http://www.pnas.org/content/early/2018/04/03/1715688115Genomic insights into the origin and diversification of late maritime hunter-gatherers from the Chilean PatagoniaConstanza de la Fuente, María C. Ávila-Arcos, Jacqueline Galimany, Meredith L. Carpenter, Julian R. Homburger, Alejandro Blanco, Paloma Contreras, Diana Cruz Dávalos, Omar Reyes, Manuel San Roman, Andrés Moreno-Estrada, Paula F. Campos, Celeste Eng, Scott Huntsman, Esteban G. Burchard, Anna-Sapfo Malaspinas, Carlos D. Bustamante, Eske Willerslev, Elena Llop, Ricardo A. Verdugo and Mauricio Moraga
PNAS April 9, 2018. 201715688; published ahead of print April 9, 2018.
https://doi.org/10.1073/pnas.1715688115Significance
Recent genomic studies of ancient and modern humans from the Americas have given a comprehensive view of the peopling of the continent. However, regional characterization of ancient and modern individuals is lacking, being key to unveiling fine-scale differences within the continent. We present genome-wide analyses of ancient and modern individuals from South America from Western Patagonia. We found a strong affinity between modern and ancient individuals from the region, providing evidence of continuity in the region for the last ∼1,000 years and regional genetic structure within Southern South America. In particular, the analysis of these ancient genomes helps address questions related to the maritime tradition in the region and its diversification posterior to the split from terrestrial hunter-gatherers.
Abstract
Patagonia was the last region of the Americas reached by humans who entered the continent from Siberia ∼15,000–20,000 y ago. Despite recent genomic approaches to reconstruct the continental evolutionary history, regional characterization of ancient and modern genomes remains understudied. Exploring the genomic diversity within Patagonia is not just a valuable strategy to gain a better understanding of the history and diversification of human populations in the southernmost tip of the Americas, but it would also improve the representation of Native American diversity in global databases of human variation. Here, we present genome data from four modern populations from Central Southern Chile and Patagonia (n = 61) and four ancient maritime individuals from Patagonia (∼1,000 y old). Both the modern and ancient individuals studied in this work have a greater genetic affinity with other modern Native Americans than to any non-American population, showing within South America a clear structure between major geographical regions. Native Patagonian Kawéskar and Yámana showed the highest genetic affinity with the ancient individuals, indicating genetic continuity in the region during the past 1,000 y before present, together with an important agreement between the ethnic affiliation and historical distribution of both groups. Lastly, the ancient maritime individuals were genetically equidistant to a ∼200-y-old terrestrial hunter-gatherer from Tierra del Fuego, which supports a model with an initial separation of a common ancestral group to both maritime populations from a terrestrial population, with a later diversification of the maritime groups.
Патагония была последним регионом Северной и Южной Америки, который был достигнут людьми, которые прибыли на континент из Сибири 15,000–20,000 лет назад. Несмотря на недавние геномные подходы к реконструкции эволюционной истории континента, региональная характеристика древних и современных геномов остается недостаточно изученной. Изучение геномного разнообразия в Патагонии - это не только ценная стратегия, позволяющая лучше понять историю и диверсификацию человеческого населения на самой южной оконечности Америки, но это также улучшит представление разнообразия коренных американцев в глобальных базах данных о человеческих вариациях. Здесь мы представляем геномные данные четырех современных популяций из Центрального Южного Чили и Патагонии (n = 61) и четырех древних приморских жителей из Патагонии (~ 1000 лет назад). Как современные, так и древние особи, изученные в этой работе, имеют большую генетическую близость с другими современными коренными американцами, чем с любой неамериканской популяцией, показывая в Южной Америке четкую структуру между основными географическими регионами. Коренные патагонцы из племён Кавескар и Ямана продемонстрировали наибольшую генетическую близость с древними людьми, что свидетельствует о генетической преемственности в регионе в течение последних 1000 лет до настоящего времени, и согласуется с этнической принадлежностью и историческим распределением обеих групп. Наконец, древние приморские обитатели были генетически равноудалены от 200-летнего наземного охотника-собирателя с Огненной Земли, что поддерживает модель с первоначальным отделением группы, предковой для обоих морских популяций, от наземной популяции, с последующей диверсификацией морских групп.