J2a-PF5197

[248446]

Готово апгрейд до 37 маркеров 627762 Usmangil - стала более очевидной его принадлежность к J2a-PF5177(xPF5252,PF7421) cluster B. Добавил его на карту PF5174

Спасибо! Интересно, что это за ветка, судя по всеми очень малочисленная?
Есть ли какое-нибудь описание к ней?
Приближенцы к Усмангилю, вероятное место зарождение?

[mikhail a.]

Около полугода назад выкладывал схему арабской ветки PF5174>S19231>S25338 http://forum.molgen.org/index.php/topic,7979.msg356216.html#msg356216
Наконец-то они созрели до того, чтобы отправить свои результаты в YFull. Теперь на дереве их уже 6 штук. Кто из них кто можно только догадываться,  но скорее всего схема ветки должна на данный момент выглядеть следующим образом:

[mikhail a.]

В дополнение к массовому приобщению арабов J2a-S25338 к YFull (см. предыдущий пост) ветка PF5174>S19231 продолжает радовать новостями:
Во-первых, появился новый увесистый 111-маркерный гаплотип - 676119, судя по имени, пакистанский сеид. Очевидно, он принадлежит к ветке  PF5174>S19231>S25338>Z6091. Снипы (надеюсь, пока) не протестированы.
Кроме 676119, в данном кластере также уже находятся два индуса, пакистанец из Белуджистана, иранец из Мазендерана, арабы из Ирака и саудит.
Во-вторых, на дереве YFull неожиданно появился новый образец PF5174>S19231>S25338>Z6083>Z6082>Z6091 https://www.yfull.com/tree/J-Z6088/
Откуда он взялся - понятия не имею, так как мне не известен ни один БигУ Z6091. Это будет первый коммерческий образец на дереве под Z6082 .

[mikhail a.]

Несколько новых результатов проекта PJ2a-F5197:
- итальянец 570784 по результатам снип-пака ожидаемо оказался  PF5197>PF5172>PF5169>PF5174>PF5177*. Таким образом он стал вторым образцом, после N115337 Burney, который просниповался в PF5177* cluster B. Пока ни одно БигУ там нет;
- саудит из Мекки 216152 протестировал очередной снип, подтвердив предикцию PF5197>PF5172>PF5169>PF5174>S19231>Z7366 Вместо того, чтобы проверить только конечный предиктованный снип или сразу шарахнуть БигУ, последовательно тестировал все снипы "от Адама", доведя таким образом общее количество протестированных снипов до 21(!). Результат важный, так как гаплотип не совсем классический для своей ветки и будет служить ориентиром на будущее (например,ближайшего к нему латино-американского (сефардского) кластера);
- пришли результаты снип-пака M12044 Saif Jasim из ветки  PF5197>YSC0000253>YSC0000246>SK1396 из кластера, в котором кроне него еще 2 человека из ОАЭ и 1 из Омана. Было очевидно, что этот кластер YSC0000246+, но все же это первое протестированное подтверждение принадлежности этой аравийской четверки;
- не совсем новость, так как уже обсуждалось на форму, но тем не менее добавлю в общую копилку: 546300 Abramyan подтвердил PF5197>PF5172>PF5169>PF5174>PF5177>PF5252. Итого теперь имеется 5 коммерческих образцов с подтвержденным PF5252+

[mikhail a.]

Татарин J-YSC0000246 из научной работы The first horse herders and the impact of early Bronze Age steppe expansions into Asia размещён на дереве YFull под номером ERS2478539. Уже существуют татарские образцы из этой ветки, но пока ни одного коммерческого полного сиквенса игрека не было. Так что - очень полезный экземпляр.

[Апти]

Татарин J-YSC0000246 из научной работы The first horse herders and the impact of early Bronze Age steppe expansions into Asia размещён на дереве YFull под номером ERS2478539. Уже существуют татарские образцы из этой ветки, но пока ни одного коммерческого полного сиквенса игрека не было. Так что - очень полезный экземпляр.

Здравствуйте Михаил!
А вы знаете этот id:ERS1789499 https://www.yfull.com/tree/J-PF5366*/ откуда?

[mikhail a.]

Татарин J-YSC0000246 из научной работы The first horse herders and the impact of early Bronze Age steppe expansions into Asia размещён на дереве YFull под номером ERS2478539. Уже существуют татарские образцы из этой ветки, но пока ни одного коммерческого полного сиквенса игрека не было. Так что - очень полезный экземпляр.

Здравствуйте Михаил!
А вы знаете этот id:ERS1789499 https://www.yfull.com/tree/J-PF5366*/ откуда?

Здравствуйте Апти! Точно не знаю, но есть подозрения, что из той же статьи и, возможно, что дДНК.

[Апти]

Здравствуйте Апти! Точно не знаю, но есть подозрения, что из той же статьи и, возможно, что дДНК.

Спасибо Михаил. Мне везде майкопцы мерещатся)

[mikhail a.]

Теперь и у нас в ветке сеть свой китаец Подветвь чисто садудовская. Общий предок глубиной в 2 тысячи лет не даёт выстроить какую-либо логическую конструкцию, которая бы объединила  Аравийский полуостров и Шандунь.

[Yaroslav]

Общий предок глубиной в 2 тысячи лет не даёт выстроить какую-либо логическую конструкцию, которая бы объединила  Аравийский полуостров и Шандунь.

Первое, что пришло на память.

Потом ещё и вот это вспомнилось.

Не говоря уже о самом банальнейшем.

Так что, варианты всё-таки есть

[mikhail a.]

Первое, что пришло на память.

Потом ещё и вот это вспомнилось.

Не говоря уже о самом банальнейшем.

Так что, варианты всё-таки есть

Это, конечно, так. Случайность любая может произойти (всякие войны, торговлю и тд. отношу к разряду случайных генетических заимствований). А вот массового обмена  генофондами быть конечно не могло.

[Yaroslav]

Ну, с другой стороны, судя по картам, J2 и до уйгуров дошли (емнип присутствуют у них даже в сравнительно значительном количестве), а это уже территория современного Китая. Правда, у вашего китайца для этого по-моему слишком молодой ВБОП. Да и не знаю, какие там J2.

[mikhail a.]

Появился второй древний J2a-PF5252.
Первым был образец  I4159 бронзового века 1600-1300 BCE из БМАК ,о котором я писал здесь.
Теперь мы имеем еще одного (вернее, сдвоенного) представителя данной ветки, в этот раз уже из Италии- LSC002/004 из Grotta La Sassa, датированный 2840–2575 cal BCE (атрибутирован как медный век). Образец опубликован в недавно вышедшей статье Ancient genomes reveal structural shifts after the arrival of Steppe-related ancestry in the Italian Peninsula. Необходимо отметить, что образец хорошего качества. Мито - H1bv1b.

Обсуждение на Антрогенике

[mikhail a.]

Проверил bam LSC002/004. Образец - действительно отличного качества. Но, к сожалению, все снипы обоих веток под J2a-PF5252: как ближневосточная Y56835, так и сардинская PF5167 - оказались негативными. Изначально надеялся, что с сардинскими образцами найдутся хотя бы некоторые общие снипы, но все 22 детектированные у LSC002/004 снипы оказались "в минусе".

[mikhail a.]

За последнее время появилось несколько дополнительных образцов дДНК, которые относятся к ветке J-PF5174:

Два образца из статьи The genetic history of the Southern Arc: A bridge between West Asia and Europe (август 2022):

• I3931   5985-5836 calBCE (7015±25 BP, PSUAMS-3058)   ARM_Aknashen_N   Aknashen   Armenia   J-PF5174   Мито: I1
  Неолит Армении. Аутосомно: CHG (68%) + анатолийский неолит.
  Абсолютно ожидаемый результат. В данной ветке (как и в целом под PF5172) армянские образцы демонстрируют наибольшее разнообразие с ВОБП уходящими в бесконечность.
• I4353   1046-900 calBCE (2810±25 BP, PSUAMS-2150)   IRN_Hasanlu_IA   Hasanlu   Iran   J-PF5252   Мито: HV1a'b'c
  Железный век Ирана из Хасанлу (южнее Урмии). Также ожидаемый результат.
  Данный образец помечен в саппле как индивидуум из цитадели (высокий холм), погибший в результате катастрофы разрушения города. Не понятно как это сочетается с датировкой образца, при том, что разрушение города урартами датируется около примерно 800 годом.
  Аутосомно: иранский неолит/CHG+анатолийский неолит + EHG. Что коррелируются с большим количеством R1b в образцах из Хасанлу и Динха тепе. Аутосомно похожи на армянскую раннюю бронзу.
  I4353 - получилось углубить субклад PF5252>Z28683>FTA27932(BY132059+; Y19213/BY13996+)
  Кстати, при дополнительном анализе бронзовик  из БАМК I4159 Bustan_BA 1600-1300 BCE так же  оказался из ветки J-FTA27932 (все снипы следующего уровня J-Y286618 не прочтены)

Еще один образец был опубликован в статья Large-scale migration into Britain during the Middle to Late Bronze Age (опубликована 12/2021) - I15823 Czech_C Энеолит Чехии возрастом 5550 лет.  Мито: K1a4a1.
Вот этот образец оказался совсем неожиданным.  Неолитические популяции Центральной Европы формировались за счет потока генов с Балкан, у которых субклад отсутствует. PF5252 обнаружен в Италии, но туда неолит пришел другим маршрутом, при этом в средиземноморском потоке анатолийский неолит был с иранской примесью.
Как вариант,  это может свидетельствовать о неолитических миграциях из Апеннин в Центральную Европу. Обе существующие на сегодня подветки PF5252 в минусе (PF5229+; PF5185+; PF5252+; Z28679+; FGC31289-;  FGC31239-; FTA27932-; Y19213 / BY13996-)
Второй образец халколита Чехии из этой статьи : I15826 Czech_C 5505 лет R-L754 R1b мито: T2b