АвторТема: The African Genome Variation Project shapes medical genetics in Africa  (Прочитано 1382 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн пенелопаАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6486
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2715/-13
  • мтДНК: H1b
The African Genome Variation Project shapes medical genetics in Africa

Deepti Gurdasani, Tommy Carstensen, Fasil Tekola-Ayele, Luca Pagani et al.

Published online 03 December 2014

Abstract

Given the importance of Africa to studies of human origins and disease susceptibility, detailed characterization of African genetic diversity is needed. The African Genome Variation Project provides a resource with which to design, implement and interpret genomic studies in sub-Saharan Africa and worldwide. The African Genome Variation Project represents dense genotypes from 1,481 individuals and whole-genome sequences from 320 individuals across sub-Saharan Africa. Using this resource, we find novel evidence of complex, regionally distinct hunter-gatherer and Eurasian admixture across sub-Saharan Africa. We identify new loci under selection, including loci related to malaria susceptibility and hypertension. We show that modern imputation panels (sets of reference genotypes from which unobserved or missing genotypes in study sets can be inferred) can identify association signals at highly differentiated loci across populations in sub-Saharan Africa. Using whole-genome sequencing, we demonstrate further improvements in imputation accuracy, strengthening the case for large-scale sequencing efforts of diverse African haplotypes. Finally, we present an efficient genotype array design capturing common genetic variation in Africa.

http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature13997.html

Оффлайн Asmat headhunter

  • Биохимическая субстанция
  • Сообщений: 14452
  • Страна: id
  • Рейтинг +939/-34
  • И того казака те тунгусы пальмами тут искололи
Re: The African Genome Variation Project shapes medical genetics in Africa
« Ответ #1 : 21 Декабрь 2014, 19:48:12 »
Цитировать
ancient Eurasian admixture was observed in central West African populations (Yoruba; ~7,500–10,500 years ago)
Голову сломал, думая, кто такой с евразийскими генами наследил у йоруба.
И обязательно ли такая датировка говорит о смешении именно у йоруба в то же время.
Может ли быть связь с распространением чадских языков? Сразу же их R1b вспоминается.
Или нило-сахарцы (прежде всего сахарцы и особенно сонгайцы, кто-то из сонгайцев вообще не так далеко от йоруба)?
Или фульбе, имеющие вроде как европеоидную примесь?
Ещё могут быть иджоидные народы в дельте Нигера - где-то вроде видел версию о миграции их предков откуда-то с верхнего Нигера, а там и те же предки фульбе недалеко.
Или какой-нибудь древний берберский след?
Или всё не то и что-то совсем небывалое?

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.