АвторТема: Ветви M178+ L839- L708-  (Прочитано 2101 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн NimissinАвтор темы

  • Сообщений: 2238
  • Рейтинг +657/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Ветви M178+ L839- L708-
« : 09 Март 2015, 09:25:53 »
Образец шорца Shor1 из базы данных Эстонского биоцентра. В области измерений работы Poznik et al (2013) нашел 90 кандидатур в снипы. Методика  - элайнмент с якутским образцом YakS8 (M2019+). Отбор кандидатур примерно соответствует методике, изложенной в статье по калибровкам SNP мутаций (Адамов и др., 2015).
Ни одна из найденных кандидатур не была известна ранее, не имеет обозначения. Я ожидал найти мутацию F4065, которая есть в образцах HGDP01203 (орочон) HGDP01221 (даур), у которых тоже Tat+, M178+, L839-, L708-. Оказалось, что рида мутации F4065 в образце Shor1 нет. Похоже, что образец Shor1 образует отдельную ветвь.
Жаль, нет STR гаплотипа. Нет ясности о степени родства образцов Shor1 и 203299 Borgoyakov.

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • ...
  • Сообщений: 8737
  • Страна: gt
  • Рейтинг +748/-7
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Ветви M178+ L839- L708-
« Ответ #1 : 09 Март 2015, 09:45:57 »
Образец шорца Shor1 из базы данных Эстонского биоцентра. В области измерений работы Poznik et al (2013) нашел 90 кандидатур в снипы. Методика  - элайнмент с якутским образцом YakS8 (M2019+). Отбор кандидатур примерно соответствует методике, изложенной в статье по калибровкам SNP мутаций (Адамов и др., 2015).
Ни одна из найденных кандидатур не была известна ранее, не имеет обозначения. Я ожидал найти мутацию F4065, которая есть в образцах HGDP01203 (орочон) HGDP01221 (даур), у которых тоже Tat+, M178+, L839-, L708-. Оказалось, что рида мутации F4065 в образце Shor1 нет. Похоже, что образец Shor1 образует отдельную ветвь.
Жаль, нет STR гаплотипа. Нет ясности о степени родства образцов Shor1 и 203299 Borgoyakov.
Интересно.
Жаль, что нет у шорца снипов, объединяющих его с кем-то еще.

Оффлайн NimissinАвтор темы

  • Сообщений: 2238
  • Рейтинг +657/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: Ветви M178+ L839- L708-
« Ответ #2 : 21 Март 2015, 12:54:18 »
Жаль, нет STR гаплотипа. Нет ясности о степени родства образцов Shor1 и 203299 Borgoyakov.
В статье Karmin et al (2015) опубликованы 23-маркерные STR гаплотипы. Сравнение локусов показывает, что гаплотипы Shor1 и 203299 - из одного и того же хакасско-шорского кластера N1c1.

Оффлайн NimissinАвтор темы

  • Сообщений: 2238
  • Рейтинг +657/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: Ветви M178+ L839- L708-
« Ответ #3 : 21 Март 2015, 12:59:05 »
Опубликованные в статье Karmin et al (2015) образцы двух марийцев и двух удмуртов N-M178 - из ананьинской ветви. Сравнение снипов показывает, что гаплотипы одного марийца и YF01599 (YFull) - из ветви В180, а гаплотипы двух удмуртов, второго марийца и YF02511 (YFull) - из ветви В181. Обозначения ветвей взяты из работы Karmin et al (2015).

Оффлайн qsq

  • Сообщений: 133
  • Рейтинг +5/-0
Re: Ветви M178+ L839- L708-
« Ответ #4 : 17 Август 2015, 14:56:59 »

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • ...
  • Сообщений: 8737
  • Страна: gt
  • Рейтинг +748/-7
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Re: Ветви M178+ L839- L708-
« Ответ #5 : 23 Июль 2016, 23:13:17 »
Судя по данным  Human Y Chromosome Haplogroup N:
A Non-trivial Time-Resolved Phylogeography
that Cuts across Language Families и другим данным четко выделяются две ветви шорско-хакаско-тувинская (B187) и японо-дауро-орочонская (F4065, B496).
Никаких общих снипов пока между этими ветвями не обнаруживается.
Возможность общего происхождения показывают только Y-STR.
Но в работе эти ветви разделены на схеме, японо-дауро-орочонская (F4065) показана как самая удаленная ветвь из всех N-M178



хотя я не нашел указание на специфические снипы, которые позволяют сделать такой вывод.

Установить реальное положение этой ветви по отношению к другим очень важно, так как  это может указать на прародину N1c1.





Оффлайн Dimitri

  • Сообщений: 328
  • Страна: ru
  • Рейтинг +52/-0
  • Y-ДНК: N-Y9022>BY32567 [RU-KO] ЖМ: R1a-M458>YP418 [RU-BEL] МЖМ: C-M48 [RU-ZAB]
  • мтДНК: HV9 [RU-SAR]
Re: Ветви M178+ L839- L708-
« Ответ #6 : 11 Март 2017, 18:32:11 »
В докторской диссертации C.Hollard (2014) опубликовано 3 ископаемых 17-маркерных гаплотипа из Хакасии (окуневская культура, 4300..3800 лет назад), относящихся к гаплогруппе N (Kh12, Kh13, Kh15). Генетическое расстояние до гаплотпа Borgoyakov (203299) - 7/16 (5/14, если отбросить палиндром DYS385). Уникальный набор маркеров у меня лично не оставляет сомнений в том, что это одна и та же ветвь N-B187. Общий предок этих трёх окуневцев и Боргоякова жил около 5-6 тыс. лет назад.
Обсуждение гаплотипов из диссертации здесь.
« Последнее редактирование: 11 Март 2017, 18:53:06 от Dimitri »

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100