АвторТема: Можно ли получить информацию о DYS'ах из 23andme  (Прочитано 3944 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн nybАвтор темы

  • Сообщений: 20
  • Страна: by
  • Рейтинг +2/-0
  • Y-ДНК: R1b1b2a
Можно ли получить информацию о DYS'ах из результатов 23andme?

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 6835
  • Страна: ru
  • Рейтинг +3620/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Re: Можно ли получить информацию о DYS'ах из 23andme
« Ответ #1 : 08 Февраль 2015, 21:13:23 »
Нет, никак нельзя

Оффлайн Daemon2017

  • Сообщений: 1396
  • Страна: ru
  • Рейтинг +638/-17
  • Y-ДНК: R1a-Y35174
  • мтДНК: V7-a2a2a2b*
Re: Можно ли получить информацию о DYS'ах из 23andme
« Ответ #2 : 08 Февраль 2015, 22:23:02 »
Можно ли получить информацию о DYS'ах из результатов 23andme?

Никак. Они же в первую очередь медициной занимались, а уж всякая генеалогия - как надбавка, как подарок.
Было бы странно, если бы они за эту сумму еще и их предоставляли.

Оффлайн nybАвтор темы

  • Сообщений: 20
  • Страна: by
  • Рейтинг +2/-0
  • Y-ДНК: R1b1b2a
Re: Можно ли получить информацию о DYS'ах из 23andme
« Ответ #3 : 09 Февраль 2015, 11:11:39 »
Ясно, спасибо.

Чтобы не создавать новой темы, спрошу здесь.

Моя гаплогруппа по 23andme - R1b1b2a (M269 -> L23 (и L49, но это по-моему одно и то же)). У некоторых людей расшифровывают мутации и дальше, например, я видел людей с результатом R1b1b2a1a2f2.
То, что у меня не расшифровано дальше, это значит, что у меня никаких таких мутаций в гаплогруппе и нет? То есть, никаким образом её нельзя "уточнить"?

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6182
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2435/-13
  • мтДНК: H1b
Re: Можно ли получить информацию о DYS'ах из 23andme
« Ответ #4 : 09 Февраль 2015, 11:19:14 »
nyb, на 23иЯ нет возможности апгрейда с "уточнениями", это же не ФТДНА...

Оффлайн nybАвтор темы

  • Сообщений: 20
  • Страна: by
  • Рейтинг +2/-0
  • Y-ДНК: R1b1b2a
Re: Можно ли получить информацию о DYS'ах из 23andme
« Ответ #5 : 09 Февраль 2015, 11:22:32 »
nyb, на 23иЯ нет возможности апгрейда с "уточнениями", это же не ФТДНА...
Я понимаю, что именно на 23иЯ ничего уточнить нельзя. Я имею ввиду, имеет ли мне смысл уточнять гаплогруппу где-то ещё, например, заказывать тест на том же ФТДНА, или же результат 23иЯ точный и окончательный.

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6182
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2435/-13
  • мтДНК: H1b
Re: Можно ли получить информацию о DYS'ах из 23andme
« Ответ #6 : 09 Февраль 2015, 11:27:28 »
nyb, на 23иЯ нет возможности апгрейда с "уточнениями", это же не ФТДНА...
Я понимаю, что именно на 23иЯ ничего уточнить нельзя. Я имею ввиду, имеет ли мне смысл уточнять гаплогруппу где-то ещё, например, заказывать тест на том же ФТДНА, или же результат 23иЯ точный и окончательный.
Аутосомный тест на ФТДНА ничего нового, скорее, не добавит, хотя плюс есть - попадете и в их базу тоже, будет, с кем результаты сравнивать. Вроде бы результаты теста можно было перенести, надо переспросить в теме на форуме, как сейчас с этим и сколько стоит.

А вот игрек, почему же не даст новое, если в ФТДНА можно сделать биг игрек? Смотрите, что получить можно: http://forum.molgen.org/index.php/topic,34.msg232979.html#msg232979
http://forum.molgen.org/index.php/topic,33.msg229837.html#msg229837

Оффлайн nybАвтор темы

  • Сообщений: 20
  • Страна: by
  • Рейтинг +2/-0
  • Y-ДНК: R1b1b2a
Re: Можно ли получить информацию о DYS'ах из 23andme
« Ответ #7 : 09 Февраль 2015, 12:06:31 »
Вроде бы результаты теста можно было перенести, надо переспросить в теме на форуме, как сейчас с этим и сколько стоит.
Там по-моему можно переносить результаты полученные с помощью чипа V3, у меня уже другой использовался (V4, что ли?).

в ФТДНА можно сделать биг игрек?
Под биг игрек вы имеете в виду Y-DNA Ancestry Tests (которые бывают 37-marker matches, 67-marker matches и 111-marker matches)? Или какой-то конкретный тест?
« Последнее редактирование: 09 Февраль 2015, 12:17:18 от nyb »

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6182
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2435/-13
  • мтДНК: H1b
Re: Можно ли получить информацию о DYS'ах из 23andme
« Ответ #8 : 09 Февраль 2015, 12:21:19 »
Цитировать
Там по-моему можно переносить результаты полученные с помощью чипа V3, у меня уже другой использовался (V4, что ли?).
Да, вот в этом и проблема.
Цитировать
Под биг игрек вы имеете в виду Y-DNA Ancestry Tests (которые бывают 37-marker matches, 67-marker matches и 111-marker matches)? Или какой-то конкретный тест?
Под биг игрек я имею в виду Big Y :) http://forum.molgen.org/index.php/topic,6255.0.html

Оффлайн smal

  • Сообщений: 1044
  • Страна: by
  • Рейтинг +409/-3
  • Y-ДНК: R-CTS9219
  • мтДНК: U4a
Re: Можно ли получить информацию о DYS'ах из 23andme
« Ответ #9 : 09 Февраль 2015, 12:33:23 »
Моя гаплогруппа по 23andme - R1b1b2a (M269 -> L23 (и L49, но это по-моему одно и то же)). У некоторых людей расшифровывают мутации и дальше, например, я видел людей с результатом R1b1b2a1a2f2.
То, что у меня не расшифровано дальше, это значит, что у меня никаких таких мутаций в гаплогруппе и нет? То есть, никаким образом её нельзя "уточнить"?

Это означает, что по Y хромосоме вы пока сделали тест начального уровня. У вас, конечно же, есть множество мутаций, которые еще просто не тестированы. Однако, для начала разберитесь со своим тестом детальнее. Надо проанализировать не только положительные снипы. Проверьте и отрицательные.

Оффлайн nybАвтор темы

  • Сообщений: 20
  • Страна: by
  • Рейтинг +2/-0
  • Y-ДНК: R1b1b2a
Re: Можно ли получить информацию о DYS'ах из 23andme
« Ответ #10 : 09 Февраль 2015, 12:54:56 »
Однако, для начала разберитесь со своим тестом детальнее. Надо проанализировать не только положительные снипы. Проверьте и отрицательные.
Не в курсе, что существуют положительные и отрицательные SNP. Где про них можно почитать? Как проверить отрицательные? Надо заказывать какой-то тест, или это можно сделать с помощью raw data из моих результатов? Как разобраться с тестом детальнее?

Оффлайн smal

  • Сообщений: 1044
  • Страна: by
  • Рейтинг +409/-3
  • Y-ДНК: R-CTS9219
  • мтДНК: U4a
Re: Можно ли получить информацию о DYS'ах из 23andme
« Ответ #11 : 09 Февраль 2015, 13:05:52 »
Не в курсе, что существуют положительные и отрицательные SNP. Где про них можно почитать? Как проверить отрицательные? Надо заказывать какой-то тест, или это можно сделать с помощью raw data из моих результатов? Как разобраться с тестом детальнее?

Да, надо raw data посмотреть. По каждому снипу на чипе может быть один из 3 результатов: положительный, отрицательный и "не прочитан".

Оффлайн nybАвтор темы

  • Сообщений: 20
  • Страна: by
  • Рейтинг +2/-0
  • Y-ДНК: R1b1b2a
Re: Можно ли получить информацию о DYS'ах из 23andme
« Ответ #12 : 09 Февраль 2015, 13:16:02 »
По каждому снипу на чипе может быть один из 3 результатов: положительный, отрицательный и "не прочитан".
Да, чтоно.

Да, надо raw data посмотреть.
Ну, не вручную же :) Инструмент для это же какой-то есть? А то как данные интерпретировать?

Оффлайн smal

  • Сообщений: 1044
  • Страна: by
  • Рейтинг +409/-3
  • Y-ДНК: R-CTS9219
  • мтДНК: U4a
Re: Можно ли получить информацию о DYS'ах из 23andme
« Ответ #13 : 09 Февраль 2015, 13:22:07 »
Там на чипе очень скромный набор снипов ниже M269, это легко и вручную сделать.

Оффлайн nybАвтор темы

  • Сообщений: 20
  • Страна: by
  • Рейтинг +2/-0
  • Y-ДНК: R1b1b2a
Re: Можно ли получить информацию о DYS'ах из 23andme
« Ответ #14 : 09 Февраль 2015, 14:12:43 »
Там на чипе очень скромный набор снипов ниже M269, это легко и вручную сделать.

Стоп. Кажется, я поторопился сказать, что всё понял.

Во-первых, снипы. В BROWSE RAW DATA они бывают либо буква, либо no call. Не понял, как это перевести в положительный/отрицательный. Следовательно, я не знаю, как посчитать/проанализировать отрицательные снипы.


Во-вторых, есть ANCESTRY TOOLS -> HAPLOGROUP TREE MUTATION MAPPER. Но я так понимаю, тут скорее "положительные" снипы (те, которые привели к моей гаплогруппе?).


В-третьих, там же, ниже, есть View differences from ancestral Y as CSV. От чего конкретно эти отличия (от "эталонного" R1b-M269?) я не очень понимаю. Или это то же самое, что и выше, но в текстовом виде? Но тут есть некоторые снипы, которых нету выше (выделил жирным)

# Differences between user's SNP calls and the ancestral state, for all SNPs on the 23andMe Y tree
# This does not include SNPs for which the ancestral state is not stored (i.e. those not on the tree)
# Format:
# chromosome,snp_id,chromosome_position,user_call,ancestral_call
Y,i4000095,2649694,T,G
Y,rs9786142,2842212,A,T
Y,rs9786184,2887824,A,C
Y,i4000275,6740172,G,T
Y,rs9306845,6941218,A,G
Y,rs7067478,7647357,A,G
Y,rs9785717,7771131,A,G
Y,rs895530,7963031,G,T

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.