CCR5del32

[Eugen Hartmann]

Кстати, может быть генетики, которые находятся на форуме, пояснят почему такая путаница со снипами и делециями? Почему для CCR5del32 есть идентификатор характерный для снипов - rs333?


rs333(-;-)
rs333(-;GTCAGTATCAATTCTGGAAGAATTTCCAGACA)
rs333(GTCAGTATCAATTCTGGAAGAATTTCCAGACA;GTCAGTATCAATTCTGGAAGAATTTCCAGACA)

Все просто.
Rs - это обозначение всех полиморфизмов по референсному сиквенсу человека.
Снип -это один из видов полиморфизмов, но, как Вы знаете, есть еще инделы (инсерции + делеции).

В данном случае Delta 32 rs333 обозначает делецию участка ДНК размером в 32 нуклеотид (GTCAGTATCAATTCTGGAAGAATTTCCAGACA)

Вадим, спасибо!

[Eugene]

Так все-таки у кого мнения насчет времени, месте и протоэтносе о появлении данного маркера? N1c1 или I1? U5b? U4? или еще что?

Europe


World

[Eugene]

Мой CCR5 normal-normal

[mouglley]

Мой CCR5 normal-normal

Обидно (хотя сейчас в Волгограде, говорят, зверствует лихорадка Занадного Нила, смертельная для CCR5 del-del).

Хотел было собрать табличку туземно-балтийско-арийских полукровок CCR5 normal-del по аутосомной части, по полученным после прогона данных через разные аутосомные калькуляторы GedMatch.

Этнопул должен был бы оказаться близким.

[Alex AXe]

II
Жаль. 

[Аббат Бузони]

II Aleksandr Sergachev
II Aleksandr Shtrunov
DI Anna Pronkina
II Gennady Shtrunov
DD Nickolay Mochalov
DI Tatyana Erisova

[Srkz]

Мой CCR5 normal-normal

Обидно (хотя сейчас в Волгограде, говорят, зверствует лихорадка Занадного Нила, смертельная для CCR5 del-del).

Хотел было собрать табличку туземно-балтийско-арийских полукровок CCR5 normal-del по аутосомной части, по полученным после прогона данных через разные аутосомные калькуляторы GedMatch.

Этнопул должен был бы оказаться близким.

У меня DI. Жалко, ни то, ни се    Ближайшие матчи RelFinder из Архангельской области

[dars]

normal-normal