Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)

[пенелопа]

The Genetic Ancestry of Modern Indus Valley Populations from Northwest India

The Indus Valley has been the backdrop for several historic and prehistoric population movements between South Asia and West Eurasia. However, the genetic structure of present-day populations from Northwest India is poorly characterized. Here we report new genome-wide genotype data for 45 modern individuals from four Northwest Indian populations, including the Ror, whose long-term occupation of the region can be traced back to the early Vedic scriptures. Our results suggest that although the genetic architecture of most Northwest Indian populations fits well on the broader North-South Indian genetic cline, culturally distinct groups such as the Ror stand out by being genetically more akin to populations living west of India; such populations include prehistorical and early historical ancient individuals from the Swat Valley near the Indus Valley. We argue that this affinity is more likely a result of genetic continuity since the Bronze Age migrations from the Steppe Belt than a result of recent admixture. The observed patterns of genetic relationships both with modern and ancient West Eurasians suggest that the Ror can be used as a proxy for a population descended from the Ancestral North Indian (ANI) population. Collectively, our results show that the Indus Valley populations are characterized by considerable genetic heterogeneity that has persisted over thousands of years.

https://www.cell.com/ajhg/fulltext/S0002-9297(18)30398-7?fbclid=IwAR19cMQVxOYgnO0WdHvW9ueHUwhqtPSGPvjp1FISk7tFsa1jFktuS_5xfqI#secsectitle0015

[Arthwr]

The Genetic Ancestry of Modern Indus Valley Populations from Northwest India

Пиратская версия:
http://sci-hub.tw/10.1016/j.ajhg.2018.10.022

[rozenblatt]

Я не знаю, постили это уже или ещё нет:

https://www.academia.edu/37947590

 РЕЗУЛЬТАТЫ ПАЛЕОГЕНЕТИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНЫЙ МАТЕРИНСКОЙ ЛИНИИ ДНК РАННЕСРЕДНЕВЕКОВЫХ ПОПУЛЯ-ЦИЙ (VI‒X ВВ. Н.Э) ЗАУРАЛЬЯ, ПРИУРАЛЬЯ И ВОЛГО-КАМЬЯ В СВЯЗИ С ПРОБЛЕМОЙ ВЕНГЕРСКОГО ЭТНОГЕНЕЗА

Беа Сейферт, Вероника Чакева, Балаж Стегмар, Даниэл Гербер, Балаж Эгиед, С.Г. Боталов, Р.Д. Голдина, Аттила Тюрк, Балаж Густав Менде, Анна Сечений-Наги

О происхождении ранних мадьяр, об их миграции из Северо-Центральной Азии существует несколько научных теорий. Пестрый этнический состав венгров эпохи обретения родины доказан археологическими и историческими источниками. Когда они пришли в Карпатский бассейн через восточноевропейскую степь и территорию Хазарского Каганата, в их составе были разные народы. Исходная территория, направление, хронология миграции мадьяр до сих пор считаются спорными вопросами среди историков, лингвистов, археологов. Наши исследования раскрывают археогенетический аспект этой проблематики. Мы изучаем раннесредневековые (VI – X вв.) популяции в Карпатском бассейне на Урале и на тех территориях, которые, возможно, связаны с миграцией мадьяр. Данные территории связаны друг с другом схожим археологическим материалом. Население кушнаренковской и караякуповской культур отождествляется с мадьярами, их первые памятники появились на Среднем и Южном Урале. В наших исследованиях мы изучали образцы с восточной (Уелги) и западной (Бояново, Бартым, Cухой Лог) сторон Среднего Урала, их полную митохондриальную ДНК. Продолжая эти исследования, мы рассмотрели Волжско-Камский регион, особенно материалы Больше-Тиганского могильника. Данные митохондриальных ДНК этого памятника позволяют обновить нашу базу данных, используя которую мы можем получить более точную картину о пути миграции мадьяр в контексте генетики.

[Ильгиз]

Я не знаю, постили это уже или ещё нет:

https://www.academia.edu/37947590

 РЕЗУЛЬТАТЫ ПАЛЕОГЕНЕТИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНЫЙ МАТЕРИНСКОЙ ЛИНИИ ДНК РАННЕСРЕДНЕВЕКОВЫХ ПОПУЛЯ-ЦИЙ (VI‒X ВВ. Н.Э) ЗАУРАЛЬЯ, ПРИУРАЛЬЯ И ВОЛГО-КАМЬЯ В СВЯЗИ С ПРОБЛЕМОЙ ВЕНГЕРСКОГО ЭТНОГЕНЕЗА

караякуповцы оказались близки друг к другу, Уелга вообще с алтайскими скифами близки.? А с венгерских могильников сами по себе, хотя того же времени?

[zastrug]

Данные митохондриальных ДНК этого памятника позволяют обновить нашу базу данных,

Это да - галочку поставят и базу расширят.

используя которую мы можем получить более точную картину о пути миграции мадьяр в контексте генетики.

А вот это ИМХО ерунда - в этом отношении мито ничего не даст.

[zastrug]

Уелга вообще с алтайскими скифами близки.?

Алтайские скифы сами по себе неоднородная популяция - там как мигранты из Средней Азии. так и местные, о чем говорит как материальная культура так и генетика.

[Finder]

Кому интересно. Результаты в виде таблиц для этой работы:

[rozenblatt]

https://rg.ru/2018/12/13/reg-sibfo/chem-barnaulskie-arheologi-zaintrigovali-kolleg-iz-garvarda.html

13.12.2018 09:05

Рубрика: Общество

Проект: В регионах

Великаны алтайских гор

Чем барнаульские археологи заинтриговали коллег из Гарварда

Текст: Сергей Зюзин

Российская газета - Неделя - Сибирь №7744 (281)

Алтайский госуниверситет и Гарвардский университет (США) в этом году заключили соглашение о сотрудничестве. Американские ученые заинтересовались работами барнаульских археологов после выступления в Гарварде Алексея Тишкина, доктора исторических наук, завкафедрой археологии, этнографии и музеологии АГУ. Алексей Алексеевич сделал развернутый доклад об этнокультурной ситуации на Алтае в древности, основанный на археологических материалах.

[rozenblatt]

дДНК из Австралии:

http://advances.sciencemag.org/content/4/12/eaau5064

Ancient nuclear genomes enable repatriation of Indigenous human remains

Joanne L. Wright1, Sally Wasef1, Tim H. Heupink1,2, Michael C. Westaway1, Simon Rasmussen3, Colin Pardoe4, Gudju Gudju Fourmile5, Michael Young6, Trish Johnson7, Joan Slade8, Roy Kennedy9, Patsy Winch10, Mary Pappin Sr.11, Tapij Wales12,*, William “Badger” Bates13, Sharnie Hamilton14, Neville Whyman14, Sheila van Holst Pellekaan15,16, Peter J. McAllister17, Paul S.C. Taçon1, Darren Curnoe18, Ruiqiang Li19, Craig Millar20,†, Sankar Subramanian1,21,†, Eske Willerslev22,23,24,†, Anna-Sapfo Malaspinas25,26,†, Martin Sikora22,‡ and David M. Lambert1,‡

Science Advances 19 Dec 2018: Vol. 4, no. 12, eaau5064

DOI: 10.1126/sciadv.aau5064

Abstract

After European colonization, the ancestral remains of Indigenous people were often collected for scientific research or display in museum collections. For many decades, Indigenous people, including Native Americans and Aboriginal Australians, have fought for their return. However, many of these remains have no recorded provenance, making their repatriation very difficult or impossible. To determine whether DNA-based methods could resolve this important problem, we sequenced 10 nuclear genomes and 27 mitogenomes from ancient pre-European Aboriginal Australians (up to 1540 years before the present) of known provenance and compared them to 100 high-coverage contemporary Aboriginal Australian genomes, also of known provenance. We report substantial ancient population structure showing strong genetic affinities between ancient and contemporary Aboriginal Australian individuals from the same geographic location. Our findings demonstrate the feasibility of successfully identifying the origins of unprovenanced ancestral remains using genomic methods.

Аннотация
   
После европейской колонизации останки предков коренных народов часто собирались для научных исследований или экспонировались в музейных коллекциях. В течение многих десятилетий коренные жители, включая коренных американцев и аборигенов Австралии, боролись за их возвращение. Однако многие из этих останков не имеют надёжно установленное происхождение, что делает их репатриацию очень трудной или невозможной. Чтобы определить, могут ли методы на основе ДНК решить эту важную проблему, мы секвенировали 10 ядерных геномов и 27 митогеномов древних доевропейских аборигенов Австралии (возрастом до 1540 лет) известного происхождения и сравнили их со 100 геномами высокого покрытия современных австралийских аборигенов, также известного происхождения. Мы сообщаем о существенной древней структуре населения, показывающей сильную генетическую связь между древними и современными австралийскими аборигенами из одного и того же географического местоположения. Наши результаты демонстрируют возможность успешной идентификации происхождения непроверенных останков аборигенных с использованием геномных методов.

Код: [Выделить]

Образец Место Возраст мтДНК Y-ДНК Покрытие Пол
BK1 Bourke, NSW 700 M42a3 - 0.03 XY
FLI2 Flinders Island, QLD 335-504 P5b1 - 0.30 XY
KP1 Barham, NSW ~ 1600 S2a1a S1a 6.90 XY
KP2 Barham, NSW ~ 1400 S2a1a - 0.40 XX
MH1 Mapoon, QLD 98-126 P5a1a - 0.04 XX
MH2 Mapoon, QLD 98-126 Q1+16223 - 0.03 XY
MH3 Mapoon, QLD 98-126 N13 - 0.01 XX
MH4 Mapoon, QLD 98-126 P12a1 - 0.03 XX
MH5 Mapoon, QLD 98-126 P3a - 0.01 XX
MH6 Mapoon, QLD 98-126 P5a1a - 0.80 XX
MH7 Mapoon, QLD 98-126 P12a1 - 0.28 XY
MH8 Mapoon, QLD 98-126 P5a1a S1c 6.80 XY
MH9 Mapoon, QLD 98-126 P12a1 - 0.00 XX
MH10 Mapoon, QLD 98-126 Q1+16223 - 0.00 XY
MH11 Mapoon, QLD 98-126 P3a - 0.01 XX
PA86 Cairns, QLD unknown P12b S1a 2.80 XY
PA109 Cairns, QLD unknown M42a1b2 - 0.30 XY
PA409.1 Cairns, QLD 214-270 P5a1a - 0.04 Unassigned
PA409.3 Cairns, QLD unknown S1a - 0.03 Unassigned
STI Stanley Island, QLD 350-400 P5b1 - 0.00 XY
WLH4 Willandra Lakes, NSW ~ 4000 S2a1a S1a 0.30 XY
WPAH1 Weipa, QLD 98-126 M42a1a - 0.01 XX
WPAH2 Weipa, QLD 98-126 M42a1a - 0.03 XX
WPAH3 Weipa, QLD 98-126 M42a1a - 0.01 XX
WPAH4 Weipa, QLD 98-126 P5a1a - 0.90 XX
WPAH5 Weipa, QLD 98-126 P7 - 0.03 XX
WPAH6 Weipa, QLD 98-126 M42a1a - 0.01 XX
WPAH7 Weipa, QLD 98-126 P5a1a - 0.02 XX


[rozenblatt]

http://archaeology.nsc.ru/journarticleru/76/1171

Уникальное захоронение воина гунно-сарматского времени в Западно-Сибирской лесостепи: результаты палеогенетического анализа

А.С. Пилипенко1–3, С.В. Черданцев1, 2, Р.О. Трапезов1, 2, Т.А. Чикишева2, Д.В. Поздняков1, 2, В.И. Молодин2, 3

1Институт цитологии и генетики СО РАН пр. Академика Лаврентьева, 10, Новосибирск, 630090, Россия

2Институт археологии и этнографии СО РАН пр. Академика Лаврентьева, 17, Новосибирск, 630090, Россия

3Новосибирский государственный университет ул. Пирогова, 1, Новосибирск, 630090, Россия

В статье представлены результаты палеогенетического исследования останков мужчины из погр. 688 памятника Сопка-2 в Барабинской лесостепи. Особенности материальной культуры и погребальной обрядности, а также монголоидный центрально-азиатский антропологический тип погребенного однозначно свидетельствуют о его инотерриториальном происхождении. Были исследованы маркеры с однородительским наследованием: митохондриальная ДНК (последовательность ГВС I и информативные позиции в кодирующей части мтДНК) и Y-хромосома (аллельный профиль 17 STR-локусов Y-хромосомы). Установлена принадлежность мтДНК исследуемого индивида к восточно-евразийской гаплогруппе D4b1, а Y-хромосомы – к восточно-евразийской гаплогруппе Q (Q1a). Таким образом, выявлен восточный вектор его глубоких генетических корней, что согласуется с палеоантропологическими данными. Результаты филогеографического анализа с использованием данных по древним и современным популяциям Евразии свидетельствуют о широком распространении выявленного нами варианта восточно-евразийской по происхождению гаплогруппы мтДНК в восточных и западных районах степного пояса. В частности, показано его присутствие в скифское время далеко за пределами Восточной Евразии – у классических скифов Северного Причерноморья. Таким образом, генетические данные не позволяют однозначно локализовать регион, из которого исследуемый индивид прибыл на территорию Барабинской лесостепи. Предложен сценарий, объясняющий противоречивость данных палеогенетики и палеоантропологии о восточных генетических корнях погребенного и преимущественно западный (сармато-аланский) круг аналогий для сопроводительного инвентаря из этого погребения. Обсуждаются возможности и ограничения использования палеогенетических методов для реконструкции различных аспектов происхождения представителей древнего населения.

[asan-kaygy]

Спасибо за ссылку

[vvw1717]

https://scfh.ru/papers/stranstvuyushchiy-rytsar-zagadochnyy-voin-slozhil-golovu-na-territorii-baraby-/
Находки из захоронения № 688 были изготовлены в разных, сильно удаленных друг от друга, точках Евразии, свидетельствуя о том, что их хозяином явно владела охота к перемене мест.
Но и на этом загадки погребения не закончились. Сам погребальный обряд оказался по своей сути достаточно синкретичным. Судите сами. По конструкции и ориентации он сопоставим с гуннским некрополем близ Иволгинского городища в Восточной Сибири, да и вышеупомянутое Тугозвонское захоронение равнинного Алтая вполне аналогично Барабинскому. С другой стороны, ярусное помещение в могилу умершего человека и лошади напоминает захоронения гуннского времени, но уже Горного Алтая! Наконец, удила местного, западносибирского, производства идентичны найденным в могильнике VI века н. э. в Прииртышье.

[пенелопа]

Соседняя тема - для помечтать  http://forum.molgen.org/index.php/topic,11533.0.html

[rozenblatt]

http://archaeology.nsc.ru/journarticleru/76/1171

Уникальное захоронение воина гунно-сарматского времени в Западно-Сибирской лесостепи: результаты палеогенетического анализа

Статья появилась в открытом доступе:

https://www.researchgate.net/publication/329886912_An_Unusual_Burial_of_a_Xiongnu-Sarmatian_Era_Warrior_in_the_Western_Siberian_Forest-Steppe_Results_of_a_Paleogenetic_Analysis_in_Russian

STR-маркеры:

DYS456 16
DYS389I 13
DYS390 24
DYS389II 28
DYS458 18
DYS19 13
DYS385a/b 13/16
DYS393 13
DYS391 10
DYS439 12
DYS635 24
DYS392 16
Y GATA H4  11
DYS437 14
DYS438 11
DYS448 23
Предсказанная гаплогруппа Q (Q1a)

[rozenblatt]

Очередная версия отклика Афанасьева и Коробова на результаты дДНК аланов: https://www.academia.edu/38047255/%D0%90%D1%84%D0%B0%D0%BD%D0%B0%D1%81%D1%8C%D0%B5%D0%B2_%D0%93.%D0%95._%D0%9A%D0%BE%D1%80%D0%BE%D0%B1%D0%BE%D0%B2_%D0%94.%D0%A1._%D0%A1%D0%B5%D0%B2%D0%B5%D1%80%D0%BE%D0%BA%D0%B0%D0%B2%D0%BA%D0%B0%D0%B7%D1%81%D0%BA%D0%B8%D0%B5_%D0%B0%D0%BB%D0%B0%D0%BD%D1%8B_%D0%BF%D0%BE_%D0%B4%D0%B0%D0%BD%D0%BD%D1%8B%D0%BC_%D0%BF%D0%B0%D0%BB%D0%B5%D0%BE%D0%B3%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D1%82%D0%B8%D0%BA%D0%B8_%D0%AD%D1%82%D0%BD%D0%BE%D0%B3%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D0%B7_%D0%B8_%D1%8D%D1%82%D0%BD%D0%B8%D1%87%D0%B5%D1%81%D0%BA%D0%B0%D1%8F_%D0%B8%D1%81%D1%82%D0%BE%D1%80%D0%B8%D1%8F_%D0%BD%D0%B0%D1%80%D0%BE%D0%B4%D0%BE%D0%B2_%D0%9A%D0%B0%D0%B2%D0%BA%D0%B0%D0%B7%D0%B0._%D0%93%D1%80%D0%BE%D0%B7%D0%BD%D1%8B%D0%B9._2018._%D0%A1._180-191

На странице 180