Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)

[Tora_sama]

Ждём игреки)))

[AleksG]

Это же 2019 ?

[Tora_sama]

А я подумал, это те образцы, о которых Юрган писал...

[Yurgan]

А я подумал, это те образцы, о которых Юрган писал...

Результаты по этим есть, но закрыты от нас.  Планируем получить. Но среди генетиков и антропологов бушуют такие страсти, все хотят быть единственными правообладателями и единственными авторами

[Аббат Бузони]

Статья-то когда будет?

[Андроново]

Project: PRJEB63318

B8-2:    R1a1a1b2a1~   R-AM00480/etc*(xAM00484) Z647/S441+ Z94+ Y3+ R-F1417- R-M605-

Образец Срубной с R1a-Y3 родственник более 100 млн. индоарийцев R1a-Y3 в Южной Азии. Остальные мужские образцы - Q-L392. Было бы очень хорошо, если бы эти образцы были выложены на Yfull, особенно образец Y3*.

https://www.yfull.com/tree/Q-L932/
https://www.yfull.com/live/tree/R-Y3/

Our understanding of prehistoric societal organization at the family level is still limited. Here, we generated genome data from 32 individuals from an approximately 3,800-year-old burial mound attributed to the Bronze Age Srubnaya-Alakul cultural tradition at the site of Nepluyevsky, located in the southern Ural region of Central Eurasia. We found that life expectancy was generally very low, with adult males living on average 8 years longer than females. A total of 35 first-degree, 40 second-degree, and 48 third-degree biological relationships connected 25 of the studied individuals, allowing us to propose a family tree spanning three generations with six brothers at its center. The oldest of these brothers had eight children with two women and the most children overall, whereas the other relationships were monogamous. Notably, sisters and female children above the age of 14 were completely absent from the site, and adult females were more genetically diverse than males. These results suggest that biological relationships between male siblings played a structural role in society, and that descent group membership was based on patrilineality. Women originated from a larger mating network and moved to join the men, with whom they were buried. Finally, the oldest brother likely held a higher social position, which was expressed in terms of fertility.

Наши представления об организации доисторического общества на уровне семьи все еще ограничены. В данной работе мы получили геномные данные 32 человек из кургана, относящегося к срубно-алакульской культурной традиции бронзового века на Неплюевском городище, расположенном на юге Урала в Центральной Евразии, возрастом около 3 800 лет. Мы обнаружили, что продолжительность жизни в целом была очень низкой, причем взрослые мужчины жили в среднем на 8 лет дольше, чем женщины. 25 человек из исследованных были связаны между собой 35 биологическими связями первой степени родства, 40 второй степени родства и 48 третьей степени родства, что позволило нам предложить родословную, охватывающую три поколения, в центре которой находятся шесть братьев. Самый старший из этих братьев имел восемь детей с двумя женщинами и наибольшее количество детей в целом, тогда как остальные отношения были моногамными. Примечательно, что сестры и дети женского пола старше 14 лет полностью отсутствовали на участке, а взрослые женщины были более генетически разнообразны, чем мужчины. Полученные результаты позволяют предположить, что биологические отношения между братьями и сестрами мужчин играли структурную роль в обществе, а принадлежность к родовой группе основывалась на патрилинейности. Женщины происходили из более крупной брачной сети и перемещались, чтобы присоединиться к мужчинам, вместе с которыми они были похоронены. Наконец, старший брат, вероятно, занимал более высокое социальное положение, что выражалось в рождаемости.

Переведено с помощью www.DeepL.com/Translator (бесплатная версия)

https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB63318

[dna archive]

Два образца с R1a-Y3/Y2 были также обнаружены в абашевской культуре. Вот это интересней поскольку они точно базовые и не содержат инокультурных примесей. Вот когда опубликуют?

Один образец R1a-Y3 Y2- известен сейчас, это образец из Александрии, тоже скорее всего абашевской культуры, возможно ранней срубной.

[kardes]

Генетическая история преемственности и мобильности в центральном Средиземноморье железного века
Железный век был динамичным периодом в истории центрального Средиземноморья, с расширением греческих и финикийских колоний и превращением Карфагена в доминирующую морскую державу Средиземноморья. Этим событиям способствовала легкость дальних путешествий после значительных достижений в мореплавании. Из археологических данных мы знаем, что торговые товары и материалы перемещались на большие расстояния в беспрецедентных количествах, но неясно, как эти закономерности соотносятся с мобильностью людей. Здесь, чтобы напрямую исследовать мобильность населения и взаимодействия, мы секвенировали геномы 30 древних людей из прибрежных городов центрального Средиземноморья, Туниса, Сардинии и центральной Италии. Мы наблюдаем значительный вклад автохтонного населения, а также весьма неоднородное происхождение, включая многих людей неместного происхождения из других частей Средиземноморского региона. Эти результаты подчеркивают как роль местного населения, так и крайнюю взаимосвязанность населения Средиземноморья железного века. Изучая вместе этих транссредиземноморских соседей, мы исследуем сложное взаимодействие между местной преемственностью и мобильностью, которые сформировали общества железного века в центральном Средиземноморье.
https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB49419

[kardes]

10-я Международная научная конференция на базе Эстонского биоцентра ISBA-2023
АБСТРАКТЫ
10-е заседание Международного общества биомолекулярной археологии (ISBA-2023)
Новые горизонты в биомолекулярной археологии
https://www.isbarch.org/assets/documents/ISBA10/ISBA10_Abstract_Book.pdf
13-16 сентября 2023 года
Эстонский национальный музей, Тарту, Эстония

[Tamu]

Абстракт одной работы из материалов конференции в Тарту-Аннотация: "Южный Кавказ на протяжении всей доисторической эпохи был центром культурных инноваций в Западной Евразии, и большой интерес вызывает история его населения от раннего голоцена до бронзового века. Однако в последующие исторические периоды, начиная примерно с 1000 г. до н.э., значительные изменения в обществе привели к диверсификации языка и образованию первых государств - Колхидского и Иберийского царств в районе современной Грузии. На протяжении всего этого периода предполагаются внешние контакты через греческие колонии, основанные на Черном море, персидскую Медийскую империю и раннюю христианизацию Иберии. Позднее, в миграционный период раннего средневековья, о присутствии различных групп из Внутренней Азии и Восточной Европы свидетельствует, например, появление искусственных удлинений черепа. Для того чтобы понять, каким образом различные виды генных потоков формировали население современной Грузии, мы получили аДНК 200 человек, относящихся к периоду от ранней бронзы до раннего средневековья. Этот плотный археогенетический набор данных с исторического Кавказа позволил нам зафиксировать удивительно высокую степень генетической преемственности на протяжении более чем трех тысячелетий. Однако, начиная с периода ранней христианизации царства ибенов и заканчивая миграционным периодом, мы выявляем приток генов из Анатолии и присутствие лиц центральноазиатского происхождения. Искусственно удлиненные черепа в своем большинстве принадлежали лицам местного происхождения, что подтверждает наличие культурной практики, часто переносимой генеалогически и путем подражания из среднеазиатских этнических групп. Кроме того, оценивая шанг идентичных по происхождению секвенций, мы устанавливаем более высокий уровень биологического родства между лицами из сельских районов, погребенных на расстоянии нескольких километров друг от друга, по сравнению с крупными городскими центрами, такими как Самтавро, близ столицы Иберийского царства. Таким образом, данное исследование демонстрирует, как тонкомасштабная динамика популяций, определяемая археогенетически, может внести новый вклад в хорошо изученные гистологические контексты.
Переведено с помощью DeepL

[kardes]

Геномы с высоким уровнем покрытия двух самых  ранних Homo sapiens в Центральной Европе.
Арев Пелин Зюмер
Аннотация:
На сегодняшний день имеется мало генетических данных, характеризующих Homo sapiens, охватывающих переход от среднего к верхнему палеолиту в Евразии, и только один геном, геном ~44 000-летнего усть-ишимского человека из Сибири, был секвенирован с высоким охватом. (Фу и др. Nature, 2014). Мы представляем два генома с высоким охватом людей, обнаруженных в двух местах в Центральной Европе, которые находятся на расстоянии примерно 230 км друг от друга: один из Ilsenhöhle Ranis («Ранис») в Германии и один из Златого Куни в Чехии (Prüfer и др. Nat. Ecol). .Эволюция 2021 г.). Эти особи относятся к числу старейших Homo sapiens, известных в Европе, и, судя по радиоуглеродному и молекулярному датированию, вероятно, старше Усть-Ишима. Мы также секвенировали геномы с низким уровнем покрытия четырех особей из Раниса, датированные периодом от 46 800 до 42 200 лет назад. Все геномы Раниса демонстрируют наибольшее генетическое сходство с геномом Златого Куня, а не с геномом любой другой особи из древних или современных популяций. Интересно, что два генома с высоким охватом имеют общие длинные области, идентичные по происхождению, что указывает на то, что эти люди также жили близко друг к другу во времени. Несмотря на наличие уровней гетерозиготности по всему геному, аналогичных современным европейцам, мы обнаруживаем длительные периоды гомозиготности в двух геномах с высоким охватом, что позволяет предположить, что в последнее время произошло сокращение размера популяции и/или недавний инбридинг среди их предков. Мы также обнаружили длинные участки неандертальского происхождения в обоих геномах, которые лучше всего объясняются одним импульсом неандертальской интрогрессии — вероятно, основным событием неандертальской интрогрессии, общим для всех неафриканцев.

[kardes]

АННОТАЦИЯ KSSP-007 Две стороны структуры родства в курганах бронзового века Северного Кавказа Докладчик: Сабина Рейнхольд Немецкий археологический институт, Германия Соавторы: Айшин Галичи1, Андрей Белинский2, Свенд Хансен3, Вольфганг Хаак1 1 Институт эволюционной антропологии Макса Планка, Германия 2 ООО "Наследие", Россия 3 Немецкий институт эволюционной антропологии, Германия Археологический институт, Германия
Аннотация:
Биологическое родство тесно взаимосвязано с социальной организацией родства и обменом партнерами по спариванию. В социальных науках это обсуждается как важнейший механизм, который формирует и поддерживает социальные отношения внутри групп и между ними. Большие погребальные насыпи (курганы), которые являются распространенной формой погребальной архитектуры в Западной Евразии бронзового века, являются высоко и широко заметными символами в ландшафтах предков. Содержащие могилы иногда нескольких десятков человек, они понимались как проявление генеалогий и, следовательно, как отражение генетических или социальных родственных связей с течением времени. Однако эти идеи никогда не подвергались систематической проверке. Усовершенствованные археогенетические методы влажной и сухой лабораторных работ теперь дают возможность изучать множество особей из одного и того же места, что, в свою очередь, позволяет проводить анализ биологического родства внутри объекта и делать выводы о структурах родства и социальной организации. Здесь мы представляем новые геномные данные из курганов на Северном Кавказе, которые раскрывают гораздо более сложную структуру биологического родства или его отсутствие, чем предполагалось ранее. Эти курганы можно рассматривать как микропереходы во времени, в которых степень генетической связанности, по-видимому, соответствует различным профилям генетической родословной, обнаруженным в этом регионе в то время: степная родословная и родство с Кавказом. Сравнивая ряд тематических исследований, мы обсуждаем примеры близких и удаленных биологически родственных особей, инбридинга и сокращения эффективной численности популяции, что дает первое представление о социальной организации культурных групп, использующих эти памятники. В частности, отсутствие биологической связи с определенными временными горизонтами ставит под сомнение интерпретацию данных как генеалогий и требует новых моделей для понимания социальной структуры различных генетических групп.

[kardes]

САРМАТЫ
АННОТАЦИЯ HGP-038
 Геномные и изотопные данныедля сарматской особи в Римской Британии
Докладчик: Марина Сильва, Институт Фрэнсиса Крика, Великобритания Соавторы: Томас Бут1, Джоанна Мур2, Кириаки Анастасиаду1, Дон Уолкер3, Александр Жилярде1, Кристофер Баррингтон1, Моника Келли 1, Миа Уильямс1, Майкл Хендерсон3, Алекс Смит 3, Дэвид Боушер3, Джанет Монтгомери2, Понтус Скоглунд1 1 Институт Фрэнсиса Крика, Великобритания 2 Университет Дарема, Великобритания 3 Лондонский музей археологии, инфраструктура мыса, Великобритания
Аннотация: В период Римской империи произошли политические и социальные изменения, подпитывается развитием дорожной и морской сети, связанным с военными кампаниями, управлением и торговлей, что приводит к интенсификации передвижения людей по Западной Евразии, включая мобильность на большие расстояния (Мартиниано и др. Nature Communication, 2016; Антонио и др. BioRxv 2022). Одним из таких исторически засвидетельствованных событий было переброска сарматской кавалерии с северо-восточных границ империи на ее западную окраину в Британии римским императором Марком Аврелием в 175 году нашей эры, после Маркоманских войн (Ричмонд, младший, 1945). Здесь мы сгенерировали ~ 4,12-кратный полный геном (MQ>30) и измерили соотношения изотопов углерода и азота у особи раннего-среднего римского периода (95% доверительный интервал 126-228 кал. CE), чьи останки были обнаружены компанией MOLA Headland Infrastructure на сельской ферме недалеко от Оффорд-Клуни, в Кембриджшире, восточная Англия, Великобритания. Мы идентифицировали этого индивидуума как кариотипически мужского пола (XY) и обнаружили, что он был аутлаером, у которого не было западноевропейских предков, связанных с охотниками-собирателями (p=1,65E-10). Вместо этого он был генетически наиболее близок к населению римского периода из современной Армении, с дополнительными предками из групп, родственных сарматам. Дополнительный анализ стабильных изотопов показывает, что в рационе его детства было высокое содержание C4-растений, что соответствует Кавказскому или понтийско-каспийскому региону, и по крайней мере два момента изменения рациона, связанных с периодами подвижности в течение его жизни. Наши результаты согласуются с тем, что этот человек был современником исторического развертывания сарматской кавалерии в Британии в 175 году нашей эры (Ричмонд, 1945). Археологический контекст личности Оффорда Клюни допускает несколько возможных объяснений того, как он прибыл в Британию, но в первую очередь подчеркивает, что миграция на большие расстояния, осуществленная империей, распространилась на сельские районы Римской Британии.

АННОТАЦИЯ HGP-036 Предварительные генетические результаты о сарматах из Карпатского бассейна Докладчик: Институт венгерских исследований имени Ошкара Шютца, Венгрия Соавторы: Золтан Мароти1, Эмиль Ньерки1, Эндре Непарачки2, Балаж Тихани2, Бенс Ковач2, Китти Маар2, Гергели Варга2, Александра Гингуцэ2, Тибор Терек2 1 Университет Сегеда, Венгрия 2 Институт венгерских исследований, Венгрия Аннотация: Генетический состав сарматских групп, проживающих в Российской степи, был относительно хорошо изучен в предыдущих публикациях, в то время как племена, прибывающие на Великую Венгерскую равнину, как правило, недостаточно изучены, а их генетическое происхождение и отношения с соседями еще предстоит исследовать. Чтобы восполнить этот пробел, мы представляем предварительные генетические результаты более чем 100 особей сарматского периода из Карпатского бассейна. Мы показываем, что некоторые наши образцы близко соответствуют сарматам из Русской степи, однако большинство из них сильно отличаются от этой группы. В отличие от ранее наблюдавшейся генетической однородности ранних русских сарматов, большинство изученных нами геномов демонстрируют явное генетическое сходство с местными обитателями Карпатского бассейна, в то время как несколько особей имеют значительное восточноазиатское генетическое сходство, что указывает на возможную социальную связь между сарматами Карпатского бассейна и восточной степью

[kardes]

ИРАН
АННОТАЦИЯ Геномный анализ HGP-003 населения Селевкидского и парфянского периодов в Северном Иране Докладчик: Мотахаре Амджади Университет Этвеша Лоранда, Венгрия Соавторы: Мариам Рамезани1, Кристоф Якаб2, Балаж Г. Менде2, Абдол Моталлеб Шарифи4, Ата Хасанпур4, Вали Джахани4, Арезу Бибак1, Махмуд Таваллаи3, Анна Сечени-Надь2 1 Тегеранский университет, Иран 2 Исследовательский центр Этвеша Лоранда, Венгрия 3 Центр генетических исследований человека Кавсар, Иран 4 Управление культурного наследия, Иран Аннотация: Селевкиды правили областью древнего Иран с 312 года до н.э. и впоследствии были вытеснены экспансией парфян, которые возглавляли значительную политическую и культурную империю в древнем Иране между 247 годом до н.э. и 224 годом нашей эры. Парфяне поддерживали имперское государство, которое простиралось от северного течения Евфрата, на территории нынешней центрально-восточной Турции, до территории современного восточного Ирана. Основной торговый путь Северного иранского Хорасана, Шелковый путь, соединял Римскую империю (Средиземное море) с империей Хань в Китае и превращал парфянские территории в центр торговли. В этой древней империи преобладали различные погребальные обычаи, обусловленные ее обширностью и исключительным культурным разнообразием. Здесь мы сообщаем об одиннадцати древних геномах периода Селевкидов-Парфян, полученных с помощью общегеномного захвата SNP и методов секвенирования методом дробовика. В данной статье рассматриваются такие места, как Вестемин (север Ирана, провинция Мазандаран), Лиар-Санг-Бон (Амлаш-Гилан - Север Ирана) и Мерсинчал (Мехдишар-Семнан), расположенные в районе Каспийского моря на Севере Ирана. Древняя ДНК особенно скудна в этом регионе, при этом географически наиболее близкие справочные данные получены из слоя железного века Хаджи Фируз, Тепе Хасанлу и Динха Тепе на северо-западе Ирана и Гонур Тепе бронзового века в Туркменистане. Геномы нового исторического периода свидетельствуют о довольно ограниченной связи со Скифией и степной областью к северу от Ирана, а также о доминировании иранской генетической родословной, восходящей к неолитическому/мезолитическому населению этого региона. Дополнительные 20-40% анатолийских неолитических предков в их геномах хорошо соответствуют ранее описанной южноевразийской генетической линии раннего голоцена (Narasimhan et al. Science 2019), предполагающий преемственность в основной структуре населения к югу от Каспийского моря вплоть до исторических времен.

АННОТАЦИЯ HGP-016 Всесторонняя картина генетической истории Ирана Докладчик: Могге Хаджиесмаил Римский университет Сапиенца, Италия Соавторы: Франческо Равасини1, Флавия Риси1, Хамид Галехдари2, Евгения Д'Атанасио3, Бениамино Тромбетта1, Фульвио Круциани1 1 Римский университет Сапиенца, Италия 2 Университет Шахида Чамрана в Ахвазе, Иран 3 Институт молекулярной биологии и патологии, Италия Аннотация: Исследования древнего генома показали, что Иран играл центральную роль в истории Евразии, являясь одним из основных центров изобретения сельского хозяйства и одомашнивания крупного рогатого скота. В то время как “иранский неолитический компонент” в настоящее время признан на большей части Евразии, генетическое разнообразие современных иранцев, особенно на уровне секвенирования всего генома (WGS), изучено слабо. Чтобы составить более полную картину генетического разнообразия и истории иранского населения, мы провели новое секвенирование всего генома 87 мужчин, представляющих 8 различных этнических групп и 3 языковые семьи (индоевропейскую, афроазиатскую, тюркско-алтайскую). Объединив наши данные WGS с соответствующими доступными современными и древними геномами, мы обнаружили, что все иранцы, независимо от этнической принадлежности, имеют преобладающее автохтонное происхождение до неолита и значительную родословную от анатолийских земледельцев эпохи неолита и степных скотоводов бронзового века. Тем не менее, были обнаружены поразительные различия между этническими группами из-за различного потока генов из Африки (в основном у арабов и южных иранцев), Центральной Азии (тюркоязычные иранцы и северо-восточные персы) и Южной Азии (индоевропейцы Южного Ирана). В целом, геномная история Ирана - это многогранная история, которая отражает положение региона как плавильного котла различных культур, языков и популяций.

[Ильгиз]

ABSTRACT HGP-044
Mixed Turkic and Mongolic ancestry reveals complex history and origin of the Tu and other Chinese populations

Носители тюркского и монгольского языков имели долгую и сложную историю взаимодействия друг с другом и с другими соседними народами. Отчасти из-за этой сложной истории ведутся споры о том, имеют ли эти две группы общее языковое происхождение. Мы предоставляем новые генетические доказательства относительно этих закономерностей, используя тот факт, что тюркские и монгольские народы имеют различные источники как западно-, так и восточноевразийского происхождения, которые, как мы показываем, могут быть использованы для разделения тюркского и монгольского происхождения в смешанных популяциях. Мы находим различные пропорции тюркских и монгольских предков, связанных между собой в современные китайские тюрко-монгольские этнические меньшинства, включая салар, бонан, дунсян, даур, монгола и Ту. Большинство из них имеют происхождение от обеих групп, за заметными исключениями, такими как салар, которые не имеют монгольского происхождения. В то время как китайские связи и взаимодействие с евразийскими степями можно проследить еще во времена династии Шан, генетическая датировка самой последней волны смешения предполагает, что современная смесь предков, присутствующая в этой популяции, сформировалась во времена расцвета Монгольской империи.
Вероятный сценарий заключается в том, что эти группы были сформированы носителями тюркского и монгольского языков, возможно, солдатами, которые осели и смешались с китайским и тибетским народами.
Многие из этих смешанных групп населения затем претерпели бы языковой сдвиг в сторону монгольского престижного языка. Этот сценарий соответствовал бы совокупным генетическим, лингвистическим и историческим свидетельствам. Кроме того, мы считаем, что наша методология различения тюркских и монгольских предков должна принести пользу любому будущему анализу истории евразийских степей.

ABSTRACT HG1-002
Genetic history of the Altai Population 4th-14th centuries

Алтайский регион Восточной Евразии представляет собой горную местность, которая разделяет западные и восточные степи, но также служит перекрестком между этими двумя регионами. Долгое время населением Алтая управляли различные кочевые государства, имевшие сходные военные и политические структуры. Средневековая эпоха Восточной Евразии недостаточно изучена с точки зрения популяционной генетики, поэтому было начато новое исследование.
Мы представляем более 100 геномов из 4-14 веков Алтайского края, которые проливают свет на сложные демографические истории высокомобильных средневековых сообществ в этом районе. Предварительные результаты показывают, что жители Алтая средневекового периода имели гетерогенный генетический профиль, будучи по-разному родственными древним и современным североазиатским, восточноазиатским и Популяции евразийских степей. Результаты указывают на многочисленные перемещения населения и смешения, которые, возможно, произошли во время политических изменений в Центральной Азии.
Имея высокую предковую североевразийскую родословную, самоедское население Одинцовская культура сформировалась в результате смешения их генетически более северных предков с кочевым народом булан-коби на Алтае, позже ассимилировавшим и интегрировавшим различные другие степные группы. Новые данные о населении Булан-коби, археологически связанном с кочевыми империями хунну, Сяньбэй и Руран, предполагают генетические связи с предположительно ираноязычным народом сака. Рано Тюркская культура развилась на основе культуры Булан-Коби в исследуемом районе. Данные показывают, что степные популяции бронзового и железного веков и восточноевразийские популяции предшественники обладали генетическими влияние на более поздние тюркские группы. Восточноевразийское происхождение значительно возросло в Алтайский край в период после образования Тюркского каганата. Распад Второго Тюркского каганата ознаменовал новые перемещения населения, привел к формированию родственной тюркам сросткинской культуры и ускорил тюркизацию самодийского народа Западной Сибири.