YP417

[Sergey Piskunov]

Здравствуйте! Недавно получил результаты генетического теста от компании Atlas. По мужской линии R1a1a1b1a1a1c1c YP417/V3192/FGC20517/M12415. Пытаюсь уточнить результат в YFull, но они просят некий файл "regions.bed". Подскажите что это за файл и где его взять? Atlas дополнительно сделали мне результаты в разных форматах: GRCh38.vcf, GRCh37.vcf, 23andMe_V5.txt. Результаты уже залил на familytreedna.com, myheritage.com, но данные еще обрабатываются.

[Semargl]

Здравствуйте! Недавно получил результаты генетического теста от компании Atlas. По мужской линии R1a1a1b1a1a1c1c YP417/V3192/FGC20517/M12415. Пытаюсь уточнить результат в YFull, но они просят некий файл "regions.bed". Подскажите что это за файл и где его взять? Atlas дополнительно сделали мне результаты в разных форматах: GRCh38.vcf, GRCh37.vcf, 23andMe_V5.txt. Результаты уже залил на familytreedna.com, myheritage.com, но данные еще обрабатываются.

В YFull загружаются только данные NGS тестов. Если брать Атлас, то: https://atlas.ru/wgs
Это сверх ценник, поэтому можно сделать тест в другой подходящей лаборатории, в 5-10 раз дешевле.

[NathanS]

По мужской линии R1a1a1b1a1a1c1c YP417/V3192/FGC20517/M12415. Пытаюсь уточнить результат...

Вы где-то в этой ветке: https://www.yfull.com/tree/R-YP417/
Далее только более продвинутые тесты - как указал Semargl, WGS в любой компании - YSEQ, Nebula, Dante или BigY в FTDNA. Помимо продвинутых тестов WGS,  неплохо бы сделать в FTDNA тест хотя бы 37 STR-маркеров, лучше 111 (111 маркеров входят в стоимость BigY). https://www.familytreedna.com/products/y-dna На тесты в FTDNA бываэт скидки - к 14 февраля, конференции RootTech (2-4 марта в этом году, день ДНК (25 апреля) и т.д.

[Sergey Piskunov]

Спасибо за информацию, к сожалению, в настоящее время, проживая в России, только Atlas.

[AVBaz]

Спасибо за информацию, к сожалению, в настоящее время, проживая в России, только Atlas.

Есть и другие https://forum.molgen.org/index.php/topic,10713.0.html, но цены там не ниже (пока).
Если препятствием для работы с зарубежными компаниями является вопрос доставки теста и оплаты, то есть вариант YSEQ:
https://forum.molgen.org/index.php/topic,6323.msg556657.html#msg556657

[Sergey Piskunov]

Спасибо за информацию, к сожалению, в настоящее время, проживая в России, только Atlas.

Есть и другие https://forum.molgen.org/index.php/topic,10713.0.html, но цены там не ниже (пока).
Если препятствием для работы с зарубежными компаниями является вопрос доставки теста и оплаты, то есть вариант YSEQ:
https://forum.molgen.org/index.php/topic,6323.msg556657.html#msg556657

Спасибо! Очень интересное предложение... А с качеством там как?

[AVBaz]

Спасибо! Очень интересное предложение... А с качеством там как?

Из того, что попадалось на форуме - озывы вполне положительные. Рекомендуют тест WGS+. Посмотрите тему по YSEQ, ссылку на которую я дал выше.
 

[Sergey Piskunov]

Спасибо! Очень интересное предложение... А с качеством там как?

Из того, что попадалось на форуме - озывы вполне положительные. Рекомендуют тест WGS+. Посмотрите тему по YSEQ, ссылку на которую я дал выше.

Заказал WGS+, надеюсь все пройдет хорошо)

[Sergey Piskunov]

Подскажите по работе с сайтом yseq.net. Зарегистрировался на сайте, сделал заказ WGS+, оплатил в рублях через Yfull. Теперь не могу зайти на сайт yseq.net, логин и пароль не принимает. Пытался сбросить, на почту ничего не приходит...? И что в итоге (какие результаты) я получу. Это будет файл или результаты на сайте, в личном кабинете опубликуют?

[Semargl]

Подскажите по работе с сайтом yseq.net. Зарегистрировался на сайте, сделал заказ WGS+, оплатил в рублях через Yfull. Теперь не могу зайти на сайт yseq.net, логин и пароль не принимает. Пытался сбросить, на почту ничего не приходит...? И что в итоге (какие результаты) я получу. Это будет файл или результаты на сайте, в личном кабинете опубликуют?

Насколько я знаю, вам должен был прийти логин и пароль от YSEQ. Знающие люди, кто заказывал, подскажут какой порядок действий. В любом случае беспокоиться не стоит, так как все проблемы быстро решаемы. Томас из YSEQ обычно оперативно отвечает на обращения.

[AleksG]

Подскажите по работе с сайтом yseq.net. Зарегистрировался на сайте, сделал заказ WGS+, оплатил в рублях через Yfull. Теперь не могу зайти на сайт yseq.net, логин и пароль не принимает. Пытался сбросить, на почту ничего не приходит...? И что в итоге (какие результаты) я получу. Это будет файл или результаты на сайте, в личном кабинете опубликуют?

Да такой же косяк был.
Помогла информация от Yfull о номере YSEQ ID, по нему смог восстановить пароль на почту

[NathanS]

Подскажите по работе с сайтом yseq.net. Зарегистрировался на сайте, сделал заказ WGS+, оплатил в рублях через Yfull. Теперь не могу зайти на сайт yseq.net, логин и пароль не принимает. Пытался сбросить, на почту ничего не приходит...? И что в итоге (какие результаты) я получу. Это будет файл или результаты на сайте, в личном кабинете опубликуют?

Томас и Астрид отписывались в фэйсбуйе, что есть проблемы с мэйлами на адреса @gmail.com. У меня тоже проблема с одним набором, автоматического мэйла не приходит, но на мой мэйл они ответили и выслали ссылку для восстановления пароля (но что-то у меня не так пошло, пока не восстановил пароль).

Результаты будут: BAM-файл (загружается по запросу), куча файлов, которые надо себе загрузить, а среди них будет и BAM-файл с вырезанными данными только по Y-хромосоме и мито, которые можно и нужно загрузить на YFull для дальнейшего анализа. Они также вам пришлют список уже известных снипов, которые у вас определены, и список ваших приватных снипов, которые у вас нашли и которым дали названия.

[Semargl]

Или напишите мне в личку - я скину вам ваш YSEQ ID, зная который вы сбросите пароль от личного кабинета.

[Sergey Piskunov]

Или напишите мне в личку - я скину вам ваш YSEQ ID, зная который вы сбросите пароль от личного кабинета.

Спасибо, Semargl! Доступ в аккаунт YSEQ, восстановлен!

[Semargl]

Или напишите мне в личку - я скину вам ваш YSEQ ID, зная который вы сбросите пароль от личного кабинета.

Спасибо, Semargl! Доступ в аккаунт YSEQ, восстановлен!

Видимо у них действительно сейчас проблемы с отправкой писем или они попадают в спам.