АвторТема: Эксперименты Srkz с аутосомами  (Прочитано 154383 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 8553
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4898/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #825 : 30 Август 2020, 16:54:43 »
Спасибо! А белорусы из каких населенных пунктов? И есть ли более новые выборки по тем и другим?
В основном там Витебщина, по-моему. Но точно не уверен. Совсем не охватывали аутосомами только северо-запад страны, судя по всему.
А что именно хотите узнать по выборкам? Там достаточно слабо различаются регионы друг от друга.

Оффлайн Гордий

  • Сообщений: 164
  • Рейтинг +13/-0
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #826 : 30 Август 2020, 17:18:34 »

А что именно хотите узнать по выборкам?

1. Сравнение белорусов Брестской области и украинцев Волынской области.
2. Сравнение белорусов Гомельской области (полесские районы) с украинцами Житомирской и Ровенской областей.
3. Сравнение украинцев правобережного Полесья (Волынская, Ровенская, Житомирская области) с украинцами других регионов.

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 8553
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4898/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #827 : 30 Август 2020, 17:24:09 »
1. Сравнение белорусов Брестской области и украинцев Волынской области.
2. Сравнение белорусов Гомельской области (полесские районы) с украинцами Житомирской и Ровенской областей.
3. Сравнение украинцев правобережного Полесья (Волынская, Ровенская, Житомирская области) с украинцами других регионов.
В научных работах так пока вообще не детализируют. Да и современные методы там не показывают полезной информации. Идёт очень плавный и постепенный переход между макрорегионами ("генетический клин"). Наверное, в данном случае стоит больше смотреть в сторону игреков.

Оффлайн Гордий

  • Сообщений: 164
  • Рейтинг +13/-0
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #828 : 30 Август 2020, 17:36:57 »
1. Сравнение белорусов Брестской области и украинцев Волынской области.
2. Сравнение белорусов Гомельской области (полесские районы) с украинцами Житомирской и Ровенской областей.
3. Сравнение украинцев правобережного Полесья (Волынская, Ровенская, Житомирская области) с украинцами других регионов.
В научных работах так пока вообще не детализируют. Да и современные методы там не показывают полезной информации. Идёт очень плавный и постепенный переход между макрорегионами ("генетический клин"). Наверное, в данном случае стоит больше смотреть в сторону игреков.

Насколько я знаю, по игрекам и митохондриям украинцев Волынской области не исследовали. Где-то попадалась информация, что Данила Галицкий, когда изгнал ятвягов из района Бреста, переселил туда много выходцев из галицких земель. Интересно, могут ли белорусы Бреста более отклоняться к галичанам, чем к волынякам? Еще возникли вопросы чисто антропологического плана - те же волыняне очень сходны были антропологически с ятвягами и латгалами. Могут ли аутосомы показать близость?

Цитировать
Идёт очень плавный и постепенный переход между макрорегионами

Проблема возникает в определении макрорегионов.

Оффлайн Stanislav S

  • Сообщений: 602
  • Страна: ru
  • Рейтинг +132/-4
  • Y-ДНК: R1a1a1b1a2b3
  • мтДНК: H3
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #829 : 30 Март 2021, 14:06:46 »
Интересно, могут ли белорусы Бреста более отклоняться к галичанам, чем к волынякам?  

Разве в то время Волынь не относилась к "галицким землям"? Насколько мне известно, в подавляющей массе галичане и волыняне составляют достаточно гомогенную генетическую популяцию, а какое то своеобразие имеют лишь субэтнические популяции бойков, лемков и гуцулов.


Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 8553
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4898/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #830 : 11 Май 2021, 13:20:06 »
Интересно,а сколько всего было удинских образцов в выборке, не появились ли новые, какой у них дрейф и как бы они смотрелись по отдельности? Может есть вариант плота для Кавказа с отдельными образцами для всех групп?
Это просто был одиночный образец, заявленный удинским. Поэтому на всякий случай убрал до появления других, подтверждающих или опровергающих. Но пока их не появилось.

Оффлайн kardes

  • Сообщений: 1176
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1733/-11
  • Y-ДНК: G2a1
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #831 : 28 Сентябрь 2021, 22:57:36 »
РСА из работы по Беле3

По двум выборкам осетин вопрос уже поднимался, обе сближаются с западными адыгами и абхазами. То что общ.осетины дальше от сев.осетин, а адыги дальше от абхаз это всё таки бОльше реальные отличия или  же влияние разного алгоритма из разных работ? Аналогичный вопрос по двум выборкам грузин? Все 20 грузин из одной работы, но с двух разных регионов Грузии, или 10 с одной работы, и 10 с другой? В других выборках вроде такой дифференциации не видно, а есть просто рыхлые результаты у кумыков и тюрок.


и ещё уфимские образцы на плоте из работы по кумыкам

и никаких "сбежавших" осетин, адыгов и грузин, а наоборот "разбежавшиеся" на плоте балкарцы и кумыки  ??? ~
« Последнее редактирование: 26 Март 2022, 02:44:13 от kardes »

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 8553
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4898/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #832 : 29 Сентябрь 2021, 10:57:17 »
По двум выборкам осетин вопрос уже поднимался, обе сближаются с западными адыгами и абхазами. То что общ.осетины дальше от сев.осетин, а адыги дальше от абхаз это всё таки бОльше реальные отличия или  же влияние разного алгоритма из разных работ? Аналогичный вопрос по двум выборкам грузин? Все 20 грузин из одной работы, но с двух разных регионов Грузии, или 10 с одной работы, и 10 с другой? В других выборках вроде такой дифференциации не видно, а есть просто рыхлые результаты у кумыков и тюрок.
Да, странная картинка. Но мне кажется, где подписано "северные осетины", это значок "общ. осетин". А северных осетин вообще здесь не вижу. Может, вместе с адыгами это и они, но тогда к значку добавлен лишний квадрат.

Какое объяснение приходит в голову. Наверное, вдоль правой стенки графика снизу вверх идёт дифференциация между компонентами Ближнего Востока и Западного Кавказа. Почему самыми выраженными западными кавказцами получились адыги, не знаю. По идее, этот полюс должен быть где-то у сванов. То, что абхазы отличаются от адыгейцев, нормально, они и должны сближаться с грузинами. Кто же расположился вместе с адыгейцами, непонятно. По идее, осетин там не должно быть. У грузин повыше может быть выборка с запада (мегрелы), пониже - с востока и из центра. А северные кавказцы сдвинуты оттуда к европейским популяциям. Тут, в принципе, ещё как-то логично выглядит сближение на проекции осетин с абхазами, хотя вообще их не спутаешь.

Оффлайн kardes

  • Сообщений: 1176
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1733/-11
  • Y-ДНК: G2a1
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #833 : 29 Сентябрь 2021, 21:52:06 »
Спасибо большое, уважаемый Srkz. Изменил немного картинку, чтобы сакцентировать вопрос. Если бы не странный одинаковый сдвиг зелёной группы адыгоосетиногрузин(при сохранении их кучности), то вообще не обратил бы внимание на этот на коленке сделанный зеркальноверхтормашный плот, который для публичной презентации Белы3 вполне пригодный. Но, похожий на сбитую мушку сдвиг, заставляет усомниться в верности используемых научных образцов у Краузе? Или сев.осетин там нет и вместо них какие-то абазины, или всё таки зелёная группа это изначально некачественно рассчитанные образцы и их использование в РСА заведомо вносит искажение в конечный расчёт? Вопрос достоверности научных выборок осетин и адыгов ранее уже поднимался и по качеству грузинских образцов вроде тоже. Даже если смешать южных осетин с абазинами, всё равно они не наложатся на адыгов. На плоте по 10 отобранных научных образцов от каждой популяции, статья готовилась вроде с 2015 года, из каких исследований их взяли Краузе/Надь и в каких работах они ещё использовались? Есть ли возможность как то перепроверить эти выборки из зелёной группы?
п.с. Краузе/Хаммель/Надь скорее всего не причём, новый "китайский" анализ от новых авторов? - Chuan-Chao Wang, Cosimo Posth, Anja Furtwängler, Katalin Sümegi, Zsolt Bánfai, Miklós Kásler, Johannes Krause & Béla Melegh

Оффлайн Kambic

  • Сообщений: 1485
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1549/-34
  • Y-ДНК: r1b
  • мтДНК: H
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #834 : 29 Сентябрь 2021, 22:57:49 »
Заметил тоже этих "осетин", но пока решил промолчать,  т.к. "меня терзают смутные сомнения"© между предвзятостью и безалаберностью. Не Краузе и Ванг, а скорее всего сами венгры напутали намешали вместе немецкие и китайские эталоны. "Разруха в головах, а не в ...советских газетах"© "...но ведь других газет нет?-тогда никакие не читайте".

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 8553
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4898/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #835 : 30 Сентябрь 2021, 06:59:08 »
Ну вот такое ещё есть безумное предположение ::) Загадочный значок, которым отмечена перемешавшаяся с адыгейцами выборка, выглядит, как наложение друг на друга значков "осетины" и "северные осетины". Что, если просто одни и те же образцы попали в обе выборки, их обработали два раза и два раза отрисовали на одном месте. Тогда логично, что программа их посчитала более специфичными, чем других кавказцев, и поместила на самый край, ведь у каждого оказалось по "суперблизкому родственнику". А для тех нескольких осетин, которые не задвоились, искажение позиции проявилось в меньшей степени  ¯\_(ツ)_/¯


« Последнее редактирование: 30 Сентябрь 2021, 09:06:27 от Srkz »

Оффлайн Kambic

  • Сообщений: 1485
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1549/-34
  • Y-ДНК: r1b
  • мтДНК: H
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #836 : 30 Сентябрь 2021, 12:09:48 »
Надо просмотреть и другие работы венгерских авторов по дднк авар, завоевателей и т.п., какие там выборки применялись. В любом случае выбор  виновных и подозреваемых лиц ограничен. У немцев, венгров и китайцев своих "научных осетин" нет, им же наши "помогли"(эстонцы,уфимцы,балановских). Не хочется пока тыкать пальцем в зрительный зал, надо сначала залезть в сОплименты.

Оффлайн SrkzАвтор темы

  • Сообщений: 8553
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4898/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #837 : 30 Сентябрь 2021, 13:01:43 »
Во всяком случае, на двух других просмотренных версиях этого плота из прошлых лет есть только North_Ossetian и образцы кучкуются более логично - общее облачко Северного Кавказа отдельно, общее облачко грузин и абхазов отдельно.

Выборки заявлены Human Origins

Цитировать
Populations for comparisons

The genomic data of populations used for comparisons are from the Human Origin Dataset: https://reich.hms.harvard.edu/allen-ancient-dna-resource-aadr-downloadable-genotypes-present-day-and-ancient-dna-data.

Вот, видимо, шесть осетин от Балановских это те, кто на плоте идут Ossetian. Остальные были и раньше. На IBD-сегменты большинство из них не проверял, потому что с Human Origins слабое пересечение по снипам, но по Admixture те старые вроде достаточно похожи на осетин )) Два последних есть с полным набором снипов, они и по IBD нормальные осетины.

3061   OCE-058   OCE-058   JeongNatureEcologyEvolution2019   Oleg Balanovsky / Elena Balanovska   0   ..   Ossetian   North Ossetia Republic   Russia   43.12   43.55   Balanovsky   ..   584954   M   ..   PASS (genotyping)                     
3062   OCE-155   OCE-155   JeongNatureEcologyEvolution2019   Oleg Balanovsky / Elena Balanovska   0   ..   Ossetian   North Ossetia Republic   Russia   43.12   43.55   Balanovsky   ..   585575   M   ..   PASS (genotyping)                     
3063   OCE-160   OCE-160   JeongNatureEcologyEvolution2019   Oleg Balanovsky / Elena Balanovska   0   ..   Ossetian   North Ossetia Republic   Russia   43.12   43.55   Balanovsky   ..   585136   M   ..   PASS (genotyping)                     
3064   OCE-161   OCE-161   JeongNatureEcologyEvolution2019   Oleg Balanovsky / Elena Balanovska   0   ..   Ossetian   North Ossetia Republic   Russia   43.12   43.55   Balanovsky   ..   585125   M   ..   PASS (genotyping)                     
3065   OCE-195   OCE-195   JeongNatureEcologyEvolution2019   Oleg Balanovsky / Elena Balanovska   0   ..   Ossetian   North Ossetia Republic   Russia   43.12   43.55   Balanovsky   ..   585541   M   ..   PASS (genotyping)                     
3066   OCE-224   OCE-224   JeongNatureEcologyEvolution2019   Oleg Balanovsky / Elena Balanovska   0   ..   Ossetian   North Ossetia Republic   Russia   43.12   43.55   Balanovsky   ..   580851   M   ..   PASS (genotyping)                     

5354   NorthOssetia19   NorthOssetia19   LazaridisNature2014   Mait Metspalu / Richard Villems / Leila Laredj / Ene Metspalu / Elza Khusnutdinova / Rita Khusainova / Sergey Litvinov   0   ..   Ossetian   Vladikavkaz_in_Republic_of_North_Ossetia_Alania   Russia   43.016667   44.65   6   ..   592769   M   ..   PASS (genotyping)                     
5363   NorthOssetia2   NorthOssetia2   LazaridisNature2014   Mait Metspalu / Richard Villems / Leila Laredj / Ene Metspalu / Elza Khusnutdinova / Rita Khusainova / Sergey Litvinov   0   ..   Ossetian   Vladikavkaz_in_Republic_of_North_Ossetia_Alania   Russia   43.016667   44.65   6   ..   593084   M   ..   PASS (genotyping)                     
5375   NorthOssetia3   NorthOssetia3   LazaridisNature2014   Mait Metspalu / Richard Villems / Leila Laredj / Ene Metspalu / Elza Khusnutdinova / Rita Khusainova / Sergey Litvinov   0   ..   Ossetian   Vladikavkaz_in_Republic_of_North_Ossetia_Alania   Russia   43.016667   44.65   6   ..   592343   M   ..   PASS (genotyping)                     
5387   NorthOssetia5   NorthOssetia5   LazaridisNature2014   Mait Metspalu / Richard Villems / Leila Laredj / Ene Metspalu / Elza Khusnutdinova / Rita Khusainova / Sergey Litvinov   0   ..   Ossetian   Vladikavkaz_in_Republic_of_North_Ossetia_Alania   Russia   43.016667   44.65   6   ..   592696   M   ..   PASS (genotyping)                     
5398   NorthOssetia11   NorthOssetia11   LazaridisNature2014   Mait Metspalu / Richard Villems / Leila Laredj / Ene Metspalu / Elza Khusnutdinova / Rita Khusainova / Sergey Litvinov   0   ..   Ossetian   Vladikavkaz_in_Republic_of_North_Ossetia_Alania   Russia   43.016667   44.65   6   ..   592981   M   ..   PASS (genotyping)                     
5399   NorthOssetia8   NorthOssetia8   LazaridisNature2014   Mait Metspalu / Richard Villems / Leila Laredj / Ene Metspalu / Elza Khusnutdinova / Rita Khusainova / Sergey Litvinov   0   ..   Ossetian   Vladikavkaz_in_Republic_of_North_Ossetia_Alania   Russia   43.016667   44.65   6   ..   593170   M   ..   PASS (genotyping)                     
5410   NorthOssetia12   NorthOssetia12   LazaridisNature2014   Mait Metspalu / Richard Villems / Leila Laredj / Ene Metspalu / Elza Khusnutdinova / Rita Khusainova / Sergey Litvinov   0   ..   Ossetian   Vladikavkaz_in_Republic_of_North_Ossetia_Alania   Russia   43.016667   44.65   6   ..   592672   M   ..   PASS (genotyping)                     
5411   NorthOssetia9   NorthOssetia9   LazaridisNature2014   Mait Metspalu / Richard Villems / Leila Laredj / Ene Metspalu / Elza Khusnutdinova / Rita Khusainova / Sergey Litvinov   0   ..   Ossetian   Vladikavkaz_in_Republic_of_North_Ossetia_Alania   Russia   43.016667   44.65   6   ..   592617   M   ..   PASS (genotyping)                     
5422   NorthOssetia14   NorthOssetia14   LazaridisNature2014   Mait Metspalu / Richard Villems / Leila Laredj / Ene Metspalu / Elza Khusnutdinova / Rita Khusainova / Sergey Litvinov   0   ..   Ossetian   Vladikavkaz_in_Republic_of_North_Ossetia_Alania   Russia   43.016667   44.65   6   ..   592753   M   ..   PASS (genotyping)                     
5433   NorthOssetia17   NorthOssetia17   LazaridisNature2014   Mait Metspalu / Richard Villems / Leila Laredj / Ene Metspalu / Elza Khusnutdinova / Rita Khusainova / Sergey Litvinov   0   ..   Ossetian   Vladikavkaz_in_Republic_of_North_Ossetia_Alania   Russia   43.016667   44.65   6   ..   592606   M   ..   PASS (genotyping)                     

12658   S_North_Ossetian-1.DG   NorthOssetia12   MallickNature2016   ..   0   present   Russia_NorthOssetian.DG   Vladikavkaz, Republic of North Ossetia Alania   Russia   43.016667   44.65   Shotgun.diploid   43.13   584699   M   ..   PASS (SGDP, Fully Public)                     
12729   S_North_Ossetian-2.DG   NorthOssetia5   MallickNature2016   ..   0   present   Russia_NorthOssetian.DG   Vladikavkaz, Republic of North Ossetia Alania   Russia   43.016667   44.65   Shotgun.diploid   46.29   582557   M   ..   PASS (SGDP, Fully Public)                     
« Последнее редактирование: 30 Сентябрь 2021, 13:23:17 от Srkz »

Оффлайн kardes

  • Сообщений: 1176
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1733/-11
  • Y-ДНК: G2a1
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #838 : 30 Сентябрь 2021, 14:23:21 »
Надо просмотреть и другие работы венгерских авторов по дднк авар, завоевателей и т.п., какие там выборки применялись. В любом случае выбор  виновных и подозреваемых лиц ограничен. У немцев, венгров и китайцев своих "научных осетин" нет, им же наши "помогли"(эстонцы,уфимцы,балановских). Не хочется пока тыкать пальцем в зрительный зал, надо сначала залезть в сОплименты.
Сам то уже наверно и в сопли давно залез и ответ заранее знал?

Во всяком случае, на двух других просмотренных версиях этого плота из прошлых лет есть только North_Ossetian и образцы кучкуются более логично - общее облачко Северного Кавказа отдельно, общее облачко грузин и абхазов отдельно.
Выборки заявлены Human Origins
 
Вот, видимо, шесть осетин от Балановских это те, кто на плоте идут Ossetian. Остальные были и раньше. На IBD-сегменты большинство из них не проверял, потому что с Human Origins слабое пересечение по снипам, но по Admixture те старые вроде достаточно похожи на осетин )) Два последних есть с полным набором снипов, они и по IBD нормальные осетины.
Ещё раз спасибо, уважаемый Srkz.
Тогда ещё  такой дополнительный вопрос, на приведенном плоте сдвинулись только старые уфимские выборки из зеленой группы или и у остальных популяций тоже есть старые сдвинутые уфимские образцы, почему у них "сломались"  только адыги, осетины и грузины)?

Оффлайн Kambic

  • Сообщений: 1485
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1549/-34
  • Y-ДНК: r1b
  • мтДНК: H
Re: Эксперименты Srkz с аутосомами
« Ответ #839 : 30 Сентябрь 2021, 17:00:14 »
Надо просмотреть и другие работы венгерских авторов по дднк авар, завоевателей и т.п., какие там выборки применялись. В любом случае выбор  виновных и подозреваемых лиц ограничен. У немцев, венгров и китайцев своих "научных осетин" нет, им же наши "помогли"(эстонцы,уфимцы,балановских). Не хочется пока тыкать пальцем в зрительный зал, надо сначала залезть в сОплименты.
Сам то уже наверно и в сопли давно залез и ответ заранее знал?
 
 старые сдвинутые уфимские образцы, почему у них "сломались"  только адыги, осетины и грузины)?
а-а, ? зачем венграм ломать осетин, адыгов и грузин, а кто передал туда сломанные старые уфимские образцы известно же, можно даже пальцем показать, но опять "меня терзают смутные сомнения" об их беспристрастности и пристрастности.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.