sicilian_R3+Spanish_North_R2 @ 28,827453
36 Ashkenazi_R3+German_R3+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 28,837213
37 Greek_Tsalka_R3+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 28,878229
38 Armenian_S76+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 28,944041
39 English_R2+Greek_R1+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 29,085679
40 Ashkenazi_R3+Norwegian_R4+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 29,174288
41 Bulgarian_S14+French_R1+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 29,186626
42 English_R2+Irish_Scottish_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 29,191701
43 English_R2+English_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 29,207628
44 Ashkenazi_R3+Sicilian_R3+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 29,224732
45 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 29,228022
46 French_R1+Norwegian_R4+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 29,240136
47 French_R1+Serbian_R1+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 29,270261
48 Ashkenazi_R3+French_R1+French_R1+Spanish_North_R2 @ 29,401855
49 French_R1+French_R1+French_R1+Spanish_North_R2 @ 29,405822
50 German_R3+Irish_Scottish_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 29,486605
51 French_R1+Romanian_D+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 29,501596
52 Greek_R1+Sicilian_R3+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 29,521209
53 French_R1+Irish_Scottish_R2+Sicilian_R3+Spanish_North_R2 @ 29,540267
54 English_R2+German_R3+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 29,547229
55 German_R3+Greek_R1+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 29,725889
56 Ashkenazi_R3+Ashkenazi_R3+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 29,764404
57 English_R2+French_R1+Sicilian_R3+Spanish_North_R2 @ 29,788115
58 Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Ukrainian_West_R2 @ 29,912473
59 German_R3+German_R3+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 29,955029
60 Bulgarian_S14+Sicilian_R3+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 30,013714
61 Serbian_R1+Sicilian_R3+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 30,024434
62 Bulgarian_S14+Irish_Scottish_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 30,039058
63 Georgian_Kaheti_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 30,08076
64 Ashkenazi_R3+Greek_R1+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 30,085494
65 Ashkenazi_R3+French_R1+Irish_Scottish_R2+Spanish_North_R2 @ 30,107768
66 Nogay_DR1+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 30,12
67 Irish_Scottish_R2+Serbian_R1+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 30,126267
68 Armenian_Lebanon_S39+French_R1+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 30,151316
69 Greek_R1+Norwegian_R4+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 30,198839
70 Karachay_R3+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 30,2033
71 Croatian_S11+French_R1+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 30,214963
72 Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Ukrainian_R2 @ 30,23983
73 Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Tatar_Kazan_Apastovskiy_R4 @ 30,255631
74 Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Tatar_Kazan_Kaybitskiy_R3 @ 30,256206
75 Bulgarian_S14+English_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 30,258472
76 Balkar_R4+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 30,262619
77 French_R1+Sicilian_R3+Sicilian_R3+Spanish_North_R2 @ 30,277329
78 Irish_Scottish_R2+Romanian_D+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 30,293784
79 Ossetian_R4+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 30,318524
80 French_R1+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Turkish_R7 @ 30,342075
81 English_R2+Serbian_R1+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 30,347037
82 Ashkenazi_R3+English_R2+French_R1+Spanish_North_R2 @ 30,365572
83 Kurdish_D+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 30,414954
84 Irish_Scottish_R2+Irish_Scottish_R2+Sicilian_R3+Spanish_North_R2 @ 30,420288
85 French_R1+Pontus_R4+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 30,428558
86 French_R1+German_R3+Sicilian_R3+Spanish_North_R2 @ 30,437301
87 Irish_Scottish_R2+Sicilian_R3+Sicilian_R3+Spanish_North_R2 @ 30,439205
88 Croatian_S11+Sicilian_R3+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 30,463063
89 Armenian_Lebanon_S39+Irish_Scottish_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 30,465993
90 French_R1+French_R1+Greek_R1+Spanish_North_R2 @ 30,472813
91 English_R2+Norwegian_R4+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 30,518773
92 Irish_Scottish_R2+Norwegian_R4+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 30,521572
93 English_R2+Romanian_D+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 30,540742
94 Romanian_D+Sicilian_R3+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 30,541701
95 Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Tatar_Mishar_West_R3 @ 30,564545
96 English_R2+Irish_Scottish_R2+Sicilian_R3+Spanish_North_R2 @ 30,58908
97 Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Tatar_Kryashen_S3 @ 30,594854
98 Ashkenazi_R3+Bulgarian_S14+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 30,597578
99 Polish_S13+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 30,601355
100 French_R1+Greek_Tsalka_R3+Spanish_North_R2+Spanish_North_R2 @ 30,612361
3321960 iterations.

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10574
  • Страна: ee
  • Рейтинг +757/-8
Re: дДНК из Ирландии - неолит и бронзовый век
« Ответ #147 : 19 Январь 2016, 23:24:10 »
Сергей, а как Вы решили проблему с диплоидностью геномов? В сапплементе пишут, что они использовали в GATK вместо UnifiedGenotyper опцию Pileup, но если на определение генотипов у BA64 с помощью Unified Genotyper требуется примерно 52 часа, то в Pileup на это уже уйдет 5 дней. Я почти довел до конца эту операцию, но на диске сервера в последний момент закончилось место  :( , из-за чего 200 гигобатный vcf урезался (plink его не хочет принимать) .  Кроме того, непонятно, как в случае с pileup производить конвертацию в формат Plink.
И еще - Вы пользовались программой MapDamage? 


 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100