АвторТема: 17 локусов  (Прочитано 20204 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: Программа TNT.
« Ответ #45 : 16 Октябрь 2009, 23:35:49 »
Маугли, а можно реальный пример где на 17 маркерах у разных гаплогрупп одинаковые гаплотипы  :D потому что такого быть не может... даже в 6 макреном гаплотипе - вспомните 6-ти маркерный период АК.

Даже внутри однофамильцев с одинаковой гаплогруппой есть по 1-2 мутации. а вы про полярные гаплогруппы говорите. Но шутку оценил.


Оффлайн VVR

  • ...
  • Сообщений: 2456
  • Страна: ua
  • Рейтинг +618/-0
  • Y-ДНК: o.R1a1a1b1a2a1a1a1e~-YP569,YP1260+;м.R1a1a1b1a1a1a2~-L260,YP1337+
  • мтДНК: K1c1h
Re: Программа TNT.
« Ответ #46 : 16 Октябрь 2009, 23:39:07 »
Маугли, а можно реальный пример где на 17 маркерах у разных гаплогрупп одинаковые гаплотипы  :D потому что такого быть не может... даже в 6 макреном гаплотипе - вспомните 6-ти маркерный период АК.

Даже внутри однофамильцев с одинаковой гаплогруппой есть по 1-2 мутации. а вы про полярные гаплогруппы говорите. Но шутку оценил.
Попробуйте в атеевском предикторе ввести базовый I2a, и он даст вероятность 0,1% R1a, т.е. на 999 БАЗОВЫХ один будет R1a, если конечно верить предиктору. Пусть соотношение бедет не точно таким, но совпадения возможны.

Оффлайн VVR

  • ...
  • Сообщений: 2456
  • Страна: ua
  • Рейтинг +618/-0
  • Y-ДНК: o.R1a1a1b1a2a1a1a1e~-YP569,YP1260+;м.R1a1a1b1a1a1a2~-L260,YP1337+
  • мтДНК: K1c1h
Re: Программа TNT.
« Ответ #47 : 16 Октябрь 2009, 23:43:33 »
Извините, совершенно забыл. Я про 12-маркерные гаплотипы. Но на 17 тоже могут совпасть.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: Программа TNT.
« Ответ #48 : 16 Октябрь 2009, 23:43:38 »
Маугли, а можно реальный пример где на 17 маркерах у разных гаплогрупп одинаковые гаплотипы  :D потому что такого быть не может... даже в 6 макреном гаплотипе - вспомните 6-ти маркерный период АК.

Даже внутри однофамильцев с одинаковой гаплогруппой есть по 1-2 мутации. а вы про полярные гаплогруппы говорите. Но шутку оценил.
Попробуйте в атеевском предикторе ввести базовый I2a, и он даст вероятность 0,1% R1a, т.е. на 999 БАЗОВЫХ один будет R1a, если конечно верить предиктору. Пусть соотношение бедет не точно таким, но совпадения возможны.
Про пердиктор - незачот. Вы на реальном примере покажите. Вот де снипованный гаплотип R1a1 а вот снипованный гаплотип C2 или D2.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: Программа TNT.
« Ответ #49 : 16 Октябрь 2009, 23:46:10 »
Извините, совершенно забыл. Я про 12-маркерные гаплотипы. Но на 17 тоже могут совпасть.
Полностью гаплотипы диметрально противоположных гаплогрупп совпасть не могут, ну теоретически можно подсчитать какова вероятность, но в жизни вы вряд ли встретите такое совпадение. Это увы миф.

Оффлайн VVR

  • ...
  • Сообщений: 2456
  • Страна: ua
  • Рейтинг +618/-0
  • Y-ДНК: o.R1a1a1b1a2a1a1a1e~-YP569,YP1260+;м.R1a1a1b1a1a1a2~-L260,YP1337+
  • мтДНК: K1c1h
Re: Программа TNT.
« Ответ #50 : 16 Октябрь 2009, 23:46:58 »
А вот протестируется хотя бы 10% мужчин-землян - 300млн. 67-ми маркеров будет мало.

Оффлайн VVR

  • ...
  • Сообщений: 2456
  • Страна: ua
  • Рейтинг +618/-0
  • Y-ДНК: o.R1a1a1b1a2a1a1a1e~-YP569,YP1260+;м.R1a1a1b1a1a1a2~-L260,YP1337+
  • мтДНК: K1c1h
Re: Программа TNT.
« Ответ #51 : 16 Октябрь 2009, 23:49:56 »
Извините, совершенно забыл. Я про 12-маркерные гаплотипы. Но на 17 тоже могут совпасть.
Полностью гаплотипы диметрально противоположных гаплогрупп совпасть не могут, ну теоретически можно подсчитать какова вероятность, но в жизни вы вряд ли встретите такое совпадение. Это увы миф.
Так Атей ведь предиктор не на пустом месте настраивал, а на реальных гаплотипах.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: Программа TNT.
« Ответ #52 : 16 Октябрь 2009, 23:50:26 »
А вот протестируется хотя бы 10% мужчин-землян - 300млн. 67-ми маркеров будет мало.
Для чего мало? Вы думаете на земле много 67-ми маркерных совпаденцев даже вашего гаплотипа? Кроме родственников ближних и дальних? Тем более из разных гаплогрупп совпадет 67 маркеров это забавно  ;D пусть хоть 3 млрд будет гаплотипов.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: Программа TNT.
« Ответ #53 : 16 Октябрь 2009, 23:52:32 »
Так Атей ведь предиктор не на пустом месте настраивал, а на реальных гаплотипах.
Разумеется на реальных. Но выборка на которой он работает не очень большая. А тут как раз чем больше обучающая выборка тем лучше. Поэтому он и мечется при определение, и определяет хорошо только близкие к модальному. Но это совсем другая история...

Оффлайн VVR

  • ...
  • Сообщений: 2456
  • Страна: ua
  • Рейтинг +618/-0
  • Y-ДНК: o.R1a1a1b1a2a1a1a1e~-YP569,YP1260+;м.R1a1a1b1a1a1a2~-L260,YP1337+
  • мтДНК: K1c1h
Re: Программа TNT.
« Ответ #54 : 16 Октябрь 2009, 23:57:50 »
А вот протестируется хотя бы 10% мужчин-землян - 300млн. 67-ми маркеров будет мало.
Для чего мало? Вы думаете на земле много 67-ми маркерных совпаденцев даже вашего гаплотипа? Кроме родственников ближних и дальних? Тем более из разных гаплогрупп совпадет 67 маркеров это забавно  ;D пусть хоть 3 млрд будет гаплотипов.
Я не сказал, что будут совпаденцы на 67-ми из разных гаплогрупп. 67-ми будет мало для нормальной филогении.

Оффлайн mouglley

  • ...
  • Сообщений: 7105
  • Страна: hr
  • Рейтинг +434/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: Программа TNT.
« Ответ #55 : 17 Октябрь 2009, 00:05:29 »
Маугли, а можно реальный пример где на 17 маркерах у разных гаплогрупп одинаковые гаплотипы  :D потому что такого быть не может... даже в 6 макреном гаплотипе - вспомните 6-ти маркерный период АК.

Даже внутри однофамильцев с одинаковой гаплогруппой есть по 1-2 мутации. а вы про полярные гаплогруппы говорите. Но шутку оценил.
Про одинаковые брещу, конечно.

Но то, что у J1 (SH2667 SH2667 SH2667), 9-ти E1b1b и I2b1 (SC14690) оказался общий предок в 6500 лет, кроме, как анекдотом, трудно чем ещё назвать.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: Программа TNT.
« Ответ #56 : 17 Октябрь 2009, 00:05:40 »
Цитировать
67-ми будет мало для нормальной филогении.
Думаю 60-70 будет достаточно. Если нет задачи "выводить дерева вплоть до поколения".

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: Программа TNT.
« Ответ #57 : 17 Октябрь 2009, 00:08:15 »
Цитировать
Но то, что у J1 (SH2667 SH2667 SH2667), 9-ти E1b1b и I2b1 (SC14690 оказался общий предок в 6500 лет, кроме, как анекдотом, трудно чем ещё назвать.
Так нужно понимать... что программа не в курсе что это разные гаплогруппы. Если б она принимала во внимание снипы то не показала бы такой возраст... при то что это возраст просто условен.

Оффлайн ValeryАвтор темы

  • Сообщений: 10107
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1380/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: 17 локусов
« Ответ #58 : 17 Октябрь 2009, 01:04:10 »
Мое мнение - надо 100-150 локусов.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: 17 локусов
« Ответ #59 : 17 Октябрь 2009, 01:25:50 »
Мое мнение - надо 100-150 локусов.
Мое 200-250. Кто больше? ))

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.