Deep Phylogenetic Analysis of Haplogroup G1

[Nimissin]

Наконец, опубликована статья по гаплогруппе G1, включая ценные данные по казахам-аргынам.

http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0122968

Deep Phylogenetic Analysis of Haplogroup G1 Provides Estimates of SNP and STR Mutation Rates on the Human Y-Chromosome and Reveals Migrations of Iranic Speakers

Abstract

Y-chromosomal haplogroup G1 is a minor component of the overall gene pool of South-West and Central Asia but reaches up to 80% frequency in some populations scattered within this area. We have genotyped the G1-defining marker M285 in 27 Eurasian populations (n= 5,346), analyzed 367 M285-positive samples using 17 Y-STRs, and sequenced ~11 Mb of the Y-chromosome in 20 of these samples to an average coverage of 67X. This allowed detailed phylogenetic reconstruction. We identified five branches, all with high geographical specificity: G1-L1323 in Kazakhs, the closely related G1-GG1 in Mongols, G1-GG265 in Armenians and its distant brother clade G1-GG162 in Bashkirs, and G1-GG362 in West Indians. The haplotype diversity, which decreased from West Iran to Central Asia, allows us to hypothesize that this rare haplogroup could have been carried by the expansion of Iranic speakers northwards to the Eurasian steppe and via founder effects became a predominant genetic component of some populations, including the Argyn tribe of the Kazakhs. The remarkable agreement between genetic and genealogical trees of Argyns allowed us to calibrate the molecular clock using a historical date (1405 AD) of the most recent common genealogical ancestor. The mutation rate for Y-chromosomal sequence data obtained was 0.78×10-9 per bp per year, falling within the range of published rates. The mutation rate for Y-chromosomal STRs was 0.0022 per locus per generation, very close to the so-called genealogical rate. The “clan-based” approach to estimating the mutation rate provides a third, middle way between direct farther-to-son comparisons and using archeologically known migrations, whose dates are subject to revision and of uncertain relationship to genetic events.

Статья написана на самом современном уровне. Поздравления всем авторам с отличной работой!

[Murzalar]

Очень интересная статья.Вот вам и и днк и канглы-кангары-печенеги.
Удивило вот это  "Армянские и башкирские кластеры имеют общего предка в дереве, в то время как казахский кластера и Индийский кластера (описано ниже) образуют самостоятельные ветви"
Я почему то думал наши G1 родня Аргынам,а оно вот как получается.

[asan-kaygy]

Дмитрий огромное спасибо за ссылку.

[Nimissin]

Напомню уважаемым форумчанам, что в 2013 году наш asan-kaygy опубликовал работу "Этногенез казахов с точки зрения популяционной генетики"
http://rjgg.molgen.org/index.php/RJGGRE/article/view/129/147

Возраст рода аргын был определен по 63 STR маркерам, как 840 +/- 270 лет. Сколько потом было нападок на asan-kaygy! Что этого не может быть, не может единый предок жить всего лишь 800 лет назад. И расчеты возраста неверны, и исторические данные неправильно интерпретируются и т.д. и т.п.
Прогресс в инструментах генетических исследований таков, что генеалогические деревья строятся с невиданной ранее точностью, без всяких документов. В случае аргынов генетическое генеалогическое дерево полностью совпало с устным шежире. Причем уточненный возраст генеалогии аргынов стал еще моложе: 627 +/- 110 лет.
Полагаю, что результаты работы убедительно продемонстрировали замечательные возможности ДНК-генеалогии, как способа генеалогических исследований.

[asan-kaygy]

Спасибо за столь теплые слова, надеюсь каждый род получит в среднем по 10 Биг У