U5a

[Natalya]

Добрый всем день! Думаю мне сюда.
получила наконец-то HVR1 и HVR2
Результат: 1) 16192Т, 16256Т,16270Т,16526А.
                2) 73G, 263G. 315.1C.
U5 (Урсула), мне здешний народ определил как

U5a2

встречается в центр. и вост. Европе

Хотелось бы подлинней гаплотипчик.

В соседней ветке нашел утилиту для определения mt-группы - выдала первым номером U5a2a2(HM246245) и ещё 3 смежных.

Это как найти. Может ссылку дадите.
спасибо.

[kaa76]

В соседней ветке нашел утилиту для определения mt-группы - выдала первым номером U5a2a2(HM246245) и ещё 3 смежных.

Это как найти. Может ссылку дадите.
спасибо.

Вот ссылка.

[Natalya]

спасибо за ссылочку, но с английским у меня никак. Подскажите как этим пользоваться.

[kaa76]

спасибо за ссылочку, но с английским у меня никак. Подскажите как этим пользоваться.

Выложил инструкцию на МолГен-Вики здесь.

[Natalya]

Ой! спасибо. все сделала. но мне выдано столько цифер и букв, как интерпретировать?

Markers found (shown as differences to rCRS):

HVR2: 73G 263G (315.1C)
CR:
HVR1: 16192T 16256T 16270T 16526A

Best mtDNA Haplogroup Matches:
1) U5a2
Defining Markers for haplogroup U5a2:
HVR2: 73G 263G
CR: 750G 1438G 2706G 3197C 4769G 7028T 8860G 9477A 11467G 11719A 12308G 12372A 13617C 14766T 14793G 15326G
HVR1: 16192T 16256T 16270T 16526A
Marker path from rCRS to haplogroup U5a2 (plus extra markers):
H2a2a(rCRS) ⇨ 263G 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 11467G 12308G 12372A ⇨ U ⇨ 3197C 9477A 13617C 16192T 16270T ⇨ U5 ⇨ 14793G 16256T ⇨ U5a ⇨ 16526A ⇨ U5a2 ⇨ (315.1C)
Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(6): 73G 263G 16192T 16256T 16270T 16526A
Extras(0): (315.1C)
Untested(16): 750 1438 2706 3197 4769 7028 8860 9477 11467 11719 12308 12372 13617 14766 14793 15326

2) U5a2b
Defining Markers for haplogroup U5a2b:
HVR2: 73G 263G
CR: 750G 1438G 2706G 3197C 4769G 7028T 8860G 9477A 9548A 11467G 11719A 12308G 12372A 13617C 14766T 14793G 15326G
HVR1: 16192T 16256T 16270T 16526A
Marker path from rCRS to haplogroup U5a2b (plus extra markers):
H2a2a(rCRS) ⇨ 263G 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 11467G 12308G 12372A ⇨ U ⇨ 3197C 9477A 13617C 16192T 16270T ⇨ U5 ⇨ 14793G 16256T ⇨ U5a ⇨ 16526A ⇨ U5a2 ⇨ 9548A ⇨ U5a2b ⇨ (315.1C)
Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(6): 73G 263G 16192T 16256T 16270T 16526A
Extras(0): (315.1C)
Untested(17): 750 1438 2706 3197 4769 7028 8860 9477 9548 11467 11719 12308 12372 13617 14766 14793 15326

2) U5a2c
Defining Markers for haplogroup U5a2c:
HVR2: 73G 263G
CR: 750G 1438G 2706G 3197C 4769G 7028T 8860G 9477A 10619T 11467G 11719A 12308G 12372A 13617C 14766T 14793G 15326G
HVR1: 16192T 16256T 16270T 16526A
Marker path from rCRS to haplogroup U5a2c (plus extra markers):
H2a2a(rCRS) ⇨ 263G 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 11467G 12308G 12372A ⇨ U ⇨ 3197C 9477A 13617C 16192T 16270T ⇨ U5 ⇨ 14793G 16256T ⇨ U5a ⇨ 16526A ⇨ U5a2 ⇨ 10619T ⇨ U5a2c ⇨ (315.1C)
Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(6): 73G 263G 16192T 16256T 16270T 16526A
Extras(0): (315.1C)
Untested(17): 750 1438 2706 3197 4769 7028 8860 9477 10619 11467 11719 12308 12372 13617 14766 14793 15326

2) U5a2b1
Defining Markers for haplogroup U5a2b1:
HVR2: 73G 263G
CR: 750G 960.1C 1438G 2706G 3197C 4769G 7028T 8860G 9477A 9548A 11467G 11719A 12308G 12372A 13617C 14766T 14793G 15326G
HVR1: 16192T 16256T 16270T 16526A
Marker path from rCRS to haplogroup U5a2b1 (plus extra markers):
H2a2a(rCRS) ⇨ 263G 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 11467G 12308G 12372A ⇨ U ⇨ 3197C 9477A 13617C 16192T 16270T ⇨ U5 ⇨ 14793G 16256T ⇨ U5a ⇨ 16526A ⇨ U5a2 ⇨ 9548A ⇨ U5a2b ⇨ 960.1C ⇨ U5a2b1 ⇨ (315.1C)
Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(6): 73G 263G 16192T 16256T 16270T 16526A
Extras(0): (315.1C)
Untested(18): 750 960.1 1438 2706 3197 4769 7028 8860 9477 9548 11467 11719 12308 12372 13617 14766 14793 15326

2) U5a2c1
Defining Markers for haplogroup U5a2c1:
HVR2: 73G 263G
CR: 750G 1438G 2706G 3197C 4769G 7028T 8860G 9469T 9477A 10619T 11467G 11719A 12308G 12372A 13617C 14766T 14793G 15326G
HVR1: 16192T 16256T 16270T 16526A
Marker path from rCRS to haplogroup U5a2c1 (plus extra markers):
H2a2a(rCRS) ⇨ 263G 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 11467G 12308G 12372A ⇨ U ⇨ 3197C 9477A 13617C 16192T 16270T ⇨ U5 ⇨ 14793G 16256T ⇨ U5a ⇨ 16526A ⇨ U5a2 ⇨ 10619T ⇨ U5a2c ⇨ 9469T ⇨ U5a2c1 ⇨ (315.1C)
Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(6): 73G 263G 16192T 16256T 16270T 16526A
Extras(0): (315.1C)
Untested(18): 750 1438 2706 3197 4769 7028 8860 9469 9477 10619 11467 11719 12308 12372 13617 14766 14793 15326

3) U5a2b1a
Defining Markers for haplogroup U5a2b1a:
HVR2: 73G 263G
CR: 750G 960.1C 1438G 2706G 3197C 4769G 7028T 8860G 9477A 9548A 11467G 11719A 12308G 12372A 12441C 13617C 14766T 14793G 15326G
HVR1: 16192T 16256T 16270T 16526A
Marker path from rCRS to haplogroup U5a2b1a (plus extra markers):
H2a2a(rCRS) ⇨ 263G 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 11467G 12308G 12372A ⇨ U ⇨ 3197C 9477A 13617C 16192T 16270T ⇨ U5 ⇨ 14793G 16256T ⇨ U5a ⇨ 16526A ⇨ U5a2 ⇨ 9548A ⇨ U5a2b ⇨ 960.1C ⇨ U5a2b1 ⇨ 12441C ⇨ U5a2b1a ⇨ (315.1C)
Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(6): 73G 263G 16192T 16256T 16270T 16526A
Extras(0): (315.1C)
Untested(19): 750 960.1 1438 2706 3197 4769 7028 8860 9477 9548 11467 11719 12308 12372 12441 13617 14766 14793 15326

[Valery]

получила наконец-то HVR1 и HVR2
Результат: 1) 16192Т, 16256Т,16270Т,16526А.
                2) 73G, 263G. 315.1C.
U5 (Урсула), мне здешний народ определил как

U5a2

встречается в центр. и вост. Европе

Правильно определили, ничего больше сказать нельзя.

[Шад]

Ой! спасибо. все сделала. но мне выдано столько цифер и букв, как интерпретировать?

Определение митогруппы носит вероятностный характер в силу неполноты информации. У Вас протестированы только HVR1 и HVR2, а предиктор основывается на полной расшифровке митоДНК. Вот он и выдает информацию о возможном субкладе - сколько совпадений и сколько позиций непротестировано. Выходит, что U5a2 - точно (с высокой вероятностью), а дальше возможны варианты, которые прояснит только FMS.

[Natalya]

понятно, т.е. мне надо что до заказать? CR ? Это что и как это до заказать?

[Шад]

понятно, т.е. мне надо что до заказать? CR ? Это что и как это до заказать?

Тест называется mtFullSequence если до этого митотесты не заказывались. Стоит 289 долларов. А если HVR1+HVR2 уже есть: mtHVR2toMega. Стоит 239 долларов.

[Centurion]

которые прояснит только FMS.

Это Федеральная Миграционная Служба? 

[Шад]

которые прояснит только FMS.

Это Федеральная Миграционная Служба? 

Нет.

[Teresh]

Получил результаты 23andMe.      James Lick выдал следующее:

Markers found (shown as differences to rCRS):

HVR2: 73G 263G 338T
CR: 750G 1438G 2706G 3197C 4769G 5557C 6023A 7028T 8860G 9477A 11467G 11719A 11935C 12308G 12372A 13617C 14766T 14793G 15218G 15326G
HVR1: 16222T 16256T 16270T 16399G


Best mtDNA Haplogroup Matches:
1) U5a1f

Defining Markers for haplogroup U5a1f:
HVR2: 73G 263G
CR: 750G 1438G 2706G 3197C 4769G 6023A 7028T 8860G 9477A 11467G 11719A 12308G 12372A 13617C 14766T 14793G 15218G 15326G
HVR1: 16192T 16256T 16270T 16399G

Marker path from rCRS to haplogroup U5a1f (plus extra markers):
H2a2a(rCRS) ⇨ 263G 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 11467G 12308G 12372A ⇨ U ⇨ 3197C 9477A 13617C 16192T 16270T ⇨ U5 ⇨ 14793G 16256T ⇨ U5a ⇨ 15218G 16399G ⇨ U5a1 ⇨ 6023A ⇨ U5a1f ⇨ 338T 5557C 11935C 16222T

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(23): 73G 263G 750G 1438G 2706G 3197C 4769G 6023A 7028T 8860G 9477A 11467G 11719A 12308G 12372A 13617C 14766T 14793G 15218G 15326G 16256T 16270T 16399G
Extras(4): 338T 5557C 11935C 16222T
Untested(1): 16192


2) U5a1

Defining Markers for haplogroup U5a1:
HVR2: 73G 263G
CR: 750G 1438G 2706G 3197C 4769G 7028T 8860G 9477A 11467G 11719A 12308G 12372A 13617C 14766T 14793G 15218G 15326G
HVR1: 16192T 16256T 16270T 16399G

Marker path from rCRS to haplogroup U5a1 (plus extra markers):
H2a2a(rCRS) ⇨ 263G 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 11467G 12308G 12372A ⇨ U ⇨ 3197C 9477A 13617C 16192T 16270T ⇨ U5 ⇨ 14793G 16256T ⇨ U5a ⇨ 15218G 16399G ⇨ U5a1 ⇨ 338T 5557C 6023A 11935C 16222T

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(22): 73G 263G 750G 1438G 2706G 3197C 4769G 7028T 8860G 9477A 11467G 11719A 12308G 12372A 13617C 14766T 14793G 15218G 15326G 16256T 16270T 16399G
Extras(5): 338T 5557C 6023A 11935C 16222T
Untested(1): 16192


3) U5a1(16192!)

Defining Markers for haplogroup U5a1(16192!):
HVR2: 73G 263G
CR: 750G 1438G 2706G 3197C 4769G 7028T 8860G 9477A 11467G 11719A 12308G 12372A 13617C 14766T 14793G 15218G 15326G
HVR1: 16256T 16270T 16399G

Marker path from rCRS to haplogroup U5a1(16192!) (plus extra markers):
H2a2a(rCRS) ⇨ 263G 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 11467G 12308G 12372A ⇨ U ⇨ 3197C 9477A 13617C 16192T 16270T ⇨ U5 ⇨ 14793G 16256T ⇨ U5a ⇨ 15218G 16399G ⇨ U5a1 ⇨ 16192C ⇨ U5a1(16192!) ⇨ 338T 5557C 6023A 11935C 16222T

Imperfect Match. Your results contained differences with this haplogroup:
Matches(22): 73G 263G 750G 1438G 2706G 3197C 4769G 7028T 8860G 9477A 11467G 11719A 12308G 12372A 13617C 14766T 14793G 15218G 15326G 16256T 16270T 16399G
Extras(5): 338T 5557C 6023A 11935C 16222T
Untested(1): 16192

Правильно ли я понимаю, что это U5a1f ?
А что такое Extras(4): 338T 5557C 11935C 16222T ? Это private mutations или ветви гаплогруппы расписаны еще не очень подробно?

[Teresh]

Получил результаты mtFullSequence от FTDNA. Чтобы сравнить с результатами 23andMe (представленными выше), прогнал FASTA-файл через утилиту Джеймса Лика. Оставил только два варианта:

Found 16569 markers at 16569 positions covering 100.0% of mtDNA.
Markers found (shown as differences to rCRS):

HVR2: 73G 263G (309.1C) (315.1C) 338T
CR: 750G 1438G 2581G 2706G 3197C 4769G 5557C 6023A 7028T 8860G 8994A 9477A 11467G 11719A 11935C 12308G 12372A 13617C 14766T 14793G 15218G 15326G 15740T
HVR1: 16192T 16222T 16256T 16270T 16399G


Best mtDNA Haplogroup Matches:

1) U5a1f

Defining Markers for haplogroup U5a1f:
HVR2: 73G 263G
CR: 750G 1438G 2706G 3197C 4769G 6023A 7028T 8860G 9477A 11467G 11719A 12308G 12372A 13617C 14766T 14793G 15218G 15326G
HVR1: 16192T 16256T 16270T 16399G

Marker path from rCRS to haplogroup U5a1f (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 11467G 12308G 12372A ⇨ U ⇨ 3197C 9477A 13617C 16192T 16270T ⇨ U5 ⇨ 14793G 16256T ⇨ U5a ⇨ 15218G 16399G ⇨ U5a1 ⇨ 6023A ⇨ U5a1f ⇨ (309.1C) (315.1C) 338T 2581G 5557C 8994A 11935C 15740T 16222T

Good Match! Your results also had extra markers for this haplogroup:
Matches(24): 73G 263G 750G 1438G 2706G 3197C 4769G 6023A 7028T 8860G 9477A 11467G 11719A 12308G 12372A 13617C 14766T 14793G 15218G 15326G 16192T 16256T 16270T 16399G
Extras(7): (309.1C) (315.1C) 338T 2581G 5557C 8994A 11935C 15740T 16222T


2) U5a1

Defining Markers for haplogroup U5a1:
HVR2: 73G 263G
CR: 750G 1438G 2706G 3197C 4769G 7028T 8860G 9477A 11467G 11719A 12308G 12372A 13617C 14766T 14793G 15218G 15326G
HVR1: 16192T 16256T 16270T 16399G

Marker path from rCRS to haplogroup U5a1 (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 2706G 7028T ⇨ HV ⇨ 14766T ⇨ R0 ⇨ 73G 11719A ⇨ R ⇨ 11467G 12308G 12372A ⇨ U ⇨ 3197C 9477A 13617C 16192T 16270T ⇨ U5 ⇨ 14793G 16256T ⇨ U5a ⇨ 15218G 16399G ⇨ U5a1 ⇨ (309.1C) (315.1C) 338T 2581G 5557C 6023A 8994A 11935C 15740T 16222T

Good Match! Your results also had extra markers for this haplogroup:
Matches(23): 73G 263G 750G 1438G 2706G 3197C 4769G 7028T 8860G 9477A 11467G 11719A 12308G 12372A 13617C 14766T 14793G 15218G 15326G 16192T 16256T 16270T 16399G
Extras(8 ): (309.1C) (315.1C) 338T 2581G 5557C 6023A 8994A 11935C 15740T 16222T


3) U5a1b
3) U5a1c
3) U5a1d

Полных совпадений по HVR1+HVR2 в базах FTDNA  и mitoSearch  нет.

[Teresh]

В FTDNA у меня имеется 6 совпадений по HVR1 и 3 отдельных совпадения по HVR2.
Похоже, что группа U5a1f еще не очень подробно расписана. В частности:
1)   у меня:   
U5a1f + 338T 2581G 5557C 8994A 11935C 15740T 16222T;
2)  у образца RUS_354 из статьи Malyarchuk B et al. (2010) The Peopling of Europe from the Mitochondrial Haplogroup U5 Perspective:
U5a1f + 203A 204C 5557C 8994A 11935C  12491T 16222T;
3) у уважаемой kbg в неполных результатах от 23andMe на стр. 2 этой ветки:
U5a1f + 5557C 11935C 16222T.

Поэтому администратор проекта U5a FGS mtDNA   на FTDNA завел для моих результатов отдельную группу: "U5a1f Group 2 - proposed new haplogroup".  Есть надежда со временем получить персональную гаплогруппу. 

[Andrey_X]

День добрый!
Заказывал 3.10.12 г. и только сегодня получил результат U5a1.
Теперь вот пытаюсь разобраться...