АвторТема: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)  (Прочитано 361735 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Sylvester

  • Сообщений: 1622
  • Страна: ru
  • Рейтинг +559/-0
  • FTDNA:290147 YFull:YF64174 GEDmatch:T532939
  • Y-ДНК: I1-Y16803 Varangians (SWE>RUS)
  • мтДНК: N1a1a1a1a2 (RUS,KAZ,BGR,HUN)
Цитировать
Цитировать
причиной этому могло стать формирование патрилинейных кланов (в которых родство считается по мужской линии) и войны между ними
.
Цитировать
Цитировать
Соотношение мужчин и женщин в это время составляло 1:17 и это «бутылочное горлышко» существовало примерно полтора тысячелетия.
Это кто-нибудь прокомментирует? Я один в а.. удивлен или еще кто есть?
Если не ошибаюсь, ранее на эту же тему была статья и обсуждение, тут http://forum.molgen.org/index.php/topic,337.msg318634.html#msg318634

Онлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1378
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1722/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
Древняя ДНК индейцев Калифорнии и Онтарио:

http://science.sciencemag.org/content/360/6392/1024

Ancient human parallel lineages within North America contributed to a coastal expansion

C. L. Scheib1,2,*, Hongjie Li3, Tariq Desai4, Vivian Link5, Christopher Kendall6, Genevieve Dewar6, Peter William Griffith1, Alexander Mörseburg1, John R. Johnson7, Amiee Potter8,9, Susan L. Kerr10, Phillip Endicott11, John Lindo12, Marc Haber13, Yali Xue13, Chris Tyler-Smith13, Manjinder S. Sandhu13, Joseph G. Lorenz14, Tori D. Randall15, Zuzana Faltyskova1, Luca Pagani2,16, Petr Danecek13, Tamsin C. O’Connell1, Patricia Martz17, Alan S. Boraas18, Brian F. Byrd19, Alan Leventhal20,21, Rosemary Cambra20, Ronald Williamson22, Louis Lesage23, Brian Holguin24, Ernestine Ygnacio-De Soto25, JohnTommy Rosas26, Mait Metspalu2, Jay T. Stock1,27, Andrea Manica28, Aylwyn Scally4, Daniel Wegmann5, Ripan S. Malhi3,*, Toomas Kivisild1,2,*

Science 01 Jun 2018:
Vol. 360, Issue 6392, pp. 1024-1027
DOI: 10.1126/science.aar6851

Abstract

Little is known regarding the first people to enter the Americas and their genetic legacy. Genomic analysis of the oldest human remains from the Americas showed a direct relationship between a Clovis-related ancestral population and all modern Central and South Americans as well as a deep split separating them from North Americans in Canada. We present 91 ancient human genomes from California and Southwestern Ontario and demonstrate the existence of two distinct ancestries in North America, which possibly split south of the ice sheets. A contribution from both of these ancestral populations is found in all modern Central and South Americans. The proportions of these two ancestries in ancient and modern populations are consistent with a coastal dispersal and multiple admixture events.

Мало что известно о первых людях, которые вошли в Америку и про их генетическое наследие. Геномный анализ древнейших человеческих останков из Северной и Южной Америки показал прямую связь между популяцией, связанной с культурой кловис, и всеми современными центральными и южноамериканцами, а также глубокий раскол, отделяющий их от североамериканцев в Канаде. Мы представляем 91 древний человеческий геном из Калифорнии и Юго-Западного Онтарио и демонстрируем существование двух различных генетических компонентов в Северной Америке, которые, возможно, разделились к югу от ледниковых щитов. Вклад обоих этих популяций встречается во всех современных индейцах Центральной и Южной Америки. Пропорции этих двух генетических компонентов в древних и современных популяциях согласуются с прибрежным расселением и множественными смешиваниями.

Оффлайн Teresh

  • Сообщений: 389
  • Страна: ru
  • Рейтинг +156/-0
  • Y-ДНК: R1a [YP237+ YP578+]
  • мтДНК: U5a1f
Древняя ДНК индейцев Калифорнии и Онтарио:
http://science.sciencemag.org/content/360/6392/1024

Supplementary Materials: http://science.sciencemag.org/content/suppl/2018/05/30/360.6392.1024.DC1
Mito и Y присутствуют.

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 5880
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2134/-12
  • мтДНК: H1b
Outstanding questions in the study of archaic hominin admixture

Abstract
The complete sequencing of archaic and modern human genomes has revolutionized the study of human history and evolution. The application of paleogenomics has answered questions that were beyond the scope of archaeology alone—definitively proving admixture between archaic and modern humans. Despite the remarkable progress made in the study of archaic–modern human admixture, many outstanding questions remain. Here, we review some of these questions, which include how frequent archaic–modern human admixture was in history, to what degree drift and selection are responsible for the loss and retention of introgressed sequences in modern human genomes, and how surviving archaic sequences affect human phenotypes.

http://journals.plos.org/plosgenetics/article?id=10.1371/journal.pgen.1007349


Онлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1378
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1722/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
У срубников обнаружили предка бубонной чумы:

https://www.nature.com/articles/s41467-018-04550-9

Article | Open

Analysis of 3800-year-old Yersinia pestis genomes suggests Bronze Age origin for bubonic plague

Maria A. Spyrou, Rezeda I. Tukhbatova, Chuan-Chao Wang, Aida Andrades Valtueña, Aditya K. Lankapalli, Vitaly V. Kondrashin, Victor A. Tsybin, Aleksandr Khokhlov, Denise Kühnert, Alexander Herbig, Kirsten I. Bos & Johannes Krause

Nature Communicationsvolume 9, Article number: 2234 (2018)
doi:10.1038/s41467-018-04550-9

Received: 30 September 2017
Accepted: 27 April 2018
Published: 08 June 2018

Abstract

The origin of Yersinia pestis and the early stages of its evolution are fundamental subjects of investigation given its high virulence and mortality that resulted from past pandemics. Although the earliest evidence of Y. pestis infections in humans has been identified in Late Neolithic/Bronze Age Eurasia (LNBA 5000–3500y BP), these strains lack key genetic components required for flea adaptation, thus making their mode of transmission and disease presentation in humans unclear. Here, we reconstruct ancient Y. pestis genomes from individuals associated with the Late Bronze Age period (~3800 BP) in the Samara region of modern-day Russia. We show clear distinctions between our new strains and the LNBA lineage, and suggest that the full ability for flea-mediated transmission causing bubonic plague evolved more than 1000 years earlier than previously suggested. Finally, we propose that several Y. pestis lineages were established during the Bronze Age, some of which persist to the present day.

Происхождение Yersinia pestis(микроба вызывающего чуму) и ранние этапы её эволюции являются фундаментальными предметами исследований, учитывая её высокую вирулентность и смертность, которая явилась результатом прошлых пандемий. Хотя самые ранние свидетельства заражения Y. pestis у людей были идентифицированы в позднем неолите / бронзовом веке Евразии (LNBA 5000-3500 лет назад), эти штаммы не содержат ключевых генетических компонентов, необходимых для адаптации к блохам, что делает их способ распространения и проявления болезни в людях неясными. Здесь мы реконструируем древние геномы Y. pestis у людей, ассоциированных с периодом позднего бронзового века(~3800 лет назад) в Самарской области современной России. Мы показываем четкие различия между нашими новыми штаммами и другими штаммами позднего неолита/бронзового века и предполагаем, что полная способность к распространению через блох, вызывающей бубонную чуму, эволюционировала более чем на 1000 лет раньше, чем предполагалось ранее. Наконец, мы предлагаем, чтобы в эпоху бронзы появилось несколько линий Y. pestis, некоторые из которых сохраняются до наших дней.

Попутно они и самого человека просеквенировали:

Human uniparental and genomic analyses

Shotgun sequencing of RT5 resulted in 1.14 billion raw reads and a 4.2-fold average human genomic coverage (Supplementary Table 3). Genetic sex identification assigned RT5 to a male, which is in line with the anthropological assignment (Fig. 1a, Supplementary Methods). Nuclear contamination estimates based on X-chromosomal heterozygosity were low in RT5, estimated at an average of 0.5% (Supplementary Table 4), which permitted the usage of all generated human data. Y-chromosomal and mitochondrial assignment revealed the individual carrying R1a1a1b and U2e2a haplogroups, respectively (Supplementary Methods, and Supplementary Table 5). To gain insight into the ancestry of RT5, we performed principal component analysis (PCA)28,29,30 and ADMIXTURE31 analysis, where previously published ancient Eurasian populations32,33,34,35 were used as comparative datasets (Fig. 1 b, c). Our PCA (Fig. 1b) and ADMIXTURE (Fig. 1b, c) plots show RT5 to have close genetic affinity to ancient populations from EBA Europe and the MLBA steppe, which are genetically distinct from EBA populations from the Central Asian steppe, as they encompass early European farmer-related ancestry as part of their genetic composition (Fig. 1c). Examples of such groups include the European “Corded Ware”-associated populations, the “Andronovo” from the Altai region and the Samara-region “Srubnaya” culture with which RT5 has been archaeologically associated.

Онлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1378
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1722/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
Древние митогеномы из Восточной Сибири:

https://www.nature.com/articles/s41598-018-27325-0

 Article | Open | Published: 12 June 2018

Investigating Holocene human population history in North Asia using ancient mitogenomes

    Gülşah Merve Kılınç, Natalija Kashuba, Reyhan Yaka, Arev Pelin Sümer, Eren Yüncü, Dmitrij Shergin, Grigorij Leonidovich Ivanov, Dmitrii Kichigin, Kjunnej Pestereva, Denis Volkov, Pavel Mandryka, Artur Kharinskii, Alexey Tishkin, Evgenij Ineshin, Evgeniy Kovychev, Aleksandr Stepanov, Aanatolij Alekseev, Svetlana Aleksandrovna Fedoseeva, Mehmet Somel, Mattias Jakobsson, Maja Krzewińska, Jan Storå & Anders Götherström

Abstract

Archaeogenomic studies have largely elucidated human population history in West Eurasia during the Stone Age. However, despite being a broad geographical region of significant cultural and linguistic diversity, little is known about the population history in North Asia. We present complete mitochondrial genome sequences together with stable isotope data for 41 serially sampled ancient individuals from North Asia, dated between c.13,790 BP and c.1,380 BP extending from the Palaeolithic to the Iron Age. Analyses of mitochondrial DNA sequences and haplogroup data of these individuals revealed the highest genetic affinity to present-day North Asian populations of the same geographical region suggesting a possible long-term maternal genetic continuity in the region. We observed a decrease in genetic diversity over time and a reduction of maternal effective population size (Ne) approximately seven thousand years before present. Coalescent simulations were consistent with genetic continuity between present day individuals and individuals dating to 7,000 BP, 4,800 BP or 3,000 BP. Meanwhile, genetic differences observed between 7,000 BP and 3,000 BP as well as between 4,800 BP and 3,000 BP were inconsistent with genetic drift alone, suggesting gene flow into the region from distant gene pools or structure within the population. These results indicate that despite some level of continuity between ancient groups and present-day populations, the region exhibits a complex demographic history during the Holocene.

Палеогенетические исследования в значительной степени прояснили популяционную историю Западной Евразии в каменном веке. Однако мало что известно об истории народонаселения в Северной Азии, несмотря на то, что это обширный географический регион со значительным культурным и языковым разнообразием. Мы представляем полные последовательности митохондриальных геномов вместе с данными по стабильным изотопам для 41 серийно отобранных индивидуумов из Северной Азии, датированных между 13,790 лет назад и 1,380 лет назад, простирающимися от палеолита до железного века. Анализ митохондриальных последовательностей ДНК и данных гаплогрупп этих индивидуумов показал наибольшую генетическую близость к современным североазиатским популяциям того же географического региона, что свидетельствует о возможной долгосрочной генетической преемственности по материнским линиям в регионе. Мы наблюдали снижение генетического разнообразия с течением времени и сокращение эффективной численности популяции матерей (Ne) примерно за семь тысяч лет до настоящего времени. Коалесцентное моделирование соответствовало генетической непрерывности между современными людьми и индивидуумами, жившими 7 000, 4800 или 3000 лет назад. Между тем, генетические различия, наблюдавшиеся между людьми 7 000 и 3000 лет назад, а также между 4800 и 3000 лет назад не могли объясняться одним только генетическим дрейфом, что свидетельствует о поступлении генов в регион из отдаленных генофондов или наличии генетической структурированности внутри популяции. Эти результаты показывают, что, несмотря на некоторый уровень преемственности между древними группами и современными популяциями, регион демонстрирует сложную демографическую историю во время голоцена.

Онлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1378
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1722/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
Запоздавшая статья: в 2014 она была бы очень важно, а сейчас уже как-то блекло смотрится:

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1002/ajpa.23607

New genetic evidence of affinities and discontinuities between bronze age Siberian populations

Clémence Hollard, Vincent Zvénigorosky, Alexey Kovalev, Yurii Kiryushin, Alexey Tishkin, Igor Lazaretov, Eric Crubézy, Bertrand Ludes, Christine Keyser

First published: 14 June 2018
https://doi.org/10.1002/ajpa.23607

 Abstract

Objectives

This work focuses on the populations of South Siberia during the Eneolithic and Bronze Age and specifically on the contribution of uniparental lineage and phenotypical data to the question of the genetic affinities and discontinuities between western and eastern populations.

Materials and Methods

We performed molecular analyses on the remains of 28 ancient humans (10 Afanasievo (3600–2500 BC) and 18 Okunevo (2500–1800 BC) individuals). For each sample, two uniparentally inherited systems (mitochondrial DNA and Y‐chromosome DNA) were studied, in order to trace back maternal and paternal lineages. Phenotype‐informative SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) were also analyzed, along with autosomal STRs (Short Tandem Repeats).

Results

Most of the Afanasievo men submitted to analysis belonged to a single sub‐haplogroup, R1b1a1a, which reveals the predominance of this haplogroup in these early Bronze Age populations. Conversely, Okunevo individuals carried more diverse paternal lineages that mostly belonged to Asian/Siberian haplogroups. These differences are also apparent, although less strongly, in mitochondrial lineage composition and phenotype marker variant frequencies.

Discussion

This study provides new elements that contribute to our understanding of the genetic interactions between populations in Eneolithic and Bronze Age southern Siberia. Our results support the hypothesis of a genetic link between Afanasievo and Yamnaya (in western Eurasia), as suggested by previous studies of other markers. However, we found no Y‐chromosome lineage evidence of a possible Afanasievo migration to the Tarim Basin. Moreover, the presence of Y‐haplogroup Q in Okunevo individuals links them to Native American populations, as was suggested by whole‐genome sequencing.


Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 8848
  • Страна: kz
  • Рейтинг +863/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Отлично. Рахмет за ссылку

Онлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1378
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1722/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
На сайте EBI вывешивают геномы из ещё не опубликованной статьи:

https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB26982

Name

Ancient genome wide analyses infer kinship structure in an Early Medieval Alemannic graveyard

Submitting

Centre Smurfit Institute of Genetics

Secondary accession(s)

ERP109016

Description

From historical and archaeological records it is posited that the European medieval household was a combination of close relatives and recruits. However, such kinship structure has not yet been directly tested at a genomic level on medieval burials. The early 7th century A.D. burial at Niederstotzingen, discovered in 1962, is the most complete and richest example of Alemannic funerary practice in Germany. Excavations found thirteen closely associated individuals that were buried with an array of inscribed bridal gear, jewellery, armour and swords. These artefacts support that the individuals had contact to outside regions in France, Northern Italy and Byzantium. This study analysed genome wide data recovered from the remains, in tandem with the archaeological context, to reconstruct kinship and the extent of outside contact. All individuals had sufficient DNA preservation to genetically sex them as male and identify nine unique mitochondrial haplotypes and two distinct Y-chromosome lineages. Applying in-solution capture; genome-wide analyses were performed on eight individuals to estimate genetic affiliation to modern West Eurasians and genetic kinship at the burial. It was observed that five individuals were direct relatives to either first or second degree. Three other individuals were not detectably related, two of which showed genomic affinity to Southern Europeans. The genetic make-up of the individuals shares no observable pattern with their orientation in the burial or the cultural association of their grave goods, with the five related individuals having grave goods associated to four diverse cultural origins. This not only supports that kinship and fellowship were held in equal regard, but that diverse cultural appropriation was practiced among closely related individuals.

Из исторических и археологических источников следует, что европейское средневековое домохозяйство представляло собой сочетание близких родственников и нанятых людей(?). Однако такая структура родства еще не была непосредственно проверена на геномном уровне в средневековых захоронениях. Погребение 7 века н.э. в Нидерштотцингене, обнаруженное в 1962 году, является самым полным и богатым примером алеманского погребального обряда в Германии. Раскопки обнаружили тринадцать тесно связанных лиц, которые были похоронены с множеством надписанных свадебных принадлежностей, ювелирных изделий, доспехов и мечей. Эти артефакты подтверждают, что люди имели контакты с отдалёнными регионами Франции, Северной Италии и Византии. В этом исследовании были проанализированы данные о геноме, извлеченные из останков, в тандеме с археологическим контекстом, для восстановления родства и степени внешнего контакта. У всех людей была достаточная сохранности ДНК для определения их генетического пола как мужчин и идентификации девяти уникальных митохондриальных гаплотипов и двух разных линий Y-хромосомы. Применение геномного захвата в растворе; для оценки генетической принадлежности к современным Западно-Евразийцам и генетического родства при погребении были проведены геномные анализы восьми особей. Было отмечено, что пять человек являются непосредственными родственниками первой или второй степени. Три других индивида не были связаны между собой, два из них проявляли геномную близость к южным европейцам. Генетический состав индивидов не имеет какой-либо заметной закономерности с их ориентацией в погребении или культурной ассоциацией их погребальных артефактов, причем пять родственников, имеют погребальные артефакты, связанные с четырьмя разнообразными культурами. Это не только подтверждает, что родство и общение осуществлялись на равной основе, но и то, что различные культурные ценности практиковались среди тесно связанных между собой лиц.

Тезисы статьи уже всплывали в прошлом году:

Abstracts from Human Evolution 2017 conference

Ancient genome wide analyses infer kinship structure in an Early Medieval Alemannic graveyard

Mr Niall O´Sullivan1,2,3*, Cosimo Posth2,4, Valentina Coia1, Verena J. Schuenemann4,6, T. Douglas Price5, Joachim Wahl7,8, Ron Pinhasi3,9, Albert Zink1*, Johannes Krause2,4*, Frank Maixner1*

1 Institute for Mummy Studies, EURAC research, Viale Druso 1, 39100, Bolzano, Italy. 2 Max Planck Institute for the Science of Human History, Kahlaische Strasse 10, 07745, Jena, Germany. 3 School of Archaeology and Earth Institute, University College Dublin, Belfield, Dublin, Ireland. 4 Institute for Archaeological Sciences, University of Tübingen, Rümelinstrasse 23, 72070, Tübingen, Germany. 5 Laboratory for Archaeological Chemistry 1180 Observatory Drive Madison, 53706, Wisconsin, USA. 6 Senckenberg Center for Human Evolution and Paleoecology, Palaeoanthropology, University of Tübingen, Rümelinstrasse 23, 72070 Tübingen, Germany. 7 State Office for Cultural Heritage Management Baden-Württemberg, Osteology, D-78467, Konstanz, Germany. 8 Institute for Archaeological Sciences, Palaeoanthropology, University of Tübingen, Rümelinstrasse 23, 72070, Tübingen, Germany. 9 Department of Anthropology, University of Vienna, Althanstrasse 14, 1090 Vienna, Austria. *Corresponding authors

From historical and archaeological records it is posited that the European medieval household was a combination of close relatives and recruits. However, such kinship structure has not yet been directly tested at a genomic level on medieval burials. The early 7th century A.D. burial at Niederstotzingen, discovered in 1962, is the most complete and richest example of Alemannic funerary practice in Germany. Excavations found thirteen closely associated individuals that were buried with an array of inscribed bridle gear, jewellery, armour and swords. These artefacts support that the individuals had contact to outside regions in France, Northern Italy and Byzantium. To reconstruct kinship and the extent of outside contact, this study analysed genome wide data recovered from the remains in tandem with the archaeological context. All individuals had sufficient DNA preservation to genetically sex them as male and identify nine unique mitochondrial haplotypes. Applying in-solution capture; genome-wide analyses were performed on eight individuals to estimate genetic affiliation to modern West Eurasians and genetic kinship at the burial. There were two distinct Y-chromosome lineages present at the burial site. It was observed that five individuals were direct relatives to either first or second degree. Three other individuals were not detectably related, two of which showed genomic affinity to Southern Europeans. The genetic make-up of the individuals shares no observable pattern with their orientation in the burial or the cultural association of their grave goods, with the five related individuals having grave goods associated to four diverse cultural origins. This not only supports that kinship and fellowship were held in equal regard, but that diverse cultural appropriation was practiced among closely related individuals. The results show the potential for genome capture of ancient DNA to reconstruct ancient households and family trees.

Онлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1378
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1722/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
http://www.kkkm.ru/posetitelyam/kalendar-afisha/vstrecha-krasnoyarskogo-arheologicheskogo-kluba

Встреча Красноярского археологического клуба

Приглашаем всех желающих на лекцию «Новые палеогенетические данные о доисторическом населении Сибири».

В программе:

    Обзор последних публикаций по древней геномной ДНК с территории Северной Евразии.
    Описание выявляемых широкомасштабных демографических феноменов.
    Краткое описание предварительных данных, полученных в Лаборатории Дэвида Райха из сибирских антропологических материалов.
    Обращение к археологам и антропологам с предложением участия в решении нескольких исследовательских проблем.

Докладчик: Александр Ким, аспирант факультета археологии Гарвардского университета, аналитик в лаборатории Дэвида Райха в Отделе генетики Медицинской школы Гарварда.

Область научных интересов: композиция древней и современной ДНК человека; данные по вопросам демографии: формирование и трансформация народов, мобильность и миграция в предыстории, социальный смысл родословной; обмен концепциями между популяционной генетикой, исторической лингвистикой и физической антропологией. Участвовал в археологических экспедициях на Аляске и в Джунгарских горах Казахстана.

Переводчик: Светлана Смушко, студент магистерской программы по этологии Стокгольмского университета.

Вопросы и предложения по встрече можно отправить Макарову Николаю Поликарповичу (mnp@kkkm.ru, mnp1955@bk.ru) или Данилейко Виктории Александровне (danileikozima@mail.ru).

Когда   Где    Стоимость
27 июня в 16:00   ул. Дубровинского, 84
Лекционный зал краеведческого музея
(вход за главным зданием музея)   Вход свободный

Онлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1378
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1722/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
Новости:
Возможно, будет статья по древним геномам Приамурья и одному мезолитическому геному Маньчжурии Хоутаомуга I. Образцы Бойсманской культуры обнаружены являться гаплогруппой C2b-F1396 (C-L1373).
www.seaa-web.org/conf18/ConferenceAbstracts.pdf


3. Chuan-chao WANG, Chao NING
Institution: Max Planck Institute for the Science of Human History
Title of Presentation: Ancient Genomic Evidence for the Deep Ancestry of Northeast Asia
Abstract: We generated genome-wide data from 27 ancient human samples from the Amur
River Basin in the Russian Far East and the Houtaomuga cemetery in northeast China dating
to around 9,000 BCE to 1,000 CE. The Mesolithic Houtaomuga and Neolithic Boisman
culture provides an unmixed surrogate for an ancient Northeast Asian lineage as does the
sample from the Iron Age Yankovsky culture and some present-day Tungusic-speaking
populations, and the paternal Y chromosome of Boisman samples belongs to C2b-F1396,
which is the predominant lineage in present-day Mongolic, Tungusic, and some Turkic
speaking populations, documenting a continuous presence of this type of ancestry in
Northeast Asia stretching back at least 11,000 years. Some present-day Tungusic-speaking
populations in China are genetically similar to Han Chinese with a proportionate ancestry
relationship ranging from 13% to 50%, which occurred at least by the Early Medieval period
and argues the Han expansion left a significant genetic signature in Northeast Asia.

Отметим, что присутствие C-L1373 в Северо-Восточной Евразии является древним. Ее ветвь C-P39 обнаружена среди американских индейцев:
High-resolution SNPs and microsatellite haplotypes point to a single, recent entry of Native American Y chromosomes into the Americas.



Оттуда же:

Исследуется древняя ДНК из Кореи и Японии:

4. Choongwon JEONG, Mark HUDSON, Martine ROBBEETS

Institution: Max Planck Institute for the Science of Human History

Title of Presentation: Genetic Footprint of the Introduction of Rice Farming into the Korean Peninsula and Japanese Archipelago

Abstract:
The appearance of the Yayoi culture in 2,300 yBP or earlier, likely from the Korean peninsula, coincides with the introduction of paddy field rice farming and metallurgy to the Japanese archipelago. A replacement of the preceding Jomon people by Yayoi provides a clear case of farming-associated demic diffusion, contributing to about 80% of the ancestry in contemporary Japanese. However, the genetic origins of Jomon and Yayoi people have not been thoroughly studied using genome-scale data.
For the genomic analysis, we collected prehistoric human remains from Korea and Japan. We are currently processing Neolithic samples from the southern shore of Korea and from Miyakojima in southern Japan, predating the Yayoi culture. By generating genome-wide data, we expect to understand the nature of prehistoric Korean and Japanese gene pools. This will provide a baseline to detect temporal changes and the spatial substructure in their gene pools.

Исследуется древняя ДНК бронзового века Монголии:

5. Christina WARINNER

Institution: Max Planck Institute for the Science of Human History

Title  of  Presentation:Population Migration and Dairy Pastoralism on the Bronze Age Mongolian Steppe

Abstract:
The  steppe belt that extends across Eurasia was the primary corridor of Late Neolithic and Bronze Age migrations that reshaped the genetics of Europe and Asia and dispersed the Indo-European language family. Beginning in the Late Neolithic, a new and highly mobile pastoralist society formed on the Western Steppe. These steppe herders expanded both westwards, contributing to the Corded Ware culture of Eastern and Central Europe, and eastwards, contributing to the mobile pastoralist Afanasevo, Sintashta, and Andronovo cultures. The eastern extent of this Western steppe herder expansion is not well defined. Here we investigate genome-wide ancestry data obtained from 20 Late Bronze Age khirigsuur burials from Khovsgol, Mongolia and further investigate evidence for dairy pastoralism by LC-MS/MS analysis of dental calculus. Overall, we observe limited Western Steppe gene flow into Late Bronze Age Mongolia, but a robust adoption of Western domesticates and ruminant dairying.

Оффлайн asan-kaygy

  • ...
  • Сообщений: 8848
  • Страна: kz
  • Рейтинг +863/-5
  • Y-ДНК: R1a1a1b2a1a-L657+,Y9+,Y944+
Спасибо за ссылки

Онлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1378
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1722/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
https://news.day.az/society/1019764.html

В Турции и Швеции будет проведен анализ ДНК древних людей, найденных в Азербайджане

В рамках проекта взятые для анализа ДНК образцы обнаруженных на территории Азербайджана останков людей периода неолита будут изучены в лабораториях Турции и Швеции с использованием современных технологий.

Онлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1378
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1722/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
Стали доступны тезисы конференции SMBE 2018: http://smbe2018.jp/mobile_app.html#abstract_pdf

Некоторые интересные доклады/постеры:

Геном представителя охотской культуры из Северной Японии, мтДНК G1b:

Human population history in the southwestern coastal region of Sea of Okhotsk, inferred from ancient genome analysis

Takehiro Sato 1, Noboru Adachi 2, Ryosuke Kimura 3, Minoru Yoneda 4, Hiroki Oota 5, Atsushi Tajima 1, Atsushi Toyoda 6, Hiromi Matsumae 7, 8, Kae Koganebuchi 3, Kentaro K Shimizu 7, 8, Tsunehiko Hanihara 4, Andrzej Weber 9, Hirofumi Kato 10, Hajime Ishida 3

1 Kanazawa University (Japan),
2 University of Yamanashi (Japan),
3 University of the Ryukyus (Japan),
4 The University of Tokyo (Japan),
5 Kitasato University (Japan),
6 National Institute of Genetics (Japan),
7 University of Zurich (Switzerland),
8 Yokohama City University (Japan),
9 University of Alberta (Canada),
10 Hokkaido University (Japan)

In 2013, an ancient human skeleton (NAT002) of the prehistoric Okhotsk culture was excavated from Hamanaka 2 site, Rebun Island, northern Japan. Radiocarbon age of NAT002 was 1060-1155 (68.2%) calAD. Some bones of this individual were affected by severe hyperostosis, suggesting SAPHO syndrome. To investigate the genetic features of the Okhotsk people, we extracted DNA from 3rd molars of NAT002 and performed whole genome sequencing. As a result of sequencing for 18 NGS libraries, the sequence data with 35-fold coverage was obtained. The typical deamination pattern and sufficiently low contamination rate were observed, ensuring the DNA authenticity. The mtDNA haplotype of NAT002 was assigned to haplogroup G1b, which is commonly observed among the modern North Asian populations. Results of outgroup f3 test, PCA, and ADMIXTURE analysis indicated that NAT002 was genetically close to the modern Nivkh and Ulch, who are living around the northern Sakhalin and the Lower Amur Basin. In addition, TREEMIX analysis indicated gene flow from the Ainu to NAT002. These findings suggest the past human migration from the Lower Amur region to the northern part of the Japanese archipelago and the admixture between the Okhotsk and Ainu lineages, corresponding to the archaeological evidences. HLA typing indicated that NAT002 possessed HLA-B40 allele, which has been reported as one of the risk factors of ankylosing spondylitis, reactive arthritis, and undifferentiated spondyloarthritis. These diseases are classified into seronegative arthritis as well as SAPHO syndrome. Therefore, HLA type of NAT002 might be one of the cause of the hyperostosis.

50 древних геномов из Ирландии, от мезолита, до бронзового века:

The Genomics of Megaliths: An Irish case study into the reconstruction of prehistoric societal landscapes through ancient DNA analysis

Lara M Cassidy 1

1 Trinity College Dublin (Ireland)

The Irish Neolithic (circa 3,800-2,500) marks the emergence of complex civilization on the island, alongside the establishment of continued contacts with other Atlantic regions, which intensify in the succeeding Copper and Bronze Ages. In addition to these cultural upheavals, the Neolithic period has been demonstrated to both begin and end with mass migration into the island, potentially from multiple external sources. However, the variable interplay between geography and culture in the catalyzation of these population movements has remained an open question. Indeed, the archaeological record would suggest regional heterogeneity in the uptake of British and continental traditions at both transition points.

Here, the potential social and cultural implications of such events are explored through the prism of ancient genomics. Imputed diploid genotypes for over 50 individuals sampled from the Mesolithic to Bronze Age periods, encompassing a diversity of megalithic structures, are presented and dissected through the use of haplotypic-sharing methods, as well as estimations of kinship and inbreeding. Combined with Y chromosome analysis these provide the first evidence of genetic structure on the island during specific prehistoric time intervals, which can be interpreted along both geographical and cultural lines. Furthermore, candidate refugiums that may recurrently act as reservoirs for older traditions and genetic ancestries are identified, as well as hub regions, which appear more susceptible to demographic disturbances on the continent, highlighting the immovable constraints of geography on both cultural and genomic evolution.

Оффлайн FenriR

  • Сообщений: 2003
  • Страна: 00
  • Рейтинг +526/-2
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: K1a
Очередная интерактивная карта с образцами дДНК
http://homeland.ku.dk/
на этот раз от проекта по изучению происхождения ранних индо-европейцев от Копенгагенского университета, с наложенными поверх культурами и степными R1-ДНК

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100