0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.
Что-то с конвертером.. В РДФ признаков 307 а в нексусе 313
Разрезал на 19 кусков по 100 (т.е. -g 100) , ми стоимость 160191. Это уазывает на наличие весов. Вадим, а в Нексусе тоже с весами? Если не затрудним, скажите какая стоимость была у ТНТ, почему 307 локусов и есть ли там веса. Я хочу понять качество DECOMPOSE в Мурке. Оно увы скверное, но хочется знать насколько Заранее спасибо.
Цитата: Valery от 22 Октябрь 2009, 21:55:03Что-то с конвертером.. В РДФ признаков 307 а в нексусе 313Все правильно, я убрал последних 6 последних признаков из rdf при переводе в нексус. Эти признаки у всех гаплотипов были одинаковые.
Вадим, но если бы элайнменты были одинаковы с точностью до константных признаков, то разница стоимости деревьев была бы меньше.
Но Вы не ответили на мой вопрос - удалось ли получить нечто графически приемлимое?
ЦитироватьНо Вы не ответили на мой вопрос - удалось ли получить нечто графически приемлимое?я остановил через пару минут когда сосчиталась небольшая часть деревьев. Мне было принципиальным увидеть что оно работает.
графики с изображением "ветви" субклада R1b
Цитата: Vadim Verenich от 15 Ноябрь 2009, 15:21:21графики с изображением "ветви" субклада R1b