мтДНК: Гаплогруппа J

[Elena V]

Видимо, речь идет о этих мутациях 7853 G>A и 9701 T>C

Да, именно об этих. Я пошлю Дж.Логану свой ID ГенБанка и спрошу об этих мутациях. Но думаю, что пока эти субклады не выделены, потому что очень мало представителей J1c4 и в FTDNA, и в ГенБанке.

Получила ответ от Дж.Логана, вполне предсказуемый. Он сейчас относит мой гаплотип к J1c4b, но пишет, что нужно ждать больше результатов тестов, чтобы точнее определить субклад. "Время покажет, насколько будет расширено дерево и какие мутации будут использованы для определения ветвей".  Что же, поживем-увидим  .

[I2a1a]

Готов Генбанковский вариант FGS татии.
Я пока еще не заряжал его в Мурку, но в онлайн варианте программы blastin выстроилось вот такое дерево. Татин FGS выделен желтым цветом.

[татиа]

Вадим, огромное спасибо! Ура.
Маленькое уточнение - это FGS мамы татии 
Я еще не научилась пользоваться ГенБанком  , не подскажете ли, не написано ли там, откуда мои соседи J1c2c? В FtDNA у мамы три HVR1 совпаденца и один HVR1+HVR2 совпаденец с польской фамилией.

[I2a1a]

Добавил Ваш сиквенс в дерево. Получилось что-то странное.

[I2a1a]

Непонятно, почему J1c2c присоединился к ветви J1c1.

[татиа]

Непонятно, почему J1c2c присоединился к ветви J1c1.

А что это может значить? Может, Ян Логан промахнулся при конвертации данных? Потому что я прислала ему просто чистую копию-картинку со странички FtDNA.
  Или Мурка пошалила?

[I2a1a]

Непонятно, почему J1c2c присоединился к ветви J1c1.

А что это может значить? Может, Ян Логан промахнулся при конвертации данных? Потому что я прислала ему просто чистую копию-картинку со странички FtDNA.
  Или Мурка пошалила?

Я посмотрю. Возможно, произошло неправильное выравнивание митосиквенсов.

[Elena V]

А это не могло быть связано с теми изменениями в классификации субкладов, которые произошли в октябре 2009 г. и о которых Дж.Логан оповестил всех членов проекта J* письмом 10/28/2009:
 A change is also being made in the academic community to take into consideration a prior precedence.  This recognition results in the interchange of the naming of the clades that I have been calling J1c1 and J1c2.  Specifically, it has been recognized that in 2004 and within J1c, a branch defined by 482 and 3394 was called J1c1, but I and others have called it J1c2.  I am adopting this change and so is Family Tree DNA.  I have renamed the groups within the J-mtDNA Project at Family Tree DNA.
И еще вопрос. Я прочитала, но не совсем уверена в своем понимании, что все корректировки в запись ГенБанка должен вносить сам владелец сиквенса, так появляются версии записи. Относится ли это и к уточнению субклада?

[I2a1a]

А это не могло быть связано с теми изменениями в классификации субкладов, которые произошли в октябре 2009 г. и о которых Дж.Логан оповестил всех членов проекта J* письмом 10/28/2009:
 A change is also being made in the academic community to take into consideration a prior precedence.  This recognition results in the interchange of the naming of the clades that I have been calling J1c1 and J1c2.  Specifically, it has been recognized that in 2004 and within J1c, a branch defined by 482 and 3394 was called J1c1, but I and others have called it J1c2.  I am adopting this change and so is Family Tree DNA.  I have renamed the groups within the J-mtDNA Project at Family Tree DNA.

Может быть, я к сожалению не в курсе.

И еще вопрос. Я прочитала, но не совсем уверена в своем понимании, что все корректировки в запись ГенБанка должен вносить сам владелец сиквенса, так появляются версии записи. Относится ли это и к уточнению субклада?

Да, я думаю, что все изменения должен вносить сам владелец сиквенса.

[татиа]

Да, я думаю, что все изменения должен вносить сам владелец сиквенса.

Лена и Вадим. я слишком неопытна пока в общении с ГенБанком, чтобы что-то вносить, я еще не  во всем разобралась. Я как и другие послала копию FGS Яну, получила от него три файла, один из которых послала в Генбанк. J1c2c совершенно официально присвоено маминой FGS FtDNA. Я ничего сама не вносила и пока оснований ничего вносить у меня нет. Могу написать обоим Логанам... но что написать... что уважаемая мною, но неизвестная им программа "M u r k a" расположила меня не там, где следовало..?

[I2a1a]

Не торопитесь, татия. Сначала надо разобраться с ситуацией.
Тут, возможно, ошибка с моей стороны закралась.

[Elena V]

татиа,
никому сейчас писать и не надо, Вы же только что внесли самые свежие данные. Я просто предположила, что в ГенБанке могут оказаться ранее внесенные и не скорректированные записи. Как в mitoSearch - почти никто не корректирует свою гаплогруппу.

[татиа]

Вадим, в том, что предположила Елена пару постов назад есть логика. Мама ведь совсем недавно еще (до FGS результатов и до новой класификации) относилась Логаном к J1c1...

[татиа]

татиа,
никому сейчас писать и не надо, Вы же только что внесли самые свежие данные. Я просто предположила, что в ГенБанке могут оказаться ранее внесенные и не скорректированные записи. Как в mitoSearch - почти никто не корректирует свою гаплогруппу.

К слову, я на днях попыталась скорректировать мамины данные в мито-серче, но там нет для этого технической возможности: в списке, где следует выбрать J1c2c нет, а вписать самой невозможно.

[I2a1a]

татиа,
никому сейчас писать и не надо, Вы же только что внесли самые свежие данные. Я просто предположила, что в ГенБанке могут оказаться ранее внесенные и не скорректированные записи. Как в mitoSearch - почти никто не корректирует свою гаплогруппу.

Логично.