Скачал себе в коллекцию геномы от Балановских из уже довольно старой
статьи. Поскольку это формат Human Origins, набор снипов там пересекается с используемым мной только на треть, из-за чего к IBD-расчётам геномы не применить, а в обычных калькуляторах очень сильно растёт разброс результатов. Поэтому ранее с ними не заморачивался.
По славянам там никакого "эксклюзива" нет, отмечу лишь, что выборка русских Лешуконского района Архангельской области оказалась ещё дальше от основной массы, чем предыдущие чемпионы - мезенцы и пинежане. На схеме пространства генофондов они вышли за пределы русского "облачка" и попали к коми-ижемцам. Собственно, это и есть самый восточный район области, углом вдающийся на территорию республики Коми, так что результат не удивляет.
Геномы с Кавказа смотрел частично, они более-менее попадают в родные выборки, но из-за высокого разброса и проблем с IBD сложно делать по ним выводы. Пока ничего такого, что могло бы сулить ценную информацию.
Что мне было интересно рассмотреть подробнее, так это ногайцев и башкир. До сих пор у меня были только результаты ногайцев из Карачаево-Черкесии с очень сильным влиянием кавказского генофонда, а у Балановских используются геномы астраханских и ставропольских ногайцев. Их результаты расположились чуть западнее выборки каракалпаков, настоящие ордынцы. Астраханские ногайцы плотно сгруппировались, а у ставропольских, по-видимому, ряд геномов - смешанного происхождения, поэтому для их положения на первой схеме взял усреднение только по пяти образцам из основного ядра.
Что касается башкир, то по ним у меня было не слишком много геномов с чётким происхождением. Если волжские татары тестируются хорошо и с ними картина в целом понятна, как более-менее и с чувашами, то по башкирам она строилась частично по предположениям. Смущала значительная разница результатов между башкирскими популяциями, а также проблема различения башкир этнических и "башкирцев" сословных. Здесь же имеется восемь выборок, рабитых по районам, хорошо накрывающих всю территорию Башкирии. "До кучи" добавил на схему и южносибирских тюрков. У казахов, каракалпаков и киргизов результаты в целом близки ранее имевшимся, поэтому не стал перегружать их образцами изображение.
Схема с усреднениями по выборкам, увеличение по клику
Схема с отдельными геномами, увеличение по клику. Ещё раз напомню, что разброс результатов сильно повышен из-за нехватки снипов. Возможно, что из-за этого и усреднения несколько сдвинуты, но не так уж сильно.
Могу сказать, что в предыдущие представления результаты вписались хорошо. Оставляя за скобками пермских татар, генофонд башкир распределяется от "южно-восточного" к "северному" кластеру. В южно-восточном кластере относительно более сильно выражены "восточные" компоненты ДНК, на схеме это правый конец "колбасы"
, а северный - левый.
Выборки из двух наиболее южных районов - Баймакского и Кугарчинского попали в южно-восточный кластер, а образцы из южного Ишимбайского и центрального Архангельского района оказываются сдвинуты от них на схеме левее и частично выше. При этом, ишимбайские образцы все достаточно близки остальным южанам, архангельские же растянуты от южно-восточного кластера к северному.
Выборка из северного Караидельского района формирует противоположный, северный полюс, и даже немного вышла за пределы облачка. Видимо, это наиболее выраженные "северяне" среди имеющихся образцов.
В северо-западных Янаульском и Илишевском районах заметен сдвиг положения маркеров к волжским татарам. Это же характерно и для части образцов из западного Давлекановского района. Наверное, проще всего это объяснить тем, что на западе татарское население наиболее значительно и с ними происходило смешение аутосомных генофондов.
Очень интересно, что в южно-восточный башкирский кластер прекрасно вписалась и выборка сибирских татар из Ялуторовского района Тюменской области. Не удивлюсь, если эта группа на деле является башкирами. Другие тюменские татары расположились между башкирами и отмеченным на схеме "облачком" ранее имевшихся образцов барабинских и томских татар. Только выборка заболотных татар уехала в тайгу.
Также стоит отметить, что хакасы чётко разделились на два кластера - один совпадает с шорцами, а второй сдвинут к востоку. При этом в выборке "Аскизский и Таштыпский районы" присутствуют люди из обоих кластеров, а в Орджоникидзевском районе "просто хакасы" попадают в шорский кластер, а хакасы-качинцы - в восточный. С этногенезом хакасов я не знаком, но наверняка это деление возникло не на пустом месте.
Мини-статья окончена