АвторТема: A accurate genetic clock  (Прочитано 1112 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн NimissinАвтор темы

  • Сообщений: 2356
  • Рейтинг +731/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b12a
A accurate genetic clock
« : 20 Май 2015, 05:26:41 »
Еще один метод расчета TMRCA. На мой взгляд - интересная работа. Я сам в 2008-2009 годах изучал влияние асимметрии мутаций на оценку возраста. Ветвящийся процесс Гальтона-Ватсона мы с Сергеем Каржавиным моделировали в 2010 году.
Жаль, работа запоздала. Сейчас все боковые ветви можно выделить по данным полного секвенирования игрек-хромосомы. Для каждого субклада, определяемого собственными снипами, возраст можно считать более простыми методами.

http://biorxiv.org/content/early/2015/05/18/019414

Abstract

Molecular clocks give ``Time to most recent common ancestor'' TMRCA} of genetic trees. By Watson-Galton most lineages terminate, with a few overrepresented singular lineages generated by W. Hamilton's ``kin selection''. Applying current methods to this non-uniform branching produces greatly exaggerated TMRCA. We introduce an inhomogenous stochastic process which detects singular lineages by asymmetries, whose reduction gives true TMRCA. This implies a new method for computing mutation rates. Despite low rates similar to mitosis data, reduction implies younger TMRCA, with smaller errors. We establish accuracy by a comparison across a wide range of time, indeed this is only clock giving consistent results for both short and long term times. In particular we show that the dominant European y-haplotypes R1a1a & R1b1a2, expand from c3700BC, not reaching Anatolia before c3300BC. While this contradicts current clocks which date R1b1a2 to either the Neolithic Near East$ or Paleo-Europe, our dates support recent genetic analysis of ancient skeletons by Reich.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.