АвторТема: Genome flux and stasis in a five millennium transect of European prehistory  (Прочитано 40196 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6332
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1328/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Genome flux and stasis in a five millennium transect of European prehistory
« Ответ #60 : 23 Октябрь 2014, 14:57:31 »
Слёзно попросила уважаемого Семаргла заглянуть в геном :) На предмет, а кто же мальчик?
Вот что рассказали: IR1 M231+ P189- M2282- M2257-
IR1 действительно N.

Присоединяюсь к просьбе:)
Я правильно понимаю, что в ближайшее время всех их можно будет увидеть на дерве YFull?

Оффлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6776
  • Страна: th
  • Рейтинг +1080/-41
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: Genome flux and stasis in a five millennium transect of European prehistory
« Ответ #61 : 23 Октябрь 2014, 15:18:53 »
соседи гальштатских кельтов  из    Mezőcsát culture с гаплогруппой N  определенно были какими то залетными  финноуграми с урала .
определенно не связана.
IR1 имеет другую линию, вероятно с Алтая или восточнее.
3000 тыс. лет назад еще греки писать не умели  ;)
IR1 скорее всего был древний иранец (всетаки культура Mezőcsát - скифская считается, тюрков еще не было).
Возможно отсюда связь греческой лингвистической линии с индо-иранской.

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2017
  • Страна: 00
  • Рейтинг +531/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: Genome flux and stasis in a five millennium transect of European prehistory
« Ответ #62 : 23 Октябрь 2014, 15:34:41 »
соседи гальштатских кельтов  из    Mezőcsát culture с гаплогруппой N  определенно были какими то залетными  финноуграми с урала .
определенно не связана.
IR1 имеет другую линию, вероятно с Алтая или восточнее.
3000 тыс. лет назад еще греки писать не умели  ;)
IR1 скорее всего был древний иранец (всетаки культура Mezőcsát - скифская считается, тюрков еще не было).
Возможно отсюда связь греческой лингвистической линии с индо-иранской.
разве не предскифской?

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: Genome flux and stasis in a five millennium transect of European prehistory
« Ответ #63 : 23 Октябрь 2014, 15:43:16 »
Слёзно попросила уважаемого Семаргла заглянуть в геном :) На предмет, а кто же мальчик?
Вот что рассказали: IR1 M231+ P189- M2282- M2257-
IR1 действительно N.

Присоединяюсь к просьбе:)
Я правильно понимаю, что в ближайшее время всех их можно будет увидеть на дерве YFull?
к сожалению на дереве их не будет.. по причине того, что они имеют много ложноотрицательных снп - после добавления их в базу они могут сильно повлиять на алгоритмы позиционирования дерева

Оффлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6776
  • Страна: th
  • Рейтинг +1080/-41
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: Genome flux and stasis in a five millennium transect of European prehistory
« Ответ #64 : 23 Октябрь 2014, 15:44:28 »
соседи гальштатских кельтов  из    Mezőcsát culture с гаплогруппой N  определенно были какими то залетными  финноуграми с урала .
определенно не связана.
IR1 имеет другую линию, вероятно с Алтая или восточнее.
3000 тыс. лет назад еще греки писать не умели  ;)
IR1 скорее всего был древний иранец (всетаки культура Mezőcsát - скифская считается, тюрков еще не было).
Возможно отсюда связь греческой лингвистической линии с индо-иранской.
разве не предскифской?
Где как написано. Может и пред-скифской. Но в любом случае либо древние ираноязычные либо родственные ираноязычным.
П.С. Не случайно же говорят Да, скифы да азиаты  ;D

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
Re: Genome flux and stasis in a five millennium transect of European prehistory
« Ответ #65 : 23 Октябрь 2014, 15:58:29 »
KO1Tiszaszőlős-Domaháza, HungaryMaleI2aR35650-5780 yearsPending
KO2Berettyóújfalu-Morotva-liget, HungaryFemaleK15570-5710 yearsPending
NE1Polgár-Ferenci-hát, HungaryFemaleU5b2c5070-5310 yearsPending
NE2Debrecen Tócópart Erdõalja, HungaryFemaleH5060-5290 yearsPending
NE5Kompolt-Kigyósér, HungaryMaleC6J1c14990-5210 yearsPending
NE6Apc-Berekalja I., HungaryMaleC6K1a3a34950-5300 yearsPending
NE7Apc-Berekalja I., HungaryMaleI2aN1a1a1a4360-4490 yearsPending
CO1Apc-Berekalja I., HungaryFemaleH2700-2900 yearsPending
BR1Kompolt-Kigyósér, HungaryFemaleK1c11980-2190 yearsPending
BR2Ludas-Varjú-dűlő, HungaryMaleJ2a1K1a1a1110-1270 yearsPending
IR1Ludas-Varjú-dűlő, HungaryMaleNG2a1830-980 yearsPending

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
Re: Genome flux and stasis in a five millennium transect of European prehistory
« Ответ #66 : 23 Октябрь 2014, 16:00:57 »

Цитировать
Я бы не рекомендовал использовать GATK, BWA и Picard на обычном персональном компьютере.
Лучше всего использовать системы распределенного вычисления, например кластеры или гриды (для GATK у меня получались самые оптимальные варианты при резервировании 8 Гб RAM под виртуальную машину Java, 2-3 узлах с 4 процессорами каждый, при увеличении значений параметров заметной глазу оптимизации не наблюдалось).
 а Вы пробывали программу Ugene? она, по идее, должна несколько облегчить работу, т.к. они собрали многие скрипты в одной программе, добавили свои и сделали ее кроссплатформенной (+ графический интерфейс), но мне трудно судить, т.к. я совершенно в этом не разбираюсь.


Нет, эта программа вряд ли превосходит вышеназванные мной, т.к. variant calling в ней это скорее побочный модуль чем основная функция.

Оффлайн Murzalar

  • Ырыу-мурзалар . Оран-хандал(наковальня)Тамга- лук со стрелой. Дерево -черемуха. Птица-Лебедь.
  • Сообщений: 5262
  • Страна: ru
  • Рейтинг +407/-36
  • Y-ДНК: I1
  • мтДНК: U5
Re: Genome flux and stasis in a five millennium transect of European prehistory
« Ответ #67 : 23 Октябрь 2014, 16:19:24 »
KO1Tiszaszőlős-Domaháza, HungaryMaleI2aR35650-5780 yearsPending
KO2Berettyóújfalu-Morotva-liget, HungaryFemaleK15570-5710 yearsPending
NE1Polgár-Ferenci-hát, HungaryFemaleU5b2c5070-5310 yearsPending
NE2Debrecen Tócópart Erdõalja, HungaryFemaleH5060-5290 yearsPending
NE5Kompolt-Kigyósér, HungaryMaleC6J1c14990-5210 yearsPending
NE6Apc-Berekalja I., HungaryMaleC6K1a3a34950-5300 yearsPending
NE7Apc-Berekalja I., HungaryMaleI2aN1a1a1a4360-4490 yearsPending
CO1Apc-Berekalja I., HungaryFemaleH2700-2900 yearsPending
BR1Kompolt-Kigyósér, HungaryFemaleK1c11980-2190 yearsPending
BR2Ludas-Varjú-dűlő, HungaryMaleJ2a1K1a1a1110-1270 yearsPending
IR1Ludas-Varjú-dűlő, HungaryMaleNG2a1830-980 yearsPending
Получается все таки 1000 лет назад?

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
Re: Genome flux and stasis in a five millennium transect of European prehistory
« Ответ #68 : 23 Октябрь 2014, 16:27:37 »
Не знаю, надо смотреть статью c указанием точного возраста уважаемых останков N

Оффлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6776
  • Страна: th
  • Рейтинг +1080/-41
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: Genome flux and stasis in a five millennium transect of European prehistory
« Ответ #69 : 23 Октябрь 2014, 16:33:38 »
Цитировать
A third genomic shift occurs around the turn of the first millennium BC. The single Iron Age genome, sampled from the pre-Scythian Mezőcsát Culture (Iron Age (IR1), 830–980 cal BC), shows a distinct shift towards Eastern Eurasian genotypes, specifically in the direction of several Caucasus population samples within the reference data set.

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2017
  • Страна: 00
  • Рейтинг +531/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Re: Genome flux and stasis in a five millennium transect of European prehistory
« Ответ #70 : 23 Октябрь 2014, 16:45:38 »
Цитировать
Получается все таки 1000 лет назад?
нет, у Чандракумара просто не указано, что сэмлы времен до н.э. (BC)

Оффлайн Mukovnikov

  • Сообщений: 1469
  • Страна: ru
  • Рейтинг +237/-6
  • Y-ДНК: N-Y4339>Y5611>F1983>S10880; мжм: N
  • мтДНК: K1c1e; мж - V13; ммж - J1c4b; мммж - H
Re: Genome flux and stasis in a five millennium transect of European prehistory
« Ответ #71 : 23 Октябрь 2014, 17:39:42 »
А каков антураж этого древнего N? Что там в могиле вместе с костяком лежало?

Оффлайн FireАвтор темы

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 9685
  • Страна: gr
  • Рейтинг +904/-133
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
Re: Genome flux and stasis in a five millennium transect of European prehistory
« Ответ #72 : 23 Октябрь 2014, 18:34:25 »
соседи гальштатских кельтов  из    Mezőcsát culture с гаплогруппой N  определенно были какими то залетными  финноуграми с урала .
лингво-исторически это геродотовые  одноглазые аримаспы с эпикантусом(продолжение складки верхнего века)..
Uralic: FB *rim[pV]se 'eyelash, eyelid'-веко

Цитировать

13. Впрочем, Аристей, сын Каистробия из Проконнеса, в своей эпической поэме сообщает, как он, одержимый Фебом, прибыл к исседонам. По его рассказам, за исседонами обитают аримаспы – одноглазые люди; за аримаспами – стерегущие золото грифы, а еще выше за ними – гипербореи на границе с морем. Все эти народы, кроме гипербореев, постоянно воюют с соседями (причем первыми начали войну аримаспы). Аримаспы изгнали исседонов из их страны, затем исседоны вытеснили скифов, а киммерийцы, обитавшие у Южного моря под напором скифов покинули свою родину[12
]

а "одноглазые" потому что сведения о аримаспах  к грекам попали через  кельтское посредство где  семантическое чередование одноглазый/косоглазый .
Proto-IE: *kaik-
Old Indian: kekara- `squint-eyed'-косоглазый
Germanic: *xaix-a- adj->Gothic: *haih-s (a) `one-eyed'-одноглазый
Latin: caecus, -a `blind, unsichtbar, dunkel, ziellos'; cacilia f. `Blindschleiche'
Celtic: OIr caech `einäugig'-одноглазый ; Cymr coeg `vacuus, deficiens', coegdall `einäugig', OCorn cuic `luocus vel monophthalmus';
          MIr leth-chaech `schielend'-косоглазый
Какой Аримасп если он близко к Армянам по аутосомам?
Аримаспы были близко к Алтаю к востоку от Исседонов. Там в Венгрии были Сигины(хотябы 2500 лет назад)

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 8292
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4700/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: Genome flux and stasis in a five millennium transect of European prehistory
« Ответ #73 : 23 Октябрь 2014, 18:34:43 »
А каков антураж этого древнего N? Что там в могиле вместе с костяком лежало?
At the southern edge of the settlement a pre-Scythian cemetery was excavated that contained two groups of skeletons. The first, with 7 graves, was very poorly preserved, while the second (with 12 graves) was better preserved. Grave 2638 (specimen IR1, a 4-6 years old child, Supplementary Table 1) belonged to the second group 71. The skeleton of the child was lying on its back in an extended position but the burial was disturbed by recent ploughing. The only excavated grave good was one broken bronze pin, but in other graves within the cemetery both ceramic and iron objects were excavated and these confirm the attribution of the cemetery to the Early Iron Age Mezőcsát Culture.

Могила была нарушена вспашкой, из вещей найдена только бронзовая булавка. Мальчик 4-6 лет.

Какой Аримасп если он близко к Армянам по аутосомам?
Это не так

Оффлайн FireАвтор темы

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 9685
  • Страна: gr
  • Рейтинг +904/-133
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
Re: Genome flux and stasis in a five millennium transect of European prehistory
« Ответ #74 : 23 Октябрь 2014, 18:43:08 »
Какой Аримасп если он близко к Армянам по аутосомам?
Это не так
Уралоидом он небыл, всетаки между Восточными Европейцами и Кавказцами он

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.