Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)

[пенелопа]

Оказывается, генетики пытались идентифицировать останки Юрия Долгорукого и Андрея Боголюбского, но это не удалось сделать...

Молекулярно-генетическое исследование митохондриальной ДНК костного вещества Целью молекулярно-генетического исследования являлась оценка пригодности костных фрагментов из трех саркофагов некрополя церкви Спаса на Берестове (г. Киев) и мощей Андрея Боголюбского в Успенском соборе (г. Владимир) для типирования митохондриальной ДНК и проведение сравнительного анализа с целью установления возможного матрилинейного родства погребенных лиц в парах: предположительно Юрий Долгорукий (10901157 гг.) и Евфимия Владимировна - сестра Ю.Долгорукого (t 1138); предположительно сыновья Юрия Долгорукого: Глеб Юрьевич (t 1171) и Андрей Юрьевич Боголюбский (t1174 гг.).

Исследование выполнялось доктором биологических наук, профессором Е.И. Рогаевым (зав. отделом Института общей генетики РАН, профессор Медицинской Школы Университета Массачусетса).

На молекулярно-генетическое исследование нами были переданы фрагменты костной ткани от скелетов 1, 2, 3, 5, упакованные в пакеты, с сопроводительными надписями. Результаты молекулярно-генетического исследования: выделить ДНК, пригодное для решения указанных задач, не удалось.

https://cyberleninka.ru/article/n/mediko-kriminalisticheskoe-issledovanie-ostankov-iz-zahoroneniya-predpolozhitelno-yuriya-dolgorukogo-i-chlenov-ego-semi-versii-i

[Valery]

жителей Борнео Пунан Бату (которые до сих пор практикуют мобильную охоту и собирательство), Тубу и Апут. Мы обнаружили глубокие родственные связи, при этом общий азиатский сигнал превосходит современные и древние представители австронезийского происхождения, что предполагает временную глубину более 7500 лет. Им также в значительной степени не хватает сигналов материковой Юго-Восточной Азии, присущих сельскохозяйственным жителям Борнео, которые сами по себе генетически гетерогенны.

спс за великолепную ссылку
Пенанский компонент ранее грубо рассматривали как вид австронезийского. Это реальное открытие, что они параллельные, хотя и родственные.

[rozenblatt]

Как же тогда А.Маргаряну удалось извлечь дднк из музейных костей викингов или черепа Хвита, который 20 лет пролежал в частном гараже?

Ну Хвит жил относительно недавно, так что древность там не сильно большая. А для статьи про викингов сотни образцов проверяли, и выбрали только лучшие. Но да, показатели у российских дДНК лабораторий пока что так себе.

[пенелопа]

Палеогенетики прочитали ДНК знатного воина из скифской «Долины царей»
В прошлом году его богатую могилу раскопали в Тыве


https://nplus1.ru/news/2023/11/10/adna-from-chinge-tey

[kardes]

Происхождение и родственные связи людей, погребённых на кладбище позднеантичного- раннесредневекового периода в Восточно-Итальянских Альпах.
Основные моменты :
Сложная генетическое происхождение у особей с одного небольшого средневекового альпийского кладбища.
Родословная в основном из Южной Европы, с немногими возможными неместными людьми.
Культурная гибридизация и сложная генетическая смесь в Южном Тироле
В многократном захоронении находится пара отец-сын, принадлежавшая к высокопоставленной семье
Краткое содержание
В Южном Тироле (Восточно-итальянские Альпы) в период поздней античности — раннего средневековья археологические данные указывают на культурную гибридизацию среди альпийских групп и народов различного происхождения. Используя палеогеномику, мы реконструировали происхождение 20 человек (4–7 вв . н.э.) с кладбища, чтобы проанализировать, имели ли они гетерогенное или гомогенное происхождение, и изучить их социальную организацию . Результаты выявили первичное генетическое происхождение из южной Европы и дополнительные предки из юго-западной, западной и северной Европы, что позволяет предположить, что культурная гибридизация сопровождалась сложной генетической примесью . Анализ родства не выявил генетического родства между единственными двумя людьми, похороненными с погребальным инвентарем. Вместо этого в одной множественной могиле была обнаружена пара отец-сын вместе с неродственными людьми и одной, возможно, неместной женщиной. Эти генетические находки указывают на наличие семьи с высоким социальным статусом , что подтверждается культурными материалами и близостью могилы к самому священному месту церкви.

Гаплогруппы I2a2a1b∗ или R1b1a∗, которые в настоящее время более распространены в Центральной и Западной Европе, или линия G2a∗, которая распространена преимущественно на Кавказе, в Центральной Европе и Италии (например, 10 , 35 , 36 ), были обнаружены у лиц более смешанного происхождения.
Почти все образцы уже на Discover FamilyTreeDNA.
https://discover.familytreedna.com/y-dna/E-FGC62258/tree
https://discover.familytreedna.com/y-dna/E-V13/tree
https://discover.familytreedna.com/y-dna/G-FT19044/tree
https://discover.familytreedna.com/y-dna/G-FGC74134/tree
https://discover.familytreedna.com/y-dna/I-BY69238/tree
https://discover.familytreedna.com/y-dna/I-BY54321/tree
https://discover.familytreedna.com/y-dna/J-Y51320/tree
https://discover.familytreedna.com/y-dna/R-M417/tree
https://discover.familytreedna.com/y-dna/R-S8183/tree
https://discover.familytreedna.com/y-dna/R-Y4354/tree
https://discover.familytreedna.com/y-dna/R-CTS11659/tree
https://discover.familytreedna.com/y-dna/J-FT417888/tree
[img[/img]http://Но FTDNA  продолжают удивлять своей демократичностью при размещении образцов палео-днк и частных лиц на своём Time Tree.

В целом анализ (K = 4) показал, что образцы BSS сохраняют высокий процент неолитического компонента, связанного с земледельцами из Анатолии (в среднем по нашим выборкам, 55,9%), что предполагает более южное происхождение, что согласуется с результатами сравнительного анализа с использованием современных данных. За неолитическим компонентом следует компонент, связанный с пастухами бронзового века из Причерноморской степи (Ямная, в среднем 36,2%), иранскими земледельцами (3,5%) и, наконец, компонент, связанный с группами охотников-собирателей (4,4%)

[G-Man]

Постер с конференции, про исследование палеогенетики тюрков: https://twitter.com/DanTabin/status/1719933938355834981

Среди авторов исследования - Леонид Вязов и Дэвид Райх.

Основной вывод - практически у всех тюркоязычных народов обнаруживается генетический компонент булан-кобинской культуры(Алтай, II вв. до н. э. — V в. н. э.). По нему можно отличить тюрков от монголов - у тюрков булан-кобинский компонент больше хуннского, у монголов - наоборот.

Не открывается. У нас в РФ твиттер заблокирован.
А там в постере гг есть?

Нет, там только аутосомы. А Imgur открывается?

https://imgur.com/VDaWX8u

Вот этих трёх, наверное, можно назвать булан-кобинцами. Образцы гунно-сарматской эпохи Алтая:

RISE600   Verh-Uimon   Q-YP844

RISE601   Verh-Uimon   Q-YP844

RISE602   Sary-Bel   J2- PH1795  (показательная карта ветви от mikhail a.)


Также они имеют крупные IBD-пересечения с образцами могильника Берель. На PCA G25 тоже рядом располагаются, поэтому можно заключить, что это близкородственные популяции.

Мужчины:

BRE005   21 BC-67 AD    Q-L330 >…> BZ93

BRE013   131-241 AD   Q-L330 >…> BZ93

BRE004   254-380 AD   Q-YP844>L713>YP789

BRE011   252-409 AD   Q-YP844>L713>YP789

[Srkz]

Вот этих трёх, наверное, можно назвать булан-кобинцами. Образцы гунно-сарматской эпохи Алтая:

RISE600   Verh-Uimon   Q-YP844

RISE601   Verh-Uimon   Q-YP844

RISE602   Sary-Bel   J2- PH1795  (показательная карта ветви от mikhail a.)

Вполне возможно, что куда-то близко к ним и попадут, да ))

[пенелопа]

А вообще у них в Сириусе были какие либо положительные результаты работы с дднк?

Говорят, что да. Впервые проведён массовый первичный генетический скрининг для более чем 200 археологических образцов с территории Русской равнины, охватывающий все временные периоды от палеолита до средних веков, полученных из отечественных коллекций. Более чем для 100 образцов высокого качества и процентного содержания древней ДНК человека было проведено полногеномное секвенирование и биоинфрматический анализ полученных данных. Для всех образцов был установлен генетический пол, определены гаплотипы митохондриальной ДНК (наследуется по материнской линии). Для части образцов удалось определить и гаплогруппы Y-хромосомы (наследуется по отцовской линии) и ряд признаков внешности (цвет волос, глаз и кожи), а также удалось выявить генетические маркеры наследственных патологий.
https://www.siriusuniversity.ru/research/research-center-for-genetics-and-life-sciences/geneticheskaya-istoriya-drevnego-naseleniya-russkoi-ravnini
И даже неандерталец.

https://www.archaeolog.ru/ru/scientific-activity/megagrants/geneticheskaya-istoriya-drevnego-naseleniya-russkoy-ravniny
Ссылки - по ссылке)

[пенелопа]

Спойлер из Телеграмм.

Завтра в печать уходит ещё одна наша статья. О захоронении женщины-аристократки  из Древнего Владимира XII века. Неофициальное её наименование - "Княгиня". Захоронение сопровождалось дорогой тканью, и открытие стало сенсацией для Владимирской области.

Вот новость про Княгиню.
https://zebra-tv.ru/novosti/jizn/arkheologicheskie-sensatsii-i-fors-mazhor/

Митогаплогруппа - H1m1. Аналоги - Северно-Запад и Балтика. Мутации будут в статье.

[rozenblatt]

https://pcr.news/novosti/md-2023-paleogenomika/

 МД-2023: Палеогеномика
Подготовила
Надежда Маркина

С развитием технологий анализа древней ДНК возникло новое направление — историческая генетика. Она позволяет получить ответы на многие вопросы археологов и историков: проверить гипотезы о путях миграций, охарактеризовать социальное устройство общества, с большой вероятностью определить черты внешности наших предков, выяснить происхождение и пути распространения инфекционных болезней, проследить биологическое родство в знаменитых династиях.

Секция по анализу древней ДНК в этом году называлась «Палеогеномика России», и не случайно. Проблему, стоящую перед отечественными специалистами, подчеркнул ведущий секции, член-корр. РАН Егор Прохорчук: до последнего времени Россия оставалась донором материала для изучения древней ДНК, на ее территории находятся интереснейшие археологические памятники, места палеонтологических находок, но анализ материала проводился в зарубежных лабораториях. С одной стороны, сказал Прохорчук, наука интернациональна, но с другой стороны, интерпретации полученных генетических результатов зачастую расходятся с представлениями российских археологов, которые десятилетиями работают с этими памятниками. Древняя ДНК порой начинает доминировать над археологическими артефактами. Проблема может быть частично разрешена созданием в стране полного цикла исследований объекта — «от археологии до математики», и появление лабораторий, которые могут работать с древней ДНК, — это очень важный этап.

[AleksG]

но анализ материала проводился в зарубежных лабораториях. С одной стороны, сказал Прохорчук, наука интернациональна, но с другой стороны, интерпретации полученных генетических результатов зачастую расходятся с представлениями российских археологов, которые десятилетиями работают с этими памятниками. Древняя ДНК порой начинает доминировать над археологическими артефактами.

"Интепретации" расходятся с "представлениями" ? Это как ?

[Srkz]

"Интепретации" расходятся с "представлениями" ? Это как ?

Ну как. Когда у археологов были идеи, которые по ДНК не подтвердились. Допустим, вспоминается старая статья Клейна, где, если не путаю по памяти, он доказывал, что никакой миграции из степи в Европу генетики со своим "ямным компонентом" обнаружить не должны были и это они что-то напридумывали. На индивидуальном уровне может оказаться, что мужской образец перепутали с женским, приезжего с местными и так далее. С другой стороны, и сами генетики могут давать полученным данным сомнительные интерпретации.

[Yurgan]

"Интепретации" расходятся с "представлениями" ? Это как ?

Ну как. Когда у археологов были идеи, которые по ДНК не подтвердились. Допустим, вспоминается старая статья Клейна, где, если не путаю по памяти, он доказывал, что никакой миграции из степи в Европу генетики со своим "ямным компонентом" обнаружить не должны были и это они что-то напридумывали. На индивидуальном уровне может оказаться, что мужской образец перепутали с женским, приезжего с местными и так далее. С другой стороны, и сами генетики могут давать полученным данным сомнительные интерпретации.

Ну так и не было никакой миграции ямников в Европу. Это уже фантазии генетиков. Прохорчук, кстати, тоже об этом говорил

[Srkz]

Ну так и не было никакой миграции ямников в Европу. Это уже фантазии генетиков. Прохорчук, кстати, тоже об этом говорил

Миграция из степи была. Я уж не влезаю в обсуждения, кто в точности эти люди археологически, всё равно не разбираюсь. Хотя если ямники это культурно-историческая общность, а не просто культура, то в чём проблема существовать внутри этой широкой общности разным по игрекам группам, непонятно. Но убрали слово "ямный" из названия компонента, и ладно.

[vvw1717]

Кристина Жур, работающая в той же лаборатории ФИЦ «Фундаментальные основы биотехнологии» РАН, рассказала о палеогенетическом исследовании, которое позволило проверить гипотезу о путях миграций человека. Исследовали зуб из могильника 5197–4850 гг.. до н.э. в районе города Нальчик. Этот могильник один из самых ранних известных погребальных комплексов на Кавказе. ДНК, выделенную из зуба, ученые сравнили с другими древними геномами, чтобы выбрать одну из трех гипотез происхождения человека из Нальчика. Первая гипотеза: это потомок самого древнего населения Кавказа. Вторая: это представитель переселенцев первой волны, у которых есть генетический компонент иранских или анатолийских земледельцев. Третья: это представитель степного энеолитического населения, смешавшегося с местным кавказским.
Положение генома из Нальчика в пространстве главных компонент оказалось промежуточным между степью и Кавказом, что указывает на контакты с населением степи. Авторы предположили, что примерно к 5000 лет до н.э. (а может быть, и раньше) на Северном Кавказе появилось население, объединившее генофонд кавказских охотников-собирателей с генофондом раннего докерамического неолита, вероятно, с территории Северной Месопотамии — Загроса, и это население в дальнейшем взаимодействовало с восточными охотниками-собирателями из степи. Это предположение встраивается в схему основных миграционных потоков, которые принесли сельское хозяйство с Ближнего Востока в Европу. Генетики показали, что миграции земледельцев могли распространяться и через Кавказ. Они подчеркивают, что это предположение не противоречит археологическим данным.

Получается "ямный" профиль (ИранКавказ+Степь) был уже на центральном Кавказе 7000 лет назад до майкопской КИО?  Всё таки Кавказская прародина ПИЕ ? Нарты- самая древняя цивилизация людей.
https://forum.molgen.org/index.php/topic,4096.msg579429.html#msg579429