Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)

[kardes]

ПОГРЕБАЛЬНАЯ ПЕЩЕРА: IRON II. ОТБОР ДРЕВНИХ ОБРАЗЦОВ ДНК И АНАЛИЗ ОДНОРОДИТЕЛЬСКИХ МАРКЕРОВ
В этом кратком отчете представлена ​​основная информация о двух людях из погребальной пещеры Iron II в Кириаф-Иариме. Генетически это один мужчина (I14918) и одна женщина (I14919). Наш анализ был сосредоточен на патрилинейных (гаплогруппа Y) и матрилинейных (гаплогруппы мтДНК) маркерах. После сравнения с другими опубликованными материалами гаплогруппы, по-видимому, имеют широкое «локальное» географическое распространение и, возможно, довольно древнее происхождение. Y гаплогруппаJ2a1a1a2b2a1b1~   , вероятно, возникла на Кавказе или в Анатолии, возможно, еще в конце верхнего палеолита. мтДНК гаплогруппа T1a9 могла присутствовать на Ближнем Востоке в PPN и H87. Возможно, их корни находятся на Аравийском полуострове. Более того, можно с осторожностью отметить, что их предковые, кладальные и субгаплогруппы продолжали существовать, главным образом на Ближнем Востоке и в Средиземноморье, на протяжении многих тысячелетий, с географически близкими примерами на таких памятниках, как Айн-Газаль в PPNB; энеолитический Пкиин; и средне-позднебронзовые Мегиддо и Алалах; эти гаплогруппы сохраняются и по сей день. Как отмечалось выше, в данном отчёте не рассматривался сложный и обширный набор аутосомных данных, полученных от этих людей; этот анализ будет представлен в последующей публикации. Высокое качество данных также позволяет предположить, что некраниальные остеологический материал других людей, упомянутых в главе 27, может дать ценные палеогеномные данные. Дальнейшие исследования этих образцов могут быть целесообразными, несмотря на общую низкую сохранность ДНК в скелетных материалах древнего Израиля.

[Arame]

Про денисовца одно непонятно.
По аутгсомам они как бы родня неандертальцов. Более близки к ним.

Но по игрекам и мито неандертальцы более близки к людям.

Как это понять. В статье не нашел обяснения.

Не найду статью, их немало было, но периодическая интрогрессия с африканской ветвью помимо пары процентов аутосом дала неандертальцам предсапиенсные Y и мито

Речь об этой статье

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2025.10.20.683404v1

Там неандертало-денисовцы отделяются от людей 800.000 лет назад по аутосомам.

А по игрекам другая картина.

[Srkz]

Там неандертало-денисовцы отделяются от людей 800.000 лет назад по аутосомам.
А по игрекам другая картина.

А как в других статьях это считают? У меня почти ничего не сохранено на эту тему, но вот открыл старую статью по сунгирцам, там расхождение с одними неандертальцами современным людям насчитали 545 тысяч лет назад, это уже ближе к картине по игрекам-мито. В идеале надо бы взять наиболее старые образцы современных людей, и наиболее молодые неандертальцев с денисовцами. Это будет одна эпоха, вот и сравнить их в одних условиях. Раз уж геномов сапиенсов эпохи расчётного расхождения у нас нет.

[zastrug]

Если когда-нибудь появятся результаты какого-то сапиенса сапиенса возрастом 200 тысяч лет, по аутосомам он тоже будет  ближе к неандертальцам и денисовцам, чем к современным людям.

С чего бы? С каких пор существа разных видов( Homo sapiens sapiens и Homo neanderthalensis с Homo denisovensis) ближе друг к другу чем существа одного вида?

[kardes]

Генетический анализ сакской культуры IA, исследование древней ДНК из могильника Боз-Бармак в Киргизии.

Genetic insights into Iron Age Saka culture: Ancient DNA analysis of the Boz-Barmak graveolens, Kyrgyzstan Опубликовано 4 ноября 2025 г.
Кочевые культуры железного века сыграли важную роль в формировании генетического и культурного ландшафта популяций Евразии. Тем не менее, несмотря на свое ключевое географическое положение, регион Центральной Евразии остается недостаточно представленным в исследованиях древней ДНК людей. Мы восполняем этот пробел с помощью геномного анализа 12 человек из могильника Боз-Бармак в Кыргызстане, связанного с сакскими скотоводами (IV-II вв. до н. э.), 9 из которых дали геномы с низким покрытием. Генетический кластерный анализ поместил этих людей в генетическую вариацию древних и современных популяций Центральной Евразии и Сибири. Мы не обнаружили доказательств наличия родственников первой степени в анализе родства, однако, по-видимому, присутствует сеть отношений второй и третьей степени. Примечательно, что все мужчины имеют одинаковый гаплотип Y-хромосомы R1a1a1b2, распространённый у современных киргизов и таджиков, в то время как митохондриальная ДНК показала сравнительно высокое разнообразие, с различными гаплогруппами, наблюдаемыми у всех исследованных индивидов. Эти результаты согласуются с археологическими и этнографическими свидетельствами патрилокальности у саков раннего железного века, где мужские линии оставались стабильными из поколения в поколение, в то время как женская мобильность способствовала генетическому разнообразию. Наше исследование дополняет наше понимание взаимодействия между родством, социальной организацией и историей населения в кочевых культурах.

[rozenblatt]

https://www.e-anthropology.com/Katalog/Arheologia/STM_DWL_fDEN_WweUtoYaKyN1.aspx

Stratum plus. 2025. №5

И. Э. Альборова, Х. Х. Мустафин, О. Ю. Чечеткина, И. В. Белоцерковская, Е. В. Веселовская (Москва, Россия), А. Н. Гаврилов (Шилово, Россия)

Результаты генетико-антропологических исследований рязано-окцев

Страницы: 405-432 | DOI: https://doi.org/10.55086/sp255405432

В настоящей работе впервые представлены результаты палеогеномных исследований представительной группы рязано-окцев из могильников Среднего Поочья конца V — начала VI веков. Из археологических образцов рязано-окцев, представлявших собой крайне деградированный антропологический материал, удалось выделить ДНК, и для всех 14 индивидов — провести секвенирование однородительских маркеров, а для двух из них — с помощью широкой панели зондов на 2,1M однонуклеотидных полиморфизмов — секвенирование аутосомных маркеров.
Выявлено разнообразие генофонда рязано-окцев по однородительским маркерам. Из шести исследованных мужских образцов у четырёх выявлены генетические линии гаплогруппы N, у двух других индивидов — R1a и J2b. В полногеномных последовательностях митохондриальной ДНК у 14 рязано-окцев выявлены полиморфизмы, определяющие гаплогруппы с западно-евразийским (H, U, R1a1a1, K1c1h, J) и с восточно-евразийским (Z1a1a) распространением.
Генетическая изменчивость разано-окцев по аутосомным маркерам было исследовано методом анализа главных компонент (PCA). При этом на геномы почти четырёх тысяч современных и средневековых образцов Евразии были спроецированы данные широкогеномного секвенирования двух индивидов (Ундрих 90 и Борок 513), полученные в настоящей работе. На графике PCA, в генетическом пространстве Евразии, индивид Ундрих 90 оказался генетически близок к финно-угорским и другим народам волго-уральского региона. Профиль аутосомной ДНК второго индивида Борок 513 попал в генетическую вариацию современных восточно-европейских популяций. Полученные результаты анализа аутосомных маркеров согласуются с результатами анализа Y-хромосомы.
С помощью анализа фенотипических маркеров рязано-окцев выполнена реконструкция внешних признаков, связанных с цветом волос, радужки глаз и кожного покрова. По черепам из трех погребений рязано-окской культуры выполнены научные реконструкции облика

Ключевые слова: рязано-окская археологическая культура; древняя ДНК, Y-хромосома; мт-ДНК; секвенирование; однонуклеотидный полиморфизм; гаплогруппа, краниология; антропологическая реконструкция внешности

[rozenblatt]

Кажись секвенировали ДНК Гитлера: https://www.independent.co.uk/news/science/adolf-hitler-dna-sexual-disorder-kallmann-syndrome-b2864008.html

[пенелопа]

У нацистского диктатора был синдром Кальмана.
Результаты исследования будут представлены в документальном фильме Channel 4 «ДНК Гитлера: портрет диктатора», в котором также развенчиваются мифы о еврейском происхождении Гитлера и приводятся доказательства того, что у него, вероятно, было одно или несколько расстройств аутистического спектра или психических заболеваний.

Учёные смогли составить профиль ДНК по образцу окровавленной ткани, которую полковник армии США отрезал от дивана, на котором Гитлер покончил с собой в 1945 году.

[Nicola_Canadian]

И это все ,что они обнародовали?
Как там дела с аутосомами да прямыми мужскими и женскими линиями?
Или это очередная утка?

[Brahgalhar]

https://discover.familytreedna.com/y-dna/R-PF6162/ancient

Proto-Yamnaya culture

I1456 R-Z645 3500-3000 BCE Durankulak Bulgaria

Интересно получается согласно данным FTDNA. Я думал ранее, что M417 только в Центральной Европе разделилась на CTS4385 и Z645.

[kardes]

кроме дднк злаковых смогли извлечь и палеообразцы людей
Метагеномный взгляд на тростниковую мумию
Аннотация.
Многочисленные исследования показали, что метагеномика открыла новое измерение в прочтении содержимого археологических находок как капсул времени. Тростниковые мумии - это ритуальные предметы, изготовленные в Древнем Египте путем формирования фигур в форме людей из зерен злаков, выращенных в смеси воды и земли. Мы провели метагеномный анализ образцов из такой мумии, датируемой второй половиной III века до н. э . Наряду с рядом явно современных загрязнителей мы идентифицировали организмы, которые нельзя исключить как имеющие историческое происхождение. Помимо значительного количества бактериальных последовательностей, принадлежащих родам Bacillus, Mesobacillus, Metabacillus, Neobacillus, Niallia, Peribacillus и Paenibacillus, мы также обнаружили следы растений, животных и людей. Последовательности, отнесённые к роду Triticum, показали наибольшее сходство с древними образцами T. turgidum ssp. dicoccum из Египта и Южного Леванта. Фрагменты, идентифицированные как принадлежащие чешуекрылым, показали наибольшее сходство с геномами бражников (Sphingidae). Анализ последовательностей, полученных от человека, выявил гаплотипы L3 (мтДНК), E и J (Y-хромосома), которые широко распространены в современной Африке.
На основании соотношения прочтений, совпадающих с X- и Y-хромосомами, был определён кариотип XY (Ry = 0,099, 95% ДИ: 0,093–0,104). При выравнивании прочтения с Y-хромосомой было получено покрытие 0,62% и средняя глубина 0,01, а гаплотип был предсказан как J1a2a1a1a∼ (путь: A1b, BT, C1a2, CT) и E1a2b1a2 (путь: BT, CT, E) с помощью pathPhynder и yHaplo соответственно.

[Farroukh]

E1a2b1a2 (путь: BT, CT, E)

Это E-Z5987

[Georg]

Соседняя тема закрыта почему-то
https://www.nature.com/articles/s41586-025-09811-4
Homo sapiens-specific evolution unveiled by ancient southern African genomes
https://naked-science.ru/article/anthropology/uchenye-nashli-sledy-drev
Южноафриканская популяция, жившая до смешения в 6 веке, была изолирована более 100000 лет и ведет начало от древнейшего разделения 300-240 килолет.
У некоторых бушменов до 80% днк от этой популяции.

У меня лично несколько вопросов (возможно риторических)
1. Пообщаться бы и провести тесты интеллекта настолько генетически удаленных индивидов, это ж или реликты или почти инопланетяне (хотя некоторые считают такими китайцев ) из-за особенностей культуры)
2. Интересно бы заставить компьютер просчитать дальнейшую гипотетическую изолированную эволюцию и дрейф генов
3. Была ли генетическая изоляция у тех групп - вроде нет, так как их гены всё-таки проникали на север (но не наоборот)

[kardes]

Большое массовое захоронение раннего железного века свидетельствует об избирательном насилии в отношении женщин и детей в Карпатском бассейне.
Рассуждения о мотивах и условиях массового насилия как устойчивой характеристики конфликта на протяжении всей истории человечества становились всё более сложными и насыщенными.Жертвы этих событий играют ключевую роль в понимании эволюции и преобразующей силы агрессивного поведения, которое развивалось от простого межгруппового конфликта до более крупного массового насилия. Здесь мы представляем результаты биоархеологического исследования 77 и биомолекулярного анализа 25 человек из массового захоронения IX века до н. э. из Гомолавы в Карпатском бассейне, Юго-Восточная Европа. Это место находится на стыке сложных социально-пространственных отношений, расходящихся культурных традиций и ценностей, а также конкурирующих идеологий использования ландшафта. Чрезмерное смертоносное насилие, совершавшееся в основном в отношении женщин и детей, предполагает избирательную демографическую предвзятость. Люди, похороненные вместе, имели мало общих, даже отдалённых, генетических связей, и поэтому их убийство представляет собой яркое свидетельство эпизода межрегионального конфликта и подспудного агрессивного сдвига во власти, насилии и гендерных отношениях в регионе. Гомолава приводит доказательства преднамеренного уничтожения отдельных групп населения региона как мотивации массового насилия в поздней доисторической Европе. Это также проливает новый свет на социально-экономическую роль и значение женщин и молодёжи в поздней доисторической Европе.
-данные доступны.

[kardes]

Происхождение, смешение популяций и патогены у современных неолитических земледельцев и охотников-собирателей на острове Готланд.
Аннотация.
На Готланде более 500 лет сосуществовали два археологических культурных комплекса, примерно с 3300 по 2800 кал. до н.э.: неолитическая культура воронкообразных кубков (FBC) и культура ямчатой ​​керамики (PWC). Происхождение земледельцев FBC и морских собирателей PWC в значительной степени совпадает с европейскими неолитическими земледельцами и европейскими мезолитическими собирателями соответственно, но прямое взаимодействие между этими группами на Готланде остается неизученным. Мы представляем геном среднего неолита (MN) с высоким покрытием и геном позднего неолита (LN) с низким покрытием из дольмена FBC в Ансарве. Мы исследуем происхождение, смешение генов и патогены среди этих земледельцев MN (n = 6), собирателей (n = 19) и представителя LN. Мы обнаружили, что недавний обмен генами между земледельцами и собирателями мог иметь место, хотя большая часть обмена генами произошла до их сосуществования на острове.
img1    img2   img3    img4
Мы также обнаружили свидетельства существования различных штаммов Yersinia pestis в трех культурных группах, что указывает на широкое распространение этого паразита среди групп с различными стратегиями жизнеобеспечения.