Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)

[Kambic]

Есть видео докладов с конференции:
https://www.youtube.com/watch?v=ow36WzmMq8k

И Сабина Рейнхольд тоже уже отстрелялась.
Есть видео с раскопок в КЧР, где туземцы местные журналюги руководителя арх. Андрея Белинского обозвали Веринским.)

[kardes]

Дополнительно проанализировали три древних образца с Кипра.
Палеогеномический взгляд на происхождение первых поселенцев на острове Кипр
Археологические данные подтверждают спорадические морские посещения восточно-средиземноморского острова Кипр эпипалеолитическими охотниками-собирателями более 12 000 лет назад, за которыми следовали постоянные поселения в период раннего неолита. Географическое происхождение этих первых мореплавателей до сих пор остается неясным. Систематически анализируя все доступные геномы от позднего плейстоцена до раннего голоцена на Ближнем Востоке (ок. 14 000–7 000 кал. до н.э.), мы обеспечиваем всесторонний обзор генетического ландшафта раннего неолитического Плодородного Полумесяца и Анатолии и делаем вывод о вероятном происхождении трех недавно опубликованные геномы из Киссонерга-Милуткии (кипрский поздний докерамический неолит B, ок. 7600–6800 кал. до н.э.). Похоже, что примерно 80% их предков происходят от акерамических неолитических жителей Центральной Анатолии, проживающих на равнине Конья или вблизи нее, а остальная часть - от генетически базовой левантийской популяции. На основании полногеномного взвешенного ковариационного анализа предков мы делаем вывод, что это событие примеси произошло примерно между 14 000 и 10 000 лет до нашей эры, что совпало с переходом от кипрского позднего эпипалеолита к докерамическому неолиту А (PPNA). Кроме того, мы выявили сильное генетическое сходство между исследованными особями Cypro-LPPNB и более поздними жителями северо-западной Анатолии и самыми ранними европейскими земледельцами эпохи неолита. Наши результаты предоставляют археологические данные о доисторических демографических процессах в Восточном Средиземноморье, обеспечивая важную информацию о раннем мореплавании, морских связях и островных поселениях.
Первые левантийские поселенцы завезли на Кипр и левантийскую домашнюю мышь.
Количество образцов, мужские   Y-гаплогруппы   и  женские    mt-гаплогруппы

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.23.599747v1

Out-of-Anatolia: культурные и генетические взаимодействия во время неолитической экспансии в Эгейском море
Posted June 28, 2024.Dilek Koptekin и др. Аннотация
Изначальное месопотамское генетическое происхождение и трансформация популяционных групп при неолитизации западных анатолийцев и  южноевропейцев.
Западная Анатолия была важнейшим, но неуловимым элементом в неолитической экспансии из Плодородного полумесяца в Европу. Используя 30 новых палеогеномов из Анатолии около 8000-6000 гг. до н. э., мы описываем ранний голоценовый генетический ландшафт Западной Анатолии, предполагая непрерывность населения с конца верхнего плейстоцена. Наши результаты показывают, что неолитизация Западной Анатолии в 7-м тысячелетии до н. э. была многогранным процессом, характеризующимся ассимиляцией неолитических практик коренными группами и притоком месопатамского населения с востока, их смешанные потомки в конечном итоге заложили основы неолитической Юго-Восточной Европы. Интересно, что наблюдаемое разнообразие материальной культуры среди эгейских сообществ раннего неолита коррелирует с их географическими расстояниями, но не с их генетическими различиями.

[kardes]

Интересно были ли там какие то существенные изменения по Y и mito ?

Да есть данные и по мужским линиям и по женским, выше добавил.

Древние геномы индейцев майя позволяют лучше понять жестокие ритуалы Чичен-Ицы и генетическую преемственность с современными их потомками.
Древний город Чичен-Ица ​​на Юкатане, Мексика, был одним из крупнейших и наиболее влиятельных поселений майя в позднем и завершающем классическом периодах (600–1000 гг. н. э.) и остается одним из наиболее интенсивно изучаемые археологические памятники Мезоамерики1–4. Однако многие вопросы, касающиеся социального и культурного использования ее церемониальных пространств, а также генетических связей ее населения с другими мезоамериканскими группами, остаются без ответа2. Здесь мы представляем полногеномные данные, полученные от 64 малолетних особей, датируемых ок. 500-900 гг. н. э., которые были найдены в подземном массовом захоронении возле Священного сенота (воронки) в церемониальном центре Чичен-Ицы. Генетический анализ показал, что все проанализированные особи были мужчинами, а несколько особей были близкими родственниками, включая две пары монозиготных близнецов. Близнецы занимают видное место в мифологии майя и более широкой мезоамериканской мифологии, где они воплощают качества двойственности между божествами и героями5, но до сих пор они не были идентифицированы в контексте погребений древних майя. Генетическое сравнение с современными людьми в регионе показывает генетическую преемственность с древними жителями Чичен-Ицы, за исключением некоторых генетических локусов, связанных с иммунитетом человека, включая комплекс HLA, что указывает на сигналы адаптации, вызванные инфекционными заболеваниями, завезенными в регион во время колониального периода.  https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB73567

[kardes]

Проект CELTUDALPS: новые взгляды на пространственную мобильность и генетические вариации в Швейцарии и северной Италии в период позднего железного века . Конференция: AGUS-GPS Jahrversammlung, Берн, Швейцария 2024 г. Марко Милелла, Зита Лаффранки, Сандра Лёш, Валентина Койя, Стефания Зингале, Алиса Паладин, Альберт Р. Цинк.
Постоянное обсуждение основных биокультурных тенденций в Европе в период позднего железного века может принести пользу. предоставление биогеохимических и биомолекулярных данных. Однако по сравнению с другими географическими регионами на территориях Швейцарии и северной Италии в этот период все еще имеется мало данных о генетической изменчивости и пространственной мобильности. Целью проекта CELTUDALPS является исследование этих проблем посредством междисциплинарного анализа большого образца скелетов (около 500 человек), представляющих культурные группы Ла Тена в Швейцарии и северной Италии между 4 и 1 веками до нашей эры. Посредством генетического, изотопного и погребального анализа цель CELTUDALPS: (а) оценить различия и сходства в пространственной мобильности среди различных анализируемых контекстов; (б) реконструировать их генетическую изменчивость и историю; и © исследуют связи между мобильностью, родственными отношениями и социальной структурой. В этом докладе мы представляем теоретическую основу нашего исследования и обсуждаем культурную, социальную и биологическую значимость первоначальных результатов швейцарского выборочного проекта.

[пенелопа]

На юге Польши нашли двойное детское погребение гуннского времени
Предки одного из этих мальчиков происходили из Азии
https://nplus1.ru/news/2024/05/02/double-burial-from-poland

Ученые провели генетический анализ человеческих останков, который показал, что оба покойных были мальчиками. Один из них был носителем митохондриальной гаплогруппы H1q и Y-хромосомной гаплогруппы I1, а второй носителем митохондриальной гаплогруппы U5a1b1 и Y-хромосомной гаплогруппы N. Генетики выяснили, что эти люди сильно отличались по своему происхождению. Так, предки похороненного на животе ребенка происходили из Европы, в то время как корни второго мальчика уходили в Азию. При этом анализ изотопов стронция показал, что ребенок с европейским происхождением родился не в той же местности, где его похоронили. Напротив, второй мальчик мог родиться на юге современной Польши, где и нашли его могилу, хотя изотопная подпись также допускает, что он мог мигрировать со Среднедунайской равнины.

[kardes]

Связи фатьяновской популяции со средневолжской абашевской культурой по данным секвенирования древней ДНК
А.В. Енговатова, Х.В. Х. Мустафи н, И.Е. Алборова (Москва, РФ), А.А. Канапин, А.А. Самсонова (Санкт-Петербург, РФ), М.Б. Медникова (Москва, РФ)
Высокопроизводительное секвенирование древней ДНК фатьяновской и абашевской культур (7 и 3 мужчин соответственно) привело к появлению новых гипотез об их происхождении и контактах. Согласно опубликованным археологическим данным, т.е. э., в связи с поразительным сходством погребального инвентаря, обнаруженного в средневолжских абашевских погребальных комплексах, с найденным в культуре колоколообразных кубков, полагают, что фатьяновцы, возможно, произошли от культуры шнуровой керамики.
Настоящее исследование впервые демонстрирует поразительное сходство фатьяновцев, представленных Волосово-Даниловским и Никульцинским могильниками Ярославской области, с тремя самостоятельными культурными группами: а) народами шнуровой культуры, преимущественно из Богемии. и Германии, б) культуры колокольчиков, встречающиеся в том же регионе, а также во Франции и Нидерландах, и в) носители унетицкой культуры. Кроме того, абашевец из кургана Пепкино (идентификатор погребения 18) генетически близок нескольким фатьяновцам из Волосово-Даниловского и Никульцинского могильников. Наконец, новый набор АМС-радиоуглеродных дат помог сузить хронологический разрыв между экспансией фатьяновцев и абашевцев в сторону Верхнего и Среднего Поволжья, тем самым указав на прямой контакт между этими двумя группами. Поэтому можно предположить, что присущий скотоводам высокоподвижный и рассредоточенный образ жизни мог привести к освоению огромных территорий на востоке, сохраняя при этом тесную связь со своими исконными землями.
В заключение, наши результаты показывают, что фатьяновцы и абашевцы, вероятно, происходят из одного и того же генетического фона и являются неотъемлемой частью мира шнуровой культуры.

[пенелопа]

Культура Дзёмон.
https://nplus1.ru/news/2024/05/08/population-history-jomon

[пенелопа]

Генетики пересчитали время смешения сапиенсов и неандертальцев. https://nplus1.ru/news/2024/05/15/neanderthal-gene-flow

[kardes]

Биоархеологические перспективы поздней античности в Далмации: палеогенетические, диетические и популяционные исследования могильника Хвара Радошевича
Аннотация:  Поздняя античность Далмация была временем и местом политических волнений в Римской империи, которые повлияли на жизнь людей, живущих в этом регионе. Позднеантичное захоронение Хвар-Радошевич, относящееся к III-V векам, расположено на хорватском далматинском острове Хвар. Учитывая временные рамки и его расположение на оживленном морском торговом пути, изучение этого захоронения дает нам представление о жизни позднеантичного населения, проживавшего на этом острове. В его состав входят 33 человека, 17 из которых похоронены в замкнутой могиле, а остальные похоронены в разных местах поблизости от гробницы. Нашей целью было предоставить новые взгляды на жизнь людей на острове в те времена, изучая происхождение, структуру населения, возможные различия среди захороненного населения, пищевые привычки и общее состояние здоровья. Анализ предкового происхождения людей, похороненных в Хвар-Радошевиче, выявил разнообразное население, отражающее генетическую изменчивость той эпохи. Идентификация генетических отклонений предполагает принадлежность к отдельным регионам Римской империи, возможно, связанным с торговыми путями, связанными с позднеантичным портом в древнем Хваре. Анализ соотношения стабильных изотопов (δ13C и δ15N) показал, что диета в основном состоит из растений C3 с минимальным потреблением морских продуктов. Высокие показатели детской смертности, маркеры физиологического стресса и стоматологических заболеваний свидетельствуют о низком качестве жизни населения. Оценка родства и особенностей питания не выявила заметных различий между людьми, похороненными внутри гробницы, и теми, кто был похоронен снаружи, что указывает на отсутствие дифференцированной практики захоронения, основанной на социальном статусе и семейных связях.
Идентификаторы Гаплогруппы

Код: [Выделить]

Genetic ID Grave Isotope ID mt haplogroup Y chromosome haplogroup
I35009 G1 HR_G1_s No genetic data E1b1b1a1b1
I34297 G10 HR_G10_s U5b1b J2a1a1a2b2a3b1a1b1a2~
I34292 G11 HR_G11_s U5b1b
failed G13 HR_G13_s No genetic data
I34296 G14 HR_G14_a HV11 E1b1b1a1b1
I34301 G15 HR_G15_s No genetic data
I34298 G16 HR_G16_a No genetic data
failed G17 HR_G17_a No genetic data
I34982 G18 HR_G18_s No genetic data
I34981 G19 HR_G19_s No genetic data
I34299 G2 HR_G2_a No genetic data
I34294 G20 HR_G20_s W3a1 J2b2a1a1a1a1a1a
I33811 G3 HR_G3_a U5b1b
failed G6 HR_G6_s No genetic data
I33812 G7 HR_G7_a U1a3
I35082 G11b / No genetic data
I34287 G12 nonadult p 5 / No genetic data
I33889 G12-A1 / H35 J1a2a1a1~
failed G12-A10 / No genetic data
I34291 G12-A12 / No genetic data
I34290 G12-A13 / U8b1a1
I33885 G12-A2 / H3k
I33808 G12-A3 / H3k J2a1a1b2a1b1b2c~
failed G12-A4 / No genetic data
failed G12-A5 / No genetic data
I33888 G12-A6 / H9a J2a1a4b
I33886 G12-A7 / HV E1b1a1a1a1c1b2a2
failed G12-A9 / No genetic data
I33809 G12-S1 / HV12b1 J2a1a1a2b1b
I33893 G12-S2 / H5a3a2
I33890 G12-S3 / R0a G2a2b2a1a1b2
I33891 G12-S4 / K1c1
failed G12, A8 / No genetic data


[Yaroslav]

Биоархеологические перспективы поздней античности в Далмации: палеогенетические, диетические и популяционные исследования могильника Хвара Радошевича

Спасибо!

Получается вроде, что все игреки ближневосточного происхождения.

I33889 G12-A1 / H35 J1a2a1a1~

Если это текущий ISOGG, то наш товарищ получается из ветки J1a2a1a1-ZS4393. Балканский субклад на ней в YFull, кстати, есть.

[rozenblatt]

На сайте ENA появилась ссылка куда выложат геномы из исследования палеогенетики Восточноевропейской равнины:

https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJNA1086800

Study Title: Genetic history of the ancient population of the Russian Plain
Center Name: Vavilov Institute of General Genetics, Russian Academy of Sciences

ENA-FIRST-PUBLIC: 2024-05-11
ENA-LAST-UPDATE: 2024-05-11

Но пока там пусто.

[Tora_sama]

На сайте ENA появилась ссылка куда выложат геномы из исследования палеогенетики Восточноевропейской равнины:

https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJNA1086800

Study Title: Genetic history of the ancient population of the Russian Plain
Center Name: Vavilov Institute of General Genetics, Russian Academy of Sciences

ENA-FIRST-PUBLIC: 2024-05-11
ENA-LAST-UPDATE: 2024-05-11

Но пока там пусто.

Если это то, о чём я думаю, то там больше 200 образцов полногеномных...

[kardes]

Если это то, о чём я думаю, то там больше 200 образцов полногеномных...

- да, Сириус

Этот проект представляет результаты крупномасштабного мультипрокси-исследования средневековой Сицилии, ключевого периода времени и места для демографического формирования Европы. В этом исследовании мы сравниваем генетическое родство и диету двух общин разных вероисповеданий (мусульманской и христианской), похороненных на соседних кладбищах на сицилийском участке Сегеста в конце нормандского периода до конца швабского периода (конец XII в. середина 13 века). Эта работа была частью гранта ERC Advanced «SICTRANSIT», целью которого было понять влияние смен режима на Сицилии в средние века.

Древние геномы выявили сложные человеческие взаимодействия древних западных тибетцев.
Западное Тибетское нагорье является перекрестком между Тибетским нагорьем, Центральной Азией и Южной Азией, а также потенциальным путем миграции людей, соединяющим эти регионы. Однако история населения западного Тибетского нагорья остается в значительной степени неисследованной из-за отсутствия древних геномов, охватывающих длительный период времени из этой области. Здесь мы представили полногеномные данные 65 человек, датированные 3500-300 годами ранее (BP) в префектуре Нгари.
 Древние популяции западного Тибетского нагорья разделяют большинство своих генетических компонентов с популяциями южного Тибетского нагорья и поддерживают генетическую преемственность с 3500 лет назад, сохраняя при этом взаимодействие с популяциями внутри и за пределами Тибетского нагорья. На Тибетском нагорье на древнее население западной части Тибетского нагорья повлияло дополнительное расширение с юга на юго-западное плато до 1800 г. до н.э. За пределами Тибетского нагорья популяции западного Тибетского нагорья взаимодействовали с популяциями как Южной, так и Центральной Азии, по крайней мере, 2000 лет назад, а генетическое влияние, связанное с Южной Азией, хотя и было очень ограниченным, исходило от мигрантов цивилизации долины Инда (IVC) в Центральной Азии. Азии вместо популяций IVC из долины Инда. В свете новых генетических данных наше исследование выявило сложные взаимосвязи популяций на Тибетском нагорье и внутри него. Образцы: [img1  .  [img2  .    [img3  . 
Site   mtDNA   /   Y chromosome
Gebusailu 2,300 BP   G2(2), Z3a1a(2), M62(1), F1(1)   /    D1a1a1(5)a
Pulanduowa 1,800 BP   U2(2), M9a1(1), A11(1), C4(1), M10a1(1), J2b1(1) /   O2a2b1(6)a
Gebusailu 3,500 BP   D4(2), C4a(1), F1c1(1), A6(1), A+152+16362+200(1)   /    D1a1a1(2), N1b2(1), O2a2b1(1)
Qulongsazha 1,600 BP   M62b1(4), A11a(2), A6(1), M9a1(1), D5a3a(1), A+152+16362+200(1)   /   O2a2b1(4), N1b2(1), D1a1a1(1)
Sangdalongguo 2,000 BP   M9a1(4), D4(3), C4a(2), U2c1(1), B4c1(1), F1d1(1), I4b(1), Z4a1(1), R30b1(1), G2a1(1), M70(1)  /   N1b2(3), N1b(1), D1a1a1(1), J2b2a(1)

[telegraaf]

На сайте ENA появилась ссылка куда выложат геномы из исследования палеогенетики Восточноевропейской равнины:

https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJNA1086800

Study Title: Genetic history of the ancient population of the Russian Plain
Center Name: Vavilov Institute of General Genetics, Russian Academy of Sciences

ENA-FIRST-PUBLIC: 2024-05-11
ENA-LAST-UPDATE: 2024-05-11

Но пока там пусто.

Если это то, о чём я думаю, то там больше 200 образцов полногеномных...

Каковы шансы, что эти образцы попадут на YFull?

[kardes]

Филогенетический взгляд на генетическое наследие венгероязычных сообществ Карпатского бассейна
Опубликовано:20 мая 2024 г.
Данное исследование посвящено изучению однородительских генетических линий венгероязычных меньшинств, проживающих в сельских деревнях Бараньи (Хорватия) и региона Зобор (Словакия). Мы стремились идентифицировать наследственные линии путем изучения генетических маркеров, распределенных по всему митогеному и на Y-хромосоме. Это позволило нам выявить различия в региональных генетических структурах внутри этих сообществ. Интегрируя наши недавно полученные генетические данные от 168 участников с ранее существовавшими наборами данных евразийской и древней ДНК, наша цель состояла в том, чтобы обогатить понимание траекторий генетической истории популяций Карпатского бассейна. Наши результаты показывают, что, хотя популяционный анализ может быть недостаточно надежным для выявления мелкомасштабных однородительских генетических паттернов при имеющихся размерах выборки, филогенетический анализ хорошо охарактеризованных данных коротких тандемных повторов Y-хромосомы (STR) и полных последовательностей митогенома позволил это сделать. раскрыть многочисленные связи с обширными регионами и эпохами. Хотя преобладающие части как отцовской, так и материнской ДНК совпадают с восточно-центральноевропейским спектром, более редкие субгаплогруппы и линии выявили [url=https://www.nature.com/articles/s41598-024-61978-4/figures/4]древние связи [/url]как с доисторическими, так и с историческими популяциями, охватывающими Европу и Восточную Евразию. Это исследование расширяет обширную область филогенетики, предлагая критический взгляд на генетическую конституцию и наследие сообществ в Восточной и Центральной Европе.(данные доступны)
-семплы  mt-    Y- :
[img1    img2   [img3    img4    [img5    img6    [img7    img8    [img9    img0
В этом исследовании мы стремились выяснить филогенетические отношения материнских и отцовских линий в сельских венгероязычных популяциях хорватской Бараньи и словацкого региона Зобор. Мы также стремились сопоставить эти результаты с результатами других евразийских популяций и результатами анализа ДНК, уделяя особое внимание древним венграм.Таким образом, среди этих двух групп можно обнаружить больше гаплогрупп восточно-евразийского происхождения (C-M216, N-VL29, R1a-M198*, R1a-Z93), чем в материнских линиях (U4a2, Y1a1, D4b2b), причем общие частоты 4,9% и 3,5% соответственно. Однако в обоих пулах отсутствуют заметные восточные типы, описанные ранее у Секеев (отцовские Q, J и материнские A, B, C). Гаплотипы ближневосточного или кавказского происхождения были обнаружены как в материнском, так и в отцовском пуле в большем количестве, чем восточноевразийские гаплогруппы (16,4% и 27,5%)
пара интересных образцов.
DV058   17685   208,23   U3b3b1   0.8946   Caucasus   C-M216   Asia (present-day China, Mongolia) якобы кавказская мама
ZB072   25642   269,19   U4b1a4   0.9933   East Eurasia   мито как Марии Шварновны