http://www.fc.id.au/2014/10/ancient-dna-matches-in-familytreedna.html При всем уважении к Феликсу, я думаю что это очень плохая идея - сравнивать современные клиентские данные с данными древних ДНК-сэмплов.
По трем объективным причинам: 1) значительное количество этих сэмплов имеют высокую гомозиготность по своим снипам, это существенно удлиняет IBD превращая их в составные сегменты. Отсюда большое количество shared cM.
2) дефолтные значения сравниваемых сэмплов - 7 сM и 700 снипов разрабатывались для чипов с относительно одинаковой плотностью покрытия снипов (т.е распределение снипов примерно равномерное по всем хромосомам). В случае с древней ДНК практически все аутосомные данные - это результат NG-сиквенирования, т.е принципиально другой методики, где как качество так и количество/плотность снипов заведома неизвестны. Поэтому результаты сравнения будут сильно далеки от реальности.
3) большая часть сэмплов имеет небольшое число снипов общих с одной из двух популярных коммерческих платформ.
Было бы интересно построить в биокондукторе графики плотности похромосомного распределения снипов в древней ДНК и сравнить их с профилями покрытия FTDNA или 23andme v3. Если разница в форме и амплитуде будет визуально заметна, тогда вряд ли посегментное сравнение с древней ДНК будет иметь смысл