Характерные особенности гаплотипов рома

[Farroukh]

Как показала филогения, для цыган рома характеристическим алелем является DYS425=0. У других цыганских групп субклада H-M82 делеции нет, DYS425=13 или около того.

В статье Проверка методов оценки TMRCA по данным о Y-STR гаплотипах европейских цыган приведены 17-маркёрные гаплотипы, и по идее, можно выявить и другие характерные маркёры.

[Centurion]

У других цыганских групп субклада H-M82 делеции нет,

в дис 425 ни у кого нету никаких делеций 

[Farroukh]

Но как тогда правильно называть нулевые аллели?

[Шад]

Но как тогда правильно называть нулевые аллели?

Вот здесь: http://www.anthrogenica.com/showthread.php?1725-Q1b-and-Significant-STRs&p=37609&viewfull=1#post37609
и далее по теме я попытался дать разъяснения про DYS425=0 и привел необходимые ссылки.
Аллели не нулевые, они просто некорректно определяются. Поэтому ФТДНА и ставить "0".

[VVR]

Вотздесь у Т.Крана на стр.31 объяснение с рисунками по DYS425. В этом маркере фактически происходит не нуль-делеция, а реклох аллеля Т-типа в С-тип. Из-за изменения типа число повторов при стандартном тестировании DYS425 не определяется. Записывают 0.

[Farroukh]

В статье Origins, admixture and founder lineages in European Roma (2015) представлены гаплотипы ромов, где помимо типичной H1a-M82 есть и H-M52 (xM82).

Интересно.

[Шад]

Wow, there's loads of high coverage Y and mtDNA data from host populations. Thanks for sharing.

http://eurogenes.blogspot.ru/2015/09/origins-and-uniparental-genetic.html

Нашел две ссылки на supplimentary info, но нигде нет  high coverage Y data. Что имелось ввиду?

[пенелопа]

Ссылка двумя сообщениями выше. Там пять вложений.
Supplementary Figure S1 (xls 38K)
Supplementary Figure S2 (pdf 673K)
Supplementary Figure S3 (pdf 9,836K)
Supplementary Figure S4 (jpeg 461K)
Supplementary Tables (xls 696K)

[Шад]

Ссылка двумя сообщениями выше. Там пять вложений.
Supplementary Figure S1 (xls 38K)
Supplementary Figure S2 (pdf 673K)
Supplementary Figure S3 (pdf 9,836K)
Supplementary Figure S4 (jpeg 461K)
Supplementary Tables (xls 696K)

Да, я это видел. Я почему-то подумал, что имелись ввиду данные полного секвенирования
А там только гаплотипы, 17 маркеров с определением терминальных снипов.

[Farroukh]

Похоже, с ромальским субкладом ситуация вырисовывается. Это H-Y17916, возраст 4000, ВБОП=600 лет (на основании английских цыган-джипси). Цыгане появились в Британии в конце 16 в, что в общем-то совпадает с ВБОПом.
Вероятно, общеромальский будет либо он же, либо на шаг выше.

[Farroukh]

Как оказалось, ВБОП ближневосточных (домари) и европейских (ромалы) цыган составляет всего 600 лет.
Y-STR расчёты Тюрина и независимо от него Адамова были верны.

[Farroukh]

Расширю предыдущий тезис. Североиндийские трайбы кочующих артистов ("дом") и различные цыганские группы в Западной Азии и Европе объединяются под H-SK1225.

Как видим, БОП всех "думба" жил задолго до арийского вторжения где-то в нынешнем Уттар-Прадеше.

Ромалы суть потомки одного мужчины, жившего 600 лет назад и именуемого ими как Синтел. В самой Индии разнообразие цыганских субкладов соизмеримо со всеми евразийскими R1b-M269 вместе взятыми

[Farharaji]

6000 лет назад наверно имели ввиду?

[Farroukh]

Если речь об Y-хромосомном Синтеле, то ему всего шестьсот лет. Предок всех ромов и западноазиатских домов.

Шесть тысяч лет назад  жил предок всех "думба" - странствующих артистов Северной Индии.

[Murzalar]

Интересно что такого 600 лет назад произошло.