АвторТема: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)  (Прочитано 1111940 раз)

0 Пользователей и 13 Гостей просматривают эту тему.

Оффлайн vvw1717

  • Сообщений: 337
  • Страна: ru
  • Рейтинг +461/-16
Карлик из античной Сицилии имел анатолийское происхождение

(сам не проверял – уж больно БАМ огромный).
Если ещё и анализ стабильных изотопов и детрина покажет не местное происхождение, то можно с уверенностью утверждать что как минимум одна морская прогулка на галере в жизни коротышки была. Качественных и пригодных для дерева yfull образцов G2a1 очень мало, может хоть теперь этот карлик из малыша станет научным гигантом?

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 6494
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4885/-5
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Карлик из античной Сицилии имел анатолийское происхождение

(сам не проверял – уж больно БАМ огромный).
Если ещё и анализ стабильных изотопов и детрина покажет не местное происхождение, то можно с уверенностью утверждать что как минимум одна морская прогулка на галере в жизни коротышки была. Качественных и пригодных для дерева yfull образцов G2a1 очень мало, может хоть теперь этот карлик из малыша станет научным гигантом?
Бамов нет. Постараюсь, если позволит время, скачать самую тяжелую пару FASTQ и перегнать сразу в T2T.

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1703
  • Страна: kg
  • Рейтинг +2318/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
https://www.nature.com/articles/s41598-024-62524-y

Geographic origin, ancestry, and death circumstances at the Cornaux/Les Sauges Iron Age bridge, Switzerland

    Zita Laffranchi, Stefania Zingale, Lara Indra, Valentina Coia, Domingo C. Salazar García, Alice Paladin, Marc-Antoine Kaeser, Géraldine Delley, Sönke Szidat, Sandra Lösch, Albert Zink & Marco Milella

Abstract

Cornaux/Les Sauges (Switzerland, Late Iron Age) revealed remnants of a wooden bridge, artifacts, and human and animal skeletal remains. The relationship between the collapsed structure and the skeletal material, whether it indicates a potential accident or cultural practices, remains elusive. We evaluate the most plausible scenario for Cornaux based on osteological, taphonomic, isotopic, and paleogenomic analysis of the recovered individuals. The latter amount to at least 20 individuals, mostly adult males. Perimortem lesions include only blunt force traumas. Radiocarbon data fall between the 3rd and 1st c. BCE, although in some cases predating available dendrochronological estimates from the bridge. Isotopic data highlight five to eight nonlocals. No close genetic relatedness links the analyzed skeletons. Paleogenomic results, the first for Iron Age Switzerland, point to a genetic affinity with other Central and Western European Iron Age groups. The type of skeletal lesions supports an accidental event as the more plausible explanation. Radiocarbon data and the demographic structure of the sample may suggest a sequence of different events possibly including executions and/or sacrifices. Isotopic and paleogenomic data, while not favoring one scenario over the other, do support earlier interpretations of the last centuries BCE in Europe as a dynamic period from a biocultural perspective.

В Корно/Лес- Сож (Швейцария, поздний железный век) были обнаружены остатки деревянного моста, артефакты, а также останки скелетов людей и животных. Связь между разрушенной конструкцией и скелетным материалом, указывает ли она на возможный несчастный случай или на культурную практику, остается неясной. Мы оцениваем наиболее правдоподобный сценарий для Корно, основываясь на остеологическом, тафономическом, изотопном и палеогеномном анализе найденных индивидов. Последние насчитывают не менее 20 особей, в основном взрослых мужчин. Посмертные повреждения включают только травмы, нанесенные тупым предметом. Радиоуглеродные данные относятся к III-I вв. до н. э., хотя в некоторых случаях они предшествуют имеющимся дендрохронологическим оценкам с моста. Изотопные данные указывают на пять-восемь нелокальных находок. Близкое генетическое родство не связывает проанализированные скелеты. Палеогеномные результаты, первые для Швейцарии железного века, указывают на генетическое родство с другими центрально- и западноевропейскими группами железного века. Тип скелетных повреждений говорит в пользу случайного события как более правдоподобного объяснения. Радиоуглеродные данные и демографическая структура выборки могут свидетельствовать о последовательности различных событий, возможно, включающих казни и/или жертвоприношения. Изотопные и палеогеномные данные, хотя и не свидетельствуют в пользу одного сценария, подтверждают более ранние интерпретации последних веков до н. э. в Европе как динамичного периода с точки зрения биокультуры.

Переведено с помощью DeepL.com (бесплатная версия)

Individual Sex Mean Coverage mtDNA Y-DNA
COR-15/17 XY 0.2982 H95* R1b1a1b1a1a2b1a ~ (R-S372)
COR-3 XY 0.0217
COR-11 XY 0.248 H2a1k R1b1a1b1a1a2b1a (R-S255)
COR-8 XY 0.6972 HV0 + 195 J2b2a1a1a1b2 ~ (J-PH1602/etc.)
COR-9 XY 0.6099 U5b1c2 R1b1a1b1a1a2b1a1 (R-L20)
COR-5 XX 0.35 U5a1a1
COR-2 XY 0.2064 V G2a2b2a1a1b1a1 ~ (G-CTS2100)
COR-19 XY 0.0228
COR-21 XY 0.2198 H13a1a1 R1b1a1b1a1a2 (R-P312)
COR-16 XY 0.7328 H3 + 152 R1b1a1b1a1a2b1 (R-L2)

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6777
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2994/-15
  • мтДНК: H1b

Оффлайн kardes

  • Сообщений: 1447
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2342/-11
  • Y-ДНК: G2a1
ДРЕВНИЙ ДНК-ТЕСТ ОТЦОВСТВА И АНАЛИЗ РОДСТВА ВЫЯВИЛИ В ОТНОШЕНИИ ОТЦА И СЫНА  ДВА СЛУЧАЯ ВРОЖДЕННОЙ АНОМАЛИИ ПОЗВОНКОВ-БАБОЧКИ В ПОЗДНЕЙ АВАРСКОЙ ПОПУЛЯЦИИ
Havaš Auguštin Dubravka1, Zagorc Brina2,3, Šarac Jelena1, Novak Mario1,4, Carić Mario1, Novokmet Natalija1, Rimpf Andrea5, Fernandes Daniel2,3,6, Olalde Iñigo7,8,9, Marjanović Damir1,10, Reich David9,11, Pinhasi Ron2,3
Недавние методологические достижения в области технологий секвенирования и древних протоколов извлечения ДНК из останков скелетов открыли окно для прямого понимания прошлого человеческих популяций. Здесь мы представляем археогенетический анализ 43 особей позднего аварского населения (8 век) на стоянке Шаренград Клопаре в Восточной Хорватии. Целью было сравнить биоархеологический анализ человеческих останков с генетическими находками, чтобы получить более глубокое понимание их социальной организации, здоровья и генетической истории. Экстракцию адДНК и подготовку библиотеки проводили в специальных помещениях для очистки адДНК. Секвенирование проводили на платформе Illumina NextSeq500. Haplogrep2 использовался для определения гаплогрупп мтДНК, а программа Yleaf - для определения гаплогрупп Y. Анализ родства до 4-й степени родства оценивался с помощью методов READ и TKGWV2. Биоантропологическое обследование этой популяции показало отсутствие умышленных присмертных повреждений. В то же время анализ родства выявил наличие как минимум четырех семей, имеющих до четырех степеней родства, что указывает на продолжение проживания на этой территории в течение более длительного периода. Некоторые захоронения предполагают социальное расслоение, особенно в нескольких традиционных могилах всадников. Одним из них был взрослый мужчина (могила 25) с интересной находкой врожденной аномалии, называемой позвонком-бабочкой. Такая же аномалия обнаружена у молодого подростка (могила 21). В обоих случаях порок развития располагался на IV поясничном позвонке. Анализ родства и Y-хромосомы подтвердил, что эти два человека были отцом и сыном и принадлежали к южноевропейской гаплогруппе Y E1b1b1a1b1a. Анализ митогенома также выявил европейские гаплогруппы T1a и H46, что указывает на смешение с местными сообществами в течение длительного периода. Это открытие подчеркивает важность использования анализа древней ДНК, чтобы пролить свет на генетическое происхождение и здоровье древних популяций с небольшими письменными историческими данными или вообще без них.

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-FTD83033
  • ...
  • Сообщений: 19115
  • Страна: az
  • Рейтинг +7215/-18
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Бабочковидный позвонок - по-русски так называется

Оффлайн kardes

  • Сообщений: 1447
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2342/-11
  • Y-ДНК: G2a1
Коллективные захоронения позднего неолита раскрывают динамику примесей в третьем тысячелетии до нашей эры и формирование европейского генома
Мы провели полногеномный анализ с высоким разрешением, включая фазировку гаплотипов семи особей из коллективного захоронения, датируемого ~ 2500 кал. до н. э., и особи из колокольного стакана, датируемой ~ 2300 кал. Коллективное захоронение выявило прибытие степных предков во Францию. Мы реконструировали геном невыбранной особи по геномам ее родственников, что позволило нам пролить свет на структуру примесей на ранних стадиях, динамику и распространение степных предков в Европе позднего неолита. Мы определили два основных периода примеси, связанных с неолитом/степью, около 3000/2900 г. до н.э. и 2600 г. до н.э. Эти импульсы предполагают различную динамику роста населения с поразительной связью с культурными комплексами шнуровой керамики и колокольчиков.
Из этих различных доказательств вырисовывается картина европейских обществ третьего тысячелетия до нашей эры с различным генетическим происхождением, стоящих друг против друга, с регионально разными результатами.Именно с этой целью мы представляем здесь палеогеномное исследование семи особей коллективного захоронения позднего неолита, датируемого примерно 2500 г. до н. э., из Парижского бассейна на севере Франции, Бревианд-ле-Пуэнт
Распространение степного происхождения по признаку пола Таким образом, при анализе настоящего набора данных гендерная предвзятость оказывается бимодальной: женщины неопредков чаще смешиваются с мужчинами степного происхождения, чем мужчины неопредок смешиваются с женщинами степного происхождения. Эта низкая частота примесей с участием мужчин нео-предков также видна на Y-хромосоме, поскольку из 21 мужчины степного происхождения в этом хорошо покрытом наборе геномных данных только двое несли Y-хромосому, отличную от типичного степного предка R1b1a1b1 ( рис. 6). и таблица S11), как ранее наблюдалось в нескольких исследованиях В Западной Европе, около 2600 г. до н. э., мы обнаруживаем новый импульс смешения нео-предков и степных предков в геноме SMGB54 из Сен-Мартен-ла-Гаренн «Les Bretelles», связанный с BBC (2339–2139 гг. до н. э.). и имеют ~ 40% степного происхождения ( рис. 5 и таблица S8). Высокая доля степных предков и длинные фрагменты гаплотипов степного происхождения в геноме SMGB54 указывают на недавнее событие примеси, примерно за 12 поколений до его рождения. Это событие могло произойти на севере Франции, где люди северного степного происхождения смешались с носителями геномов юго-западного неолита без степного происхождения

Оффлайн Древ

  • Сообщений: 1173
  • Страна: ru
  • Рейтинг +346/-4
  • Y-ДНК: I-PH1410
  • мтДНК: H5a1a*
"определили митохондриальную гаплогруппу — V1a1, которая сегодня распространена в западной части Евразии, а ее самым древним известным представителем был человек из хорватской пещеры Безданяча, который жил в среднем или позднем бронзовом веке (около 1500–800 годов до нашей эры)"
https://nplus1.ru/news/2024/06/15/individual-from-vyatich

Это невероятно древние времена для данной митоГГ. Кто-нибудь знает, о каком образце речь?

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 10189
  • Страна: ru
  • Рейтинг +5929/-10
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
"определили митохондриальную гаплогруппу — V1a1, которая сегодня распространена в западной части Евразии, а ее самым древним известным представителем был человек из хорватской пещеры Безданяча, который жил в среднем или позднем бронзовом веке (около 1500–800 годов до нашей эры)"
https://nplus1.ru/news/2024/06/15/individual-from-vyatich

Это невероятно древние времена для данной митоГГ. Кто-нибудь знает, о каком образце речь?
I18723, датировка "по контексту". Там же в пещере и CTS10228 I18719. В общем, могли записать в бронзовики группу останков славянского периода.

Оффлайн Древ

  • Сообщений: 1173
  • Страна: ru
  • Рейтинг +346/-4
  • Y-ДНК: I-PH1410
  • мтДНК: H5a1a*
I18723, датировка "по контексту". Там же в пещере и CTS10228 I18719. В общем, могли записать в бронзовики группу останков славянского периода.
CTS10228 это ещё более древний субклад. Либо недотипированный.
Но, в любом случае, благодарю за ответ.
Хоть вопрос и остался... Непонятно, кто тут прав.

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 10189
  • Страна: ru
  • Рейтинг +5929/-10
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
CTS10228 это ещё более древний субклад. Либо недотипированный.
Думаю, недотипирование, поскольку уровень Y3120 там не прочитан, как и в принципе почти все нижележащие снипы. И аутосомно образец плюс-минус похож на современного балканского славянина. Просто его ранее уже обсуждали в контексте древних славян, вот и запомнился.
« Последнее редактирование: 22 Июня 2024, 06:36:50 от Srkz »

Оффлайн G-Man

  • Сообщений: 751
  • Страна: ru
  • Рейтинг +742/-1
  • Y-ДНК: G-Z6700
Карлик из античной Сицилии имел анатолийское происхождение

Скелетные останки мужчины с морфологическими признаками карликовости были найдены в 2009 году в западном некрополе Гимеры на Сицилии. Генетический анализ геномных данных, полученных для этого человека, подтвердил диагноз ахондроплазии. Этот человек имел полностью анатолийское происхождение.

https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB53912

5 век до н.э.


https://discover.familytreedna.com/y-dna/G-Z31464/tree


Ветвь и в наше время встречается в бывшей Magna Graecia (Сицилия и Южная Италия)

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 6494
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4885/-5
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Карлик из античной Сицилии имел анатолийское происхождение

(сам не проверял – уж больно БАМ огромный).
Если ещё и анализ стабильных изотопов и детрина покажет не местное происхождение, то можно с уверенностью утверждать что как минимум одна морская прогулка на галере в жизни коротышки была. Качественных и пригодных для дерева yfull образцов G2a1 очень мало, может хоть теперь этот карлик из малыша станет научным гигантом?
Бамов нет. Постараюсь, если позволит время, скачать самую тяжелую пару FASTQ и перегнать сразу в T2T.
попробовал маппировать 4 раза. Ввиду слабости машины, все попытки закончились ошибкой. Добраться до другого компа смогу не ранее чем через неделю. Возможно у кого-то есть возможность быстрее смаппировать bam?) Валера?

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6777
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2994/-15
  • мтДНК: H1b
Неандертальский ребенок из Таджикистана.
https://nplus1.ru/news/2024/06/19/khudji
Пересказ на русском о древних "швейцарцах". https://nplus1.ru/news/2024/06/18/cornaux

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1703
  • Страна: kg
  • Рейтинг +2318/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.23.600259v1

Female lineages and changing kinship patterns in Neolithic Çatalhöyük

Eren Yuncu, Ayca Kucukakdag Dogu, Damla Kaptan, Muhammed Siddik Kilic, Camilla Mazzucato, Merve Nur Guler, Elifnaz Eker, Busra Katircioglu, Maciej Chylenski, Kivilcim Basak Vural, Arda Sevkar, Gozde Atag, Nefize Ezgi Altinisik, Fatma Kucuk Baloglu, Defne Bozkurt, Jessica Pearson, Marco Milella, Cansu Karamurat, Sevval Akturk, Ekin Saglican, Nisan Yildiz, Dilek Koptekin, Sevgi Yorulmaz, Duygu Deniz Kazanci, Ayca Aydogan, Nergis Bilge Karabulut, Kanat Gurun, Eline M.J. Schotsmans, Jana Anvari, Eva Rosenstock, Jennifer Byrnes, Peter F. Biehl, David Orton, Vendela Kempe Lagerholm, Hasan Can Gemici, Milena Vasic, Arkadiusz Marciniak, Cigdem Atakuman, Yilmaz Selim Erdal, Emrah Kirdok, Marin Pilloud, Clark Spencer Larsen, Scott D. Haddow, Anders Gotherstrom, Christopher J. Knusel, Fusun Ozer, Ian Hodder, Mehmet Somel

doi: https://doi.org/10.1101/2024.06.23.600259
This article is a preprint and has not been certified by peer review [what does this mean?].

Abstract

Arguments have long suggested that the advent of early farming in the Near East and Anatolia was linked to a "Goddess" cult. However, evidence for a dominant female role in these societies has been scarce. We studied social organisation, mobility patterns and gendered practices in Neolithic Southwest Asia using 131 paleogenomes from Çatalhöyük East Mound (7100-5950 BCE), a major settlement in Central Anatolia with an uninterrupted occupation and an apparent egalitarian structure. In contrast to widespread genetic evidence for patrilocality in Neolithic Europe, the Çatalhöyük individuals revealed no indication of patrilocal mobility. Analysing genetic kin ties among individuals buried in the same house (co-burials) across 35 Çatalhöyük buildings, we identified close ties concentrated within buildings and among neighbours in Çatalhöyük's Early period, akin to those in the preceding Pre-Pottery Neolithic in Southwest Asia. This pattern weakened over time: by the late 7th millennium BCE, subadults buried in the same building were rarely closely genetically related, despite sharing similar diets. Still, throughout the site′s occupation, genetic connections within Çatalhöyük buildings were much more frequently connected via the maternal than the paternal line. We also identified differential funerary treatment of female subadults compared to those of males, with a higher frequency of grave goods associated with females. Our results reveal how kinship practices changed while key female roles persisted over one thousand years in a large Neolithic community in western Eurasia.

Уже давно высказывались предположения, что появление раннего земледелия на Ближнем Востоке и в Анатолии было связано с культом "богини". Однако доказательств доминирующей женской роли в этих обществах было мало. Мы изучили социальную организацию, модели мобильности и гендерные практики в неолитической Юго-Западной Азии, используя 131 палеогеном из Восточного кургана Чаталхёюка (7100-5950 гг. до н.э.), крупного поселения в Центральной Анатолии с непрерывной оккупацией и очевидной эгалитарной структурой. В отличие от широко распространенных генетических свидетельств патрилокальности в неолитической Европе, индивиды из Чаталхёйюка не обнаружили признаков патрилокальной мобильности. Анализируя генетические родственные связи между людьми, похороненными в одном доме (совместные захоронения) в 35 постройках Чаталхёюка, мы выявили тесные связи, сосредоточенные внутри построек и среди соседей в ранний период Чаталхёюка, как и в предшествующем докерамическом неолите в Юго-Западной Азии. Со временем эта закономерность ослабла: к концу VII тысячелетия до н. э. взрослые люди, погребенные в одном и том же здании, редко оказывались в тесном генетическом родстве, несмотря на схожий рацион питания. Тем не менее, на протяжении всего периода существования поселения генетические связи внутри построек Чаталхёйюка гораздо чаще осуществлялись по материнской, чем по отцовской линии. Мы также выявили различия в погребальном обращении с женскими субвзрослыми особями по сравнению с мужскими: чаще встречаются могильные предметы, связанные с женщинами. Наши результаты показывают, как менялась практика родства, в то время как ключевые женские роли сохранялись на протяжении тысячи лет в крупном неолитическом сообществе на западе Евразии.

Переведено с помощью DeepL.com (бесплатная версия)

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.