АвторТема: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)  (Прочитано 606344 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн zastrug

  • ...
  • Сообщений: 11223
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2802/-49
  • I2b1c (P78+)=I2a2a1b1a= I2a1b1a2a1a1( I-FT413656)
  • Y-ДНК: I2b1c
  • мтДНК: T2a1a
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #2070 : 12 Февраль 2020, 21:15:56 »
О какой первой волне неолитчиков с такими гаплогруппами может говорить автор статьи?

Оффлайн Yaroslav

  • Сообщений: 18700
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4673/-14
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #2071 : 14 Февраль 2020, 12:01:08 »
Не дДНК, но не знаю, где профильная тема. Если что, пусть модераторы перенесут.

Цитировать
Генетики обнаружили ДНК неизвестного вида гоминид в геноме африканцев

В геноме коренных западно-африканцев найдены следы до сих пор неизвестных видов людей. Это удалось выяснить благодаря новому способу выявления в ДНК современного человека генов других видов гоминидов.

Для поиска этим методом не нужно знать геном "вторженца". С его помощью ученым уже удалось выяснить, что предки народов Западной Африки скрещивались с неизвестными науке гоминидами (семейство отряда приматов, к которому относятся питекантропы, неандертальцы и современные люди).

Как известно, наши предки скрещивались с неандертальцами и денисовцами, генетический материал которых еще можно получить из найденных останков. Но, вероятно, межвидовые пары формировались и еще с кем-то.

Поэтому американские генетики Арун Дурвасула и Шрирам Санкарараман из Калифорнийского университета разработали новую методику поиска генов других видов в ДНК человека. Новация в том, что не надо сравнивать геномы того, у кого ищут другие гены, с теми, от кого он их "взял".

Данные о генетическом материале (всего 405 полных геномов) современных людей были взяты по йоруба, менде и еще двум западноафриканским народам. Исследователи обнаружили у нынешних жителей Западной Африки от двух до 19 процентов ДНК, которых не было у неандертальцев и денисовцев и пришли к выводу, что предки некоторых западноафриканских народов 43 тысячи лет назад скрещивались с пока еще неизвестными видами людей, которые отделились еще до появления неандертальцев и денисовцев.

Источник:

Цитировать
Recovering signals of ghost archaic introgression in African populations

Abstract

While introgression from Neanderthals and Denisovans has been documented in modern humans outside Africa, the contribution of archaic hominins to the genetic variation of present-day Africans remains poorly understood. We provide complementary lines of evidence for archaic introgression into four West African populations. Our analyses of site frequency spectra indicate that these populations derive 2 to 19% of their genetic ancestry from an archaic population that diverged before the split of Neanderthals and modern humans. Using a method that can identify segments of archaic ancestry without the need for reference archaic genomes, we built genome-wide maps of archaic ancestry in the Yoruba and the Mende populations. Analyses of these maps reveal segments of archaic ancestry at high frequency in these populations that represent potential targets of adaptive introgression. Our results reveal the substantial contribution of archaic ancestry in shaping the gene pool of present-day West African populations.

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 8292
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4700/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #2072 : 14 Февраль 2020, 12:44:15 »
Цитировать
Генетики обнаружили ДНК неизвестного вида гоминид в геноме африканцев
Исследователи обнаружили у нынешних жителей Западной Африки от двух до 19 процентов ДНК, которых не было у неандертальцев и денисовцев и пришли к выводу, что предки некоторых западноафриканских народов 43 тысячи лет назад скрещивались с пока еще неизвестными видами людей, которые отделились еще до появления неандертальцев и денисовцев.

Непонятно мне, почему сравнили с одним неандертальским и одним денисовским геномом, однако сделали вывод об отсутствии этих аллелей у всех неандертальцев и денисовцев.

Оффлайн Yaroslav

  • Сообщений: 18700
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4673/-14
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #2073 : 14 Февраль 2020, 12:59:49 »
Непонятно мне, почему сравнили с одним неандертальским и одним денисовским геномом, однако сделали вывод об отсутствии этих аллелей у всех неандертальцев и денисовцев.

Возможно, в англоязычном оригинале есть вменяемое объяснение. Пишут, что использовался какой-то новый метод.

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 8292
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4700/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #2074 : 14 Февраль 2020, 14:07:32 »
Возможно, в англоязычном оригинале есть вменяемое объяснение. Пишут, что использовался какой-то новый метод.
Да я и просмотрел по диагонали оригинал. Если уловил суть метода, по какой-то теории/модели должно быть одно распределение общих с неандертальцами производных аллелей, а получается другое. Отсюда выводы о разделении и смешении. Неохота глубоко штудировать статью. Однако 19% ДНК у кого-то в Африке от чуждого всем трём ветвям человечества (кроманьонцы, неандертальцы, денисовцы) ствола это таки заявка на серьёзную сенсацию. По логике, подобное должны были давно заметить раньше.

Оффлайн zastrug

  • ...
  • Сообщений: 11223
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2802/-49
  • I2b1c (P78+)=I2a2a1b1a= I2a1b1a2a1a1( I-FT413656)
  • Y-ДНК: I2b1c
  • мтДНК: T2a1a
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #2075 : 22 Февраль 2020, 18:00:40 »
Paleogenomic Evidence for Multi-generational Mixing between Neolithic Farmers and Mesolithic Hunter-Gatherers in the Lower Danube Basin (2020) - https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5483232/
А это уже было? Я просто пропустил?
SC1_Meso   Schela Cladovei (Romania)   8,814 ± 261      U5b2c    R      
SC2_Meso   Schela Cladovei (Romania)   −   2.83×           U5a1c   R1      
OC1_Meso   Ostrovul Corbului (Romania)   8,704 ± 269    K1         R1b   

Оффлайн Arthwr

  • Сообщений: 1331
  • Страна: ua
  • Рейтинг +785/-6
    • http://r1b-pf7562.blogspot.com/
  • Y-ДНК: R1b-PF7563
  • мтДНК: K1c1e
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #2076 : 22 Февраль 2020, 18:57:40 »
Paleogenomic Evidence for Multi-generational Mixing between Neolithic Farmers and Mesolithic Hunter-Gatherers in the Lower Danube Basin (2020) - https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5483232/

https://www.yfull.com/tree/R-V2219*/

https://www.yfull.com/samples-from-paper/387/

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1569
  • Страна: kg
  • Рейтинг +2073/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #2077 : 24 Февраль 2020, 22:35:25 »
https://www.nature.com/articles/s41467-020-14523-6

Article
Open Access
Published: 24 February 2020

Genetic history from the Middle Neolithic to present on the Mediterranean island of Sardinia

Joseph H. Marcus, Cosimo Posth, Harald Ringbauer, Luca Lai, Robin Skeates, Carlo Sidore, Jessica Beckett, Anja Furtwängler, Anna Olivieri, Charleston W. K. Chiang, Hussein Al-Asadi, Kushal Dey, Tyler A. Joseph, Chi-Chun Liu, Clio Der Sarkissian, Rita Radzevičiūtė, Megan Michel, Maria Giuseppina Gradoli, Patrizia Marongiu, Salvatore Rubino, Vittorio Mazzarello, Daniela Rovina, Alessandra La Fragola, Rita Maria Serra, Pasquale Bandiera, Raffaella Bianucci, Elisa Pompianu, Clizia Murgia, Michele Guirguis, Rosana Pla Orquin, Noreen Tuross, Peter van Dommelen, Wolfgang Haak, David Reich, David Schlessinger, Francesco Cucca, Johannes Krause & John Novembre

Nature Communications volume 11, Article number: 939 (2020) Cite this article
Abstract

The island of Sardinia has been of particular interest to geneticists for decades. The current model for Sardinia’s genetic history describes the island as harboring a founder population that was established largely from the Neolithic peoples of southern Europe and remained isolated from later Bronze Age expansions on the mainland. To evaluate this model, we generate genome-wide ancient DNA data for 70 individuals from 21 Sardinian archaeological sites spanning the Middle Neolithic through the Medieval period. The earliest individuals show a strong affinity to western Mediterranean Neolithic populations, followed by an extended period of genetic continuity on the island through the Nuragic period (second millennium BCE). Beginning with individuals from Phoenician/Punic sites (first millennium BCE), we observe spatially-varying signals of admixture with sources principally from the eastern and northern Mediterranean. Overall, our analysis sheds light on the genetic history of Sardinia, revealing how relationships to mainland populations shifted over time.

Остров Сардиния на протяжении десятилетий представляет особый интерес для генетиков. Современная модель генетической истории Сардинии описывает остров как место, где проживает население, происходящее в основном из неолитических народов южной Европы и оставшееся изолированным от более поздних экспансий бронзового века на материке. Для оценки этой модели мы генерируем данные древней ДНК по всему геному для 70 человек из 21 археологического памятника Сардинии, охватывающих период от среднего неолита вплоть до средневековья. Самые ранние особи демонстрируют сильное сродство с неолитическими популяциями западного Средиземноморья, за которым следует длительный период генетической непрерывности на острове до нурагического периода (второе тысячелетие до нашей эры). Начиная с особей из финикийских/пунических поселений (первое тысячелетие до н.э.), мы наблюдаем пространственно-изменяющиеся сигналы примеси с источниками, главным образом, из восточного и северного Средиземноморья. В целом, наш анализ проливает свет на генетическую историю Сардинии, выявляя, как со временем менялись взаимоотношения с материковыми популяциями.

Оффлайн Yaroslav

  • Сообщений: 18700
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4673/-14
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #2078 : 24 Февраль 2020, 23:24:29 »
Full ID   Archeological Site   Region   Y Haplogroup (ISOGG 2018)   mtDNA Haplogroup

AMC001 Aho M. Carru Alghero, SS - U6a7a

AMC005 Aho M. Carru Alghero, SS - L2a1

AMC014 Aho M. Carru Alghero, SS G2a2a1a2a1a T2b

COR001 Corona Moltana/ Zarau Bonnanaro, SAS - K1b1a1

COR002 Corona Moltana/ Zarau Bonnanaro, SAS I2a1a2 K1b1a1

FIL004 Filigosa, t.1 Macomer, NUO - H1

I0206 Su Grutta ’e is Bittuleris Seulo, CA R1b1-? (xM269) K1a4a1

I0207 Su Grutta ’e is Bittuleris Seulo, CA R1? (single marker on R) T2b3

I0209 Su Grutta ’e is Bittuleris Seulo, CA R1b1b X2b3

I0210 Su Grutta ’e is Bittuleris Seulo, CA R? (single marker on R) V

ISB001_ISB002 Su Grutta ’e is Bittuleris Seulo, CA I2a1a1a H1

ISC001 S’Iscia ‘e sas Piras Usini, SS I2a1b1 T2b3

LON001 Grutta I de Longu Fresu Seulo, CA - J2b1a8

LON003_LON004 Grutta I de Longu Fresu Seulo, CA G2a2b2a K1a2a

MA110.INM001 Ingurtosu Mannu Donori, CA R1b1b2a T2b3

MA112.ISR001 Is Arutas Cabras, OR G2a2b2b1a1 V

MA138.ISR002 Is Arutas Cabras, OR R1b1b H5a

MA78.SUA008 Riparo sotto roccia Su Asedazzu Seulo, CA R1b1b H3u

MA79.LON002 Grutta I de Longu Fresu Seulo, CA - U5b2b3

MA82.SCA002_SCA003 Riparo sotto roccia Su Cannisoni 1 Seulo, CA - H1

MA85.STE001 Su Stampu Erdi Seulo, CA - H1e1a

MA87.SUA009 Riparo sotto roccia Su Asedazzu Seulo, CA R1b1b J2b1a

MA88.SUA004 Riparo sotto roccia Su Asedazzu Seulo, CA - U5b2b5

MA89.CDS001 Cannas di Sotto, t. 12 Carbonia, CI R1b1b2 K1b1a1

MSR002 Monte Sirai Carbonia, CI G2a2a1a H13b1

MSR003 Monte Sirai Carbonia, CI - J1c3

NOE001 Noeddale Ossi, SS G2a2a1a2a1 H1

NOE002 Noeddale Ossi, SS ? HV0a

ORC001 S’Orcu ‘e Tueri Perdasdefogu, NUO - J1c3

ORC002 S’Orcu ‘e Tueri Perdasdefogu, NUO I2a1a1a1a1a1a1e5~ HV0j

ORC003 S’Orcu ‘e Tueri Perdasdefogu, NUO J2b2a1 K1a4a1

ORC004 S’Orcu ‘e Tueri Perdasdefogu, NUO I2a1b1 H3

ORC005 S’Orcu ‘e Tueri Perdasdefogu, NUO - J1c3

ORC006 S’Orcu ‘e Tueri Perdasdefogu, NUO G2a2b2b1a1a H1

ORC007 S’Orcu ‘e Tueri Perdasdefogu, NUO J2b2a1 H1e1a

ORC008 S’Orcu ‘e Tueri Perdasdefogu, NUO J2b2a1 H1

ORC009 S’Orcu ‘e Tueri Perdasdefogu, NUO - T2b3

PJU002 Padru Jossu Seneghe, OR - U5b2b5

SEC001 Serra Crabiles, t.3 Sennori, SS G2a2a1a2a1a J2b1a

SEC002 Serra Crabiles, t.3 Sennori, SS G2a2a1a2a1a J1c3

SEC004 Serra Crabiles, t.3 Sennori, SS - K2b1a

SEC005 Serra Crabiles, t.3 Sennori, SS - J1c3n'o'p

SEC006 Serra Crabiles, t.3 Sennori, SS - J2b1a

SID005 S'isteridolzu Ossi, SS I2? K1a

SID006 S'isteridolzu Ossi, SS I2a1b1 J1c1

SNN001 San Nicola Necropoli Esterna Sassari, SAS E1b1b1a1b1 U5a1d2a

SNN002 San Nicola Necropoli Esterna Sassari, SAS R1b1a1b H1j2a

SNN003 San Nicola Necropoli Esterna Sassari, SAS - H3f1

SNN004 San Nicola Necropoli Esterna Sassari, SAS R1b1a1b J2b1a7

SUA001 Riparo sotto roccia Su Asedazzu Seulo, CA R1b1b T2b3a

SUA002 Riparo sotto roccia Su Asedazzu Seulo, CA R1b1b H3

SUA003 Riparo sotto roccia Su Asedazzu Seulo, CA R1b1b H1

SUA005 Riparo sotto roccia Su Asedazzu Seulo, CA - H1

SUA006 Riparo sotto roccia Su Asedazzu Seulo, CA - H3ay

SUA007 Riparo sotto roccia Su Asedazzu Seulo, CA R1b1b T2c1d

SUC001 Su Crucifissu Mannu, t.16 Porto Torres, SAS - U5b3

SUC002 Su Crucifissu Mannu, t.16 Porto Torres, SAS - J1c3

SUC003 Su Crucifissu Mannu, t.16 Porto Torres, SAS I2a1b1 J1c3

SUC004 Su Crucifissu Mannu, t.16 Porto Torres, SAS - K1a

SUC005 Su Crucifissu Mannu, t.16 Porto Torres, SAS I2a1b1 K1a4a1

SUC006 Su Crucifissu Mannu, t.16 Porto Torres, SAS I2a1b1 H1av

SUC007 Su Crucifissu Mannu, t.16 Porto Torres, SAS I2a1b1 J2a1a1

SUC008 Su Crucifissu Mannu, t.22 Porto Torres, SAS - H4a1a

SUC009 Su Crucifissu Mannu, t.22 Porto Torres, SAS I2a1b J2a1a1

VIL004 Villamar Villamar, VS - I
VIL006 Villamar Villamar, VS - L2a1c3b1

VIL007 Villamar Villamar, VS J1a2a1a2d2b2 K1a3a

VIL009 Villamar Villamar, VS - V

VIL010 Villamar Villamar, VS - H3

VIL011 Villamar Villamar, VS R1b1a1b1 K1a3a


Оффлайн Arame

  • Сообщений: 956
  • Страна: am
  • Рейтинг +387/-1
  • J1-Z1842
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #2080 : 25 Февраль 2020, 13:56:22 »
Это работа Фернандеса интересна тем что в Сицилии в бронзовом веке появляется J2 из Греции по аутосомам минойцы.

Было бы интересно узнать более детально про эти J2.

https://www.nature.com/articles/s41559-020-1102-0

Article
Published: 24 February 2020
The spread of steppe and Iranian-related ancestry in the islands of the western Mediterranean
« Последнее редактирование: 25 Февраль 2020, 14:03:06 от Arame »

Оффлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1472
  • Страна: ru
  • Рейтинг +470/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #2081 : 25 Февраль 2020, 16:21:57 »
Это работа Фернандеса интересна тем что в Сицилии в бронзовом веке появляется J2 из Греции по аутосомам минойцы.

Было бы интересно узнать более детально про эти J2.

https://www.nature.com/articles/s41559-020-1102-0

Article
Published: 24 February 2020
The spread of steppe and Iranian-related ancestry in the islands of the western Mediterranean
Ссылка на сырые данные в статье имеется, так что вскоре узнаем.

Оффлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1472
  • Страна: ru
  • Рейтинг +470/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b
Re: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #2082 : 25 Февраль 2020, 17:19:03 »
Можно где-нибудь увидеть статью в открытом доступе?

Оффлайн Andvari

  • Сообщений: 327
  • Страна: ru
  • Рейтинг +167/-1
  • Y-ДНК: R1a - Y10802 (predicted)

Оффлайн mikhail a.

  • Сообщений: 1472
  • Страна: ru
  • Рейтинг +470/-0
  • Y-ДНК: J2a-PF5252
  • мтДНК: T2b

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.