L-M27

[AppS]

Тема будет посвящена L-M27.
Она же  L1 FTDNA или ISOGG L1a


Первично обработал людей этой подгруппы из L-проекта:
- большинство короткие гаплотипы
- редко кто указывает дальнепредка, а если и указывает, то деда-прадеда
- впечатление, что много собраных по какой-то местной програме вроде курского проекта. Например, Керальский проект в Индии. Почему к частоте распостранения есть вопросы.

Тем не менее, комбинируя информацию со множества, в основном арабских и индийских, привязал к странам, что посильно оживило карту. Если видите кого-то привязаным к центру Индии, Ирана, ОАЭ, Сауд Аравии или просто к Аравийскому морю, то это значит, что больше чем страна узнать не удалось.

Имеем по факту:
- много на севере Пакистана, Пенджаб и около
- на юге Индии - Керала и около
- среди арабских стран вокруг Арабского моря и Персидского залива, причем больше в собственно арабских, но встречаются немного и в Ираке, Иране, Ливане. Выбоки под вопросом, но среди арабов их не сильнооо меньше чем среди индо-пакистанцев в процентном соотношении.
- Европа: пару в Испании и колониях, один в баскском проекте, два в Украине на Левобережье, и с десяток в Германии-Австрии-Бенелюксе с невнятных коротких выборок. Между собою обычно в дальнем родстве.
- в РФ среди кочевых народов единицы(а), привязка казахо-ногая под некоторым вопросом.
- между Европой и арабами с индо-пакистанцами прямой цепочки не видно, но к европейским обычно арабы ближе.

из-за коротких гаплотипов сказать кто кому родственник трудно.

[AppS]

если правильно понимаю первый биг игрек
безымянный кит N92407 с Ирана

углубление до
L-F3987
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest-neighbors/62066/
M27+, CTS10362+, CTS109+, CTS11358+, CTS11575+, CTS11726+, CTS125+, CTS12632+, CTS1996+, CTS2888+, CTS3331+, CTS3431+, CTS3536+, CTS3648+, CTS3654+, CTS3662+, CTS3868+, CTS3996+, CTS4364+, CTS4368+, CTS4443+, CTS4740+, CTS4783+, CTS5175+, CTS5318+, CTS5457+, CTS5532+, CTS6135+, CTS6383+, CTS6800+, CTS6888+, CTS6907+, CTS753+, CTS7922+, CTS7933+, CTS8243+, CTS8980+, CTS9828+, F1046+, F1209+, F1302+, F1320+, F1329+, F1704+, F1714+, F1753+, F1767+, F2048+, F2075+, F2142+, F2155+, F2302+, F2402+, F2587+, F2688+, F2710+, F2837+, F2985+, F2993+, F3111+, F3136+, F3335+, F3556+, F3692+, F3987+, F719+, L132+, L15+, L16+, L298+, L350+, L430+, L468+, L470+, L498+, L656+, M11+, M139+, M168+, M185+, M20+, M22+, M235+, M27+, M294+, M42+, M61+, M76+, M89+, M94+, P128+, P131+, P132+, P135+, P136+, P138+, P14+, P141+, P145+, P146+, P148+, P151+, P158+, P159+, P160+, P166+, P187+, P329+, PAGES00121+, PF1016+, PF1029+, PF1031+, PF1040+, PF1046+, PF1061+, PF1092+, PF1097+, PF110+, PF1203+, PF1269+, PF1276+, PF192+, PF210+, PF212+, PF223+, PF234+, PF258+, PF2591+, PF2593+, PF2599+, PF2608+, PF2611+, PF2615+, PF2624+, PF263+, PF2643+, PF272+, PF2745+, PF2747+, PF2748+, PF2749+, PF2770+, PF278+, PF292+, PF316+, PF325+, PF342+, PF500+, PF5516+, PF5517+, PF5519+, PF5522+, PF5524+, PF5526+, PF5528+, PF5531+, PF5532+, PF5535+, PF5536+, PF5539+, PF5554+, PF5557+, PF5563+, PF5564+, PF5566+, PF5583+, PF5586+, PF5683+, PF5686+, PF5689+, PF5692+, PF5693+, PF5694+, PF5695+, PF5699+, PF5705+, PF5715+, PF5717+, PF5718+, PF5720+, PF5723+, PF5729+, PF5732+, PF5733+, PF5737+, PF5743+, PF5744+, PF5747+, PF5754+, PF5756+, PF5757+, PF5771+, PF5773+, PF5779+, PF5790+, PF5791+, PF5795+, PF5802+, PF5804+, PF5806+, PF5810+, PF5813+, PF5815+, PF5821+, PF5823+, PF5829+, PF5830+, PF5832+, PF5833+, PF5837+, PF5839+, PF5841+, PF5842+, PF667+, PF719+, PF725+, PF779+, PF796+, PF803+, PF815+, PF821+, PF840+, PF844+, PF892+, PF937+, PF951+, PF954+, PF970+, V186+, V189+, V205+, V52+, V9+

остальные похожие на биг игрек
N92407
N9890
M9285
284206
N126552

[Шад]

Скорее похоже на Geno 2.0

[AppS]

Может и так.

[Шад]

Может и так.

Конечно не буду утверждать, что все BigY уже есть на дерве YFull, но на текущий момент это выглядит так:
http://yfull.com/tree/L/
L-M27 ни одного, только один L1c
Но L-M27 весьма подробно охвачен научными образцами (20 штук). Индия, Пакистан, Шри-Ланка.

[AppS]

Но L-M27 весьма подробно охвачен научными образцами (20 штук). Индия, Пакистан, Шри-Ланка.

20 шт - это подробно? и то в данном случае подразумевается под научными образцами?

[Шад]

Но L-M27 весьма подробно охвачен научными образцами (20 штук). Индия, Пакистан, Шри-Ланка.

20 шт - это подробно? и то в данном случае подразумевается под научными образцами?

Посмотрите по ссылке на дерево от YFull. К моменту запуска их проекта ими были обработаны общедоступные образцы из научных публикаций и открытых проектов типа 1K Genomes, PGP, HDGP. А то, что им поступает на интерпретацию имеет идентификатор типа YFxxxxx. На научных образцах использована их "родная" нотификация, из их проектов и есть трех буквенный код популяции

[AppS]

Шад
спасибо, понял. У меня просто словосочетание "научная выборка" ассоциируется с сотней коротких (до 17м) результатов.

Если я правильно понял, то Европы нет в выборке вообще?

[Шад]

Шад
спасибо, понял. У меня просто словосочетание "научная выборка" ассоциируется с сотней коротких (до 17м) результатов.

Если я правильно понял, то Европы нет в выборке вообще?

Никого. Насколько я понял в рамках этих проектов исследовались преимущественно экзотические популяции.
Единственный выход - агитировать заказывать BigY или Full Genomes Prime/Elite,

[AppS]

Шад
Пока не очень выходит агитировать даже многомаркеров заказывать.
из проекта L всего два европейца, имеющих 67 маркеров - украинец с Полтавщины и итальянец с Пьемонта. Ну и я потихоньку своего довожу. 111 - только полтавец.

[AppS]

Брахманы с Saraswat Brahmins haplotypes by Yadav et al.,2010
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest-neighbors/65710/
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest-neighbors/65709/

[AppS]

L1-M27 Пакистан
http://prr.hec.gov.pk/Chapters/1026S-4.pdf

[AppS]

329584 - Новый европеец L-M27, да еще и с 67 маркерами, с  Oderzo Италия.
http://www.semargl.me/haplogroups/maps/630/

Как это обычно бывает для евро L-M27 ближайшие не европейцы, а все те же ребята с Персидского залива, на больших дистанциях.

Примечание: если видите значок в центре страны - с большой вероятностью указана была только страна.

[AppS]

добавил два с кавказа осетин и черкес.
OSE-509 и CHRK-514
чуть ли не первые L27 на Кавказе


появился L m27 со Словении.
 
384889         Slovenia    L-M20    11    22    14    10    13-17    11    12    11    12    14    2

[AppS]

У курдов тоже очень разнообразный L
http://kurdishdna.blogspot.de/2014/10/kurdish-y-dna-part-xi.html

Haplogroup L
2x L a.k.a. hg28 (Yezidis from Armenia in Yepiskoposian et al., 2006)
1x L a.k.a. hg28 (Iraqi Kurds in Nebel et al., 2001)
1x L-M11* (Kurdistan-Iran in Cristofaro et al., 2013)
5x L-M20 (Iraqi Kurds in Stenersen et al., 2004; based on Athey's Haplogroup predictor)
2x L-M20 (Iranian Kurds in Malyarchuk et al., 2013)
1x L1-M76  (M295; Kurd from Iran, originally from Amed region)
1x L1a-M76  (Iranian Kurds in Grugni et al., 2012)
1x L1a-M76 (Kurdistan-Iran in Cristofaro et al., 2013)
1x L1b-M317 (Kurdistan-Iran in Cristofaro et al., 2013)
1x L1c-M357 (Kurdistan-Iran in Cristofaro et al., 2013)