Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)

[пенелопа]

Сейчас хазар­ский каганат - это почва для лженаучных открытий

Мощная цитата

хазарами АК занимался, в этой вышеупомянутой лабе анализы делал. может он же и насчет Грозного подсуетился, да не вышло...

[Kambic]

G2 основная гг корсиканцев
http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0200641

[rozenblatt]

https://www.nature.com/articles/s41598-018-29914-5

Mitochondrial genomes reveal an east to west cline of steppe ancestry in Corded Ware populations

    Anna Juras, Maciej Chyleński, Edvard Ehler, Helena Malmström, Danuta Żurkiewicz, Piotr Włodarczak, Stanisław Wilk, Jaroslav Peška, Pavel Fojtík, Miroslav Králík, Jerzy Libera, Jolanta Bagińska, Krzysztof Tunia, Viktor I. Klochko, Miroslawa Dabert, Mattias Jakobsson & Aleksander Kośko

Scientific Reportsvolume 8, Article number: 11603 (2018) | Download Citation

Abstract

From around 4,000 to 2,000 BC the forest-steppe north-western Pontic region was occupied by people who shared a nomadic lifestyle, pastoral economy and barrow burial rituals. It has been shown that these groups, especially those associated with the Yamnaya culture, played an important role in shaping the gene pool of Bronze Age Europeans, which extends into present-day patterns of genetic variation in Europe. Although the genetic impact of these migrations from the forest-steppe Pontic region into central Europe have previously been addressed in several studies, the contribution of mitochondrial lineages to the people associated with the Corded Ware culture in the eastern part of the North European Plain remains contentious. In this study, we present mitochondrial genomes from 23 Late Eneolithic and Bronze Age individuals, including representatives of the north-western Pontic region and the Corded Ware culture from the eastern part of the North European Plain. We identified, for the first time in ancient populations, the rare mitochondrial haplogroup X4 in two Bronze Age Catacomb culture-associated individuals. Genetic similarity analyses show close maternal genetic affinities between populations associated with both eastern and Baltic Corded Ware culture, and the Yamnaya horizon, in contrast to larger genetic differentiation between populations associated with western Corded Ware culture and the Yamnaya horizon. This indicates that females with steppe ancestry contributed to the formation of populations associated with the eastern Corded Ware culture while more local people, likely of Neolithic farmer ancestry, contributed to the formation of populations associated with western Corded Ware culture.

мтДНК ямников, катакомбников и прочих из украинского Приднестровья, шнуровиков из Польши и Чехии. Вывод: восточные шнуровики по мтДНК похожи на ямников, западные шнуровики похожи на неолитчиков Западной Европы.

[пенелопа]

Это всё где-нибудь опубликовано?

Розенблатт,  попыталась найти концы в ФБ. Не поверите, авторы генофонд.рф об исследованиях родственников Грозного и пр., что перечислено, ничего не слышали. Может быть и правда всем известный персонаж со своей Академией подсуетился. Тогда результаты надо ждать в "Вестнике"

[vvw1717]

G2 основная гг корсиканцев
http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0200641

авторы рассматривают взаимосвязь корсиканской культуры Торре с Сардинской Нурагической как общую для G2 шерданов как неолитических мигрантов с Кавказа?
   "Согласно распространённой среди историков версии, эти «морские разбойники» были предками сардов, заселивших позднее Сардинию. Израильский археолог Адам Зерталь указывает на сходство построек Ахвата (города, который он считает столицей шерданов и отождествляет с Харошеф-Гоимом, упомянутым в 4-й главе «Книги Судей») с нурагическими постройками Сардинии.
Есть также гипотеза, что этому народу обязан своим названием город Сарды в Малой Азии.
Наконец, согласно третьей гипотезе, шердены ассоциируются с дарданами (союзниками троянцев).
Этническая принадлежность дарданов, как и троянцев (тевкров), а также их язык остаются спорным вопросом. Остатки их материальной культуры указывают на тесную связь с лувийцами контакты с другими народами Малой Азии, Фракией и ахейцами. 
Археологические находки более раннего периода (энеолит) на территории Троады указывают на сильное сходство с материальной культурой того же периода в Мунтении и Молдавии, как и с карпато-балканским регионом в целом. Предполагается, что изделия материальной культуры (керамика, статуэтки) были импортированы в Троаду и являются кукутенскими по происхождению."

[rozenblatt]

Может быть и правда всем известный персонаж со своей Академией подсуетился. Тогда результаты надо ждать в "Вестнике"

Ну вот почему всегда так, могла быть хорошая статья про происхождение Ивана Грозного, а получится как всегда.

[пенелопа]

https://m.lenta.ru/news/2018/08/03/hobbits/
Исследователи проанализировали геном 32 пигмеев, живущих в окрестностях Лян Буа, чтобы определить, какая его доля унаследована от неандертальцев, денисовцев и неизвестных источников, одним из которых могли быть «хоббиты».

[rozenblatt]

Вроде старая тема http://www.aif.ru/society/science/kod_knyagini_skolko_rodstvennikov_russkih_carey_prozhivaet_v_rossii
 17:52 29/10/2014    "В вузовской лаборатории Корниенко работает по выходным и в свободное время. Уже четвёртый год с группой учёных по заданию музея-заповедника «Московский кремль» исследует ДНК московских княгинь Софии Палеолог (1455–1503) и Елены Глинской (1508–1538). Княгини покоятся в Вознесенском монастыре (Москва). Оттуда для изучения привезён материал."

 Если в 2014 году они пишут что "Уже четвёртый год ... исследует ДНК московских княгинь", то получается что он уже восьмой год их исследует?

[Remmo]

Вроде старая тема http://www.aif.ru/society/science/kod_knyagini_skolko_rodstvennikov_russkih_carey_prozhivaet_v_rossii
 17:52 29/10/2014    "В вузовской лаборатории Корниенко работает по выходным и в свободное время. Уже четвёртый год с группой учёных по заданию музея-заповедника «Московский кремль» исследует ДНК московских княгинь Софии Палеолог (1455–1503) и Елены Глинской (1508–1538). Княгини покоятся в Вознесенском монастыре (Москва). Оттуда для изучения привезён материал."

 Если в 2014 году они пишут что "Уже четвёртый год ... исследует ДНК московских княгинь", то получается что он уже восьмой год их исследует?

В статье написано, что "Основные итоги работы будут озвучены в докладе Игоря Корниенко в 2015 году" Возможно было опубликовано где-либо.

[zastrug]

В статье написано, что "Основные итоги работы будут озвучены в докладе Игоря Корниенко в 2015 году" Возможно было опубликовано где-либо.

В "Мухасранском рабочем"? Иначе как никто не заметил публикации то?

[Remmo]

Я только высказал предположение.

[dirchuprov]

https://m.lenta.ru/news/2018/08/03/hobbits/
Исследователи проанализировали геном 32 пигмеев, живущих в окрестностях Лян Буа, чтобы определить, какая его доля унаследована от неандертальцев, денисовцев и неизвестных источников, одним из которых могли быть «хоббиты».

В продолжение "хоббитской" темы: https://www.livescience.com/63248-hobbits-pygmies-evolution.html

[rozenblatt]

Копенгагенская лаборатория провела пока что не опубликованное исследование более 300 образцов эпохи викингов практически со всей Северной Европы:

https://forskning.ku.dk/find-en-forsker/?pure=en/publications/id(dd2e6351-fd95-4e1f-a1d2-382fb0e41d5b).html



Find en forsker
Population Genomics of Vikings

Research output: Book/Report › Ph.D. thesis › Research

    Presentation
    Citation formats

Ashot Margaryan
Since its conception 33 years ago, the field of ancient DNA has rapidly evolved providing powerful molecular tools for reconstructing recent evolutionary histories of many biological species, including humans. The significant technological advancement of Next Generation Sequencing within the last 10 years has allowed for the sequencing of whole mammalian ancient genomes, granting access to thousands of times more informative markers in the nuclear genome. The gradual decline of sequencing costs along with ever improving sampling, DNA recovery and sequencing methods have made it possible to sequence hundreds of whole ancient genomes from human remains, extending the reach of ancient DNA from single genome studies into large, population-scale projects, spanning both time and geographic locality. The main aim of this thesis was to reconstruct the genetic history of the Vikings using whole genome data from a large number of ancient Viking Age individuals excavated in various sites from Scandinavia, North Atlantic, the British Isles and Eastern Europe (Chapter 2). This allowed us to address questions relating to genetic structure and relationship of different Viking groups across space and time. In addition, by analysing earlier Iron Age samples from Scandinavia and comparing the genomic data of the Vikings with other ancient datasets we could also shed light on possible demographic events that may have occurred before and during the Viking Age in Northern Europe. The diversity of human pathogens in Northern Europe was also assessed during the Viking Age, finding a wide variety of pathogenic species including prokaryotic, eukaryotic and viral species. With 378 ancient samples >0.1X average depth of coverage this is one of the largest aDNA projects conducted so far. Despite the increased genetic resolution that whole genome sequencing can offer, it unfortunately remains relatively expensive to apply for ancient human samples from temperate regions due to the poor preservation of the ancient material. In such cases, the whole mitochondrial genome sequencing can be used to reconstruct the demographic history of the human female populations. As one of my side-projects, I retrieved and analysed 52 ancient human mtDNA sequences from the South Caucasus and applied demographic modelling to assess the genetic structure of the maternal line in that region for the last eight millennia (Chapter 3). It was possible to detect a surprising level of genetic stability for the female gene pool in spite of numerous cultural shifts since the Neolithic. The extracted and sequenced DNA from ancient anthropological remains may not only contain endogenous human molecules but also pathogenic DNA, which has been extensively studied for the past few years allowing for the reconstruction of recent evolutionary histories of many pathogenic bacterial species. Most of the studies conducted so far have used human teeth and postcranial bones for pathogen detection from anthropological remains. However, in light of recent investigations suggesting that the otic capsule (petrous bone) is the best skeletal part for DNA preservation, the petrous bone gradually becomes the sample of choice in the ancient DNA community, in favour of teeth and postcranial bones. No systematic analysis has been done so far to assess the potential effect of this sample choice on the ancient pathogen retrieval in ancient samples. In the fourth chapter we evaluate the yield of pathogen DNA from the petrous bones and teeth samples using Y. pestis positive ancient samples as well as assess the overall metagenomic profile of these two skeletal parts. The results indicate that the petrous bones do not yield detectable levels of ancient plague DNA and have much lower metagenomic diversity in comparison with the teeth samples. This suggests that even though the petrous bones usually have higher levels of endogenous DNA, they are not as suitable for ancient pathogen detection to the degree that teeth are.
Original language   English
Publisher   Natural History Museum of Denmark, Faculty of Science, University of Copenhagen
State   Published - 2017
Links

    https://rex.kb.dk/primo-explore/fulldisplay?docid=KGL01011006696&context=L&vid=NUI&search_scope=KGL&tab=default_tab&lang=da_DK

[Ринат]

Копенгагенская лаборатория провела пока что не опубликованное исследование более 300 образцов эпохи викингов практически со всей Северной Европы:

https://forskning.ku.dk/find-en-forsker/?pure=en/publications/id(dd2e6351-fd95-4e1f-a1d2-382fb0e41d5b).html



Find en forsker
Population Genomics of Vikings

Research output: Book/Report › Ph.D. thesis › Research

    Presentation
    Citation formats

Ashot Margaryan

Спасибо

Молодец Ашот     , как и обещал.

[rozenblatt]

https://nplus1.ru/news/2018/08/22/the-direct-offspring

Девочка из Денисовой пещеры оказалась дочерью неандерталки и денисовца

Девочка-подросток, фрагмент кости которой недавно обнаружили в Денисовой пещере, была дочерью женщины-неандертальца и мужчины-денисовца, говорится в Nature. Ученые впервые нашли прямого потомка двух вымерших видов. Предположительно, подобные смешанные союзы встречались довольно часто.

The genome of the offspring of a Neanderthal mother and a Denisovan father

    Viviane Slon, Fabrizio Mafessoni, Benjamin Vernot, Cesare de Filippo, Steffi Grote, Bence Viola, Mateja Hajdinjak, Stéphane Peyrégne, Sarah Nagel, Samantha Brown, Katerina Douka, Tom Higham, Maxim B. Kozlikin, Michael V. Shunkov, Anatoly P. Derevianko, Janet Kelso, Matthias Meyer, Kay Prüfer & Svante Pääbo

Nature (2018) | Download Citation
Abstract

Neanderthals and Denisovans are extinct groups of hominins that separated from each other more than 390,000 years ago1,2. Here we present the genome of ‘Denisova 11’, a bone fragment from Denisova Cave (Russia)3 and show that it comes from an individual who had a Neanderthal mother and a Denisovan father. The father, whose genome bears traces of Neanderthal ancestry, came from a population related to a later Denisovan found in the cave4,5,6. The mother came from a population more closely related to Neanderthals who lived later in Europe2,7 than to an earlier Neanderthal found in Denisova Cave8, suggesting that migrations of Neanderthals between eastern and western Eurasia occurred sometime after 120,000 years ago. The finding of a first-generation Neanderthal–Denisovan offspring among the small number of archaic specimens sequenced to date suggests that mixing between Late Pleistocene hominin groups was common when they met.