Извлечение человеческой ДДНК из предметов(ожерелья изготовленного из кости изюбря), обнаруженных в Денисовой пещере. Елена Эссель ,Елена Ивановна Завала ,Эллен Шульц-Корнас ,Максим Борисович Козликин ,Хелен Фьюласс ,Бенджамин Верно ,Михаил Владимирович Шунков ,Деревянко Анатолий Павлович ,Катерина Дука ,Ян Барнс ,Мари-Сесиль Сулье ,Анна Шмидт ,Мерлин Шимански ,Ценка Цанова ,Николай Сираков ,Елена Эндарова ,Шеннон П. Макферрон ,Жан-Жак Хаблин ,Джанет Келсо ,Сванте Паабо ,Матея Хайдиняк ,Мари Соресси иМатиас Мейер
Nature ( 2023 )
Артефакты и предметы, изготовленные из камней, костей и зубов, имеют фундаментальное значение для нашего понимания стратегий существования древнего человека, его поведения и культуры в плейстоцене. Хотя эти ресурсы многочисленны, невозможно надёжно связать артефакты с конкретными человеческими особями, если только они не обнаружены в погребениях, что является редкостью в этот период времени.
Здесь мы сообщаем о разработке нового неразрушающего метода постепенного высвобождения ДНК, извлечённой из древних костных и зубных предметов. Применение данного метода к
верхнепалеолитической подвеске из зубов оленя из Денисовой пещеры, Россия, привело
к восстановлению древних митохондриальных геномов человека и оленя, что позволило нам оценить возраст подвески примерно в 19 000–25 000 лет. Анализ ядерной ДНК идентифицирует предполагаемого создателя или владельца подвески как женщину с сильным генетическим сходством
с группой древних людей Северной Евразии (
мито-гаплогруппа U), которые жили примерно в то же время, но ранее были обнаружены только дальше на восток в Сибири. Наша работа дает новое определение тому, как культурные и генетические исследования могут быть связаны в доисторической археологии.
Таким образом, артефакты изготовленные из костей или зубов животных, являются ранее неиспользованным источником древней человеческой ДНК, который может дать представление о происхождении и биологическом поле людей, которые держали в руках или носили эти предметы в глубоком прошлом. Представленный здесь метод неразрушающего извлечения ДНК позволяет поэтапно высвобождать эту ДНК и позволяет отличить ДНК, глубоко проникшую в объект во время его изготовления или использования, от ДНК, которая может происходить из окружающего осадка. Следует отметить, что глубина охвата целевых участков в ядерном геноме человека, полученная с помощью DCP1, аналогична той, которая была получена с помощью гибридизационного захвата хорошо сохранившихся плейстоценовых человеческих останков.. Кроме того, восстановление ДНК человека и фауны позволило провести две независимые генетические оценки их возраста. Чтобы определить, как часто человеческая ДНК может быть извлечена из палеолитических костных артефактов, поскольку загрязнение поверхностной ДНК может затруднить эти анализы, мы призываем археологов применять строгие протоколы их извлечения, для минимизации манипуляций с ними как во время, так и после раскопок. Если это будет сделано, то возможно систематически сочетать генетические и культурологические анализы для изучения использовавшихся древними людьми различных костных предметов с целью выявления определенного биологического пола или генетического происхождения древних людей.
Мы применили этот протокол к 15 образцам из пещеры Квинсей, пещеры Бачо Киро и пещеры Денисова. Предполагаемый возраст этих экземпляров колеблется от 55 до 35 тыс. лет . Затем неразрушающее выделение ДНК было применено к 15 образцам костей, раскопанным в пещере Квинсей, все из слоев, относимых к шательперронскому технокомплексу и датируемых, вероятно, 45–35 тыс. лет назад , к трем зубчатым подвескам , раскопанным в начальном верхнем палеолите (45–43 тыс . ), квадрат Е-3, южной камеры Денисовой пещеры. Образцы из пещеры Бачо Киро и Денисовой пещеры были извлечены и обработаны с использованием стерильных перчаток, при этом были приняты дополнительные меры предосторожности, чтобы свести к минимуму заражение современной ДНК.