Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)

[Yurgan]

А как перевести на генетические маркеры ?
1175-1275   sk372   R1b1a1a2
1175-1225   sk328   R1b1a1a2a1a1c2b1b4e1a2c1
1585-1897   wf629    "N1a1a1a1a1a1a5
1585-1897   wf193    R1b1a1a
1585-1897   wf131    I1a
1585-1897   wf301    I1a
1585-1897   wf531    R1b1a1a2a1a
1585-1897   wf305   R1a1a1b1a3a3b1
1585-1897   wf148    "R1a1a1b1a3a2e1
1585-1897   wf192    I1a1b1g
совр.          tr1   R1b1a1a2a2
совр.          tr11   R1b1a1a2a1a1c2b2a1b1a1a2b2
совр.          tr12    J2a1b
совр.          tr13    R1b1a1a2a1a1c2b1b4e1a2c1
совр.          tr14   R1a1a1b1a3a2e4b
совр.          tr15   I1a2a1a1d1a
совр.          tr17   I1a1b1a4a2f1a1a1
совр.          tr18   I1a1b1a4a2
совр.          tr20    R1a1a1b1a3a2a1
совр.          tr21   R1b1a1a2a1a1b1a
совр.          tr3    "I1a1b1a4a2f1a1a7
совр.          tr5    "R1a1a1b1a3a1
совр.          tr7   E1b1b1b2a1a4d2c
совр.          tr8    "R1b1a1a2a1a1b1b
совр.          tr9   R1b1a1a2a1a1g

Смотрите в статье, на какую версию древа ISOGG ссылаются авторы
У них ссылка идет на версию 2018

Исходя из этого N1a1a1a1a1a1a5 = N1c1-Y7795

Но на древе R нет R1b1a1a2a1a1c2b1b4e1a2c1, поэтому остается гадать, что авторы имели ввиду.
Использование номенклатуры без указания снипов ведет к непонимаю, какой же этот субклад

[Farroukh]

Ешник https://www.yfull.com/tree/E-Y15561/ что довольно нетипично для европейца. Либо это семит

Ашкеназ (большой субклад E-Y6923) из еврейской общины Тронхейма

[Древ]

А как перевести на генетические маркеры ?
1175-1275   sk372   R1b1a1a2
1175-1225   sk328   R1b1a1a2a1a1c2b1b4e1a2c1
1585-1897   wf629    "N1a1a1a1a1a1a5
1585-1897   wf193    R1b1a1a
1585-1897   wf131    I1a
1585-1897   wf301    I1a
1585-1897   wf531    R1b1a1a2a1a
1585-1897   wf305   R1a1a1b1a3a3b1
1585-1897   wf148    "R1a1a1b1a3a2e1
1585-1897   wf192    I1a1b1g
совр.          tr1   R1b1a1a2a2
совр.          tr11   R1b1a1a2a1a1c2b2a1b1a1a2b2
совр.          tr12    J2a1b
совр.          tr13    R1b1a1a2a1a1c2b1b4e1a2c1
совр.          tr14   R1a1a1b1a3a2e4b
совр.          tr15   I1a2a1a1d1a
совр.          tr17   I1a1b1a4a2f1a1a1
совр.          tr18   I1a1b1a4a2
совр.          tr20    R1a1a1b1a3a2a1
совр.          tr21   R1b1a1a2a1a1b1a
совр.          tr3    "I1a1b1a4a2f1a1a7
совр.          tr5    "R1a1a1b1a3a1
совр.          tr7   E1b1b1b2a1a4d2c
совр.          tr8    "R1b1a1a2a1a1b1b
совр.          tr9   R1b1a1a2a1a1g

Смотрите в статье, на какую версию древа ISOGG ссылаются авторы
У них ссылка идет на версию 2018

Исходя из этого N1a1a1a1a1a1a5 = N1c1-Y7795

Но на древе R нет R1b1a1a2a1a1c2b1b4e1a2c1, поэтому остается гадать, что авторы имели ввиду.
Использование номенклатуры без указания снипов ведет к непонимаю, какой же этот субклад

R1b1a1a2a1a1c2b1b4e1a2c1 это S378/Z158. На Yfull это R-Z159
https://isogg.org/tree/2016/ISOGG_HapgrpR16.html

[kardes]

Древняя ДНК из гробниц, связанных с королевством Тубо, на северо-востоке Тибетского нагорья показала их генетическую близость как к тибето-бирманскому, так и к алтайскому населению. Сюэ-Эр Ю, Чан Сун, Йе-Тао Цзоу, Цзи-Юань Ли, Сяоянь Рен и Хуэй Ли

Подъем царства Тубо считается ключевым периодом формирования современных групп на Тибетском нагорье. Этническое происхождение жителей королевства Тубо довольно сложное, а их генетическая структура остается неясной. Гробницы периода царства Тубо в уезде Дулан провинции Цинхай, датируемые седьмым веком, считаются останками, оставленными завоевателями Тубо или народом Туюхун, в котором доминировало Царство Тубо. Человеческие останки в этих гробницах — идеальный материал для изучения динамики населения в королевстве Тубо. В этой статье мы проанализировали полногеномные данные восьми останков из этих гробниц с помощью секвенирования и панелей мультиплексной ПЦР и сравнили результаты с данными доступных древних и современных популяций в Восточной Азии. Обнаружена генетическая преемственность между древним народом дулан с древними племенами сяньби в Северо-Восточной Азии, древними поселенцами на Тибетском нагорье и современными тибето-бирманскими популяциями. Удивительно, но у каждой восьмой особи были типичные генетические черты популяций из Центральной Азии. Таким образом, генетическое разнообразие древних людей дулан и их связь с другими популяциями представляют собой пример сложного происхождения жителей королевства Тубо и их дальних связей с населением в обширном географическом регионе древней Азии.

[kardes]

Предковое генетическое наследие венгероязычных популяций реткезов (Венгрия) и долины Ваг (Словакия).
Венгры завоеватели и гунны?106 образцов долины Реткёз и 48 образцов из Ваг были собраны в контактных зонах венгерско-словацких территорий и генотипированы по Y-хромосомным гаплотипам и гаплогруппам. Результаты сравнивались с современными и архаичными данными из опубликованных источников. Генетический состав популяции реткезов из Венгрии и популяции долины Ваг из Словакии указывает на разные истории. В популяции Rétköz лучше сохранились отцовские линии, которые также были обнаружены у венгерских завоевателей, такие как R1a-Z93, N-M46, Q-M242 и R1b-L23. Эти гаплогруппы встречались у 10% населения. Однако для населения долины Ваг характерно полное отсутствие этих гаплогрупп. Наше исследование не выявило генетической связи между населением долины Ваг и венгерскими завоевателями;
Мужчины венгерских реткезов имели общие гаплотипы с мужчинами древних хунну, древних аварцев, кавказских аварцев, абхазов, балкарцев и черкесов в гаплогруппах R1a-Z93, N1c-M46 и R1b-L23, что указывает на общий генетический след. Еще одно различие между двумя изученными венгерскими популяциями можно сделать из графика MDS на основе Fst. Долина Ваг в западной части венгерско-словацкой контактной зоны генетически ближе к западноевропейцам. Напротив, Реткез находится в восточной части этой зоны и, следовательно, ближе к восточным европейцам.
Предварительно принято: Окончательная отформатированная версия статьи будет опубликована в ближайшее время.

[Павлов Сергей]

А где можно посмотреть поподробнее статью про Венгрию и Словакию?

[kardes]

ДДНК людей из пещеры Красного оленя: https://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(22)00928-9
Юго-Восточная Азия является центром расселения доисторических поселений и миграций современных людей в Азиатско-Тихоокеанском регионе. Однако структура расселения и структура населения палеолитических людей в этом регионе остаются неясными, и древняя ДНК может предоставить прямую информацию. Здесь мы секвенировали геном позднеплейстоценового гоминина (MZR), датированного примерно 14,0 тысяч лет назад из пещеры Ред-Дир, расположенной на юго-западе Китая, о котором ранее сообщалось, что он обладает мозаичными чертами современных и архаичных гомининов. MZR — это первый позднеплейстоценовый геном из южной части Восточной Азии. Наши результаты показывают, что MZR — это современный человек, который представляет раннюю диверсифицированную родословную в Восточной Азии. МтДНК MZR принадлежит к вымершей базовой линии гаплогруппы M9, отражающее богатое матрилинейное разнообразие на юге Восточной Азии в позднем плейстоцене. В сочетании с опубликованными данными мы обнаружили четкую генетическую стратификацию в древних южных популяциях Восточной/Юго-Восточной Азии и некоторую степень дивергенции между югом и севером в позднем плейстоцене, и MZR был идентифицирован как южный восточноазиатский, который демонстрирует генетическую преемственность до настоящего времени. дневные популяции. Примечательно, что MZR тесно связан с восточноазиатским происхождением, которое способствовало появлению первых американцев.

Практика родства в юго-восточной Европе раннего железного века: генетический и изотопный анализ погребений курганного кладбища Долгеньиве, Доленьска, Словения Анализ ДНК показывает, что все семь человек, погребенных в кургане раннего железного века в Долгендживе на юго-востоке Словении, являются близкими биологическими родственниками. Хотя состав группы не предполагает строгого соблюдения системы родства по отцовской или матрилинейной линии, погребальная традиция представляется сильно гендерной, при этом семейные связи как по мужской, так и по женской линии играют важную роль в структурировании сообществ. Мы исследуем последствия для нашего понимания родства и погребальных практик в юго-восточной Европе раннего железного века.
и ещё инсайды: Новая средневековая немецкая ДДНК из Лауххайма и образцы из Италии

[kardes]

18 ДДНК из Азербайджана (от неолита до бронзового века)
История населения Южного Кавказа от неолита до бронзового века и его долгосрочные взаимодействия с Анатолийским полуостровом
Алтынишик Н.Е., Эрдал Ю.С.  Урарту веОтеси Семпозюму, Ван, Турция, 7–9 сентября 2022 г.
Резюме
Археологические и археогеномные исследования, проводившиеся на Южном Кавказе до настоящего времени, были направлены на понимание истории населения региона и его взаимоотношений с другими западно-евразийскими популяциями. Хотя недавние исследования показывают, что движение человека на Кавказ изменилось во время неолита и в эпоху бронзы, точные источники и динамика этих изменений до сих пор остаются нерешенными, в основном из-за ограниченного пространственного и временного распределения образцов генома.
В этом пилотном исследовании мы секвенировали геномы 32 скелетов из различных археологических памятников в Азербайджане, датируемых периодами между неолитом и поздним бронзовым веком. Из них 18 человек дали достаточные данные о древней ДНК для последующего анализа. Анализ этих данных свидетельствует об изменении генетической структуры населения региона при переходе от эпипалеолита к неолиту. В частности, южнокавказские популяции генетически стали ближе к генофонду докерамического неолита Верхней Месопотамии, представленному геномами из Чайёню. Между тем геномы бронзового века Южного Кавказа образуют кластер, отличный от геномов более ранних периодов. Этот результат предполагает еще одно событие примеси, возможно, начавшееся с бронзового века.
Давние отношения между Южным Кавказом и Анатолийским полуостровом подтверждаются данными материальной культуры, а также археогеномными исследованиями. Как сообщалось ранее, предполагалось, что поток генов, связанный с Кавказом, внес большой вклад в генофонд Анатолии с начала периода энеолита. В целом наши результаты показывают, что отношения между этими областями были не однонаправленными, а двунаправленными, и взаимный поток генов начался по крайней мере в начале энеолита.

[Павлов Сергей]

18 ДДНК из Азербайджана (от неолита до бронзового века)
История населения Южного Кавказа от неолита до бронзового века и его долгосрочные взаимодействия с Анатолийским полуостровом
Алтынишик Н.Е., Эрдал Ю.С.  Урарту веОтеси Семпозюму, Ван, Турция, 7–9 сентября 2022 г.

Ссылка не работает

[G-Man]

Genetic History of Anatolia during Holocene
https://open.metu.edu.tr/handle/11511/99472

Новые образцы с Кавказа выделены черным




Явная лажа с определением гаплогрупп geo006 и gur016 из-за плохого покрытия

[Farroukh]

Ради скромности отмечу, что самый нижний образец (zrj003) был предоставлен автором этих строк
С момента отправки образца до выхода статьи прошло целых 6 лет, да и сам результат (всего лишь на уровне J1*) тоже не ахти, но хоть какая-то динамика по дДНК из Азербайджана. Надеюсь, это только начало

[Tora_sama]

Интересные новости)



Мы получили гаплотип древнего защитника Золотаревского городища. Результат оказался неожидан.

С высокой вероятностью — R1b-L51, а наиболее близкие совпаденцы — R1b-U106. Сразу очевидны центральноевропейские связи.
начинаем серьезное обсуждение с открывателем, профессором Геннадием Николаевичем Белорыбкиным. Итоговая интерпретация будет выложена на наших ресурсах. Дело будет небыстрое, и в этот раз выкладываем маркеры сразу (есть такая возможность).

DYS576 18
DYS389I 13
DYS635 23
DYS389II 29
DYS460 11
DYS458 17
DYS391 12
DYS456 18
DYS390 24
DYS438 10
DYS570 18
DYS437 15
DYS385 11 15
DYS393 13
DYS439 12
DYS481 24
DYS533 12

[Farroukh]

По этому результату есть что обсудить. Предлагаю открыть отдельную тему в разделе R1b.
UPD: Тему создал

[Kambic]

Образцы из центральной Грузии получаются из тех периодов когда там ещё не было грузин или всё таки у них не было G2 ? А в аутосомах у них только CHG и ANF и даже у "баскокартвела" (по фаерской терминологии) geo029 R1b1a2a2 onlykaukaz? Или для аутосом использовали другие образцы? Для geo017 Доглаури(3155BP) , geo015 Доглаури Кура-Аракс (49002ВР) и  zrj003 Шамахи(1722ВР) датировки в обоих таблицах сходятся, а для Диднаури (3021ВР) и Назарлеби(3200ВР) нет такого соответствия по датам. Почти половина mt  показывает кавказскую  К и только одна линия U.

Из центральной Грузии (Догълаури) всего один Y образец - J2a1b1, все остальные из Диднаури и Назарлеби, которые находятся на востоке Грузии.
https://ibb.co/WHPgLRy https://ibb.co/2cfXQRZ

Два Доглаури( geo 015 и geo017). А где тогда надо дднк баскокартвеловгрузин копать?

А какая Y гг под geo017?

Женщина ж

Он это знает, просто ушёл от ответа).

Внимательно прочитайте что там написано и что вы пишете.

Ушёл от ответа.)

[Erkman]

Из центральной Грузии (Догълаури) всего один Y образец - J2a1b1, все остальные из Диднаури и Назарлеби, которые находятся на востоке Грузии.
https://ibb.co/WHPgLRy https://ibb.co/2cfXQRZ