мтДНК: Гаплогруппа J

[I2a1a]

Вадим, в том, что предположила Елена пару постов назад есть логика. Мама ведь совсем недавно еще (до FGS результатов и до новой класификации) относилась Логаном к J1c1...

Похоже, так оно и есть. Ветвь J1c2 в новом дереве отделяется от J1c только мутацией 03394 T>C  .
Тем не менее, FGS Вашей мамы попал в один узел с FGS,который по старой номенклатуре обозначен как J1c1b,  c определяющими мутациями 685 G>A, 13281 T>C, 13933 A>G.

[татиа]

Вадим, спасибо большое за древо.
Конечно, положение мое какое-то неуверенное... 
Но подождем новых J-результатов, может быть, произойдет корректировка.
А у представителей J1c2... a и b обозначено в ГенБанке, из какого они региона?

[I2a1a]

Вадим, спасибо большое за древо.
Конечно, положение мое какое-то неуверенное... 
Но подождем новых J-результатов, может быть, произойдет корректировка.
А у представителей J1c2... a и b обозначено в ГенБанке, из какого они региона?

J1c2a=(Genbank код AY495210.1) взят из работы  Coble,M.D., Just,R.S., O'Callaghan,J.E., Letmanyi,I.H.,Peterson,C.T., Irwin,J.A. and Parsons,T.J. "Single nucleotide polymorphisms over the entire mtDNA genome thatincrease the power of forensic testing in Caucasians" Int. J. Legal Med. 118 (3), 137-146 (2004)
J1c2b=(Genbank код EF177420.1) из работы Pereira,L., Goncalves,J., Franco-Duarte,R., Silva,J., Rocha,T., Arnold,C., Richards,M. and Macaulay,V. "No evidence for a mtDNA role in sperm motility: data from complete sequencing of asthenozoospermic males"  (unpublished?) данных о этно-принадлежности нет, но поскольку статья написана португальскими учеными, то скорее всего митосиквенс из Португалии.

[татиа]

   эх... остается только ждать.

[I2a1a]

  эх... остается только ждать.

Под Caucasians авторы подразумевали скорее не столько жителей Кавказа, сколько расовый европейский тип.

[татиа]

  эх... остается только ждать.

Под Caucasians авторы подразумевали скорее не столько жителей Кавказа, сколько расовый европейский тип.

Ага. Я эту ошибку еще делала год назад .
Спасибо, Вадим.

[татиа]

А у нас еще есть mouglley с J1c3c, а его что-то на нашем древе не видно...

И вот, что я еще подумала  ... нельзя ли подбить уважаемую Gentis на тестирование FGS наших Григорьева, Центуриона, Веренича и супруги Вертера по суперскидочным ценам. Знакомства же у нас в этой лаборатории есть... 

[mouglley]

А я только из 23andMe данные имею - мало, наверное.

[татиа]

А я только из 23andMe данные имею - мало, наверное.

Тогда включаю в листинг прошения к уважаемой Gentis и mouglley тоже.

Получается как раз 5 человек - вполне скидочное количество... 

[I2a1a]

А я только из 23andMe данные имею - мало, наверное.

Тогда включаю в листинг прошения к уважаемой Gentis и mouglley тоже.

Получается как раз 5 человек - вполне скидочное количество... 

Хорошая тема, только в Gentis пока вроде не делают FGS.

[татиа]

Хорошая тема, только в Gentis пока вроде не делают FGS.

Как же это!  Как же тогда раскручивать эту уважаемую компанию, если не представлена вся линейка услуг и не проводятся регулярные скидочные акции...
Одним Первым каналом сыт не будешь 

[Grigoriev]

Для того чтобы Гентис (ОН) мог начать заниматься FGS  и пр. в России должен быть сформирован рынок на mtDNA, а в России  пока и с Игреком сложности имеются...

[татиа]

Не знаю как в России, а вот меня моя штатовская пен-френд на 23&Me спросила, предоставляют ли подобные услуги в России. У нее есть русский муж и ей база 23&Me для русских представляется бессмысленной. Хочет искать RF-кузенов мужа в российских базах.
Вот я и впала в глубокую задумчивость: тест-то я ей знаю, где посоветовать сделать, а базу вы ей где раздобудете?   

А рынок будет тогда, когда будут скидки. На 23&Me ситуация оживляется только во время скидок. Вне скидок: ни шатко - ни валко.

Раз уж мы на J*. 5 лучших представителей J*-сообщества, они же элита ДНК-генеалогии, они же лидеры сайта, - нуждаются в FGS. Как будем решать эту проблему? Необходим грант и добрая воля лаборатории.

[I2a1a]

23ия записало меня просто в J1c

J1c defining mutations
rCRS=14798    rs28357681
 
J1 defining mutations
rCRS=462    rs41402146
rCRS=462    i3001451
rCRS=3010    rs3928306
 
J defining mutations
rCRS=295    rs41528348
rCRS=295    i4001145
rCRS=489    rs28625645
rCRS=10398    rs2853826
rCRS=12612    rs28359172
rCRS=13708    rs28359178
rCRS=16069    i3001561
 
JT defining mutations
rCRS=11251    rs3915952
rCRS=15452    rs3088309
rCRS=16126    i3001602
rCRS=16126    i3001603
 
R2'JT defining mutations
rCRS=4216    rs1599988
 
R defining mutations
rCRS=12705    rs2854122
rCRS=16223    rs2853513
 
N defining mutations
rCRS=8701    i3000759
rCRS=9540    rs2248727
rCRS=9540    i3001497
rCRS=10398    rs2853826
rCRS=10873    rs2857284
rCRS=15301    rs28573847
rCRS=15301    i3001523
 
L3 defining mutations
rCRS=769    rs2853519
rCRS=769    i3001949
rCRS=1018    rs2856982
rCRS=1018    i3001452
 
L3'4 defining mutations
rCRS=182    rs41473347
rCRS=182    i3001445
rCRS=3594    rs2854134
rCRS=7256    rs28625947
rCRS=13650    rs2854123
rCRS=16278    rs41458645
rCRS=16278    i3001790
 
L3'4'6 defining mutations
rCRS=4104    rs1117205
rCRS=7521    i1000010
rCRS=7521    i3001488
 
L2'3'4'6 defining mutations
rCRS=195    rs2857291
rCRS=195    i3002066
rCRS=247    rs41334645
rCRS=247    i3001448
rCRS=825    rs2853520
rCRS=8655    rs2853822
rCRS=8655    i3002650
rCRS=10688    rs2853488
rCRS=10810    rs28358282
rCRS=10810    i3000954
rCRS=13105    rs2853501
rCRS=13506    rs2857287
rCRS=15301    rs28573847
rCRS=15301    i3001523
rCRS=16129    rs5005270
rCRS=16129    i3001531
rCRS=16129    i3001605
rCRS=16187    i4000590
rCRS=16187    i4000591
rCRS=16189    rs28693675
rCRS=16189    i4000587
 
L2-6 defining mutations
rCRS=152    i3001922
rCRS=2758    rs2856980
rCRS=2885    rs2854130
rCRS=7146    rs28546855
rCRS=8468    rs1116907
rCRS=8468    i3000730
 
L1-6 defining mutations
rCRS=146    i3001869
rCRS=182    rs41473347
rCRS=182    i3001445
rCRS=4312    i3002160
rCRS=10664    rs2854121
rCRS=10915    rs2857285
rCRS=11914    rs2853496
rCRS=13276    rs2853502
rCRS=16230    rs2853514

[I2a1a]

Добавил в выборку FGS J1c. По иронии судьбы им оказался сиквенс Dan Dragachi из моей митогруппы на 23ия. Он аккуратно лег туда, куда ему было положено - в предковый узел всех J1c возрастом 14-15 000 лет (раньше этот узел обозначался пустой точкой схождения узлов). Где-то там должно отличается ответвление моей мито пра*-бабушки.