Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)

[rozenblatt]

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S2352409X21001061?via%3Dihub

Ancestry and identity in Bronze Age Catacomb culture burials: A meta-tale of graves, skeletons, and DNA

Maria A.Ochir-Goryaeva a Igor V.Kornienko a b c
Tatiana G.Faleeva b c d Olga Yu.Aramova c Mikhail A.Makhotkin b Erdni A.Kekeev a Evgeny G.Burataev a Viktoria V.Kukanova a Yurij S.Sidorenko b e Duane R.Chartier f Theodore G.Schurr g Tatiana V.Tatarinov a h i j k

https://doi.org/10.1016/j.jasrep.2021.102894

Highlights

•    Archaeological and molecular analysis of human remains from the Catacomb culture.
•    Y-chromosome STR analysis revealed that both individuals belonged to haplogroup R1b.
•    MtDNA analysis revealed the two Catacomb males to belong to haplogroups H and N.
•    There is a possible relationship between the Catacomb and Yamnaya cultures.
•    Analysis of cultural and historical processes in Europe during the Bronze Age.

Abstract

After discovering the first kurgans in the steppes, the archaeologists were faced with the need to determine the social status of buried persons and the relationship between people buried within the same necropolis. Archaeology has developed its methods and criteria for assessing the social status of buried persons, such as the size of the burial kurgans, the location of burials in the center or on the periphery of the kurgan, the wealth of implements, etc. With the introduction of paleogenetic methods into archeology, new opportunities for research in this direction are opening up. The analysis of ancient DNA is a tool that allows you not to assume but to establish consanguinity.

This study presents the archaeological and molecular analysis of human remains from the East-Manych variant of the Catacomb culture. Catacomb culture dominated eastern Ukraine and southern Russia in the 3rd millennium BCE. The skeletons were recovered from kurgans of the Ergeninskii kurgan group in Kalmykia (Russia) that were radiocarbon dated the Bronze Age (25th–23rd century BCE). Y-chromosome STR analysis revealed that both individuals belonged to haplogroup R1b. This paternal lineage appears at high frequency in central, western, and northern Europe, and commonly appears among the Yamnaya. Analysis of mitochondrial DNA variation revealed the Catacomb males to belong to haplogroups H and N, respectively, both of which also appeared in the Yamnaya. These genetic data suggest a possible relationship between the Catacomb and Yamnaya cultures and contribute to our understanding of the cultural and historical processes occurring in the steppes of Eastern Europe during the Bronze Age.

Родословная и идентичность в катакомбных захоронениях катакомбной культуры бронзового века: Мета-история могил, скелетов и ДНК.
Основные моменты
- Археологический и молекулярный анализ человеческих останков из катакомбной культуры.
- Y-хромосомный СТР-анализ показал, что обе особи принадлежат к гаплогруппе R1b.
- МтДНК-анализ показал, что оба мужчины катакомбной культуры принадлежат к гаплогруппам H и N.
- Существует возможная связь между катакомбной и ямной культурами.
- Анализ культурно-исторических процессов в Европе в эпоху бронзы.

Аннотация

После обнаружения первых курганов в степях археологи столкнулись с необходимостью определения социального статуса погребенных и отношений между людьми, похороненными в одном некрополе. Археология разработала свои методы и критерии оценки социального статуса погребенных, такие как размер погребальных курганов, расположение захоронений в центре или на периферии кургана, богатство орудий труда и т.д. С внедрением палеогенетических методов в археологию открываются новые возможности для исследований в этом направлении. Анализ древней ДНК является инструментом, позволяющим не предполагать, а устанавливать родство.

В данном исследовании представлен археологический и молекулярный анализ человеческих останков из Восточно-Манычского варианта катакомбной культуры. Катакомбная культура доминировала на востоке Украины и юге России в III тысячелетии до нашей эры. Скелеты были извлечены из курганов Ергенинской курганной группы в Калмыкии (Россия), которые были радиоуглеродными, датированными бронзовым веком (25-23 вв. до н.э.). Y-хромосомный СТР-анализ показал, что обе особи принадлежат к гаплогруппе R1b. Эта отцовская родословная встречается на высоких частотах в центральной, западной и северной Европе и обычно встречается среди ямной. Анализ вариаций митохондриальной ДНК показал, что катакомбные самцы принадлежат к гаплогруппам H и N соответственно, причем обе они также появились на Ямной. Эти генетические данные позволяют предположить возможную связь катакомбной и ямной культур и способствуют нашему пониманию культурно-исторических процессов, происходящих в степях Восточной Европы в эпоху бронзы.

Переведено с помощью www.DeepL.com/Translator (бесплатная версия)

[Andvari]

Тут полный текст
https://www.researchgate.net/publication/350441357_Ancestry_and_identity_in_Bronze_Age_Catacomb_culture_burials_A_meta-tale_of_graves_skeletons_and_DNA

[пенелопа]

Баски.

Andre Flores-Bello, Frederic Bauduer, Jasone Salaberria et al.  Genetic origins, singularity,and heterogeneity of Basques // Current Biology 31, 1–11 May 24, 2021 https://doi.org/10.1016/j.cub.2021.03.010
 

Статья в свободном доступе https://www.cell.com/current-biology/pdfExtended/S0960-9822(21)00349-3

Пересказ на генофонде: http://xn--c1acc6aafa1c.xn--p1ai/?page_id=33774&fbclid=IwAR2oT20GltE57EDtnuQErTRpk2_AqNWbw0KT0XkFGWqNbnCK5MzGfxUrfrA

[Fire]

Баски.

Ну если у басков нет кавказского компонента, то возможно поэтому они и не ИЕ, и их R1b были авангардом в западном походе, которые пробежали мимо белых женщин вслед за северным оленем. Если грубо, то два варианта для эускара: или свой язык для R1b, или язык от европейских I-охотников мезолита,  и их отдалённое сходство с сардинцами как раз из за последних,  если пишут об изначальной обособленности этих баскских групп.

Компонента "Progress" из предгорий энеолита Кавказа у Басков навалом, того что родственен Ямной.
"Закавказского" компонента нет у Басков

[rozenblatt]

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352409X21001516

Related in death? A curious case of a foetus hidden in bishop Peder Winstrup’s coffin in Lund, Sweden

MajaKrzewińska, Ricardo Rodríguez-Varela, Caroline Ahlström Arcini, Torbjörn Ahlström, Niklas Hertzman, Jan Storå, Anders Götherström

https://doi.org/10.1016/j.jasrep.2021.102939

Highlights

•    Genomic analysis reveals possible role of kin relations associated with an uncommon burial practice.
•    Genomic and genealogical analyses used in kinship study.
•    A second-degree kinship relation demonstrated between the bishop of Lund, Peder Winstrup (1605–1679) and a 5–6-month-old foetus.
•    Foetus of a probable grandchild found in the same coffin as the bishop of Lund, Peder Winstrup who died in 1679.

Abstract

When the famous bishop of Lund, Peder Winstrup, died in 1679 he was laid to rest in a family crypt in Lund Cathedral alongside his wife. Following a restoration of the Cathedral in the late 19th century, Peder Winstrup’s coffin was moved to the crypt, as the family grave was dismantled. In 2012, a decision was made to move his remains to a different location presenting scientists with an opportunity to investigate bishop’s mummified remains. Unexpectedly, hidden underneath Winstrup’s body, a small bundle containing mummified remains of a 5–6-month-old foetus was found. This finding prompted questions regarding the possible relation between both individuals with most hypotheses suggesting no relation and an opportunistic character of the placement of the foetus in bishop’s coffin. Here we test the hypotheses using ancient DNA genomics, including mitochondrial DNA and Y chromosome data, as tools for kinship analyses. We identified a second-degree kinship relation, which, in combination with genealogical analysis, suggests a grandparent-grandchild relation, as highly probable affiliation.

Основные моменты

- Геномный анализ выявляет возможную роль родственных связей, связанных с необычной погребальной практикой.
- Геномный и генеалогический анализ, используемый при изучении родственных связей.
- Родственные связи второй степени продемонстрированы между епископом Лундским Педером Винструпом (1605-1679) и 5-6-месячным плодом.
- Плод вероятного внука, найденный в том же гробу, что и епископ Лундский, Педер Винструп, умерший в 1679 году.

Резюме

Когда в 1679 году умер знаменитый епископ Лундский, Педер Винструп, он был похоронен в семейном склепе в Лундском соборе вместе со своей женой. После реставрации собора в конце 19 века гроб Педера Винструпа был перенесен в склеп, так как семейная могила была разобрана. В 2012 году было принято решение переместить его останки в другое место, предоставив ученым возможность исследовать мумифицированные останки епископа. Неожиданно, спрятанный под телом Винструпа, был найден небольшой пучок, содержащий мумифицированные останки 5-6-месячного зародыша. Эта находка вызвала вопросы относительно возможной связи между обеими индивидами с большинством гипотез, указывающих на отсутствие связи и оппортунистический характер помещения плода в гроб епископа. Здесь мы проверяем гипотезы, используя древние ДНК геномики, в том числе данные митохондриальной ДНК и Y-хромосомы, в качестве инструментов для анализа родства. Мы выявили родственные связи второй степени, которые, в сочетании с генеалогическим анализом, предполагают наличие родственных связей между прародителями и внуками, как высоко вероятную связь.

Переведено с помощью www.DeepL.com/Translator (бесплатная версия)

Код: [Выделить]

Sample_ID MtDNA Hg ISOGG Y Hg
Win001_all (PW) H3b7 R1b1a1a2a1a2
win002_all (Foetus) U5a1a1 R1b1a1a2a1a2

Немного предыстории: https://lenta.ru/news/2015/06/23/lund/

[falcon16]

Райх готовится к публикации 216 палео днк

Ydna/Mtdna  https://www.yfull.com/samples-from-paper/499/
Карта  https://reichdata.hms.harvard.edu/pub/datasets/agdp/maps/agdp_map.html
Allen Ancient Genome Diversity Project. Pre-publication data release of high quality shotgun sequencing data from 216 ancient individuals  https://reich.hms.harvard.edu/ancient-genome-diversity-project

[rozenblatt]

https://www.rfbr.ru/rffi/ru/rffi_contest_results/o_2120773

Итоги конкурса лучших проектов фундаментальных научных исследований по теме «Древняя ДНК в комплексных исследованиях истории Евразии, палеосреды и социальных инфекций»

Код конкурса: (Древняя ДНК) Конкурс на лучшие проекты фундаментальных научных исследований по теме «Древняя ДНК в комплексных исследованиях истории Евразии, палеосреды и социальных инфекций»

Год конкурса: 2021

На конкурс лучших проектов фундаментальных научных исследований по теме «Древняя ДНК в комплексных исследованиях истории Евразии, палеосреды и социальных инфекций» было подано 42 заявки. По результатам проведенной экспертизы финансовую поддержку получили 15 проектов.
Список поддержанных проектов

Руководитель
   

Номер проекта
   

Название проекта

Абрамсон Наталья Иосифовна
   

20-29-01038
   

В поисках ускользающего севера:реконструкция эволюционной истории песца (Vulpes lagopus) от позднего плейстоцена до современности по данным изменчивости митохондриальных геномов.

Балабанова Мария Афанасьевна
   

20-29-01020
   

Генетическая структура савромато-раннесарматских популяций Южного Приуралья и Нижнего Поволжья .

Балановская Елена Владимировна
   

20-29-01037
   

Генофонд алан: поиск их предков и потомков на Кавказе и в степях Предкавказья

Балановский Олег Павлович
   

20-29-01017
   

Взаимодействие славянских и финноязычных племен в Волго-Окском междуречье и этногенез русского народа: генетическая история длиной в тысячелетие

Гончаров Артемий Евгеньевич
   

20-29-01043
   

Патоценозы археологических памятников и палеонтологических местонахождений Арктики.

Григорьева Лена Валерьевна
   

20-29-01021
   

Эволюция грызунов и зайцеобразных Северо-Восточной Евразии в плейстоцене – голоцене: Анализ палеоДНК уникальных находок из вечной мерзлоты

Добровольская Мария Всеволодовна
   

20-29-01006
   

На северных рубежах Геродотовой Скифии: палеогеномный портрет номадов Среднего Дона раннего железного века.

Жигалова Надежда Алексеевна
   

20-29-01032
   

Поиск эпигенетических детерминант ожирения путем сравнения профилей метилирования геномов древнего и современного человека

Криницына Анастасия Александровна
   

20-29-01039
   

Древняя ДНК растений: баркодинг неидентифированых образцов исторического фонда Гербария МГУ и археологических находок растительного происхождения из Средней России

Пилипенко Александр Сергеевич
   

20-29-01024
   

Генетическая история населения юга Западной Сибири эпохи неолита - развитой бронзы (VII - начало II тыс. до н.э.) в контексте этнокультурных процессов в Северной Евразии

Трифонов Виктор Анатольевич
   

20-29-01035
   

Генетическое разнообразие древних народов С-З Кавказа в контексте культурных изменений эпохи энеолита - бронзы (V– II тыс. до н.э.)

Холодова Марина Владимировна
   

20-29-01013
   

Генетические характеристики ископаемых экологических форм казарок в голоцене

Чикишева Татьяна Алексеевна
   

20-29-01011
   

Генетическая история, палеоэкология и культура древнейшего населения Алтая

Щур Владимир Львович
   

20-29-01028
   

Разработка методов популяционного анализа древней и современной ДНК по правдоподобию генотипов

Энговатова Ася Викторовна
   

20-29-01002
   

Миграции населения эпохи бронзы в лесной полосе на Русской равнине по данным палеогенетики и археологии



https://volsu.ru/news_archive.php?ELEMENT_ID=37686

Ученые ВолГУ получили грант РФФИ на изучение генетической структуры савромато-раннесарматских популяций
Подведены результаты конкурса грантов Российского фонда фундаментальных исследований на лучшие научные проекты по теме «Древняя ДНК в комплексных исследованиях истории Евразии, палеосреды и социальных инфекций». Из 42 поданных заявок эксперты выбрали только 15. Проект доктора исторических наук, профессора кафедры отечественной и всеобщей истории, археологии Волгоградского государственного университета Марии Афанасьевны Балабановой «Генетическая структура савромато-раннесарматских популяций Южного Приуралья и Нижнего Поволжья» получил поддержку фонда.

[пенелопа]

Неандертальцы. https://science.sciencemag.org/content/early/2021/04/14/science.abf1667

[rozenblatt]

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960982221004516

Early Alpine occupation backdates westward human migration in Late Glacial Europe

Published: April 21, 2021
https://doi.org/10.1016/j.cub.2021.03.078

Highlights

•    Genetic replacement in Southern European hunter-gatherers started at least 17 ka ago
•    The shift follows the LGM and precedes the onset of the Bølling/Allerød event
•    This process is chronologically associated with major cultural transitions in Europe

Summary

Before the end of the Last Glacial Maximum (LGM, ∼16.5 ka ago)1 set in motion major shifts in human culture and population structure,2 a consistent change in lithic technology, material culture, settlement pattern, and adaptive strategies is recorded in Southern Europe at ∼18–17 ka ago. In this time frame, the landscape of Northeastern Italy changed considerably, and the retreat of glaciers allowed hunter-gatherers to gradually recolonize the Alps.3, 4, 5, 6 Change within this renewed cultural frame (i.e., during the Late Epigravettian phase) is currently associated with migrations favored by warmer climate linked to the Bølling-Allerød onset (14.7 ka ago),7, 8, 9, 10, 11 which replaced earlier genetic lineages with ancestry found in an individual who lived ∼14 ka ago at Riparo Villabruna, Italy, and shared among different contexts (Villabruna Cluster).9 Nevertheless, these dynamics and their chronology are still far from being disentangled due to fragmentary evidence for long-distance interactions across Europe.12 Here, we generate new genomic data from a human mandible uncovered at Riparo Tagliente (Veneto, Italy), which we directly dated to 16,980–16,510 cal BP (2σ). This individual, affected by focal osseous dysplasia, is genetically affine to the Villabruna Cluster. Our results therefore backdate by at least 3 ka the diffusion in Southern Europe of a genetic component linked to Balkan/Anatolian refugia, previously believed to have spread during the later Bølling/Allerød event. In light of the new genetic evidence, this population replacement chronologically coincides with the very emergence of major cultural transitions in Southern and Western Europe.

Основные моменты

- Генетическая замещение у южно-европейских охотников-собирателей началось, по крайней мере, 17 тысяч лет назад.
- Эта смена следует за LGM и предшествует наступлению события Бёллинга/Аллерёда.
- Этот процесс хронологически связан с крупными культурными изменениями в Европе.

Резюме

До того, как конец Последнего ледникового максимума (LGM, ∼16.5 ka назад)1 привел в движение крупные сдвиги в человеческой культуре и структуре населения2 , в Южной Европе фиксируются последовательные изменения в технологии литологии, материальной культуре, характере расселения и адаптивных стратегиях ∼18-17 тысяч лет назад. В это время ландшафт северо-восточной Италии значительно изменился, а отступление ледников позволило охотникам-собирателям постепенно заново колонизировать Альпы.3, 4, 5, 6 Изменения внутри этого обновленного культурного каркаса (т.е, в позднеэпиграветский период) в настоящее время ассоциируется с миграциями, которым благоприятствует более теплый климат, связанный с наступлением Боллинг-Аллерёда (14,7 ка назад)7 , 8, 9, 10, 11, которые заменили более ранние генетические родословные на родословные, найденные у особи, жившей ∼14 ка назад в Рипаро Виллабруна, Италия, и разделяемой между различными контекстами (Кластер Виллабруна). 9 Тем не менее, эта динамика и их хронология все еще далека от распутывания из-за фрагментарных свидетельств о дальних взаимодействиях по всей Европе12. Здесь мы генерируем новые геномные данные из человеческой нижней челюсти, обнаруженной в Рипаро Тальенте (Венето, Италия), которые мы непосредственно датировали 16 980-16 510 cal BP (2σ). Эта особь, пораженная очаговой дисплазией, генетически связана с кластером Виллабруна. Поэтому наши результаты отодвигают по крайней мере на 3 тысячи лет назад диффузию в Южной Европе генетического компонента, связанного с балканско-анатолийскими рефугиями, которые, как ранее считалось, распространились во время более позднего события в Бёллинге/Аллерёде. В свете новых генетических данных такое замещение популяции хронологически совпадает с самим возникновением крупных культурных переходов в Южной и Западной Европе.

Переведено с помощью www.DeepL.com/Translator (бесплатная версия)

мтДНК - U2′3′4’7’8’9
Y-ДНК - I2

[falcon16]

The genomic history of the Aegean palatial civilizations (2021) - https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(21)00370-6?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0092867421003706%3Fshowall%3Dtrue

Kou01
https://www.yfull.com/tree/J-Z36834*/
Pta08
https://www.yfull.com/tree/G-PF3345/
mtdna:
Mik15
https://www.yfull.com/mtree/J2b1/
Log04
https://www.yfull.com/mtree/J1c-a/
Log02
https://www.yfull.com/mtree/H55a/
Kou03
https://www.yfull.com/mtree/K1a1/

[Deus]

Я так понимаю Mik15 это первый протестированный пеласг,выходит они все же были не индоевропейцами...

[Arame]

50 процентов степной примеси в средной бронзе.  ~2300 днэ
Ничего себе.  Из другой книги

"Middle Helladic period between 2200 and 2000 BC a wave of Greek tribes, later self-styled Hellenes, poured into the southern part of the Balkan Peninsula. They were coming to Aegeida from the north. During the excavations of many settlements, the Early Helladic cultural layer is separated from the subsequent ones by a layer of ash. Other Early Helladic settlements were abandoned altogether. The conquerors were called Minias. "

[Fire]

Я так понимаю Mik15 это первый протестированный пеласг,выходит они все же были не индоевропейцами...

Пеласги в Греции существовали и в эпоху Железа.
Сомневаюсь что Mik15 4500-5000 лет назад мог быть Пеласгом

[Deus]

Я так понимаю Mik15 это первый протестированный пеласг,выходит они все же были не индоевропейцами...

Пеласги в Греции существовали и в эпоху Железа.
Сомневаюсь что Mik15 4500-5000 лет назад мог быть Пеласгом

Пеласги тут жили до греков,обычно считается что до греческое население континентальной греции было пеласгами,а эгейских островов лелегами

[Fire]

Я так понимаю Mik15 это первый протестированный пеласг,выходит они все же были не индоевропейцами...

Пеласги в Греции существовали и в эпоху Железа.
Сомневаюсь что Mik15 4500-5000 лет назад мог быть Пеласгом

Пеласги тут жили до греков,обычно считается что до греческое население континентальной греции было пеласгами,а эгейских островов лелегами

Аж до 7 века до н.э. Фессалия и горы к северу от Фессалии назывались так же Пеласгией, в 12 веке до н.э Пеласги были союзниками Трои. Пеласги так же были пришлыми на Крите в эпоху поздней Бронзы и раннего железа.
Часть южной Пеласгии, южной Фессалии, Пеласгический Аргос принадлежал Ахилу.

П.С.
Эллины-Мирмидоны из местности Фтия крайнего юго-востока Пеласгии, были на стороне Пелопонесских Ахейцев Микенцев Данайцев, против Троянцев