АвторТема: YP417  (Прочитано 97145 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Sergey Piskunov

  • Сообщений: 23
  • Страна: ru
  • Рейтинг +11/-0
  • Y-ДНК: YP1137>R-PH3052
  • мтДНК: J1c4b1b (T13635C)
Re: YP417
« Ответ #690 : 29 Январь 2023, 22:46:32 »
Здравствуйте! Недавно получил результаты генетического теста от компании Atlas. По мужской линии R1a1a1b1a1a1c1c YP417/V3192/FGC20517/M12415. Пытаюсь уточнить результат в YFull, но они просят некий файл "regions.bed". Подскажите что это за файл и где его взять? Atlas дополнительно сделали мне результаты в разных форматах: GRCh38.vcf, GRCh37.vcf, 23andMe_V5.txt. Результаты уже залил на familytreedna.com, myheritage.com, но данные еще обрабатываются.

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 6144
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4442/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: YP417
« Ответ #691 : 29 Январь 2023, 23:06:46 »
Здравствуйте! Недавно получил результаты генетического теста от компании Atlas. По мужской линии R1a1a1b1a1a1c1c YP417/V3192/FGC20517/M12415. Пытаюсь уточнить результат в YFull, но они просят некий файл "regions.bed". Подскажите что это за файл и где его взять? Atlas дополнительно сделали мне результаты в разных форматах: GRCh38.vcf, GRCh37.vcf, 23andMe_V5.txt. Результаты уже залил на familytreedna.com, myheritage.com, но данные еще обрабатываются.
В YFull загружаются только данные NGS тестов. Если брать Атлас, то: https://atlas.ru/wgs
Это сверх ценник, поэтому можно сделать тест в другой подходящей лаборатории, в 5-10 раз дешевле.

Оффлайн NathanS

  • Сообщений: 1279
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1209/-2
Re: YP417
« Ответ #692 : 29 Январь 2023, 23:30:57 »
По мужской линии R1a1a1b1a1a1c1c YP417/V3192/FGC20517/M12415. Пытаюсь уточнить результат...
Вы где-то в этой ветке: https://www.yfull.com/tree/R-YP417/
Далее только более продвинутые тесты - как указал Semargl, WGS в любой компании - YSEQ, Nebula, Dante или BigY в FTDNA. Помимо продвинутых тестов WGS,  неплохо бы сделать в FTDNA тест хотя бы 37 STR-маркеров, лучше 111 (111 маркеров входят в стоимость BigY). https://www.familytreedna.com/products/y-dna На тесты в FTDNA бываэт скидки - к 14 февраля, конференции RootTech (2-4 марта в этом году, день ДНК (25 апреля) и т.д.
« Последнее редактирование: 29 Январь 2023, 23:38:24 от NathanS »

Оффлайн Sergey Piskunov

  • Сообщений: 23
  • Страна: ru
  • Рейтинг +11/-0
  • Y-ДНК: YP1137>R-PH3052
  • мтДНК: J1c4b1b (T13635C)
Re: YP417
« Ответ #693 : 30 Январь 2023, 05:56:12 »
Спасибо за информацию, к сожалению, в настоящее время, проживая в России, только Atlas.

Оффлайн AVBaz

  • Сообщений: 173
  • Страна: ru
  • Рейтинг +129/-0
  • Y-ДНК: R1a-Y35 (YP582+, YP1079+)
Re: YP417
« Ответ #694 : 30 Январь 2023, 08:17:34 »
Спасибо за информацию, к сожалению, в настоящее время, проживая в России, только Atlas.
Есть и другие https://forum.molgen.org/index.php/topic,10713.0.html, но цены там не ниже (пока).
Если препятствием для работы с зарубежными компаниями является вопрос доставки теста и оплаты, то есть вариант YSEQ:
https://forum.molgen.org/index.php/topic,6323.msg556657.html#msg556657

Оффлайн Sergey Piskunov

  • Сообщений: 23
  • Страна: ru
  • Рейтинг +11/-0
  • Y-ДНК: YP1137>R-PH3052
  • мтДНК: J1c4b1b (T13635C)
Re: YP417
« Ответ #695 : 30 Январь 2023, 20:15:00 »
Спасибо за информацию, к сожалению, в настоящее время, проживая в России, только Atlas.
Есть и другие https://forum.molgen.org/index.php/topic,10713.0.html, но цены там не ниже (пока).
Если препятствием для работы с зарубежными компаниями является вопрос доставки теста и оплаты, то есть вариант YSEQ:
https://forum.molgen.org/index.php/topic,6323.msg556657.html#msg556657
Спасибо! Очень интересное предложение... А с качеством там как?

Оффлайн AVBaz

  • Сообщений: 173
  • Страна: ru
  • Рейтинг +129/-0
  • Y-ДНК: R1a-Y35 (YP582+, YP1079+)
Re: YP417
« Ответ #696 : 30 Январь 2023, 20:50:23 »
Спасибо! Очень интересное предложение... А с качеством там как?
Из того, что попадалось на форуме - озывы вполне положительные. Рекомендуют тест WGS+. Посмотрите тему по YSEQ, ссылку на которую я дал выше.
 

Оффлайн Sergey Piskunov

  • Сообщений: 23
  • Страна: ru
  • Рейтинг +11/-0
  • Y-ДНК: YP1137>R-PH3052
  • мтДНК: J1c4b1b (T13635C)
Re: YP417
« Ответ #697 : 31 Январь 2023, 18:35:31 »
Спасибо! Очень интересное предложение... А с качеством там как?
Из того, что попадалось на форуме - озывы вполне положительные. Рекомендуют тест WGS+. Посмотрите тему по YSEQ, ссылку на которую я дал выше.
Заказал WGS+, надеюсь все пройдет хорошо)

Оффлайн Sergey Piskunov

  • Сообщений: 23
  • Страна: ru
  • Рейтинг +11/-0
  • Y-ДНК: YP1137>R-PH3052
  • мтДНК: J1c4b1b (T13635C)
Re: YP417
« Ответ #698 : 31 Январь 2023, 19:37:50 »
Подскажите по работе с сайтом yseq.net. Зарегистрировался на сайте, сделал заказ WGS+, оплатил в рублях через Yfull. Теперь не могу зайти на сайт yseq.net, логин и пароль не принимает. Пытался сбросить, на почту ничего не приходит...? И что в итоге (какие результаты) я получу. Это будет файл или результаты на сайте, в личном кабинете опубликуют?

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 6144
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4442/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: YP417
« Ответ #699 : 31 Январь 2023, 19:53:32 »
Подскажите по работе с сайтом yseq.net. Зарегистрировался на сайте, сделал заказ WGS+, оплатил в рублях через Yfull. Теперь не могу зайти на сайт yseq.net, логин и пароль не принимает. Пытался сбросить, на почту ничего не приходит...? И что в итоге (какие результаты) я получу. Это будет файл или результаты на сайте, в личном кабинете опубликуют?
Насколько я знаю, вам должен был прийти логин и пароль от YSEQ. Знающие люди, кто заказывал, подскажут какой порядок действий. В любом случае беспокоиться не стоит, так как все проблемы быстро решаемы. Томас из YSEQ обычно оперативно отвечает на обращения.

Оффлайн AleksG

  • Maternal Y-DNA: R-L365->YP940>R-FT439430
  • Сообщений: 1159
  • Страна: 00
  • Рейтинг +495/-4
  • Y-ДНК: Q-PH2513
  • мтДНК: U5a1a1a5
Re: YP417
« Ответ #700 : 31 Январь 2023, 20:36:22 »
Подскажите по работе с сайтом yseq.net. Зарегистрировался на сайте, сделал заказ WGS+, оплатил в рублях через Yfull. Теперь не могу зайти на сайт yseq.net, логин и пароль не принимает. Пытался сбросить, на почту ничего не приходит...? И что в итоге (какие результаты) я получу. Это будет файл или результаты на сайте, в личном кабинете опубликуют?

Да такой же косяк был.
Помогла информация от Yfull о номере YSEQ ID, по нему смог восстановить пароль на почту

Оффлайн NathanS

  • Сообщений: 1279
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1209/-2
Re: YP417
« Ответ #701 : 31 Январь 2023, 20:43:20 »
Подскажите по работе с сайтом yseq.net. Зарегистрировался на сайте, сделал заказ WGS+, оплатил в рублях через Yfull. Теперь не могу зайти на сайт yseq.net, логин и пароль не принимает. Пытался сбросить, на почту ничего не приходит...? И что в итоге (какие результаты) я получу. Это будет файл или результаты на сайте, в личном кабинете опубликуют?

Томас и Астрид отписывались в фэйсбуйе, что есть проблемы с мэйлами на адреса @gmail.com. У меня тоже проблема с одним набором, автоматического мэйла не приходит, но на мой мэйл они ответили и выслали ссылку для восстановления пароля (но что-то у меня не так пошло, пока не восстановил пароль).

Результаты будут: BAM-файл (загружается по запросу), куча файлов, которые надо себе загрузить, а среди них будет и BAM-файл с вырезанными данными только по Y-хромосоме и мито, которые можно и нужно загрузить на YFull для дальнейшего анализа. Они также вам пришлют список уже известных снипов, которые у вас определены, и список ваших приватных снипов, которые у вас нашли и которым дали названия.

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 6144
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4442/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: YP417
« Ответ #702 : 01 Февраль 2023, 18:03:03 »
Или напишите мне в личку - я скину вам ваш YSEQ ID, зная который вы сбросите пароль от личного кабинета.

Оффлайн Sergey Piskunov

  • Сообщений: 23
  • Страна: ru
  • Рейтинг +11/-0
  • Y-ДНК: YP1137>R-PH3052
  • мтДНК: J1c4b1b (T13635C)
Re: YP417
« Ответ #703 : 01 Февраль 2023, 20:24:34 »
Или напишите мне в личку - я скину вам ваш YSEQ ID, зная который вы сбросите пароль от личного кабинета.
Спасибо, Semargl! Доступ в аккаунт YSEQ, восстановлен!

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 6144
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4442/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: YP417
« Ответ #704 : 01 Февраль 2023, 21:52:24 »
Или напишите мне в личку - я скину вам ваш YSEQ ID, зная который вы сбросите пароль от личного кабинета.
Спасибо, Semargl! Доступ в аккаунт YSEQ, восстановлен!
Видимо у них действительно сейчас проблемы с отправкой писем или они попадают в спам.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.